158 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_2240 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011883  Ddes_2232  integrase family protein  100 
 
 		 197 aa  408  1e-113  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.394376  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2240  integrase family protein  100 
 
 		 197 aa  408  1e-113  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.0000448435  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1165  integrase family protein  40.91 
 
 		 187 aa  124  9e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010724  Nther_2955  integrase family protein  38.67 
 
 		 187 aa  115  3e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.819146  n/a   
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3590  integrase family protein  37.91 
 
 		 189 aa  112  3e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  normal  0.0592429  n/a   
 
 
-
 
NC_012794  GWCH70_3453  integrase family protein  36.61 
 
 		 189 aa  110  1.0000000000000001e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.590005  normal  0.791222 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3599  integrase family protein  40 
 
 		 180 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.616601  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1859  prophage LambdaSa2, site-specific recombinase phage integrase family protein  37.29 
 
 		 180 aa  105  4e-22  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00377207  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2613  prophage LambdaBa04, site-specific recombinase, phage integrase family  36.52 
 
 		 180 aa  101  6e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.301879  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4494  phage integrase family site specific recombinase  32.22 
 
 		 188 aa  100  1e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1368  prophage LambdaBa04, site-specific recombinase, phage integrase family  36.67 
 
 		 180 aa  100  1e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.358053 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0652  DNA integration/recombination/invertion protein  35.96 
 
 		 180 aa  100  1e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4574  integrase family protein  31.67 
 
 		 188 aa  100  1e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2711  prophage LambdaBa04, site-specific recombinase, phage integrase family  34.78 
 
 		 180 aa  100  1e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0042219  normal  0.247582 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4009  prophage LambdaBa04, site-specific recombinase, phage integrase family  35.39 
 
 		 180 aa  99  4e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4641  phage integrase family site specific recombinase  31.67 
 
 		 188 aa  97.8  8e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4995  phage integrase family site specific recombinase  31.67 
 
 		 188 aa  97.8  8e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4865  site-specific recombinase, phage integrase family  31.67 
 
 		 188 aa  97.8  8e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4886  phage integrase family site specific recombinase  31.67 
 
 		 188 aa  97.4  1e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4476  phage integrase family site specific recombinase  31.67 
 
 		 188 aa  97.8  1e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4879  site-specific recombinase, phage integrase family  31.11 
 
 		 188 aa  96.7  2e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0382  site-specific recombinase, phage integrase family  31.32 
 
 		 188 aa  96.3  3e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4855  site-specific recombinase, phage integrase family  31.32 
 
 		 188 aa  96.3  3e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0174  integrase family protein  36.31 
 
 		 186 aa  95.9  3e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00273109  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1590  phage integrase family site specific recombinase  33.89 
 
 		 182 aa  92  5e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000133866  n/a   
 
 
-
 
NC_012790  GWCH70_3470  integrase family protein  36.31 
 
 		 182 aa  92  5e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010182  BcerKBAB4_5345  integrase family protein  34.81 
 
 		 182 aa  87.8  9e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011656  BCAH187_E0001  site-specific recombinase  32.42 
 
 		 190 aa  87.4  1e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.149945  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3451  integrase family protein  34.05 
 
 		 186 aa  87  2e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0127606  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0577  prophage LambdaBa02, site-specific recombinase, phage integrase family  32.37 
 
 		 180 aa  84.7  7e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2286  phage integrase  32.97 
 
 		 188 aa  82  0.000000000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000274502  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3034  integrase family protein  33.33 
 
 		 206 aa  81.6  0.000000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.155662  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1007  site-specific recombinase  31.84 
 
 		 183 aa  80.1  0.00000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  8.22552e-63 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1343  phage integrase family site specific recombinase  31.98 
 
 		 179 aa  79  0.00000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.311312  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1342  phage integrase family site specific recombinase  31.98 
 
 		 179 aa  79  0.00000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1586  phage integrase family site specific recombinase  31.98 
 
 		 176 aa  79  0.00000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.645051  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1370  phage integrase family site specific recombinase  31.98 
 
 		 179 aa  78.6  0.00000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1481  phage integrase family site specific recombinase  31.98 
 
 		 176 aa  78.6  0.00000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1553  site-specific recombinase, phage integrase family  31.98 
 
 		 176 aa  79  0.00000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000100783 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1516  site-specific recombinase, phage integrase family  31.98 
 
 		 176 aa  79  0.00000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1622  site-specific recombinase, phage integrase family  31.98 
 
 		 176 aa  79  0.00000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1384  integrase family protein  31.98 
 
 		 176 aa  79  0.00000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.334457  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6236  integrase family protein  29.21 
 
 		 207 aa  78.2  0.00000000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0998  phage integrase family protein  33.53 
 
 		 215 aa  77.8  0.00000000000008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00570052  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4392  prophage LambdaBa02, site-specific recombinase, phage integrase family  32.95 
 
 		 180 aa  77.8  0.00000000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3791  phage integrase family site specific recombinase  32.97 
 
 		 208 aa  77  0.0000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0452484 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3811  prophage LambdaBa02, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  29.48 
 
 		 180 aa  76.6  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0141622  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0815  integrase family protein  30.73 
 
 		 183 aa  77  0.0000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2230  prophage LambdaBa02, site-specific recombinase, phage integrase family  32.37 
 
 		 180 aa  76.3  0.0000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1185  phage integrase family protein  31.4 
 
 		 176 aa  75.9  0.0000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00690161  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0811  Phage integrase  29.67 
 
 		 208 aa  75.1  0.0000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1978  phage integrase family protein  31.14 
 
 		 238 aa  74.7  0.0000000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00595062 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3829  site-specific recombinase, phage integrase family  31.4 
 
 		 176 aa  74.7  0.0000000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000329942 
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0017  prophage integration/recombination/invertion protein  33.7 
 
 		 190 aa  73.6  0.000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000444728  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0119  integrase family protein  31.36 
 
 		 209 aa  72.8  0.000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007107  pE33L9_0009  integrase/recombinase  33.68 
 
 		 190 aa  70.9  0.00000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2671  phage integrase family protein  32.89 
 
 		 191 aa  71.2  0.00000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.196134  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0772  integrase family protein  31.18 
 
 		 209 aa  70.9  0.00000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0412  integrase  32.46 
 
 		 190 aa  69.7  0.00000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0192917  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0217  phage integrase family protein  29.94 
 
 		 200 aa  69.3  0.00000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3357  integrase family protein  31.36 
 
 		 209 aa  69.3  0.00000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.276444  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1255  integrase family protein  31.89 
 
 		 186 aa  68.9  0.00000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0791  integrase family protein  31.36 
 
 		 209 aa  69.3  0.00000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.334688  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4099  prophage lambdaba02, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  29.8 
 
 		 169 aa  68.9  0.00000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3817  integrase family protein  26.47 
 
 		 210 aa  68.6  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.736864  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4790  integrase family protein  30.77 
 
 		 209 aa  68.6  0.00000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2339  integrase family protein  27.98 
 
 		 210 aa  68.6  0.00000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0020288 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5964  Phage integrase  28.11 
 
 		 208 aa  67.4  0.0000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0164  DNA integration/recombination/inversion protein  31.41 
 
 		 190 aa  66.6  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0167632  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1729  phage integrase family protein  30.73 
 
 		 207 aa  66.6  0.0000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.425016  normal  0.48456 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2386  integrase family protein  28.57 
 
 		 208 aa  67  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0378  integrase family protein  31.25 
 
 		 190 aa  64.7  0.0000000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3703  phage integrase family protein  34.21 
 
 		 174 aa  63.5  0.000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2590  hypothetical protein  27.67 
 
 		 210 aa  63.9  0.000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0020859 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0438  phage integrase, N-terminus  35.64 
 
 		 97 aa  62.8  0.000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0989457  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1123  phage integrase family protein  30.86 
 
 		 198 aa  62.8  0.000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1181  phage integrase family protein  30.86 
 
 		 198 aa  62.8  0.000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.820562  normal  0.553114 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3899  phage integrase family protein  30.86 
 
 		 198 aa  62.8  0.000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.97558 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2164  phage integrase family protein  30.86 
 
 		 198 aa  63.2  0.000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3517  phage integrase family protein  29.89 
 
 		 188 aa  62.8  0.000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0377  integrase family protein  29.26 
 
 		 186 aa  62.4  0.000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000239772 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3208  phage integrase family protein  26.97 
 
 		 204 aa  62.8  0.000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0839313  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0658  phage integrase protein  28.83 
 
 		 210 aa  60.8  0.00000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008496  LEUM_A08  integrase  28.34 
 
 		 195 aa  59.3  0.00000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.000000003137  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3467  integrase family protein  27.33 
 
 		 197 aa  59.3  0.00000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001839  site-specific recombinase phage integrase family  28.34 
 
 		 186 aa  59.3  0.00000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6093  integrase family protein  28.05 
 
 		 210 aa  58.9  0.00000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.61747  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2267  phage integrase family protein  26.47 
 
 		 210 aa  58.5  0.00000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.783329  normal  0.401703 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0824  phage integrase family protein  27.33 
 
 		 197 aa  58.2  0.00000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.917981  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0251  phage integrase family protein  26.42 
 
 		 198 aa  57  0.0000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.705292 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1254  phage integrase family protein  30.19 
 
 		 186 aa  56.6  0.0000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.709211 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6083  integrase family protein  26.56 
 
 		 210 aa  56.6  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3118  phage integrase  26.19 
 
 		 210 aa  56.2  0.0000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06813  integrase  26.88 
 
 		 197 aa  56.2  0.0000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0660  integrase family protein  28.24 
 
 		 284 aa  55.1  0.0000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4334  phage integrase family protein  32.5 
 
 		 173 aa  55.5  0.0000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1950  phage integrase family protein  26.71 
 
 		 197 aa  55.1  0.0000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.827298  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2062  phage integrase family site specific recombinase  27.5 
 
 		 198 aa  54.7  0.0000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.27505  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2569  phage integrase family protein  27.67 
 
 		 198 aa  54.3  0.000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0769947 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1617  site-specific tyrosine recombinase XerC  28.9 
 
 		 330 aa  54.3  0.000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000155402  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>