More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BcerKBAB4_5345 on replicon NC_010182
Organism: Bacillus weihenstephanensis KBAB4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010182  BcerKBAB4_5345  integrase family protein  100 
 
 
182 aa  373  1e-102  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3599  integrase family protein  46.11 
 
 
180 aa  156  2e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.616601  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1368  prophage LambdaBa04, site-specific recombinase, phage integrase family  46.37 
 
 
180 aa  155  3e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.358053 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2613  prophage LambdaBa04, site-specific recombinase, phage integrase family  46.37 
 
 
180 aa  153  1e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.301879  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2711  prophage LambdaBa04, site-specific recombinase, phage integrase family  45.56 
 
 
180 aa  153  2e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0042219  normal  0.247582 
 
 
-
 
NC_010724  Nther_2955  integrase family protein  46.84 
 
 
187 aa  152  2.9999999999999998e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.819146  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4009  prophage LambdaBa04, site-specific recombinase, phage integrase family  45.56 
 
 
180 aa  152  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012794  GWCH70_3453  integrase family protein  46.32 
 
 
189 aa  150  1e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.590005  normal  0.791222 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0652  DNA integration/recombination/invertion protein  45.25 
 
 
180 aa  149  1e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3590  integrase family protein  44.74 
 
 
189 aa  142  3e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  normal  0.0592429  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0815  integrase family protein  44 
 
 
183 aa  142  3e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1007  site-specific recombinase  42.55 
 
 
183 aa  140  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  8.22552e-63 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0577  prophage LambdaBa02, site-specific recombinase, phage integrase family  42.46 
 
 
180 aa  139  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0174  integrase family protein  43.33 
 
 
186 aa  139  3e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00273109  n/a   
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0017  prophage integration/recombination/invertion protein  42.7 
 
 
190 aa  138  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000444728  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3811  prophage LambdaBa02, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  41.9 
 
 
180 aa  137  6e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0141622  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2286  phage integrase  47.25 
 
 
188 aa  136  1e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000274502  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1165  integrase family protein  41.49 
 
 
187 aa  137  1e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007107  pE33L9_0009  integrase/recombinase  43.82 
 
 
190 aa  135  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0412  integrase  43.26 
 
 
190 aa  135  4e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0192917  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0164  DNA integration/recombination/inversion protein  43.82 
 
 
190 aa  134  5e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0167632  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1590  phage integrase family site specific recombinase  40 
 
 
182 aa  132  3.9999999999999996e-30  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000133866  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4392  prophage LambdaBa02, site-specific recombinase, phage integrase family  42.46 
 
 
180 aa  130  6.999999999999999e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2230  prophage LambdaBa02, site-specific recombinase, phage integrase family  41.9 
 
 
180 aa  129  3e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3451  integrase family protein  44.51 
 
 
186 aa  128  5.0000000000000004e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0127606  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4099  prophage lambdaba02, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  42.21 
 
 
169 aa  127  6e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1859  prophage LambdaSa2, site-specific recombinase phage integrase family protein  40.32 
 
 
180 aa  125  3e-28  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00377207  n/a   
 
 
-
 
NC_012790  GWCH70_3470  integrase family protein  35.68 
 
 
182 aa  122  3e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1370  phage integrase family site specific recombinase  40.35 
 
 
179 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1481  phage integrase family site specific recombinase  40.35 
 
 
176 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1185  phage integrase family protein  40.59 
 
 
176 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00690161  n/a   
 
 
-
 
NC_011656  BCAH187_E0001  site-specific recombinase  37.5 
 
 
190 aa  119  3e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.149945  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1516  site-specific recombinase, phage integrase family  40.94 
 
 
176 aa  118  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1586  phage integrase family site specific recombinase  40.94 
 
 
176 aa  118  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.645051  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1343  phage integrase family site specific recombinase  40.94 
 
 
179 aa  118  3.9999999999999996e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.311312  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1342  phage integrase family site specific recombinase  40.94 
 
 
179 aa  118  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1553  site-specific recombinase, phage integrase family  40.94 
 
 
176 aa  118  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000100783 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1622  site-specific recombinase, phage integrase family  40.94 
 
 
176 aa  118  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3829  site-specific recombinase, phage integrase family  40.94 
 
 
176 aa  117  6e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000329942 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1384  integrase family protein  40.35 
 
 
176 aa  116  9.999999999999999e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.334457  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4494  phage integrase family site specific recombinase  38.55 
 
 
188 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4855  site-specific recombinase, phage integrase family  36.87 
 
 
188 aa  107  1e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0382  site-specific recombinase, phage integrase family  36.87 
 
 
188 aa  106  2e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4641  phage integrase family site specific recombinase  36.87 
 
 
188 aa  105  4e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4865  site-specific recombinase, phage integrase family  36.87 
 
 
188 aa  105  4e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4995  phage integrase family site specific recombinase  36.87 
 
 
188 aa  105  4e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4574  integrase family protein  35.87 
 
 
188 aa  105  5e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4476  phage integrase family site specific recombinase  36.31 
 
 
188 aa  104  6e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4879  site-specific recombinase, phage integrase family  36.31 
 
 
188 aa  104  6e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4886  phage integrase family site specific recombinase  36.31 
 
 
188 aa  104  9e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0644  phage integrase family protein  33.85 
 
 
186 aa  101  5e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0659  phage integrase family protein  33.85 
 
 
186 aa  101  5e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.271524  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2232  integrase family protein  34.81 
 
 
197 aa  87.8  7e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.394376  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2240  integrase family protein  34.81 
 
 
197 aa  87.8  7e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.0000448435  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1255  integrase family protein  33.16 
 
 
186 aa  86.3  2e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2953  phage integrase family site specific recombinase  30.85 
 
 
186 aa  84.3  9e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.603832  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3517  phage integrase family protein  32.52 
 
 
188 aa  82.8  0.000000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0377  integrase family protein  32.52 
 
 
186 aa  82  0.000000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000239772 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1254  phage integrase family protein  32.69 
 
 
186 aa  81.6  0.000000000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.709211 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1729  phage integrase family protein  33.15 
 
 
207 aa  80.9  0.000000000000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.425016  normal  0.48456 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0439  phage integrase, C-terminus  53.85 
 
 
73 aa  80.5  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.264159  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0998  phage integrase family protein  33.13 
 
 
215 aa  80.5  0.00000000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00570052  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001839  site-specific recombinase phage integrase family  30.57 
 
 
186 aa  80.1  0.00000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6236  integrase family protein  28.73 
 
 
207 aa  79.7  0.00000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1448  phage integrase family site specific recombinase  31.16 
 
 
188 aa  76.3  0.0000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1694  phage integrase family protein  30.85 
 
 
212 aa  76.6  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.470129  normal  0.0225811 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1771  phage integrase family protein  31.38 
 
 
204 aa  77  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.753085 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1799  phage integrase family protein  31.38 
 
 
204 aa  75.9  0.0000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.968459  normal  0.396821 
 
 
-
 
NC_008496  LEUM_A08  integrase  30.72 
 
 
195 aa  75.5  0.0000000000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.000000003137  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3034  integrase family protein  31.87 
 
 
206 aa  72.8  0.000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.155662  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2267  phage integrase family protein  28.92 
 
 
210 aa  72.8  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.783329  normal  0.401703 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2339  integrase family protein  30.51 
 
 
210 aa  72.4  0.000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0020288 
 
 
-
 
NC_011730  PCC7424_5548  integrase family protein  29.94 
 
 
289 aa  72  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5964  Phage integrase  29.67 
 
 
208 aa  71.6  0.000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0660  integrase family protein  35.67 
 
 
284 aa  71.2  0.000000000007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3791  phage integrase family site specific recombinase  31.35 
 
 
208 aa  69.3  0.00000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0452484 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1978  phage integrase family protein  31.21 
 
 
238 aa  68.9  0.00000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00595062 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1344  integrase family protein  27.81 
 
 
292 aa  68.6  0.00000000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000678444  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0811  Phage integrase  28.19 
 
 
208 aa  68.2  0.00000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0438  phage integrase, N-terminus  39.81 
 
 
97 aa  67.4  0.0000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0989457  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2489  tyrosine recombinase XerD  28.99 
 
 
318 aa  67.4  0.0000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.189208  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1732  integrase/recombinase XerD  31.45 
 
 
308 aa  66.6  0.0000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6957  integrase family protein  28.28 
 
 
292 aa  67  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1201  site-specific tyrosine recombinase XerD  29.32 
 
 
321 aa  65.5  0.0000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.731595  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0119  integrase family protein  30.54 
 
 
209 aa  65.1  0.0000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0312  phage integrase  30.12 
 
 
209 aa  65.1  0.0000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2386  integrase family protein  27.32 
 
 
208 aa  65.1  0.0000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0791  integrase family protein  30.54 
 
 
209 aa  64.7  0.0000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.334688  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0602  site-specific tyrosine recombinase XerC  31.74 
 
 
324 aa  64.7  0.0000000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00926796 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2452  tyrosine recombinase XerD  29.08 
 
 
306 aa  64.7  0.0000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0952029  normal  0.728507 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2671  phage integrase family protein  28.42 
 
 
191 aa  64.3  0.0000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.196134  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3357  integrase family protein  31.14 
 
 
209 aa  64.3  0.0000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.276444  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6093  integrase family protein  29.3 
 
 
210 aa  63.9  0.000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.61747  normal 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3700  integrase family protein  29.63 
 
 
295 aa  63.5  0.000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5291  integrase family protein  29.3 
 
 
210 aa  64.3  0.000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6605  integrase family protein  28 
 
 
292 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1560  tyrosine recombinase XerD  28.57 
 
 
331 aa  62.8  0.000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.736869  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7462  integrase family protein  28 
 
 
292 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.105755  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7619  integrase family protein  28 
 
 
292 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.192826  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0106  phage integrase family protein  32.24 
 
 
295 aa  63.5  0.000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>