203 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_0378 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013517  Sterm_0378  integrase family protein  100 
 
 		 190 aa  377  1e-104  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2102  integrase family protein  40.76 
 
 		 193 aa  111  7.000000000000001e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1859  prophage LambdaSa2, site-specific recombinase phage integrase family protein  35.1 
 
 		 180 aa  77  0.0000000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00377207  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3811  prophage LambdaBa02, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  33.57 
 
 		 180 aa  68.9  0.00000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0141622  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4099  prophage lambdaba02, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  33.57 
 
 		 169 aa  68.6  0.00000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3590  integrase family protein  30.57 
 
 		 189 aa  67.8  0.0000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  normal  0.0592429  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2230  prophage LambdaBa02, site-specific recombinase, phage integrase family  34.97 
 
 		 180 aa  66.6  0.0000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4392  prophage LambdaBa02, site-specific recombinase, phage integrase family  35.66 
 
 		 180 aa  66.2  0.0000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0174  integrase family protein  35.46 
 
 		 186 aa  66.2  0.0000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00273109  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0577  prophage LambdaBa02, site-specific recombinase, phage integrase family  30.32 
 
 		 180 aa  65.5  0.0000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3451  integrase family protein  35.21 
 
 		 186 aa  65.5  0.0000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0127606  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2613  prophage LambdaBa04, site-specific recombinase, phage integrase family  30.92 
 
 		 180 aa  65.1  0.0000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.301879  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2711  prophage LambdaBa04, site-specific recombinase, phage integrase family  29.61 
 
 		 180 aa  64.7  0.0000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0042219  normal  0.247582 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2240  integrase family protein  31.25 
 
 		 197 aa  64.7  0.0000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.0000448435  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2232  integrase family protein  31.25 
 
 		 197 aa  64.7  0.0000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.394376  n/a   
 
 
-
 
NC_012794  GWCH70_3453  integrase family protein  32.26 
 
 		 189 aa  64.3  0.0000000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.590005  normal  0.791222 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0652  DNA integration/recombination/invertion protein  29.14 
 
 		 180 aa  63.9  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1368  prophage LambdaBa04, site-specific recombinase, phage integrase family  29.68 
 
 		 180 aa  62  0.000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.358053 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4009  prophage LambdaBa04, site-specific recombinase, phage integrase family  29.41 
 
 		 180 aa  61.6  0.000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010724  Nther_2955  integrase family protein  27.85 
 
 		 187 aa  61.6  0.000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.819146  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0998  phage integrase family protein  33.12 
 
 		 215 aa  60.8  0.00000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00570052  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3599  integrase family protein  30.97 
 
 		 180 aa  60.1  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.616601  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1590  phage integrase family site specific recombinase  30.34 
 
 		 182 aa  58.9  0.00000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000133866  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1729  phage integrase family protein  29.88 
 
 		 207 aa  58.5  0.00000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.425016  normal  0.48456 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2286  phage integrase  31.72 
 
 		 188 aa  58.2  0.00000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000274502  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1343  phage integrase family site specific recombinase  28.57 
 
 		 179 aa  57.8  0.00000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.311312  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1342  phage integrase family site specific recombinase  28.57 
 
 		 179 aa  57.8  0.00000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6236  integrase family protein  28.32 
 
 		 207 aa  57.8  0.00000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1586  phage integrase family site specific recombinase  28.57 
 
 		 176 aa  57.8  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.645051  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1370  phage integrase family site specific recombinase  28.57 
 
 		 179 aa  57.4  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1622  site-specific recombinase, phage integrase family  28.57 
 
 		 176 aa  57.8  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1481  phage integrase family site specific recombinase  28.57 
 
 		 176 aa  57.4  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1516  site-specific recombinase, phage integrase family  28.57 
 
 		 176 aa  57.8  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1553  site-specific recombinase, phage integrase family  28.57 
 
 		 176 aa  57.8  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000100783 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1384  integrase family protein  28.57 
 
 		 176 aa  57.8  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.334457  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3034  integrase family protein  28.86 
 
 		 206 aa  56.6  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.155662  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3829  site-specific recombinase, phage integrase family  28.57 
 
 		 176 aa  57  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000329942 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1185  phage integrase family protein  28.57 
 
 		 176 aa  57  0.0000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00690161  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3791  phage integrase family site specific recombinase  29.71 
 
 		 208 aa  56.2  0.0000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0452484 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1220  site-specific tyrosine recombinase XerC  30.99 
 
 		 330 aa  55.5  0.0000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010182  BcerKBAB4_5345  integrase family protein  28.99 
 
 		 182 aa  54.7  0.0000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1281  integrase family protein  30.15 
 
 		 429 aa  54.7  0.0000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0441454  normal  1 
 
 
-
 
NC_012790  GWCH70_3470  integrase family protein  31.13 
 
 		 182 aa  54.7  0.0000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5964  Phage integrase  27.46 
 
 		 208 aa  53.5  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008496  LEUM_A08  integrase  29.05 
 
 		 195 aa  53.1  0.000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.000000003137  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0815  integrase family protein  30.34 
 
 		 183 aa  53.1  0.000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2953  phage integrase family site specific recombinase  28.22 
 
 		 186 aa  53.1  0.000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.603832  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1978  phage integrase family protein  27.78 
 
 		 238 aa  52.8  0.000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00595062 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1799  phage integrase family protein  31.76 
 
 		 204 aa  51.6  0.000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.968459  normal  0.396821 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1007  site-specific recombinase  29.94 
 
 		 183 aa  50.8  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  8.22552e-63 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0811  Phage integrase  25 
 
 		 208 aa  50.8  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1617  site-specific tyrosine recombinase XerC  28.83 
 
 		 330 aa  51.2  0.00001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000155402  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3208  phage integrase family protein  28.83 
 
 		 204 aa  51.2  0.00001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0839313  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2164  phage integrase family protein  29.11 
 
 		 198 aa  51.2  0.00001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3592  phage integrase family protein  31.65 
 
 		 419 aa  50.8  0.00001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1227  integrase family protein  31.17 
 
 		 305 aa  50.1  0.00002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.842173  decreased coverage  0.000216705 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1448  phage integrase family site specific recombinase  31.08 
 
 		 188 aa  49.7  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1456  integrase family protein  30.2 
 
 		 337 aa  49.7  0.00002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.699839  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0412  integrase  28.86 
 
 		 190 aa  50.1  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0192917  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1202  integrase family protein  33.33 
 
 		 346 aa  50.1  0.00002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011656  BCAH187_E0001  site-specific recombinase  26.49 
 
 		 190 aa  50.1  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.149945  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1428  integrase family protein  25.35 
 
 		 421 aa  50.4  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3517  phage integrase family protein  28 
 
 		 188 aa  50.1  0.00002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2633  phage integrase family protein  30.94 
 
 		 419 aa  50.1  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0164  DNA integration/recombination/inversion protein  29.53 
 
 		 190 aa  49.3  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0167632  n/a   
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0017  prophage integration/recombination/invertion protein  27.81 
 
 		 190 aa  49.3  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000444728  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4855  site-specific recombinase, phage integrase family  26.85 
 
 		 188 aa  49.3  0.00003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1123  phage integrase family protein  29.11 
 
 		 198 aa  49.7  0.00003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1181  phage integrase family protein  29.11 
 
 		 198 aa  49.7  0.00003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.820562  normal  0.553114 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1771  phage integrase family protein  31.08 
 
 		 204 aa  49.7  0.00003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.753085 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3899  phage integrase family protein  29.11 
 
 		 198 aa  49.7  0.00003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.97558 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1254  phage integrase family protein  30.2 
 
 		 186 aa  49.7  0.00003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.709211 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0788  phage integrase family protein  30.71 
 
 		 293 aa  49.7  0.00003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4012  tyrosine recombinase XerC  31.76 
 
 		 294 aa  49.3  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00152232  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6168  integrase family protein  26.32 
 
 		 411 aa  49.3  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03935  integrase  26.56 
 
 		 406 aa  48.9  0.00004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.439206  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1113  integrase  40.23 
 
 		 407 aa  49.3  0.00004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06590  site-specific recombinase, integrase family  26.83 
 
 		 312 aa  48.9  0.00004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0527476  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20700  site-specific recombinase, integrase family  26.83 
 
 		 395 aa  48.9  0.00004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3189  integrase family protein  28.36 
 
 		 320 aa  48.9  0.00004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00303256 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0377  integrase family protein  28 
 
 		 186 aa  48.9  0.00004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000239772 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2062  phage integrase family site specific recombinase  26.63 
 
 		 198 aa  48.5  0.00005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.27505  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3274  phage integrase family site specific recombinase  27.34 
 
 		 159 aa  48.9  0.00005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0177  site-specific tyrosine recombinase XerC  29.25 
 
 		 323 aa  48.9  0.00005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5143  phage integrase family site specific recombinase  27.94 
 
 		 404 aa  48.9  0.00005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0463539  n/a   
 
 
-
 
NC_007107  pE33L9_0009  integrase/recombinase  28.19 
 
 		 190 aa  48.5  0.00006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1694  phage integrase family protein  30.41 
 
 		 212 aa  48.5  0.00006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.470129  normal  0.0225811 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0247  integrase family protein  27.61 
 
 		 322 aa  48.1  0.00007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.121071  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0337  Integrase  38.46 
 
 		 311 aa  48.1  0.00008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.180562  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0382  site-specific recombinase, phage integrase family  26.17 
 
 		 188 aa  47.8  0.00009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4641  phage integrase family site specific recombinase  26.17 
 
 		 188 aa  47.4  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001839  site-specific recombinase phage integrase family  24.85 
 
 		 186 aa  47  0.0001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4995  phage integrase family site specific recombinase  26.17 
 
 		 188 aa  47.4  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0553  site-specific tyrosine recombinase XerC  27.4 
 
 		 329 aa  47.8  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.172687  normal  0.167276 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0772  integrase family protein  28.19 
 
 		 209 aa  47.8  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4865  site-specific recombinase, phage integrase family  26.17 
 
 		 188 aa  47.4  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0119  integrase family protein  28.16 
 
 		 209 aa  47  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4886  phage integrase family site specific recombinase  26.85 
 
 		 188 aa  47  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1390  site-specific tyrosine recombinase XerC  23.93 
 
 		 328 aa  47  0.0002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000179914  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0536  site-specific tyrosine recombinase XerC  25.62 
 
 		 300 aa  47  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.538013  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>