More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BcerKBAB4_5530 on replicon NC_010180
Organism: Bacillus weihenstephanensis KBAB4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007103  pE33L466_0018  site-specific tyrosine recombinase XerS  97.48 
 
 		 358 aa  716    Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000485096  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5530  site-specific tyrosine recombinase XerS  100 
 
 		 357 aa  731    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.267916  hitchhiker  0.00142122 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5532  site-specific tyrosine recombinase XerS  41.41 
 
 		 368 aa  278  1e-73  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000644958 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1302  site-specific tyrosine recombinase XerS  38.3 
 
 		 356 aa  256  3e-67  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.287333  n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0136  site-specific tyrosine recombinase XerS  40.23 
 
 		 361 aa  252  9.000000000000001e-66  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.293476  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0978  site-specific tyrosine recombinase XerS  39.83 
 
 		 356 aa  245  9e-64  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1013  site-specific tyrosine recombinase XerS  40.65 
 
 		 356 aa  243  3.9999999999999997e-63  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00257725  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0151  site-specific tyrosine recombinase XerS  40.47 
 
 		 361 aa  241  1e-62  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0200  site-specific tyrosine recombinase XerS  40.06 
 
 		 361 aa  241  1e-62  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  9.249629999999999e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0311  site-specific tyrosine recombinase XerS  39.24 
 
 		 361 aa  241  2e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1006  site-specific tyrosine recombinase XerS  38.26 
 
 		 356 aa  239  5e-62  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000475631  normal  1 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0261  site-specific tyrosine recombinase XerS  38.6 
 
 		 361 aa  238  1e-61  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0994  site-specific tyrosine recombinase XerS  37.18 
 
 		 359 aa  235  7e-61  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000205377  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0728  site-specific tyrosine recombinase XerC  30.52 
 
 		 330 aa  127  3e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.442089  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1390  site-specific tyrosine recombinase XerC  28.33 
 
 		 328 aa  120  3e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000179914  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1654  site-specific tyrosine recombinase XerC  28.24 
 
 		 330 aa  114  2.0000000000000002e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000000234006  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2195  integrase family protein  28.7 
 
 		 350 aa  111  2.0000000000000002e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1617  site-specific tyrosine recombinase XerC  28.28 
 
 		 330 aa  110  5e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000155402  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1366  site-specific tyrosine recombinase XerC  27.51 
 
 		 450 aa  109  6e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000415693  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11080  phage integrase family protein  32.14 
 
 		 310 aa  108  1e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0105178  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1179  site-specific tyrosine recombinase XerC  28.12 
 
 		 450 aa  106  5e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.0000000142279  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1762  phage/XerD family site-specific recombinase  28.83 
 
 		 338 aa  101  2e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0952  site-specific tyrosine recombinase XerC  27.71 
 
 		 329 aa  101  2e-20  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2699  integrase family protein  26.36 
 
 		 327 aa  99  1e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1473  tyrosine recombinase XerD  27.67 
 
 		 296 aa  97.1  4e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.202075  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2052  tyrosine recombinase XerD  26.36 
 
 		 296 aa  97.1  4e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0564  tyrosine recombinase XerC subunit  27.24 
 
 		 328 aa  94.7  2e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4012  tyrosine recombinase XerC  27.99 
 
 		 294 aa  94.4  3e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00152232  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0688  integrase family protein  26.52 
 
 		 336 aa  93.2  6e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0884  integrase  30.9 
 
 		 302 aa  93.2  7e-18  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.161871  hitchhiker  0.000000000000894527 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0842  hypothetical protein  28.89 
 
 		 290 aa  92.4  1e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0285  tyrosine recombinase XerC  29.08 
 
 		 302 aa  92  1e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0651  tyrosine recombinase XerC subunit  27.53 
 
 		 307 aa  91.3  2e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1982  tyrosine recombinase XerC  29.27 
 
 		 298 aa  90.5  4e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0026523  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0273  tyrosine recombinase XerC  25.47 
 
 		 300 aa  89.7  7e-17  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.007038  normal  0.809464 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0435  integrase family protein  27.52 
 
 		 299 aa  89.7  8e-17  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0611  integrase family protein  27.78 
 
 		 337 aa  89.4  9e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3715  integrase family protein  29.8 
 
 		 298 aa  89.4  1e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0470  tyrosine recombinase XerC  26.79 
 
 		 293 aa  88.2  2e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1624  phage/XerD family site-specific recombinase  26.23 
 
 		 341 aa  88.2  2e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.389199 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0487  tyrosine recombinase XerC  26.93 
 
 		 293 aa  88.2  2e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000269064 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2346  tyrosine recombinase XerC  27.43 
 
 		 302 aa  88.6  2e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.126195  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2509  integrase family protein  35.33 
 
 		 380 aa  87.8  3e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.593152  normal  0.73908 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1769  tyrosine recombinase XerD  29.17 
 
 		 304 aa  87.4  3e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.151783  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0666  Phage integrase, N-terminal SAM- like  26.9 
 
 		 310 aa  87  5e-16  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.555034  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1585  site-specific recombinase XerD-like  25.46 
 
 		 332 aa  87  5e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.264485  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3090  tyrosine recombinase XerD  24.62 
 
 		 320 aa  86.7  5e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0758  phage integrase family protein  25.16 
 
 		 304 aa  86.3  8e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.000222973  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3920  site-specific tyrosine recombinase XerD  32.91 
 
 		 296 aa  85.5  0.000000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000317777  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0716  tyrosine recombinase XerC  26.58 
 
 		 307 aa  84.7  0.000000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.841608  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0590  tyrosine recombinase XerD  28.36 
 
 		 306 aa  85.1  0.000000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0660  integrase family protein  33.54 
 
 		 284 aa  85.1  0.000000000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0478  integrase family protein  26.64 
 
 		 312 aa  84.7  0.000000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1178  tyrosine recombinase XerC subunit  24.19 
 
 		 300 aa  85.1  0.000000000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_623  site-specific recombinase  26.58 
 
 		 307 aa  84.3  0.000000000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0489  tyrosine recombinase XerC  35.1 
 
 		 299 aa  84.3  0.000000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.110232  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0562  integrase/recombinase  29.03 
 
 		 308 aa  84.3  0.000000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0843058  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0409  Phage integrase  25.53 
 
 		 317 aa  84.3  0.000000000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.383536  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1185  tyrosine recombinase XerD  24.23 
 
 		 315 aa  84.3  0.000000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0531401  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4199  site-specific tyrosine recombinase XerD  24.92 
 
 		 296 aa  84  0.000000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00345142  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1038  site-specific tyrosine recombinase XerD  24.92 
 
 		 296 aa  84  0.000000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00331502  normal  0.0102802 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4158  site-specific tyrosine recombinase XerD  32.91 
 
 		 296 aa  83.6  0.000000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.44443  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0704  integrase family protein  24.92 
 
 		 305 aa  83.6  0.000000000000005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000143659  unclonable  0.0000000274126 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3846  site-specific tyrosine recombinase XerD  32.91 
 
 		 296 aa  83.6  0.000000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0256715  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0623  site-specific recombinase  28.7 
 
 		 332 aa  83.6  0.000000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2788  site-specific tyrosine recombinase XerD  32.28 
 
 		 296 aa  83.6  0.000000000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000777667  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4222  site-specific tyrosine recombinase XerD  32.91 
 
 		 296 aa  83.6  0.000000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00160259  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0341  tyrosine recombinase XerC  25.15 
 
 		 317 aa  83.6  0.000000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000100724  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0063  tyrosine recombinase XerC  24.34 
 
 		 304 aa  83.6  0.000000000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0401  integrase family protein  25.3 
 
 		 310 aa  83.6  0.000000000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69710  site-specific tyrosine recombinase XerC  28.94 
 
 		 303 aa  83.6  0.000000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.737312  normal  0.478185 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1113  phage integrase family protein  23.27 
 
 		 364 aa  83.2  0.000000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0671879  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4127  tyrosine recombinase XerC  35.1 
 
 		 301 aa  82.8  0.000000000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.442069 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3999  site-specific tyrosine recombinase XerD  32.28 
 
 		 296 aa  82.8  0.000000000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.189801  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4113  site-specific tyrosine recombinase XerD  32.28 
 
 		 296 aa  82.8  0.000000000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.00015e-24 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3830  site-specific tyrosine recombinase XerD  32.28 
 
 		 296 aa  82.8  0.000000000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1383  integrase family protein  25.08 
 
 		 307 aa  82.8  0.000000000000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4311  site-specific tyrosine recombinase XerD  32.28 
 
 		 296 aa  82.8  0.000000000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.789664  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0325  tyrosine recombinase XerC  27.33 
 
 		 297 aa  82.8  0.000000000000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2391  site-specific tyrosine recombinase XerC  28.08 
 
 		 311 aa  82.8  0.000000000000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0818  tyrosine recombinase XerC  24.91 
 
 		 296 aa  82.4  0.00000000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.368613  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0478  tyrosine recombinase XerD  24.77 
 
 		 319 aa  82.4  0.00000000000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1028  tyrosine recombinase XerD subunit  25.9 
 
 		 313 aa  82  0.00000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00856798  unclonable  0.00000000634873 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1344  integrase family protein  27.53 
 
 		 292 aa  82.4  0.00000000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000678444  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1082  integrase family protein  27.24 
 
 		 290 aa  81.6  0.00000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0626  site-specific tyrosine recombinase XerC  25.82 
 
 		 315 aa  81.6  0.00000000000002  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1996  site-specific tyrosine recombinase XerC  26.56 
 
 		 300 aa  81.3  0.00000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0582  integrase family protein  24.32 
 
 		 330 aa  82  0.00000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.132855 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0476  tyrosine recombinase XerD  25.85 
 
 		 302 aa  81.3  0.00000000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3102  integrase family protein  25.69 
 
 		 301 aa  81.6  0.00000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000184896  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1750  tyrosine recombinase XerD  24.61 
 
 		 294 aa  81.6  0.00000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0918  integrase  27.01 
 
 		 307 aa  81.6  0.00000000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.0200604 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1225  integrase family protein  26.59 
 
 		 301 aa  81.6  0.00000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.103765  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4583  tyrosine recombinase XerD  35.1 
 
 		 317 aa  81.3  0.00000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.422443 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3450  tyrosine recombinase XerD  35.1 
 
 		 322 aa  81.3  0.00000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1337  tyrosine recombinase XerC  24.91 
 
 		 298 aa  81.3  0.00000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0149085  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1312  tyrosine recombinase XerC  24.91 
 
 		 298 aa  81.3  0.00000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.199373  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0574  integrase family protein  26.12 
 
 		 304 aa  80.9  0.00000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000663621  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0517  integrase family protein  25.58 
 
 		 335 aa  80.5  0.00000000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0242  site-specific tyrosine recombinase XerC  26.45 
 
 		 299 aa  80.5  0.00000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.322874  normal  0.826572 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>