More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BCG9842_0136 on replicon NC_011775
Organism: Bacillus cereus G9842



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011775  BCG9842_0136  site-specific tyrosine recombinase XerS  100 
 
 
361 aa  742    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.293476  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0151  site-specific tyrosine recombinase XerS  85.32 
 
 
361 aa  607  1e-173  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0261  site-specific tyrosine recombinase XerS  80.33 
 
 
361 aa  592  1e-168  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0200  site-specific tyrosine recombinase XerS  79.78 
 
 
361 aa  589  1e-167  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  9.249629999999999e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0311  site-specific tyrosine recombinase XerS  80.33 
 
 
361 aa  589  1e-167  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5532  site-specific tyrosine recombinase XerS  62.88 
 
 
368 aa  489  1e-137  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000644958 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0018  site-specific tyrosine recombinase XerS  40.82 
 
 
358 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000485096  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5530  site-specific tyrosine recombinase XerS  40.23 
 
 
357 aa  252  9.000000000000001e-66  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.267916  hitchhiker  0.00142122 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1302  site-specific tyrosine recombinase XerS  36.34 
 
 
356 aa  231  1e-59  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.287333  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1013  site-specific tyrosine recombinase XerS  36.9 
 
 
356 aa  224  2e-57  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00257725  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0978  site-specific tyrosine recombinase XerS  35.49 
 
 
356 aa  214  1.9999999999999998e-54  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0994  site-specific tyrosine recombinase XerS  33.06 
 
 
359 aa  209  5e-53  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000205377  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1006  site-specific tyrosine recombinase XerS  32.96 
 
 
356 aa  209  8e-53  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000475631  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2195  integrase family protein  28.69 
 
 
350 aa  114  2.0000000000000002e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2699  integrase family protein  29.26 
 
 
327 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1390  site-specific tyrosine recombinase XerC  27.86 
 
 
328 aa  108  2e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000179914  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1654  site-specific tyrosine recombinase XerC  28.03 
 
 
330 aa  107  4e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000000234006  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11080  phage integrase family protein  38.46 
 
 
310 aa  105  1e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0105178  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0063  tyrosine recombinase XerC  24.69 
 
 
304 aa  104  3e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1624  phage/XerD family site-specific recombinase  25.9 
 
 
341 aa  102  8e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.389199 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0396  tyrosine recombinase XerD  33.53 
 
 
309 aa  98.2  2e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1299  site-specific tyrosine recombinase XerC  26.41 
 
 
291 aa  98.2  2e-19  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1617  site-specific tyrosine recombinase XerC  26.82 
 
 
330 aa  98.6  2e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000155402  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1320  tyrosine recombinase XerD  24.19 
 
 
302 aa  97.1  4e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3715  integrase family protein  27.5 
 
 
298 aa  96.7  6e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0273  tyrosine recombinase XerC  26.33 
 
 
300 aa  96.3  7e-19  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.007038  normal  0.809464 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0952  site-specific tyrosine recombinase XerC  27.04 
 
 
329 aa  96.3  8e-19  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0688  integrase family protein  26.33 
 
 
336 aa  95.9  9e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004441  site-specific recombinase XerD  24.32 
 
 
305 aa  95.5  1e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0727  tyrosine recombinase XerD  25.94 
 
 
304 aa  95.9  1e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.689003 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1366  site-specific tyrosine recombinase XerC  27.84 
 
 
450 aa  95.5  1e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000415693  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1698  integrase family protein  27.49 
 
 
314 aa  95.5  1e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.23599  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4306  integrase/recombinase XerC  34.87 
 
 
299 aa  95.1  2e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0788  phage integrase family protein  27.4 
 
 
293 aa  95.1  2e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5501  site-specific tyrosine recombinase XerC  24.3 
 
 
299 aa  94.7  2e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.345753  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0519  phage integrase family protein  25.37 
 
 
300 aa  94.7  2e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.24612  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0728  site-specific tyrosine recombinase XerC  36.36 
 
 
330 aa  94.7  2e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.442089  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0285  tyrosine recombinase XerC  27.41 
 
 
302 aa  94.7  2e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0623  site-specific recombinase  26.71 
 
 
332 aa  94  3e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0564  tyrosine recombinase XerC subunit  24.66 
 
 
328 aa  94.4  3e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0497  tyrosine recombinase XerC  21.74 
 
 
324 aa  94  4e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.237269  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0198  tyrosine recombinase XerC subunit  24.22 
 
 
291 aa  94  4e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0021573 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0489  tyrosine recombinase XerC  34.21 
 
 
299 aa  93.6  5e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.110232  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0817  tyrosine recombinase XerD  31.18 
 
 
305 aa  93.6  5e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.763193  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2544  tyrosine recombinase XerC  24.4 
 
 
318 aa  93.6  5e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.774585  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0582  integrase family protein  24.07 
 
 
330 aa  93.6  5e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.132855 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0325  tyrosine recombinase XerC  25.62 
 
 
297 aa  93.6  5e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1982  tyrosine recombinase XerC  37.42 
 
 
298 aa  93.2  6e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0026523  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0180  site-specific tyrosine recombinase XerC  24.85 
 
 
324 aa  93.2  6e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0271  site-specific tyrosine recombinase XerC  26.95 
 
 
351 aa  92.8  8e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.28022  normal  0.462537 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0553  site-specific tyrosine recombinase XerC  26.97 
 
 
329 aa  92.8  8e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.172687  normal  0.167276 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0401  site-specific tyrosine recombinase XerC  25.29 
 
 
324 aa  92.8  9e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.145415 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0394  tyrosine recombinase XerC  34.87 
 
 
299 aa  92.8  9e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3631  tyrosine recombinase XerC  34.87 
 
 
299 aa  92.8  9e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.465228 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0393  tyrosine recombinase XerC  34.87 
 
 
299 aa  92.8  9e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.426652 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3960  site-specific tyrosine recombinase XerC  24.85 
 
 
311 aa  92  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.011638  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0758  phage integrase family protein  24.47 
 
 
304 aa  92.4  1e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.000222973  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1762  phage/XerD family site-specific recombinase  24.32 
 
 
338 aa  92.4  1e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3835  tyrosine recombinase XerC  25.36 
 
 
304 aa  92  1e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.955587  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1179  site-specific tyrosine recombinase XerC  26.99 
 
 
450 aa  92.4  1e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.0000000142279  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0380  tyrosine recombinase XerC  34.21 
 
 
304 aa  91.3  2e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0722  phage integrase family protein  31.46 
 
 
306 aa  91.3  2e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0599364 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1996  site-specific tyrosine recombinase XerC  24.46 
 
 
300 aa  91.3  2e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2366  integrase family protein  24.48 
 
 
314 aa  91.7  2e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.18523  hitchhiker  0.000000198716 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2746  tyrosine recombinase XerC  24.48 
 
 
314 aa  91.7  2e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1769  tyrosine recombinase XerD  30.3 
 
 
304 aa  91.3  2e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.151783  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3661  site-specific tyrosine recombinase XerC  25.66 
 
 
311 aa  91.3  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002113  tyrosine recombinase XerC  30.12 
 
 
310 aa  90.9  3e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10100  site-specific recombinase XerD  26.53 
 
 
332 aa  90.9  3e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0447  tyrosine recombinase XerC  36.18 
 
 
299 aa  90.9  3e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1457  integrase family protein  23.46 
 
 
326 aa  90.5  4e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0185  site-specific tyrosine recombinase XerC  25.08 
 
 
299 aa  90.1  5e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1268  integrase family protein  27.78 
 
 
353 aa  90.1  5e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0536  site-specific tyrosine recombinase XerC  27 
 
 
300 aa  90.1  5e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.538013  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69710  site-specific tyrosine recombinase XerC  24.78 
 
 
303 aa  90.1  5e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.737312  normal  0.478185 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0840  integrase family protein  27.87 
 
 
294 aa  90.1  6e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.774041 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2332  tyrosine recombinase XerD  26.2 
 
 
292 aa  90.1  6e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00307  site-specific tyrosine recombinase XerC  29.52 
 
 
313 aa  89.7  6e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6023  site-specific tyrosine recombinase XerC  24.78 
 
 
303 aa  90.1  6e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0607  recombinase  26.06 
 
 
296 aa  90.1  6e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0562  site-specific tyrosine recombinase XerD  23.62 
 
 
300 aa  89.7  6e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3971  tyrosine recombinase XerC  34.21 
 
 
306 aa  89.7  7e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1878  tyrosine recombinase XerD  26.3 
 
 
292 aa  89.4  8e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0222  integrase/recombinase XerC  24.69 
 
 
299 aa  89.7  8e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3312  site-specific tyrosine recombinase XerD  32.7 
 
 
298 aa  89.4  1e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0492  phage integrase family site specific recombinase  25.89 
 
 
294 aa  88.6  1e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0248661  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0920  site-specific tyrosine recombinase XerD  31.45 
 
 
299 aa  88.6  1e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0879  site-specific tyrosine recombinase XerD  31.45 
 
 
299 aa  88.6  1e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.201006  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3847  site-specific tyrosine recombinase XerD  31.45 
 
 
299 aa  88.6  1e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.349121 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0128  site-specific tyrosine recombinase XerC  29.52 
 
 
303 aa  89  1e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.742386  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0426  site-specific tyrosine recombinase XerC  25.67 
 
 
321 aa  88.6  1e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3580  tyrosine recombinase XerC  34.21 
 
 
302 aa  89.4  1e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.636062  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1118  tyrosine recombinase XerD  28.24 
 
 
304 aa  89  1e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2117  tyrosine recombinase XerD  33.13 
 
 
298 aa  89  1e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.815623  normal  0.0464222 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2391  site-specific tyrosine recombinase XerC  30.12 
 
 
311 aa  88.6  1e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4127  tyrosine recombinase XerC  25.62 
 
 
301 aa  89  1e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.442069 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1995  site-specific tyrosine recombinase XerD  26 
 
 
302 aa  89.4  1e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0815  site-specific tyrosine recombinase XerD  32.08 
 
 
298 aa  88.2  2e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.624778  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0611  integrase family protein  24.77 
 
 
337 aa  88.2  2e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3275  site-specific tyrosine recombinase XerD  32.08 
 
 
298 aa  88.2  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>