290 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_0998 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009513  Lreu_0998  phage integrase family protein  100 
 
 		 215 aa  442  1e-123  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00570052  n/a   
 
 
-
 
NC_012794  GWCH70_3453  integrase family protein  37.42 
 
 		 189 aa  95.5  5e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.590005  normal  0.791222 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0652  DNA integration/recombination/invertion protein  30.56 
 
 		 180 aa  93.6  2e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3599  integrase family protein  31.32 
 
 		 180 aa  91.7  8e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.616601  n/a   
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3590  integrase family protein  35.71 
 
 		 189 aa  91.7  8e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  normal  0.0592429  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2613  prophage LambdaBa04, site-specific recombinase, phage integrase family  33.88 
 
 		 180 aa  91.7  9e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.301879  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4009  prophage LambdaBa04, site-specific recombinase, phage integrase family  31.48 
 
 		 180 aa  86.3  3e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2711  prophage LambdaBa04, site-specific recombinase, phage integrase family  31.32 
 
 		 180 aa  86.3  4e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0042219  normal  0.247582 
 
 
-
 
NC_011656  BCAH187_E0001  site-specific recombinase  32.5 
 
 		 190 aa  85.9  5e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.149945  normal  1 
 
 
-
 
NC_010724  Nther_2955  integrase family protein  33.13 
 
 		 187 aa  84.7  8e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.819146  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1368  prophage LambdaBa04, site-specific recombinase, phage integrase family  30.77 
 
 		 180 aa  84.7  0.000000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.358053 
 
 
-
 
NC_012790  GWCH70_3470  integrase family protein  32.52 
 
 		 182 aa  84.3  0.000000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1165  integrase family protein  30.65 
 
 		 187 aa  80.9  0.00000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1590  phage integrase family site specific recombinase  29.63 
 
 		 182 aa  80.9  0.00000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000133866  n/a   
 
 
-
 
NC_010182  BcerKBAB4_5345  integrase family protein  33.13 
 
 		 182 aa  80.5  0.00000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1007  site-specific recombinase  31.58 
 
 		 183 aa  78.6  0.00000000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  8.22552e-63 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2240  integrase family protein  33.53 
 
 		 197 aa  77.8  0.0000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.0000448435  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2232  integrase family protein  33.53 
 
 		 197 aa  77.8  0.0000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.394376  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0815  integrase family protein  30.92 
 
 		 183 aa  77.8  0.0000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0174  integrase family protein  31.85 
 
 		 186 aa  77  0.0000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00273109  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4574  integrase family protein  29.38 
 
 		 188 aa  76.3  0.0000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1859  prophage LambdaSa2, site-specific recombinase phage integrase family protein  34.18 
 
 		 180 aa  75.9  0.0000000000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00377207  n/a   
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0017  prophage integration/recombination/invertion protein  27.42 
 
 		 190 aa  74.3  0.000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000444728  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4476  phage integrase family site specific recombinase  28.25 
 
 		 188 aa  73.2  0.000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4879  site-specific recombinase, phage integrase family  28.81 
 
 		 188 aa  73.2  0.000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4886  phage integrase family site specific recombinase  27.68 
 
 		 188 aa  72  0.000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4494  phage integrase family site specific recombinase  28.25 
 
 		 188 aa  71.2  0.00000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4855  site-specific recombinase, phage integrase family  27.68 
 
 		 188 aa  71.2  0.00000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4641  phage integrase family site specific recombinase  27.68 
 
 		 188 aa  69.7  0.00000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0164  DNA integration/recombination/inversion protein  28.8 
 
 		 190 aa  69.7  0.00000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0167632  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0412  integrase  27.42 
 
 		 190 aa  70.1  0.00000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0192917  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6236  integrase family protein  26.77 
 
 		 207 aa  70.1  0.00000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4865  site-specific recombinase, phage integrase family  27.68 
 
 		 188 aa  69.7  0.00000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4995  phage integrase family site specific recombinase  27.68 
 
 		 188 aa  69.7  0.00000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0382  site-specific recombinase, phage integrase family  27.68 
 
 		 188 aa  69.3  0.00000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008496  LEUM_A08  integrase  30.18 
 
 		 195 aa  68.9  0.00000000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.000000003137  n/a   
 
 
-
 
NC_007107  pE33L9_0009  integrase/recombinase  28.81 
 
 		 190 aa  67  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0577  prophage LambdaBa02, site-specific recombinase, phage integrase family  30.67 
 
 		 180 aa  67  0.0000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3811  prophage LambdaBa02, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  30.67 
 
 		 180 aa  66.2  0.0000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0141622  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4099  prophage lambdaba02, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  30.86 
 
 		 169 aa  65.9  0.0000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0712  integrase family protein  24.87 
 
 		 285 aa  63.9  0.000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00227312  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2286  phage integrase  34.76 
 
 		 188 aa  63.5  0.000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000274502  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7462  integrase family protein  30.6 
 
 		 292 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.105755  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2339  integrase family protein  26.47 
 
 		 210 aa  63.2  0.000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0020288 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6957  integrase family protein  29.51 
 
 		 292 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2062  phage integrase family site specific recombinase  28.18 
 
 		 198 aa  63.5  0.000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.27505  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7619  integrase family protein  30.6 
 
 		 292 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.192826  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6605  integrase family protein  30.6 
 
 		 292 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3451  integrase family protein  32.5 
 
 		 186 aa  62.4  0.000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0127606  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1185  phage integrase family protein  29.68 
 
 		 176 aa  62  0.000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00690161  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0795  phage integrase family protein  23.81 
 
 		 283 aa  61.6  0.000000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0439  phage integrase, C-terminus  42.86 
 
 		 73 aa  61.2  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.264159  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0772  integrase family protein  29.76 
 
 		 209 aa  60.8  0.00000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4392  prophage LambdaBa02, site-specific recombinase, phage integrase family  27.33 
 
 		 180 aa  61.2  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0752  phage integrase family site specific recombinase  25.91 
 
 		 309 aa  60.5  0.00000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.232674  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0378  integrase family protein  33.12 
 
 		 190 aa  60.8  0.00000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6083  integrase family protein  26.54 
 
 		 210 aa  60.1  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1255  integrase family protein  31.37 
 
 		 186 aa  60.8  0.00000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2569  phage integrase family protein  30.46 
 
 		 198 aa  60.8  0.00000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0769947 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1586  phage integrase family site specific recombinase  29.03 
 
 		 176 aa  60.1  0.00000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.645051  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1370  phage integrase family site specific recombinase  29.03 
 
 		 179 aa  59.7  0.00000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1343  phage integrase family site specific recombinase  29.03 
 
 		 179 aa  60.1  0.00000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.311312  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1342  phage integrase family site specific recombinase  29.03 
 
 		 179 aa  60.1  0.00000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1384  integrase family protein  29.03 
 
 		 176 aa  59.7  0.00000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.334457  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1481  phage integrase family site specific recombinase  29.03 
 
 		 176 aa  59.7  0.00000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1622  site-specific recombinase, phage integrase family  29.03 
 
 		 176 aa  60.1  0.00000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1516  site-specific recombinase, phage integrase family  29.03 
 
 		 176 aa  60.1  0.00000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1254  phage integrase family protein  30 
 
 		 186 aa  59.7  0.00000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.709211 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1553  site-specific recombinase, phage integrase family  29.03 
 
 		 176 aa  60.1  0.00000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000100783 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2230  prophage LambdaBa02, site-specific recombinase, phage integrase family  26.71 
 
 		 180 aa  59.3  0.00000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3118  phage integrase  26.79 
 
 		 210 aa  59.3  0.00000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1619  phage integrase family protein  26.45 
 
 		 286 aa  59.3  0.00000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3208  phage integrase family protein  25.6 
 
 		 204 aa  59.3  0.00000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0839313  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3829  site-specific recombinase, phage integrase family  29.03 
 
 		 176 aa  58.5  0.00000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000329942 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2590  hypothetical protein  25.36 
 
 		 210 aa  58.5  0.00000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0020859 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6093  integrase family protein  25.93 
 
 		 210 aa  58.5  0.00000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.61747  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0106  phage integrase family protein  24.68 
 
 		 295 aa  58.2  0.00000008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2946  phage integrase family protein  24.19 
 
 		 190 aa  58.5  0.00000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.329988 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0435  integrase family protein  27.93 
 
 		 299 aa  58.2  0.00000009  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1448  phage integrase family site specific recombinase  29.14 
 
 		 188 aa  57.4  0.0000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0791  integrase family protein  26.95 
 
 		 209 aa  57.4  0.0000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.334688  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0811  Phage integrase  25.29 
 
 		 208 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1123  phage integrase family protein  27.27 
 
 		 198 aa  58.2  0.0000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1181  phage integrase family protein  27.27 
 
 		 198 aa  58.2  0.0000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.820562  normal  0.553114 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1771  phage integrase family protein  29.14 
 
 		 204 aa  57.4  0.0000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.753085 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3899  phage integrase family protein  27.27 
 
 		 198 aa  58.2  0.0000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.97558 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0658  phage integrase protein  26.11 
 
 		 210 aa  58.2  0.0000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0119  integrase family protein  26.9 
 
 		 209 aa  57  0.0000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2671  phage integrase family protein  30.52 
 
 		 191 aa  57.4  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.196134  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1799  phage integrase family protein  29.14 
 
 		 204 aa  57  0.0000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.968459  normal  0.396821 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3357  integrase family protein  26.19 
 
 		 209 aa  56.2  0.0000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.276444  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1694  phage integrase family protein  27.04 
 
 		 212 aa  56.2  0.0000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.470129  normal  0.0225811 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5291  integrase family protein  25.45 
 
 		 210 aa  56.2  0.0000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0251  phage integrase family protein  29.89 
 
 		 198 aa  56.2  0.0000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.705292 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2102  integrase family protein  24.84 
 
 		 193 aa  55.8  0.0000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2164  phage integrase family protein  26.74 
 
 		 198 aa  55.5  0.0000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0377  integrase family protein  28.95 
 
 		 186 aa  55.1  0.0000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000239772 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1026  integrase family protein  26.14 
 
 		 283 aa  55.1  0.0000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000319361  normal  0.791294 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4790  integrase family protein  26.32 
 
 		 209 aa  55.1  0.0000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1732  integrase/recombinase XerD  24.29 
 
 		 308 aa  54.7  0.000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>