More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_6083 on replicon NC_010510
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010510  Mrad2831_6083  integrase family protein  100 
 
 		 210 aa  421  1e-117  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6093  integrase family protein  97.62 
 
 		 210 aa  414  9.999999999999999e-116  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.61747  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5291  integrase family protein  96.67 
 
 		 210 aa  412  1e-114  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0658  phage integrase protein  72.86 
 
 		 210 aa  326  2.0000000000000001e-88  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1287  integrase family protein  80.48 
 
 		 203 aa  320  7e-87  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4334  phage integrase family protein  70.24 
 
 		 173 aa  254  6e-67  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6236  integrase family protein  59.9 
 
 		 207 aa  248  4e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2590  hypothetical protein  59.41 
 
 		 210 aa  241  7e-63  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0020859 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0811  Phage integrase  57.92 
 
 		 208 aa  239  2e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3118  phage integrase  56.86 
 
 		 210 aa  239  2e-62  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0119  integrase family protein  59.2 
 
 		 209 aa  238  5.999999999999999e-62  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0772  integrase family protein  58.59 
 
 		 209 aa  238  6.999999999999999e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2339  integrase family protein  54.85 
 
 		 210 aa  238  6.999999999999999e-62  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0020288 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2386  integrase family protein  58.08 
 
 		 208 aa  237  9e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3357  integrase family protein  58.42 
 
 		 209 aa  236  2e-61  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.276444  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4790  integrase family protein  58.21 
 
 		 209 aa  235  3e-61  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3034  integrase family protein  57.21 
 
 		 206 aa  234  5.0000000000000005e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.155662  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0791  integrase family protein  58.21 
 
 		 209 aa  234  7e-61  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.334688  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5964  Phage integrase  55.56 
 
 		 208 aa  231  6e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3791  phage integrase family site specific recombinase  55.02 
 
 		 208 aa  228  6e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0452484 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3208  phage integrase family protein  54.77 
 
 		 204 aa  227  1e-58  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0839313  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3817  integrase family protein  59.49 
 
 		 210 aa  224  1e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.736864  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1729  phage integrase family protein  53.23 
 
 		 207 aa  224  1e-57  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.425016  normal  0.48456 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2267  phage integrase family protein  54.55 
 
 		 210 aa  223  1e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.783329  normal  0.401703 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1978  phage integrase family protein  61.21 
 
 		 238 aa  209  2e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00595062 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0217  phage integrase family protein  49.74 
 
 		 200 aa  206  3e-52  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2569  phage integrase family protein  47.69 
 
 		 198 aa  201  9e-51  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0769947 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2062  phage integrase family site specific recombinase  46.67 
 
 		 198 aa  200  9.999999999999999e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.27505  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2164  phage integrase family protein  45.92 
 
 		 198 aa  188  4e-47  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0261  putative tyrosine recombinase XerD  56.49 
 
 		 175 aa  184  1.0000000000000001e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1123  phage integrase family protein  44.9 
 
 		 198 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1181  phage integrase family protein  44.9 
 
 		 198 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.820562  normal  0.553114 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3899  phage integrase family protein  44.9 
 
 		 198 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.97558 
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4474  integrase family protein  47.69 
 
 		 198 aa  182  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06813  integrase  43.46 
 
 		 197 aa  175  5e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3467  integrase family protein  42.71 
 
 		 197 aa  169  2e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0824  phage integrase family protein  42.71 
 
 		 197 aa  169  4e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.917981  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0251  phage integrase family protein  44.04 
 
 		 198 aa  165  5e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.705292 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1950  phage integrase family protein  41.67 
 
 		 197 aa  162  4.0000000000000004e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.827298  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0790  hypothetical protein  61.68 
 
 		 130 aa  139  3e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.517667  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3446  phage integrase family protein  45.21 
 
 		 163 aa  137  8.999999999999999e-32  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.993422  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0365  hypothetical protein  68.75 
 
 		 103 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0134906 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1167  hypothetical protein  60.53 
 
 		 78 aa  95.5  5e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.347632 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0280  phage integrase family site specific recombinase  66.15 
 
 		 66 aa  93.6  2e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0153  phage integrase family site specific recombinase  40 
 
 		 141 aa  92.8  3e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.246008  n/a   
 
 
-
 
NC_010724  Nther_2955  integrase family protein  30 
 
 		 187 aa  75.5  0.0000000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.819146  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1166  hypothetical protein  55.56 
 
 		 76 aa  75.5  0.0000000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.347632 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1787  hypothetical protein  59.32 
 
 		 79 aa  71.2  0.00000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0121442  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2576  hypothetical protein  47.06 
 
 		 89 aa  69.7  0.00000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011656  BCAH187_E0001  site-specific recombinase  26.49 
 
 		 190 aa  67.4  0.0000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.149945  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0652  DNA integration/recombination/invertion protein  28.81 
 
 		 180 aa  67  0.0000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2613  prophage LambdaBa04, site-specific recombinase, phage integrase family  27.43 
 
 		 180 aa  67  0.0000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.301879  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3599  integrase family protein  27.27 
 
 		 180 aa  66.6  0.0000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.616601  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0174  integrase family protein  27.52 
 
 		 186 aa  65.9  0.0000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00273109  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4009  prophage LambdaBa04, site-specific recombinase, phage integrase family  25.57 
 
 		 180 aa  65.1  0.0000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2271  phage integrase family protein  30 
 
 		 321 aa  63.2  0.000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1428  phage integrase  29.01 
 
 		 317 aa  62.4  0.000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.473602  normal  0.0585003 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2711  prophage LambdaBa04, site-specific recombinase, phage integrase family  24.56 
 
 		 180 aa  61.6  0.000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0042219  normal  0.247582 
 
 
-
 
NC_010182  BcerKBAB4_5345  integrase family protein  28.03 
 
 		 182 aa  61.6  0.000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1368  prophage LambdaBa04, site-specific recombinase, phage integrase family  25.57 
 
 		 180 aa  61.6  0.000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.358053 
 
 
-
 
NC_012794  GWCH70_3453  integrase family protein  30.32 
 
 		 189 aa  61.2  0.00000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.590005  normal  0.791222 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0861  integrase/recombinase XerC  35.03 
 
 		 304 aa  60.5  0.00000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0998  phage integrase family protein  26.54 
 
 		 215 aa  60.1  0.00000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00570052  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00203  tyrosine recombinase  29.63 
 
 		 306 aa  59.7  0.00000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3590  integrase family protein  28.82 
 
 		 189 aa  58.9  0.00000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  normal  0.0592429  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1720  tyrosine recombinase XerD  33.58 
 
 		 319 aa  58.5  0.00000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.514315 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0728  site-specific tyrosine recombinase XerC  29.27 
 
 		 330 aa  58.9  0.00000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.442089  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2484  phage integrase  28.1 
 
 		 304 aa  58.5  0.00000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.72317  normal  0.0269236 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3811  prophage LambdaBa02, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  29.45 
 
 		 180 aa  58.2  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0141622  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4099  prophage lambdaba02, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  29.45 
 
 		 169 aa  57.8  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008496  LEUM_A08  integrase  26.45 
 
 		 195 aa  57.4  0.0000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.000000003137  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2230  prophage LambdaBa02, site-specific recombinase, phage integrase family  30.67 
 
 		 180 aa  57  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2240  integrase family protein  26.56 
 
 		 197 aa  56.6  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.0000448435  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3835  tyrosine recombinase XerC  33.51 
 
 		 304 aa  57  0.0000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.955587  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2232  integrase family protein  26.56 
 
 		 197 aa  56.6  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.394376  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0815  integrase family protein  28.75 
 
 		 183 aa  56.2  0.0000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03687  site-specific tyrosine recombinase XerC  30.77 
 
 		 298 aa  55.8  0.0000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.446663  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03636  hypothetical protein  30.77 
 
 		 298 aa  55.8  0.0000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.487194  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4168  tyrosine recombinase XerC  30.77 
 
 		 298 aa  55.5  0.0000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4271  site-specific tyrosine recombinase XerC  30.77 
 
 		 298 aa  55.5  0.0000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1611  tyrosine recombinase  25.93 
 
 		 308 aa  55.5  0.0000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.4794 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4177  site-specific tyrosine recombinase XerC  30.77 
 
 		 298 aa  55.5  0.0000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0208532 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4196  site-specific tyrosine recombinase XerC  30.77 
 
 		 298 aa  55.5  0.0000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0689633  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0341  tyrosine recombinase XerC  30.97 
 
 		 317 aa  55.5  0.0000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000100724  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4036  site-specific tyrosine recombinase XerC  30.77 
 
 		 298 aa  55.5  0.0000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4330  site-specific tyrosine recombinase XerC  30.77 
 
 		 298 aa  55.5  0.0000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04122  site-specific tyrosine recombinase XerC  30.72 
 
 		 305 aa  55.1  0.0000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3629  integrase family protein  30.32 
 
 		 290 aa  54.3  0.000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1007  site-specific recombinase  28.05 
 
 		 183 aa  54.7  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  8.22552e-63 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3661  integrase family protein  30.32 
 
 		 290 aa  54.3  0.000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.311976  decreased coverage  0.00000149049 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1654  site-specific tyrosine recombinase XerC  29.01 
 
 		 330 aa  54.3  0.000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000000234006  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0185  site-specific tyrosine recombinase XerC  28.72 
 
 		 302 aa  54.3  0.000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.182372  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5250  site-specific tyrosine recombinase XerC  30.13 
 
 		 298 aa  54.7  0.000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3696  integrase family protein  28.74 
 
 		 334 aa  53.5  0.000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0795  phage integrase family protein  27.69 
 
 		 283 aa  53.5  0.000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3981  site-specific tyrosine recombinase XerC  30.38 
 
 		 300 aa  53.9  0.000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.105897  normal  0.285215 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4006  integrase family protein  28.74 
 
 		 334 aa  53.5  0.000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0858  phage integrase  27.22 
 
 		 289 aa  53.9  0.000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2876  integrase family protein  30.12 
 
 		 241 aa  53.5  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0452  tyrosine recombinase XerC subunit  29.01 
 
 		 335 aa  53.5  0.000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.577676  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>