31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_1787 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_1787  hypothetical protein  100 
 
 		 79 aa  159  2e-38  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0121442  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6083  integrase family protein  59.32 
 
 		 210 aa  71.2  0.000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6093  integrase family protein  57.63 
 
 		 210 aa  70.9  0.000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.61747  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0790  hypothetical protein  66 
 
 		 130 aa  67.8  0.00000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.517667  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0658  phage integrase protein  54.24 
 
 		 210 aa  67.4  0.00000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5291  integrase family protein  52.54 
 
 		 210 aa  67  0.00000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4334  phage integrase family protein  46.05 
 
 		 173 aa  66.2  0.0000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1287  integrase family protein  60.87 
 
 		 203 aa  56.2  0.0000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0811  Phage integrase  46.81 
 
 		 208 aa  49.7  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1729  phage integrase family protein  46.67 
 
 		 207 aa  49.3  0.00002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.425016  normal  0.48456 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1978  phage integrase family protein  43.48 
 
 		 238 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00595062 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2339  integrase family protein  46.67 
 
 		 210 aa  47.8  0.00006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0020288 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3034  integrase family protein  41.3 
 
 		 206 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.155662  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0772  integrase family protein  39.06 
 
 		 209 aa  47  0.00009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5964  Phage integrase  36.76 
 
 		 208 aa  47  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3791  phage integrase family site specific recombinase  41.3 
 
 		 208 aa  47  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0452484 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2590  hypothetical protein  42.22 
 
 		 210 aa  45.8  0.0002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0020859 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3208  phage integrase family protein  41.67 
 
 		 204 aa  45.1  0.0003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0839313  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2386  integrase family protein  42.55 
 
 		 208 aa  45.1  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4790  integrase family protein  40.62 
 
 		 209 aa  45.1  0.0003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0119  integrase family protein  40.62 
 
 		 209 aa  44.3  0.0006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0791  integrase family protein  39.06 
 
 		 209 aa  43.1  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.334688  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0824  phage integrase family protein  44.44 
 
 		 197 aa  43.1  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.917981  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3467  integrase family protein  44.44 
 
 		 197 aa  43.1  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06813  integrase  44.44 
 
 		 197 aa  42.7  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0261  putative tyrosine recombinase XerD  39.53 
 
 		 175 aa  42.4  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0217  phage integrase family protein  45.45 
 
 		 200 aa  42  0.003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3118  phage integrase  39.13 
 
 		 210 aa  41.6  0.003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2569  phage integrase family protein  34.69 
 
 		 198 aa  41.2  0.004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0769947 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3357  integrase family protein  40.32 
 
 		 209 aa  41.2  0.005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.276444  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6236  integrase family protein  37.78 
 
 		 207 aa  40.8  0.006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>