123 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_2671 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_2671  phage integrase family protein  100 
 
 
191 aa  388  1e-107  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.196134  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3703  phage integrase family protein  89.08 
 
 
174 aa  296  1e-79  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2240  integrase family protein  32.89 
 
 
197 aa  71.2  0.000000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.0000448435  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2232  integrase family protein  32.89 
 
 
197 aa  71.2  0.000000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.394376  n/a   
 
 
-
 
NC_012794  GWCH70_3453  integrase family protein  28.57 
 
 
189 aa  66.6  0.0000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.590005  normal  0.791222 
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3590  integrase family protein  27.65 
 
 
189 aa  64.3  0.000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  normal  0.0592429  n/a   
 
 
-
 
NC_010182  BcerKBAB4_5345  integrase family protein  28.42 
 
 
182 aa  64.3  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012790  GWCH70_3470  integrase family protein  28 
 
 
182 aa  62  0.000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011656  BCAH187_E0001  site-specific recombinase  29.14 
 
 
190 aa  57.8  0.00000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.149945  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0998  phage integrase family protein  30.52 
 
 
215 aa  57.4  0.0000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00570052  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0174  integrase family protein  26.54 
 
 
186 aa  57  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00273109  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0652  DNA integration/recombination/invertion protein  27.27 
 
 
180 aa  55.8  0.0000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010724  Nther_2955  integrase family protein  24.47 
 
 
187 aa  55.5  0.0000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.819146  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1368  prophage LambdaBa04, site-specific recombinase, phage integrase family  28.21 
 
 
180 aa  55.5  0.0000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.358053 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1007  site-specific recombinase  26.8 
 
 
183 aa  55.1  0.0000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  8.22552e-63 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1165  integrase family protein  26.8 
 
 
187 aa  55.1  0.0000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0815  integrase family protein  26.8 
 
 
183 aa  55.1  0.0000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1148  phage integrase family site specific recombinase  26.14 
 
 
328 aa  54.3  0.000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0281308  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1590  phage integrase family site specific recombinase  26.82 
 
 
182 aa  53.9  0.000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000133866  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3451  integrase family protein  29.27 
 
 
186 aa  53.9  0.000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0127606  n/a   
 
 
-
 
NC_011734  PCC7424_5625  integrase family protein  27.11 
 
 
273 aa  53.1  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0164  DNA integration/recombination/inversion protein  29.94 
 
 
190 aa  52.8  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0167632  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0401  integrase family protein  25 
 
 
310 aa  52.8  0.000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4009  prophage LambdaBa04, site-specific recombinase, phage integrase family  26.92 
 
 
180 aa  52.4  0.000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0039  tyrosine recombinase XerD  24.84 
 
 
312 aa  52  0.000005  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2613  prophage LambdaBa04, site-specific recombinase, phage integrase family  27.71 
 
 
180 aa  52  0.000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.301879  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2953  phage integrase family site specific recombinase  26.35 
 
 
186 aa  51.6  0.000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.603832  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1859  prophage LambdaSa2, site-specific recombinase phage integrase family protein  29.68 
 
 
180 aa  51.2  0.000008  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00377207  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0412  integrase  28.81 
 
 
190 aa  50.8  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0192917  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1431  phage integrase  25.13 
 
 
309 aa  50.8  0.00001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.145363  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1268  integrase family protein  24.67 
 
 
353 aa  50.8  0.00001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2711  prophage LambdaBa04, site-specific recombinase, phage integrase family  27.04 
 
 
180 aa  50.8  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0042219  normal  0.247582 
 
 
-
 
NC_011733  PCC7424_5613  hypothetical protein  26.51 
 
 
273 aa  50.1  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2175  tyrosine recombinase XerD  30.07 
 
 
299 aa  50.1  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0577  prophage LambdaBa02, site-specific recombinase, phage integrase family  29.81 
 
 
180 aa  50.1  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0017  prophage integration/recombination/invertion protein  29.11 
 
 
190 aa  49.3  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000444728  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0687  Phage integrase  23.12 
 
 
310 aa  49.3  0.00003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.004827  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001839  site-specific recombinase phage integrase family  27.22 
 
 
186 aa  49.3  0.00004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0169  phage integrase family protein  25.81 
 
 
282 aa  48.9  0.00004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0558238  n/a   
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0015  Phage integrase  22.54 
 
 
310 aa  48.5  0.00006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.230922  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0312  phage integrase  26.98 
 
 
209 aa  48.5  0.00006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1185  phage integrase family protein  26.04 
 
 
176 aa  48.5  0.00006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00690161  n/a   
 
 
-
 
NC_007107  pE33L9_0009  integrase/recombinase  26.7 
 
 
190 aa  48.1  0.00008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1003  tyrosine recombinase XerD subunit  25.32 
 
 
302 aa  48.1  0.00008  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.497558  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0752  phage integrase family site specific recombinase  28.19 
 
 
309 aa  47.8  0.0001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.232674  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1448  phage integrase family site specific recombinase  25.14 
 
 
188 aa  47.4  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3811  prophage LambdaBa02, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  28.29 
 
 
180 aa  47.8  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0141622  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4099  prophage lambdaba02, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  28.29 
 
 
169 aa  47.8  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1771  phage integrase family protein  25.14 
 
 
204 aa  47.4  0.0001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.753085 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3599  integrase family protein  27.03 
 
 
180 aa  47.4  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.616601  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1639  integrase family protein  27.74 
 
 
301 aa  47.4  0.0001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0514216  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4879  site-specific recombinase, phage integrase family  24.68 
 
 
188 aa  47.8  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4057  site-specific recombinase, phage integrase family  25 
 
 
325 aa  46.6  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.251442  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4476  phage integrase family site specific recombinase  24.03 
 
 
188 aa  47  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1694  phage integrase family protein  24.57 
 
 
212 aa  47  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.470129  normal  0.0225811 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1300  tyrosine recombinase XerD subunit  28.48 
 
 
297 aa  46.6  0.0002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1799  phage integrase family protein  25.14 
 
 
204 aa  46.6  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.968459  normal  0.396821 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1254  phage integrase family protein  24.43 
 
 
186 aa  47  0.0002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.709211 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1384  integrase family protein  25.6 
 
 
176 aa  46.6  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.334457  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4574  integrase family protein  24.68 
 
 
188 aa  47  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5294  integrase family protein  26.43 
 
 
268 aa  47  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0825  site-specific tyrosine recombinase XerC  22.76 
 
 
277 aa  46.6  0.0002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0104756  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0736  site-specific tyrosine recombinase XerC  22.76 
 
 
294 aa  46.6  0.0002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3829  site-specific recombinase, phage integrase family  25.6 
 
 
176 aa  46.6  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000329942 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2436  tyrosine recombinase XerD  27.86 
 
 
305 aa  46.2  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.578966 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1586  phage integrase family site specific recombinase  25.6 
 
 
176 aa  45.8  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.645051  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0660  integrase family protein  26.88 
 
 
284 aa  46.2  0.0003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1622  site-specific recombinase, phage integrase family  25.6 
 
 
176 aa  45.8  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1516  site-specific recombinase, phage integrase family  25.6 
 
 
176 aa  45.8  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1553  site-specific recombinase, phage integrase family  25.6 
 
 
176 aa  45.8  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000100783 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4886  phage integrase family site specific recombinase  23.38 
 
 
188 aa  45.8  0.0004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1370  phage integrase family site specific recombinase  25.6 
 
 
179 aa  45.8  0.0004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1343  phage integrase family site specific recombinase  25.6 
 
 
179 aa  45.8  0.0004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.311312  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1342  phage integrase family site specific recombinase  25.6 
 
 
179 aa  45.8  0.0004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1481  phage integrase family site specific recombinase  25.6 
 
 
176 aa  45.8  0.0004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4855  site-specific recombinase, phage integrase family  24.68 
 
 
188 aa  45.4  0.0004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011730  PCC7424_5548  integrase family protein  24.16 
 
 
289 aa  45.4  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2544  tyrosine recombinase XerC  24.83 
 
 
318 aa  45.1  0.0006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.774585  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04122  site-specific tyrosine recombinase XerC  22.76 
 
 
305 aa  45.1  0.0006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0292  tyrosine recombinase XerD  25.83 
 
 
305 aa  44.7  0.0007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4494  phage integrase family site specific recombinase  24.03 
 
 
188 aa  44.7  0.0008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11988  putative tyrosine recombinase  24.05 
 
 
298 aa  44.7  0.0008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1255  integrase family protein  23.9 
 
 
186 aa  44.7  0.0008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0378  integrase family protein  31.88 
 
 
190 aa  44.7  0.0009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0382  site-specific recombinase, phage integrase family  24.68 
 
 
188 aa  44.7  0.0009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0950  phage integrase family site specific recombinase  24.03 
 
 
354 aa  44.3  0.001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0218535  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2127  tyrosine recombinase XerD  25.77 
 
 
308 aa  43.9  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.518947  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0879  phage integrase family site specific recombinase  24.03 
 
 
354 aa  44.3  0.001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.159654  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0787  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E-like protein  24.85 
 
 
320 aa  44.3  0.001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  decreased coverage  0.00453269  unclonable  0.000000000000100471 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2286  phage integrase  26.83 
 
 
188 aa  43.9  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000274502  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0401  site-specific tyrosine recombinase XerC  24.52 
 
 
324 aa  44.3  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.145415 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0319  tyrosine recombinase XerD  25.17 
 
 
307 aa  44.3  0.001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.944891  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0377  integrase family protein  25.29 
 
 
186 aa  43.9  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000239772 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4641  phage integrase family site specific recombinase  23.38 
 
 
188 aa  43.5  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4995  phage integrase family site specific recombinase  23.38 
 
 
188 aa  43.5  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4524  Phage integrase  25.49 
 
 
310 aa  43.5  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6252  phage integrase-like SAM-like  27.4 
 
 
381 aa  43.5  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0735  integrase/recombinase  25.32 
 
 
355 aa  43.1  0.002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  decreased coverage  0.000138239  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1012  phage integrase family site specific recombinase  24.03 
 
 
354 aa  43.5  0.002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000959514  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0292  phage integrase family protein  28 
 
 
440 aa  43.1  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>