More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_1268 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013512  Sdel_1268  integrase family protein  100 
 
 		 353 aa  728    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0843  phage integrase family site specific recombinase  56.77 
 
 		 354 aa  385  1e-106  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00824905  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0105  hydrogenase expression/formation protein  54.76 
 
 		 354 aa  375  1e-103  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2090  transport protein  54.76 
 
 		 353 aa  376  1e-103  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0326537  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1991  metallo-beta-lactamase family protein  55.33 
 
 		 353 aa  371  1e-102  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0735  integrase/recombinase  55.14 
 
 		 355 aa  370  1e-101  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  decreased coverage  0.000138239  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1012  phage integrase family site specific recombinase  55.01 
 
 		 354 aa  363  3e-99  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000959514  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0879  phage integrase family site specific recombinase  54.73 
 
 		 354 aa  362  5.0000000000000005e-99  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.159654  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0950  phage integrase family site specific recombinase  54.44 
 
 		 354 aa  360  2e-98  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0218535  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1132  phage integrase family site specific recombinase  52.59 
 
 		 352 aa  360  2e-98  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1094  phage integrase family site specific recombinase  33.78 
 
 		 223 aa  107  3e-22  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.331299  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0660  integrase family protein  33.68 
 
 		 284 aa  105  1e-21  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2815  integrase/recombinase XerD  30.89 
 
 		 311 aa  103  5e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1531  phage integrase family protein  30.33 
 
 		 311 aa  103  5e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.504949 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1906  integrase family protein  28.83 
 
 		 295 aa  102  9e-21  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.713326  normal  0.217947 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1481  phage integrase family protein  30.08 
 
 		 311 aa  101  2e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0281722  normal  0.205606 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1202  tyrosine recombinase XerC  26.77 
 
 		 304 aa  101  2e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.910177  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1611  tyrosine recombinase  29.25 
 
 		 308 aa  100  4e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.4794 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0106  phage integrase family protein  34.34 
 
 		 295 aa  99.8  7e-20  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0426  site-specific tyrosine recombinase XerC  29.46 
 
 		 321 aa  99.4  8e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2346  tyrosine recombinase XerC  32.16 
 
 		 302 aa  98.6  1e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.126195  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0536  site-specific tyrosine recombinase XerC  29.46 
 
 		 300 aa  99  1e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.538013  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1300  tyrosine recombinase XerD subunit  34.87 
 
 		 297 aa  98.6  1e-19  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0678  tyrosine recombinase XerD  29.52 
 
 		 294 aa  99.4  1e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0265142 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3715  integrase family protein  32.27 
 
 		 298 aa  97.4  3e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2105  tyrosine recombinase XerD  26.5 
 
 		 297 aa  97.1  4e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.179497  hitchhiker  0.00877552 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3929  site-specific tyrosine recombinase XerC  33.69 
 
 		 299 aa  96.7  5e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000313294  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3572  site-specific tyrosine recombinase XerC  34.22 
 
 		 299 aa  96.7  5e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000685052  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1427  tyrosine recombinase XerD subunit  35.83 
 
 		 295 aa  96.7  5e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3843  site-specific tyrosine recombinase XerC  34.22 
 
 		 299 aa  96.7  5e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.27577e-62 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2117  tyrosine recombinase XerD  34.21 
 
 		 298 aa  95.1  1e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.815623  normal  0.0464222 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3682  site-specific tyrosine recombinase XerC  33.69 
 
 		 299 aa  95.1  2e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.245295  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3590  site-specific tyrosine recombinase XerC  33.16 
 
 		 299 aa  94.7  2e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0796955  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0083  site-specific tyrosine recombinase XerC  29.73 
 
 		 322 aa  94.4  2e-18  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3654  site-specific tyrosine recombinase XerC  33.16 
 
 		 301 aa  95.1  2e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000489449  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3969  site-specific tyrosine recombinase XerC  33.69 
 
 		 299 aa  95.1  2e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000391393  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1282  tyrosine recombinase XerD  32.31 
 
 		 295 aa  94.4  2e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.63418  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1314  site-specific tyrosine recombinase XerC  32.62 
 
 		 299 aa  94.4  3e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000019497  unclonable  8.39468e-26 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0677  integrase family protein  28.92 
 
 		 291 aa  94  3e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.92563 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1720  tyrosine recombinase XerD  32.84 
 
 		 319 aa  94  4e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.514315 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1668  tyrosine recombinase XerD subunit  32.11 
 
 		 295 aa  93.6  4e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.179488  normal  0.0195248 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0063  tyrosine recombinase XerC  32.98 
 
 		 304 aa  94  4e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0039  tyrosine recombinase XerD  31.09 
 
 		 312 aa  93.6  4e-18  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1732  integrase/recombinase XerD  28.82 
 
 		 308 aa  93.2  5e-18  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3873  site-specific tyrosine recombinase XerC  33.16 
 
 		 299 aa  93.6  5e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00557083  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2483  site-specific tyrosine recombinase XerC  29.54 
 
 		 299 aa  93.6  5e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000855714  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3796  phage integrase family protein  30.93 
 
 		 304 aa  93.6  5e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3878  site-specific tyrosine recombinase XerC  33.16 
 
 		 299 aa  92.8  7e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000107327  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0912  integrase/recombinase  30.93 
 
 		 304 aa  93.2  7e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0261382  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2332  tyrosine recombinase XerD  33.33 
 
 		 292 aa  92.4  9e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1914  integrase/recombinase  30.2 
 
 		 304 aa  92.4  1e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00100079  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2169  tyrosine recombinase XerD  34.54 
 
 		 298 aa  92.4  1e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.167772  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1104  site-specific tyrosine recombinase XerC  29.13 
 
 		 300 aa  92.4  1e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000317379  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2692  tyrosine recombinase XerD  35.83 
 
 		 295 aa  92.4  1e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.457784  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0872  hypothetical protein  30.71 
 
 		 286 aa  92  1e-17  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000507301  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11988  putative tyrosine recombinase  28.38 
 
 		 298 aa  91.7  2e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1982  tyrosine recombinase XerC  28.74 
 
 		 298 aa  91.7  2e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0026523  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2567  site-specific tyrosine recombinase XerD  32.41 
 
 		 313 aa  91.7  2e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.615759 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0602  phage integrase family protein  31.09 
 
 		 317 aa  91.3  2e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00243284  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0687  Phage integrase  31.82 
 
 		 310 aa  91.7  2e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.004827  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1513  site-specific recombinase  29.07 
 
 		 295 aa  91.7  2e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.110584  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0198  tyrosine recombinase XerC subunit  32.92 
 
 		 291 aa  91.3  2e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0021573 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1428  phage integrase  29.2 
 
 		 317 aa  91.7  2e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.473602  normal  0.0585003 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0842  hypothetical protein  28.88 
 
 		 290 aa  91.3  2e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0918  integrase  29.48 
 
 		 307 aa  91.3  2e-17  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.0200604 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2440  tyrosine recombinase XerD  32.99 
 
 		 332 aa  91.7  2e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.691328  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1819  integrase/recombinase XerD  34.76 
 
 		 295 aa  90.9  3e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.530175  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0401  site-specific tyrosine recombinase XerC  27.68 
 
 		 324 aa  90.9  3e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.145415 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1878  tyrosine recombinase XerD  32.8 
 
 		 292 aa  90.5  4e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47730  site-specific tyrosine recombinase XerC  31.17 
 
 		 299 aa  90.5  4e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0435757  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11080  phage integrase family protein  29.41 
 
 		 310 aa  90.5  4e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0105178  n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0136  site-specific tyrosine recombinase XerS  27.78 
 
 		 361 aa  90.1  5e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.293476  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3450  tyrosine recombinase XerD  36.94 
 
 		 322 aa  90.1  5e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0530  tyrosine recombinase XerD  31.22 
 
 		 320 aa  90.1  5e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.931339  normal  0.0955198 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2271  phage integrase family protein  29.57 
 
 		 321 aa  90.1  5e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3062  site-specific tyrosine recombinase XerD  28.57 
 
 		 308 aa  90.1  6e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2383  tyrosine recombinase XerD  36.25 
 
 		 295 aa  90.1  6e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1996  site-specific tyrosine recombinase XerC  29.75 
 
 		 300 aa  89.7  7e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1844  site-specific tyrosine recombinase XerC  31.05 
 
 		 315 aa  89.7  7e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.104424  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0159  integrase family protein  34.39 
 
 		 295 aa  89.7  7e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1916  site-specific tyrosine recombinase XerC  31.05 
 
 		 315 aa  89.7  8e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.391518  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0180  site-specific tyrosine recombinase XerC  27.23 
 
 		 324 aa  89.4  8e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1654  site-specific tyrosine recombinase XerC  29.84 
 
 		 330 aa  89.4  9e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000000234006  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0488  tyrosine recombinase XerD  30.29 
 
 		 319 aa  89.4  9e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0367  site-specific tyrosine recombinase XerD  30 
 
 		 298 aa  89  1e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0861  integrase/recombinase XerC  26.18 
 
 		 304 aa  89  1e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0942  site-specific tyrosine recombinase XerC  31.61 
 
 		 315 aa  89  1e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1639  integrase family protein  33.33 
 
 		 301 aa  88.6  1e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0514216  n/a   
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0015  Phage integrase  30.81 
 
 		 310 aa  89.4  1e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.230922  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1687  tyrosine recombinase XerD subunit  32.99 
 
 		 314 aa  89.4  1e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0144  tyrosine recombinase XerD  27.53 
 
 		 305 aa  89  1e-16  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3892  site-specific tyrosine recombinase XerD  33.16 
 
 		 299 aa  89.4  1e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.413643  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4583  tyrosine recombinase XerD  32.29 
 
 		 317 aa  89.4  1e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.422443 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0177  site-specific tyrosine recombinase XerC  28.7 
 
 		 323 aa  88.6  1e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3090  tyrosine recombinase XerD  29.49 
 
 		 320 aa  89  1e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4012  tyrosine recombinase XerC  32.61 
 
 		 294 aa  89.4  1e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00152232  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0607  recombinase  29.52 
 
 		 296 aa  88.2  2e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0116  Phage integrase, N-terminal SAM- like  29.18 
 
 		 309 aa  87.4  3e-16  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03636  hypothetical protein  28.16 
 
 		 298 aa  87.8  3e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.487194  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0651  tyrosine recombinase XerC subunit  25.56 
 
 		 307 aa  87.8  3e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>