More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_3208 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008740  Maqu_3208  phage integrase family protein  100 
 
 		 204 aa  420  1e-117  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0839313  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0811  Phage integrase  65 
 
 		 208 aa  288  3e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2386  integrase family protein  63.13 
 
 		 208 aa  278  3e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5964  Phage integrase  60.1 
 
 		 208 aa  270  9e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3034  integrase family protein  62.31 
 
 		 206 aa  269  2e-71  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.155662  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6236  integrase family protein  60.1 
 
 		 207 aa  268  2.9999999999999997e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3118  phage integrase  63.59 
 
 		 210 aa  263  8.999999999999999e-70  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3791  phage integrase family site specific recombinase  61.39 
 
 		 208 aa  261  4.999999999999999e-69  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0452484 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2339  integrase family protein  61.22 
 
 		 210 aa  258  4e-68  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0020288 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2267  phage integrase family protein  59.6 
 
 		 210 aa  256  2e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.783329  normal  0.401703 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1729  phage integrase family protein  59.18 
 
 		 207 aa  253  2.0000000000000002e-66  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.425016  normal  0.48456 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2590  hypothetical protein  57.71 
 
 		 210 aa  246  1e-64  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0020859 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0772  integrase family protein  55.67 
 
 		 209 aa  245  3e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0119  integrase family protein  56.1 
 
 		 209 aa  244  6.999999999999999e-64  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0791  integrase family protein  55.61 
 
 		 209 aa  243  9.999999999999999e-64  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.334688  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0217  phage integrase family protein  59.18 
 
 		 200 aa  243  9.999999999999999e-64  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3357  integrase family protein  56.06 
 
 		 209 aa  238  6.999999999999999e-62  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.276444  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2062  phage integrase family site specific recombinase  57.65 
 
 		 198 aa  237  8e-62  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.27505  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3817  integrase family protein  55.33 
 
 		 210 aa  237  8e-62  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.736864  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4790  integrase family protein  54.15 
 
 		 209 aa  236  1e-61  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6083  integrase family protein  54.77 
 
 		 210 aa  227  1e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6093  integrase family protein  54.77 
 
 		 210 aa  226  2e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.61747  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2569  phage integrase family protein  55.67 
 
 		 198 aa  226  2e-58  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0769947 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5291  integrase family protein  55.9 
 
 		 210 aa  225  4e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0658  phage integrase protein  53.77 
 
 		 210 aa  225  4e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4474  integrase family protein  59.28 
 
 		 198 aa  225  4e-58  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1978  phage integrase family protein  60.12 
 
 		 238 aa  222  4e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00595062 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06813  integrase  53.12 
 
 		 197 aa  219  3e-56  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1950  phage integrase family protein  53.89 
 
 		 197 aa  217  8.999999999999998e-56  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.827298  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3467  integrase family protein  53.89 
 
 		 197 aa  213  9.999999999999999e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0824  phage integrase family protein  53.89 
 
 		 197 aa  213  9.999999999999999e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.917981  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2164  phage integrase family protein  50.77 
 
 		 198 aa  206  2e-52  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1287  integrase family protein  51.53 
 
 		 203 aa  204  6e-52  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1123  phage integrase family protein  50.26 
 
 		 198 aa  203  2e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1181  phage integrase family protein  50.26 
 
 		 198 aa  203  2e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.820562  normal  0.553114 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3899  phage integrase family protein  50.26 
 
 		 198 aa  203  2e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.97558 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0251  phage integrase family protein  48.19 
 
 		 198 aa  196  1.0000000000000001e-49  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.705292 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0261  putative tyrosine recombinase XerD  59.46 
 
 		 175 aa  196  2.0000000000000003e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4334  phage integrase family protein  51.63 
 
 		 173 aa  163  1.0000000000000001e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3446  phage integrase family protein  52.03 
 
 		 163 aa  159  3e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.993422  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0153  phage integrase family site specific recombinase  54.2 
 
 		 141 aa  125  4.0000000000000003e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.246008  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0365  hypothetical protein  66.27 
 
 		 103 aa  122  5e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0134906 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0280  phage integrase family site specific recombinase  67.69 
 
 		 66 aa  97.8  1e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0790  hypothetical protein  50.53 
 
 		 130 aa  97.8  1e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.517667  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1167  hypothetical protein  56.58 
 
 		 78 aa  88.2  7e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.347632 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6970  hypothetical protein  66.67 
 
 		 88 aa  87.4  1e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1166  hypothetical protein  50.67 
 
 		 76 aa  80.5  0.00000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.347632 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2576  hypothetical protein  49.3 
 
 		 89 aa  77.8  0.0000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1654  site-specific tyrosine recombinase XerC  26.19 
 
 		 330 aa  70.5  0.00000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000000234006  n/a   
 
 
-
 
NC_012794  GWCH70_3453  integrase family protein  26.38 
 
 		 189 aa  70.1  0.00000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.590005  normal  0.791222 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0728  site-specific tyrosine recombinase XerC  27.27 
 
 		 330 aa  68.6  0.00000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.442089  n/a   
 
 
-
 
NC_011656  BCAH187_E0001  site-specific recombinase  26.29 
 
 		 190 aa  68.2  0.00000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.149945  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1611  tyrosine recombinase  25.38 
 
 		 308 aa  67  0.0000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.4794 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1720  tyrosine recombinase XerD  33.98 
 
 		 319 aa  65.9  0.0000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.514315 
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3590  integrase family protein  24.56 
 
 		 189 aa  65.1  0.0000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  normal  0.0592429  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2271  phage integrase family protein  37.84 
 
 		 321 aa  64.7  0.000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010724  Nther_2955  integrase family protein  26.34 
 
 		 187 aa  63.2  0.000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.819146  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0952  site-specific tyrosine recombinase XerC  28.12 
 
 		 329 aa  62.8  0.000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3451  integrase family protein  27.65 
 
 		 186 aa  63.2  0.000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0127606  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0174  integrase family protein  25.93 
 
 		 186 aa  63.2  0.000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00273109  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2240  integrase family protein  26.97 
 
 		 197 aa  62.8  0.000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.0000448435  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3981  site-specific tyrosine recombinase XerC  28 
 
 		 300 aa  62.4  0.000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.105897  normal  0.285215 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2232  integrase family protein  26.97 
 
 		 197 aa  62.8  0.000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.394376  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1428  phage integrase  26.22 
 
 		 317 aa  62  0.000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.473602  normal  0.0585003 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4229  site-specific tyrosine recombinase XerC  29.3 
 
 		 300 aa  60.8  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4277  site-specific tyrosine recombinase XerC  29.3 
 
 		 300 aa  60.8  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4336  site-specific tyrosine recombinase XerC  29.3 
 
 		 300 aa  60.8  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4159  site-specific tyrosine recombinase XerC  29.3 
 
 		 300 aa  60.8  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.937296  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4177  site-specific tyrosine recombinase XerC  29.3 
 
 		 300 aa  60.8  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.225708  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2613  prophage LambdaBa04, site-specific recombinase, phage integrase family  29.14 
 
 		 180 aa  60.1  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.301879  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5250  site-specific tyrosine recombinase XerC  29.3 
 
 		 298 aa  59.3  0.00000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1165  integrase family protein  26.4 
 
 		 187 aa  59.7  0.00000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010182  BcerKBAB4_5345  integrase family protein  27.17 
 
 		 182 aa  59.7  0.00000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03687  site-specific tyrosine recombinase XerC  29.3 
 
 		 298 aa  58.9  0.00000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.446663  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03636  hypothetical protein  29.3 
 
 		 298 aa  58.9  0.00000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.487194  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4330  site-specific tyrosine recombinase XerC  29.3 
 
 		 298 aa  58.9  0.00000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0998  phage integrase family protein  25.6 
 
 		 215 aa  59.3  0.00000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00570052  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4168  tyrosine recombinase XerC  29.3 
 
 		 298 aa  58.9  0.00000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4177  site-specific tyrosine recombinase XerC  29.3 
 
 		 298 aa  58.9  0.00000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0208532 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4036  site-specific tyrosine recombinase XerC  29.3 
 
 		 298 aa  58.9  0.00000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4271  site-specific tyrosine recombinase XerC  29.3 
 
 		 298 aa  58.9  0.00000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4196  site-specific tyrosine recombinase XerC  29.3 
 
 		 298 aa  58.9  0.00000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0689633  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00203  tyrosine recombinase  27.39 
 
 		 306 aa  58.5  0.00000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4076  phage integrase  28.95 
 
 		 298 aa  58.2  0.00000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4009  prophage LambdaBa04, site-specific recombinase, phage integrase family  26.54 
 
 		 180 aa  57.8  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3312  site-specific tyrosine recombinase XerD  28.34 
 
 		 298 aa  57.8  0.0000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1902  phage integrase  25.89 
 
 		 293 aa  57.8  0.0000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.162765  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0381  tyrosine recombinase XerD  28.64 
 
 		 303 aa  57.8  0.0000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1797  phage integrase  26.43 
 
 		 303 aa  57.8  0.0000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.742134 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1617  site-specific tyrosine recombinase XerC  27.74 
 
 		 330 aa  57.4  0.0000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000155402  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3115  phage integrase  30.13 
 
 		 298 aa  57  0.0000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1634  integrase family protein  26.71 
 
 		 354 aa  55.8  0.0000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.280587  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002113  tyrosine recombinase XerC  31.45 
 
 		 310 aa  55.5  0.0000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3599  integrase family protein  27.43 
 
 		 180 aa  55.1  0.0000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.616601  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4012  tyrosine recombinase XerC  25 
 
 		 294 aa  55.5  0.0000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00152232  n/a   
 
 
-
 
NC_013163  Cyan8802_4591  integrase family protein  26.34 
 
 		 316 aa  55.1  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000000427706  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00307  site-specific tyrosine recombinase XerC  31.45 
 
 		 313 aa  54.7  0.0000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1368  prophage LambdaBa04, site-specific recombinase, phage integrase family  25.93 
 
 		 180 aa  54.7  0.0000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.358053 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2484  phage integrase  26.06 
 
 		 304 aa  54.7  0.0000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.72317  normal  0.0269236 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0377  integrase family protein  27.81 
 
 		 186 aa  54.3  0.000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000239772 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>