158 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_3703 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_3703  phage integrase family protein  100 
 
 		 174 aa  352  1e-96  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2671  phage integrase family protein  89.08 
 
 		 191 aa  322  2e-87  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.196134  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2232  integrase family protein  34.23 
 
 		 197 aa  76.3  0.0000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.394376  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2240  integrase family protein  34.23 
 
 		 197 aa  76.3  0.0000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.0000448435  n/a   
 
 
-
 
NC_012794  GWCH70_3453  integrase family protein  29.31 
 
 		 189 aa  68.2  0.00000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.590005  normal  0.791222 
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3590  integrase family protein  30 
 
 		 189 aa  67.8  0.00000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  normal  0.0592429  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0998  phage integrase family protein  30.77 
 
 		 215 aa  65.9  0.0000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00570052  n/a   
 
 
-
 
NC_012790  GWCH70_3470  integrase family protein  28 
 
 		 182 aa  65.1  0.0000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011656  BCAH187_E0001  site-specific recombinase  29.8 
 
 		 190 aa  63.9  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.149945  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0174  integrase family protein  29.01 
 
 		 186 aa  62.8  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00273109  n/a   
 
 
-
 
NC_010182  BcerKBAB4_5345  integrase family protein  28.22 
 
 		 182 aa  60.8  0.000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1590  phage integrase family site specific recombinase  29.25 
 
 		 182 aa  60.5  0.00000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000133866  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3451  integrase family protein  31.71 
 
 		 186 aa  60.5  0.00000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0127606  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0412  integrase  33.52 
 
 		 190 aa  59.7  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0192917  n/a   
 
 
-
 
NC_010724  Nther_2955  integrase family protein  25.58 
 
 		 187 aa  59.7  0.00000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.819146  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0164  DNA integration/recombination/inversion protein  33.52 
 
 		 190 aa  58.5  0.00000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0167632  n/a   
 
 
-
 
NC_007107  pE33L9_0009  integrase/recombinase  32.96 
 
 		 190 aa  57  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1368  prophage LambdaBa04, site-specific recombinase, phage integrase family  28.57 
 
 		 180 aa  57  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.358053 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0815  integrase family protein  27.45 
 
 		 183 aa  57  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0312  phage integrase  29.35 
 
 		 209 aa  56.6  0.0000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0652  DNA integration/recombination/invertion protein  27.92 
 
 		 180 aa  56.2  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1165  integrase family protein  26.14 
 
 		 187 aa  55.5  0.0000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4009  prophage LambdaBa04, site-specific recombinase, phage integrase family  27.27 
 
 		 180 aa  55.1  0.0000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0039  tyrosine recombinase XerD  25.47 
 
 		 312 aa  54.7  0.0000006  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1007  site-specific recombinase  26.14 
 
 		 183 aa  54.3  0.0000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  8.22552e-63 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2711  prophage LambdaBa04, site-specific recombinase, phage integrase family  26.42 
 
 		 180 aa  53.1  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0042219  normal  0.247582 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3599  integrase family protein  28.28 
 
 		 180 aa  53.1  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.616601  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2953  phage integrase family site specific recombinase  26.95 
 
 		 186 aa  52.8  0.000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.603832  n/a   
 
 
-
 
NC_011734  PCC7424_5625  integrase family protein  27.11 
 
 		 273 aa  52  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2613  prophage LambdaBa04, site-specific recombinase, phage integrase family  28.08 
 
 		 180 aa  51.6  0.000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.301879  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4574  integrase family protein  24.68 
 
 		 188 aa  51.6  0.000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4879  site-specific recombinase, phage integrase family  24.03 
 
 		 188 aa  51.2  0.000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0017  prophage integration/recombination/invertion protein  31.25 
 
 		 190 aa  51.2  0.000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000444728  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1268  integrase family protein  24.14 
 
 		 353 aa  51.2  0.000008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0378  integrase family protein  29.86 
 
 		 190 aa  50.4  0.00001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1859  prophage LambdaSa2, site-specific recombinase phage integrase family protein  29.03 
 
 		 180 aa  50.8  0.00001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00377207  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4476  phage integrase family site specific recombinase  23.38 
 
 		 188 aa  50.8  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4855  site-specific recombinase, phage integrase family  24.68 
 
 		 188 aa  50.4  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011733  PCC7424_5613  hypothetical protein  27.52 
 
 		 273 aa  50.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0401  integrase family protein  25 
 
 		 310 aa  50.8  0.00001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4886  phage integrase family site specific recombinase  22.73 
 
 		 188 aa  49.7  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1694  phage integrase family protein  23.56 
 
 		 212 aa  49.7  0.00002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.470129  normal  0.0225811 
 
 
-
 
NC_011730  PCC7424_5548  integrase family protein  26.85 
 
 		 289 aa  49.7  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0660  integrase family protein  26.38 
 
 		 284 aa  49.7  0.00002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1254  phage integrase family protein  24.71 
 
 		 186 aa  50.1  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.709211 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1448  phage integrase family site specific recombinase  23.56 
 
 		 188 aa  49.3  0.00003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0015  Phage integrase  24.56 
 
 		 310 aa  49.3  0.00003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.230922  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0687  Phage integrase  24.12 
 
 		 310 aa  48.9  0.00003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.004827  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1771  phage integrase family protein  23.56 
 
 		 204 aa  49.3  0.00003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.753085 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04122  site-specific tyrosine recombinase XerC  25.52 
 
 		 305 aa  48.9  0.00003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2286  phage integrase  28.66 
 
 		 188 aa  49.3  0.00003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000274502  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0382  site-specific recombinase, phage integrase family  24.03 
 
 		 188 aa  48.9  0.00004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4494  phage integrase family site specific recombinase  23.38 
 
 		 188 aa  48.5  0.00005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0292  phage integrase family protein  28.67 
 
 		 440 aa  48.5  0.00005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1255  integrase family protein  24.22 
 
 		 186 aa  48.5  0.00005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1799  phage integrase family protein  23.56 
 
 		 204 aa  48.1  0.00006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.968459  normal  0.396821 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001839  site-specific recombinase phage integrase family  27.22 
 
 		 186 aa  47.8  0.00007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0401  site-specific tyrosine recombinase XerC  25.48 
 
 		 324 aa  47.8  0.00007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.145415 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1300  tyrosine recombinase XerD subunit  26.67 
 
 		 297 aa  47.8  0.00008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0736  site-specific tyrosine recombinase XerC  23.97 
 
 		 294 aa  47.4  0.00009  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1384  integrase family protein  25 
 
 		 176 aa  47.4  0.00009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.334457  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1148  phage integrase family site specific recombinase  22.58 
 
 		 328 aa  47.4  0.0001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0281308  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4641  phage integrase family site specific recombinase  22.73 
 
 		 188 aa  47.4  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4995  phage integrase family site specific recombinase  22.73 
 
 		 188 aa  47.4  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0772  phage integrase  24.52 
 
 		 304 aa  47.4  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.672054 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4865  site-specific recombinase, phage integrase family  22.73 
 
 		 188 aa  47.4  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2175  tyrosine recombinase XerD  27.97 
 
 		 299 aa  47  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0825  site-specific tyrosine recombinase XerC  23.97 
 
 		 277 aa  47.4  0.0001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0104756  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3811  prophage LambdaBa02, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  28.1 
 
 		 180 aa  46.2  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0141622  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4099  prophage lambdaba02, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  28.1 
 
 		 169 aa  46.6  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0553  site-specific tyrosine recombinase XerC  26.32 
 
 		 329 aa  46.2  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.172687  normal  0.167276 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3829  site-specific recombinase, phage integrase family  24.4 
 
 		 176 aa  46.2  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000329942 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1185  phage integrase family protein  24.4 
 
 		 176 aa  46.6  0.0002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00690161  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4057  site-specific recombinase, phage integrase family  23.21 
 
 		 325 aa  45.8  0.0003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.251442  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0271  site-specific tyrosine recombinase XerC  25.81 
 
 		 351 aa  46.2  0.0003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.28022  normal  0.462537 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1586  phage integrase family site specific recombinase  24.4 
 
 		 176 aa  45.4  0.0004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.645051  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0950  phage integrase family site specific recombinase  24.18 
 
 		 354 aa  45.4  0.0004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0218535  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1343  phage integrase family site specific recombinase  24.4 
 
 		 179 aa  45.4  0.0004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.311312  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1342  phage integrase family site specific recombinase  24.4 
 
 		 179 aa  45.4  0.0004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1553  site-specific recombinase, phage integrase family  24.4 
 
 		 176 aa  45.4  0.0004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000100783 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1622  site-specific recombinase, phage integrase family  24.4 
 
 		 176 aa  45.4  0.0004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0879  phage integrase family site specific recombinase  24.18 
 
 		 354 aa  45.4  0.0004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.159654  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1516  site-specific recombinase, phage integrase family  24.4 
 
 		 176 aa  45.4  0.0004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1844  site-specific tyrosine recombinase XerC  23.49 
 
 		 315 aa  45.4  0.0004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.104424  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5294  integrase family protein  26.43 
 
 		 268 aa  45.4  0.0004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1916  site-specific tyrosine recombinase XerC  22.82 
 
 		 315 aa  45.1  0.0005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.391518  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1370  phage integrase family site specific recombinase  24.4 
 
 		 179 aa  45.1  0.0005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1481  phage integrase family site specific recombinase  24.4 
 
 		 176 aa  45.1  0.0005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1639  integrase family protein  26.92 
 
 		 301 aa  45.1  0.0005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0514216  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4524  Phage integrase  26.45 
 
 		 310 aa  45.1  0.0005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1012  phage integrase family site specific recombinase  24.18 
 
 		 354 aa  45.1  0.0005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000959514  n/a   
 
 
-
 
NC_011760  Mchl_5760  integrase family protein  27.33 
 
 		 291 aa  45.1  0.0005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0177  site-specific tyrosine recombinase XerC  25.66 
 
 		 323 aa  44.7  0.0006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0752  phage integrase family site specific recombinase  27.52 
 
 		 309 aa  44.7  0.0007  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.232674  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11988  putative tyrosine recombinase  22.15 
 
 		 298 aa  44.7  0.0007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2102  integrase family protein  28.48 
 
 		 193 aa  44.7  0.0007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0519  phage integrase family protein  27.63 
 
 		 300 aa  44.7  0.0007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.24612  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2237  site-specific recombinase XerD-like  28.1 
 
 		 225 aa  44.3  0.0009  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0311543  normal  0.392069 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0507  tyrosine recombinase XerD  22.88 
 
 		 339 aa  43.9  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1003  tyrosine recombinase XerD subunit  24.05 
 
 		 302 aa  43.9  0.001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.497558  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>