150 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_2102 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_2102  integrase family protein  100 
 
 		 193 aa  389  1e-107  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0378  integrase family protein  40.76 
 
 		 190 aa  111  7.000000000000001e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012790  GWCH70_3470  integrase family protein  29.3 
 
 		 182 aa  65.5  0.0000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010724  Nther_2955  integrase family protein  30.86 
 
 		 187 aa  65.9  0.0000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.819146  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0174  integrase family protein  32.08 
 
 		 186 aa  65.5  0.0000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00273109  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2953  phage integrase family site specific recombinase  34.21 
 
 		 186 aa  64.7  0.0000000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.603832  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2613  prophage LambdaBa04, site-specific recombinase, phage integrase family  31.28 
 
 		 180 aa  63.9  0.000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.301879  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2711  prophage LambdaBa04, site-specific recombinase, phage integrase family  33.11 
 
 		 180 aa  63.2  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0042219  normal  0.247582 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1799  phage integrase family protein  32.93 
 
 		 204 aa  63.5  0.000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.968459  normal  0.396821 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1771  phage integrase family protein  32.93 
 
 		 204 aa  62.8  0.000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.753085 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1448  phage integrase family site specific recombinase  32.93 
 
 		 188 aa  62.4  0.000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1694  phage integrase family protein  32.32 
 
 		 212 aa  61.6  0.000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.470129  normal  0.0225811 
 
 
-
 
NC_010182  BcerKBAB4_5345  integrase family protein  28.83 
 
 		 182 aa  61.2  0.000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1859  prophage LambdaSa2, site-specific recombinase phage integrase family protein  29.56 
 
 		 180 aa  60.8  0.00000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00377207  n/a   
 
 
-
 
NC_012794  GWCH70_3453  integrase family protein  32.69 
 
 		 189 aa  59.7  0.00000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.590005  normal  0.791222 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1255  integrase family protein  29.09 
 
 		 186 aa  60.5  0.00000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4009  prophage LambdaBa04, site-specific recombinase, phage integrase family  32.41 
 
 		 180 aa  59.3  0.00000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1368  prophage LambdaBa04, site-specific recombinase, phage integrase family  33.11 
 
 		 180 aa  58.9  0.00000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.358053 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3599  integrase family protein  31.46 
 
 		 180 aa  58.9  0.00000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.616601  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0652  DNA integration/recombination/invertion protein  30.73 
 
 		 180 aa  58.5  0.00000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1185  phage integrase family protein  26.92 
 
 		 176 aa  58.2  0.00000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00690161  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1586  phage integrase family site specific recombinase  25.64 
 
 		 176 aa  57  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.645051  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1370  phage integrase family site specific recombinase  25 
 
 		 179 aa  56.6  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1343  phage integrase family site specific recombinase  25.64 
 
 		 179 aa  57  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.311312  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1342  phage integrase family site specific recombinase  25.64 
 
 		 179 aa  57  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1622  site-specific recombinase, phage integrase family  25.64 
 
 		 176 aa  57  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1481  phage integrase family site specific recombinase  25 
 
 		 176 aa  56.6  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1254  phage integrase family protein  30.43 
 
 		 186 aa  56.6  0.0000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.709211 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1516  site-specific recombinase, phage integrase family  25.64 
 
 		 176 aa  57  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1384  integrase family protein  25.64 
 
 		 176 aa  56.6  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.334457  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1553  site-specific recombinase, phage integrase family  25.64 
 
 		 176 aa  57  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000100783 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1590  phage integrase family site specific recombinase  29.56 
 
 		 182 aa  55.8  0.0000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000133866  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3829  site-specific recombinase, phage integrase family  25.64 
 
 		 176 aa  55.8  0.0000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000329942 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0998  phage integrase family protein  24.84 
 
 		 215 aa  55.8  0.0000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00570052  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3451  integrase family protein  30.67 
 
 		 186 aa  55.5  0.0000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0127606  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0577  prophage LambdaBa02, site-specific recombinase, phage integrase family  29.82 
 
 		 180 aa  55.1  0.0000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3811  prophage LambdaBa02, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  29.48 
 
 		 180 aa  54.3  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0141622  n/a   
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3590  integrase family protein  31.48 
 
 		 189 aa  54.3  0.000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  normal  0.0592429  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0177  site-specific tyrosine recombinase XerC  30.2 
 
 		 323 aa  54.3  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008496  LEUM_A08  integrase  27.88 
 
 		 195 aa  53.5  0.000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.000000003137  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0251  phage integrase family protein  28.85 
 
 		 198 aa  52.8  0.000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.705292 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3517  phage integrase family protein  28.74 
 
 		 188 aa  53.1  0.000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0401  site-specific tyrosine recombinase XerC  27.5 
 
 		 324 aa  52.8  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.145415 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4099  prophage lambdaba02, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  29.45 
 
 		 169 aa  52  0.000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0377  integrase family protein  28.14 
 
 		 186 aa  51.6  0.000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000239772 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0536  site-specific tyrosine recombinase XerC  28.19 
 
 		 300 aa  51.2  0.000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.538013  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0238  site-specific tyrosine recombinase XerC  33.12 
 
 		 306 aa  51.6  0.000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0625179  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1456  integrase family protein  27.81 
 
 		 337 aa  51.2  0.000008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.699839  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0164  DNA integration/recombination/inversion protein  27.33 
 
 		 190 aa  50.8  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0167632  n/a   
 
 
-
 
NC_007107  pE33L9_0009  integrase/recombinase  26.28 
 
 		 190 aa  50.8  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1030  site-specific tyrosine recombinase XerC  27.78 
 
 		 307 aa  50.4  0.00001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6605  integrase family protein  27.15 
 
 		 292 aa  50.4  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7462  integrase family protein  27.15 
 
 		 292 aa  50.4  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.105755  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7619  integrase family protein  27.15 
 
 		 292 aa  50.4  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.192826  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0271  site-specific tyrosine recombinase XerC  29.53 
 
 		 351 aa  49.7  0.00003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.28022  normal  0.462537 
 
 
-
 
NC_008696  Tpen_1891  phage integrase family protein  27.92 
 
 		 278 aa  49.3  0.00003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0017  prophage integration/recombination/invertion protein  25 
 
 		 190 aa  48.9  0.00004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000444728  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0553  site-specific tyrosine recombinase XerC  28.86 
 
 		 329 aa  48.9  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.172687  normal  0.167276 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0426  site-specific tyrosine recombinase XerC  28.19 
 
 		 321 aa  48.9  0.00005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0858  phage integrase  25.4 
 
 		 289 aa  48.5  0.00006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2286  phage integrase  26.28 
 
 		 188 aa  48.5  0.00006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000274502  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6957  integrase family protein  26.49 
 
 		 292 aa  48.1  0.00007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2232  integrase family protein  26.95 
 
 		 197 aa  48.1  0.00008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.394376  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2240  integrase family protein  26.95 
 
 		 197 aa  48.1  0.00008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.0000448435  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1654  site-specific tyrosine recombinase XerC  29.88 
 
 		 330 aa  48.1  0.00008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000000234006  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2339  integrase family protein  25.48 
 
 		 210 aa  47.8  0.00009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0020288 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0401  integrase family protein  24.2 
 
 		 337 aa  48.1  0.00009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.663201  normal  0.0314633 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0412  integrase  25.64 
 
 		 190 aa  47.8  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0192917  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0381  tyrosine recombinase XerD  26.09 
 
 		 303 aa  47.4  0.0001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0180  site-specific tyrosine recombinase XerC  28.95 
 
 		 324 aa  47.8  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0337  Integrase  38.18 
 
 		 311 aa  47.4  0.0001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.180562  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3700  integrase family protein  25.75 
 
 		 295 aa  47.8  0.0001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1431  phage integrase  27.1 
 
 		 309 aa  47  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.145363  n/a   
 
 
-
 
NC_011732  PCC7424_5582  integrase family protein  25.68 
 
 		 313 aa  47  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0116  Phage integrase, N-terminal SAM- like  28.25 
 
 		 309 aa  45.8  0.0003  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0163  integrase family protein  27.88 
 
 		 342 aa  46.2  0.0003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.70922  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04790  integrase  36.47 
 
 		 274 aa  45.8  0.0003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4117  integrase family protein  24.86 
 
 		 337 aa  46.2  0.0003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.944065  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2230  prophage LambdaBa02, site-specific recombinase, phage integrase family  31.18 
 
 		 180 aa  46.2  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1177  integrase family protein  28.67 
 
 		 329 aa  46.2  0.0003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.151473 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3208  phage integrase family protein  23.57 
 
 		 204 aa  45.4  0.0004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0839313  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1148  phage integrase family site specific recombinase  23.86 
 
 		 328 aa  45.4  0.0005  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0281308  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1196  tyrosine recombinase XerD  30.93 
 
 		 309 aa  45.4  0.0005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0670859  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3102  integrase family protein  25.84 
 
 		 301 aa  45.4  0.0005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000184896  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3062  site-specific tyrosine recombinase XerD  24.71 
 
 		 308 aa  45.1  0.0006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0971  integrase family protein  44.23 
 
 		 328 aa  45.1  0.0006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1844  site-specific tyrosine recombinase XerC  28.95 
 
 		 315 aa  45.1  0.0006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.104424  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6093  integrase family protein  28.29 
 
 		 210 aa  45.4  0.0006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.61747  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1344  integrase family protein  25 
 
 		 292 aa  45.1  0.0007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000678444  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3665  integrase family protein  28.57 
 
 		 313 aa  45.1  0.0007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.211751 
 
 
-
 
NC_004310  BR1916  site-specific tyrosine recombinase XerC  28.29 
 
 		 315 aa  44.7  0.0008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.391518  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0083  site-specific tyrosine recombinase XerC  27.11 
 
 		 322 aa  44.7  0.0008  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2501  site-specific tyrosine recombinase XerC  28.29 
 
 		 312 aa  44.7  0.0009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.504706  normal  0.936606 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1743  Phage integrase  28.31 
 
 		 270 aa  44.3  0.001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1165  integrase family protein  24.48 
 
 		 187 aa  44.3  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2809  phage integrase family protein  27.51 
 
 		 311 aa  44.3  0.001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4392  prophage LambdaBa02, site-specific recombinase, phage integrase family  34.13 
 
 		 180 aa  44.7  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3396  site-specific tyrosine recombinase XerD  26.62 
 
 		 298 aa  43.9  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39510  site-specific tyrosine recombinase XerD  26.28 
 
 		 298 aa  43.9  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3153  tyrosine recombinase XerD  26.85 
 
 		 443 aa  43.5  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.408525  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>