69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_4334 on replicon NC_009668
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009668  Oant_4334  phage integrase family protein  100 
 
 
173 aa  353  6.999999999999999e-97  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0658  phage integrase protein  95.24 
 
 
210 aa  330  5e-90  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6083  integrase family protein  70.24 
 
 
210 aa  254  4e-67  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6093  integrase family protein  70.24 
 
 
210 aa  253  7e-67  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.61747  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5291  integrase family protein  68.45 
 
 
210 aa  249  1e-65  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1287  integrase family protein  62.5 
 
 
203 aa  202  2e-51  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6236  integrase family protein  54.49 
 
 
207 aa  173  9.999999999999999e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0261  putative tyrosine recombinase XerD  54.3 
 
 
175 aa  172  9.999999999999999e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0791  integrase family protein  55.13 
 
 
209 aa  171  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.334688  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0772  integrase family protein  53.75 
 
 
209 aa  170  1e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1729  phage integrase family protein  53.85 
 
 
207 aa  169  1e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.425016  normal  0.48456 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0811  Phage integrase  53.21 
 
 
208 aa  169  1e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3034  integrase family protein  54.9 
 
 
206 aa  169  2e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.155662  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5964  Phage integrase  50 
 
 
208 aa  169  2e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2590  hypothetical protein  53.85 
 
 
210 aa  168  3e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0020859 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2339  integrase family protein  53.59 
 
 
210 aa  168  4e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0020288 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0119  integrase family protein  54.49 
 
 
209 aa  167  6e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4790  integrase family protein  54.49 
 
 
209 aa  166  2e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3357  integrase family protein  54.49 
 
 
209 aa  165  4e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.276444  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3208  phage integrase family protein  51.63 
 
 
204 aa  163  9e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0839313  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2386  integrase family protein  48.19 
 
 
208 aa  162  2.0000000000000002e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3118  phage integrase  50.64 
 
 
210 aa  162  3e-39  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0790  hypothetical protein  74.77 
 
 
130 aa  160  1e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.517667  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3791  phage integrase family site specific recombinase  52.6 
 
 
208 aa  158  3e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0452484 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0217  phage integrase family protein  47.71 
 
 
200 aa  153  1e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2267  phage integrase family protein  48.72 
 
 
210 aa  150  5.9999999999999996e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.783329  normal  0.401703 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3817  integrase family protein  50.98 
 
 
210 aa  148  4e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.736864  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2062  phage integrase family site specific recombinase  45.45 
 
 
198 aa  143  1e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.27505  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1978  phage integrase family protein  52.21 
 
 
238 aa  140  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00595062 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2569  phage integrase family protein  44.16 
 
 
198 aa  139  9.999999999999999e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0769947 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06813  integrase  42 
 
 
197 aa  127  1.0000000000000001e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2164  phage integrase family protein  43.87 
 
 
198 aa  126  2.0000000000000002e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4474  integrase family protein  45.45 
 
 
198 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1123  phage integrase family protein  42.58 
 
 
198 aa  122  3e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3467  integrase family protein  41.33 
 
 
197 aa  122  3e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1181  phage integrase family protein  42.58 
 
 
198 aa  122  3e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.820562  normal  0.553114 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3899  phage integrase family protein  42.58 
 
 
198 aa  122  3e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.97558 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0824  phage integrase family protein  41.33 
 
 
197 aa  121  5e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.917981  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1950  phage integrase family protein  41.33 
 
 
197 aa  118  3.9999999999999996e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.827298  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0251  phage integrase family protein  37.5 
 
 
198 aa  108  5e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.705292 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0153  phage integrase family site specific recombinase  40 
 
 
141 aa  89.4  2e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.246008  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3446  phage integrase family protein  37.14 
 
 
163 aa  78.2  0.00000000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.993422  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2576  hypothetical protein  44.3 
 
 
89 aa  70.9  0.000000000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1166  hypothetical protein  47.3 
 
 
76 aa  68.9  0.00000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.347632 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1787  hypothetical protein  46.05 
 
 
79 aa  66.2  0.0000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0121442  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1167  hypothetical protein  58.7 
 
 
78 aa  56.6  0.0000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.347632 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0365  hypothetical protein  62.5 
 
 
103 aa  56.2  0.0000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0134906 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6970  hypothetical protein  48.21 
 
 
88 aa  55.8  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2240  integrase family protein  32.5 
 
 
197 aa  55.5  0.0000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.0000448435  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2232  integrase family protein  32.5 
 
 
197 aa  55.5  0.0000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.394376  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0174  integrase family protein  26.32 
 
 
186 aa  54.3  0.0000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00273109  n/a   
 
 
-
 
NC_011656  BCAH187_E0001  site-specific recombinase  26 
 
 
190 aa  50.4  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.149945  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4009  prophage LambdaBa04, site-specific recombinase, phage integrase family  28.69 
 
 
180 aa  48.9  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010724  Nther_2955  integrase family protein  29.03 
 
 
187 aa  48.9  0.00004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.819146  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2613  prophage LambdaBa04, site-specific recombinase, phage integrase family  29.85 
 
 
180 aa  48.5  0.00005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.301879  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1165  integrase family protein  26.81 
 
 
187 aa  48.1  0.00006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2271  phage integrase family protein  28.36 
 
 
321 aa  46.2  0.0002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0652  DNA integration/recombination/invertion protein  28.03 
 
 
180 aa  45.8  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012794  GWCH70_3453  integrase family protein  27.34 
 
 
189 aa  46.2  0.0003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.590005  normal  0.791222 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2711  prophage LambdaBa04, site-specific recombinase, phage integrase family  28.69 
 
 
180 aa  45.4  0.0004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0042219  normal  0.247582 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3459  hypothetical protein  45.65 
 
 
55 aa  42.4  0.003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1436  integrase family protein  27.54 
 
 
641 aa  41.6  0.005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0728  site-specific tyrosine recombinase XerC  26.32 
 
 
330 aa  41.6  0.006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.442089  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3451  integrase family protein  25.21 
 
 
186 aa  41.6  0.006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0127606  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1720  tyrosine recombinase XerD  30 
 
 
319 aa  41.2  0.007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.514315 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1804  Integrase  35 
 
 
400 aa  40.8  0.01  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.222465  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1333  Integrase  35 
 
 
400 aa  40.8  0.01  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.455073  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0312  Integrase  35 
 
 
400 aa  40.8  0.01  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0150741  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0032  Integrase  35 
 
 
400 aa  40.8  0.01  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.857579  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>