238 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_0174 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_0174  integrase family protein  100 
 
 		 186 aa  379  1e-104  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00273109  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2286  phage integrase  64.52 
 
 		 188 aa  245  3e-64  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000274502  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3451  integrase family protein  66.67 
 
 		 186 aa  240  1e-62  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0127606  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2613  prophage LambdaBa04, site-specific recombinase, phage integrase family  45.81 
 
 		 180 aa  150  8e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.301879  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0652  DNA integration/recombination/invertion protein  43.58 
 
 		 180 aa  147  9e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4009  prophage LambdaBa04, site-specific recombinase, phage integrase family  43.58 
 
 		 180 aa  144  5e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010724  Nther_2955  integrase family protein  47.22 
 
 		 187 aa  142  2e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.819146  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2711  prophage LambdaBa04, site-specific recombinase, phage integrase family  43.02 
 
 		 180 aa  143  2e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0042219  normal  0.247582 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1368  prophage LambdaBa04, site-specific recombinase, phage integrase family  44.13 
 
 		 180 aa  142  2e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.358053 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3599  integrase family protein  43.02 
 
 		 180 aa  139  1.9999999999999998e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.616601  n/a   
 
 
-
 
NC_010182  BcerKBAB4_5345  integrase family protein  43.33 
 
 		 182 aa  139  3e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012794  GWCH70_3453  integrase family protein  42.08 
 
 		 189 aa  132  3.9999999999999996e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.590005  normal  0.791222 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1859  prophage LambdaSa2, site-specific recombinase phage integrase family protein  42.7 
 
 		 180 aa  130  2.0000000000000002e-29  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00377207  n/a   
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3590  integrase family protein  40.44 
 
 		 189 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  normal  0.0592429  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1590  phage integrase family site specific recombinase  38.33 
 
 		 182 aa  123  1e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000133866  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0815  integrase family protein  41.24 
 
 		 183 aa  119  3e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1165  integrase family protein  38.07 
 
 		 187 aa  118  4.9999999999999996e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1007  site-specific recombinase  41.57 
 
 		 183 aa  117  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  8.22552e-63 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3811  prophage LambdaBa02, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  40 
 
 		 180 aa  114  6e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0141622  n/a   
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0017  prophage integration/recombination/invertion protein  36.02 
 
 		 190 aa  113  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000444728  n/a   
 
 
-
 
NC_007107  pE33L9_0009  integrase/recombinase  38.38 
 
 		 190 aa  112  3e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0577  prophage LambdaBa02, site-specific recombinase, phage integrase family  38.29 
 
 		 180 aa  111  7.000000000000001e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0164  DNA integration/recombination/inversion protein  37.91 
 
 		 190 aa  109  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0167632  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0412  integrase  36.56 
 
 		 190 aa  108  6e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0192917  n/a   
 
 
-
 
NC_008496  LEUM_A08  integrase  36.7 
 
 		 195 aa  106  2e-22  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.000000003137  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1370  phage integrase family site specific recombinase  33.92 
 
 		 179 aa  105  3e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1343  phage integrase family site specific recombinase  34.5 
 
 		 179 aa  105  3e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.311312  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1342  phage integrase family site specific recombinase  34.5 
 
 		 179 aa  105  3e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1481  phage integrase family site specific recombinase  33.92 
 
 		 176 aa  105  3e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1586  phage integrase family site specific recombinase  34.5 
 
 		 176 aa  105  4e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.645051  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1384  integrase family protein  34.5 
 
 		 176 aa  105  4e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.334457  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1622  site-specific recombinase, phage integrase family  34.5 
 
 		 176 aa  105  4e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012790  GWCH70_3470  integrase family protein  36.22 
 
 		 182 aa  105  4e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1553  site-specific recombinase, phage integrase family  34.5 
 
 		 176 aa  105  4e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000100783 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1516  site-specific recombinase, phage integrase family  34.5 
 
 		 176 aa  105  4e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3829  site-specific recombinase, phage integrase family  34.5 
 
 		 176 aa  105  5e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000329942 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4099  prophage lambdaba02, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  38.55 
 
 		 169 aa  101  5e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1185  phage integrase family protein  33.33 
 
 		 176 aa  101  8e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00690161  n/a   
 
 
-
 
NC_011656  BCAH187_E0001  site-specific recombinase  38.2 
 
 		 190 aa  100  2e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.149945  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4494  phage integrase family site specific recombinase  33.9 
 
 		 188 aa  99  3e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4574  integrase family protein  32.77 
 
 		 188 aa  99.4  3e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4879  site-specific recombinase, phage integrase family  32.2 
 
 		 188 aa  97.4  9e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4641  phage integrase family site specific recombinase  32.77 
 
 		 188 aa  97.4  1e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4476  phage integrase family site specific recombinase  32.58 
 
 		 188 aa  97.4  1e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4995  phage integrase family site specific recombinase  32.77 
 
 		 188 aa  97.4  1e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4865  site-specific recombinase, phage integrase family  32.77 
 
 		 188 aa  97.4  1e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4855  site-specific recombinase, phage integrase family  32.39 
 
 		 188 aa  97.1  1e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4886  phage integrase family site specific recombinase  32.77 
 
 		 188 aa  96.7  2e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2230  prophage LambdaBa02, site-specific recombinase, phage integrase family  37.14 
 
 		 180 aa  96.3  2e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2240  integrase family protein  36.31 
 
 		 197 aa  95.9  3e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.0000448435  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2232  integrase family protein  36.31 
 
 		 197 aa  95.9  3e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.394376  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0382  site-specific recombinase, phage integrase family  32.39 
 
 		 188 aa  95.1  5e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1694  phage integrase family protein  38.27 
 
 		 212 aa  93.6  1e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.470129  normal  0.0225811 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1771  phage integrase family protein  38.78 
 
 		 204 aa  94  1e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.753085 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4392  prophage LambdaBa02, site-specific recombinase, phage integrase family  37.71 
 
 		 180 aa  94  1e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1448  phage integrase family site specific recombinase  38.78 
 
 		 188 aa  93.6  2e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1799  phage integrase family protein  38.78 
 
 		 204 aa  93.2  2e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.968459  normal  0.396821 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001839  site-specific recombinase phage integrase family  34.38 
 
 		 186 aa  93.6  2e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0377  integrase family protein  40.48 
 
 		 186 aa  91.7  6e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000239772 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3517  phage integrase family protein  40.48 
 
 		 188 aa  90.5  1e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1254  phage integrase family protein  38.86 
 
 		 186 aa  89.7  2e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.709211 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1255  integrase family protein  39.13 
 
 		 186 aa  84.3  0.000000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0659  phage integrase family protein  30.32 
 
 		 186 aa  81.3  0.000000000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.271524  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0644  phage integrase family protein  30.32 
 
 		 186 aa  81.3  0.000000000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0439  phage integrase, C-terminus  53.03 
 
 		 73 aa  79  0.00000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.264159  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1729  phage integrase family protein  31.13 
 
 		 207 aa  77.4  0.0000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.425016  normal  0.48456 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0998  phage integrase family protein  31.85 
 
 		 215 aa  77  0.0000000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00570052  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2339  integrase family protein  27.16 
 
 		 210 aa  77  0.0000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0020288 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2267  phage integrase family protein  28.4 
 
 		 210 aa  75.5  0.0000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.783329  normal  0.401703 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6236  integrase family protein  30 
 
 		 207 aa  75.1  0.0000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2953  phage integrase family site specific recombinase  30.1 
 
 		 186 aa  73.9  0.000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.603832  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0438  phage integrase, N-terminus  39.22 
 
 		 97 aa  70.9  0.00000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0989457  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0772  integrase family protein  28.95 
 
 		 209 aa  70.9  0.00000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2569  phage integrase family protein  30.67 
 
 		 198 aa  70.1  0.00000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0769947 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3034  integrase family protein  27.81 
 
 		 206 aa  69.7  0.00000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.155662  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2386  integrase family protein  25.95 
 
 		 208 aa  69.7  0.00000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0791  integrase family protein  28.95 
 
 		 209 aa  69.7  0.00000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.334688  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3357  integrase family protein  29.61 
 
 		 209 aa  68.9  0.00000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.276444  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2590  hypothetical protein  28.86 
 
 		 210 aa  68.6  0.00000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0020859 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0119  integrase family protein  28.95 
 
 		 209 aa  68.6  0.00000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6093  integrase family protein  28.86 
 
 		 210 aa  68.2  0.00000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.61747  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1978  phage integrase family protein  27.15 
 
 		 238 aa  67.8  0.00000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00595062 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3817  integrase family protein  28.48 
 
 		 210 aa  67.4  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.736864  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0378  integrase family protein  35.46 
 
 		 190 aa  66.2  0.0000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0811  Phage integrase  25.83 
 
 		 208 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6083  integrase family protein  27.52 
 
 		 210 aa  65.9  0.0000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0217  phage integrase family protein  29.45 
 
 		 200 aa  65.9  0.0000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5291  integrase family protein  28.19 
 
 		 210 aa  65.1  0.0000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2102  integrase family protein  32.08 
 
 		 193 aa  65.5  0.0000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4790  integrase family protein  27.63 
 
 		 209 aa  65.1  0.0000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0261  putative tyrosine recombinase XerD  28.57 
 
 		 175 aa  63.9  0.000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2062  phage integrase family site specific recombinase  29.53 
 
 		 198 aa  63.9  0.000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.27505  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5964  Phage integrase  27.63 
 
 		 208 aa  64.3  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3208  phage integrase family protein  25.93 
 
 		 204 aa  63.2  0.000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0839313  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0658  phage integrase protein  24.83 
 
 		 210 aa  62  0.000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3791  phage integrase family site specific recombinase  26.8 
 
 		 208 aa  61.6  0.000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0452484 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06813  integrase  26.85 
 
 		 197 aa  60.8  0.00000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0824  phage integrase family protein  29.49 
 
 		 197 aa  58.2  0.00000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.917981  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3467  integrase family protein  29.49 
 
 		 197 aa  58.2  0.00000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2671  phage integrase family protein  26.54 
 
 		 191 aa  57  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.196134  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>