More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene pE33L466_0018 on replicon NC_007103
Organism: Bacillus cereus E33L



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007103  pE33L466_0018  site-specific tyrosine recombinase XerS  100 
 
 
358 aa  733    Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000485096  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5530  site-specific tyrosine recombinase XerS  97.48 
 
 
357 aa  716    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.267916  hitchhiker  0.00142122 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5532  site-specific tyrosine recombinase XerS  41.13 
 
 
368 aa  275  8e-73  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000644958 
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0136  site-specific tyrosine recombinase XerS  40.82 
 
 
361 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.293476  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1302  site-specific tyrosine recombinase XerS  37.43 
 
 
356 aa  251  1e-65  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.287333  n/a   
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0200  site-specific tyrosine recombinase XerS  40.64 
 
 
361 aa  244  9.999999999999999e-64  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  9.249629999999999e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0978  site-specific tyrosine recombinase XerS  39.27 
 
 
356 aa  244  1.9999999999999999e-63  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0151  site-specific tyrosine recombinase XerS  41.06 
 
 
361 aa  243  3e-63  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0261  site-specific tyrosine recombinase XerS  39.18 
 
 
361 aa  241  2e-62  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0311  site-specific tyrosine recombinase XerS  39.24 
 
 
361 aa  238  8e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1006  site-specific tyrosine recombinase XerS  37.68 
 
 
356 aa  236  4e-61  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000475631  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1013  site-specific tyrosine recombinase XerS  39.76 
 
 
356 aa  236  5.0000000000000005e-61  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00257725  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0994  site-specific tyrosine recombinase XerS  36.6 
 
 
359 aa  233  6e-60  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000205377  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0728  site-specific tyrosine recombinase XerC  28.86 
 
 
330 aa  125  1e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.442089  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1390  site-specific tyrosine recombinase XerC  28.61 
 
 
328 aa  124  4e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000179914  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1366  site-specific tyrosine recombinase XerC  28.37 
 
 
450 aa  114  3e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000415693  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1654  site-specific tyrosine recombinase XerC  27.95 
 
 
330 aa  112  1.0000000000000001e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000000234006  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1179  site-specific tyrosine recombinase XerC  28.99 
 
 
450 aa  111  2.0000000000000002e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.0000000142279  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2195  integrase family protein  28.74 
 
 
350 aa  110  4.0000000000000004e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11080  phage integrase family protein  31.82 
 
 
310 aa  109  6e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0105178  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1617  site-specific tyrosine recombinase XerC  26.82 
 
 
330 aa  106  5e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000155402  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0952  site-specific tyrosine recombinase XerC  27.56 
 
 
329 aa  103  3e-21  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1762  phage/XerD family site-specific recombinase  30.06 
 
 
338 aa  103  4e-21  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4012  tyrosine recombinase XerC  28.62 
 
 
294 aa  99.4  9e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00152232  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1473  tyrosine recombinase XerD  27.99 
 
 
296 aa  97.8  3e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.202075  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2699  integrase family protein  25.54 
 
 
327 aa  96.7  6e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0564  tyrosine recombinase XerC subunit  28.17 
 
 
328 aa  96.3  8e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2052  tyrosine recombinase XerD  25.84 
 
 
296 aa  94.7  2e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0884  integrase  31.94 
 
 
302 aa  92.8  7e-18  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.161871  hitchhiker  0.000000000000894527 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1524  integrase family protein  28.09 
 
 
300 aa  92  1e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.681425  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0688  integrase family protein  26.91 
 
 
336 aa  92.4  1e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0285  tyrosine recombinase XerC  28.25 
 
 
302 aa  91.3  2e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0842  hypothetical protein  29.21 
 
 
290 aa  90.9  3e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0273  tyrosine recombinase XerC  25.79 
 
 
300 aa  90.5  4e-17  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.007038  normal  0.809464 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0470  tyrosine recombinase XerC  27.1 
 
 
293 aa  90.5  4e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0487  tyrosine recombinase XerC  27.24 
 
 
293 aa  90.5  4e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000269064 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0611  integrase family protein  27.78 
 
 
337 aa  89  1e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2346  tyrosine recombinase XerC  28.37 
 
 
302 aa  89.4  1e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.126195  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0651  tyrosine recombinase XerC subunit  27.22 
 
 
307 aa  88.6  2e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1982  tyrosine recombinase XerC  29.63 
 
 
298 aa  88.6  2e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0026523  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1769  tyrosine recombinase XerD  28.27 
 
 
304 aa  88.6  2e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.151783  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1624  phage/XerD family site-specific recombinase  26.32 
 
 
341 aa  87.8  3e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.389199 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0758  phage integrase family protein  25.16 
 
 
304 aa  87.4  3e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.000222973  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0660  integrase family protein  33.54 
 
 
284 aa  86.7  6e-16  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3715  integrase family protein  29.02 
 
 
298 aa  86.7  6e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3090  tyrosine recombinase XerD  24.92 
 
 
320 aa  86.3  7e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2509  integrase family protein  34.67 
 
 
380 aa  86.3  8e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.593152  normal  0.73908 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0623  site-specific recombinase  28.4 
 
 
332 aa  85.5  0.000000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1585  site-specific recombinase XerD-like  25.46 
 
 
332 aa  85.9  0.000000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.264485  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3102  integrase family protein  26.3 
 
 
301 aa  85.9  0.000000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000184896  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0666  Phage integrase, N-terminal SAM- like  27.22 
 
 
310 aa  84.7  0.000000000000002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.555034  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0435  integrase family protein  27.33 
 
 
299 aa  84.3  0.000000000000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1996  site-specific tyrosine recombinase XerC  26.96 
 
 
300 aa  84.3  0.000000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0409  Phage integrase  26.14 
 
 
317 aa  84  0.000000000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.383536  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1225  integrase family protein  27.16 
 
 
301 aa  83.6  0.000000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.103765  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0704  integrase family protein  25.83 
 
 
305 aa  83.6  0.000000000000004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000143659  unclonable  0.0000000274126 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0063  tyrosine recombinase XerC  24.34 
 
 
304 aa  83.2  0.000000000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0489  tyrosine recombinase XerC  34.44 
 
 
299 aa  83.2  0.000000000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.110232  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0590  tyrosine recombinase XerD  28.47 
 
 
306 aa  82.8  0.000000000000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0341  tyrosine recombinase XerC  25.15 
 
 
317 aa  82.8  0.000000000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000100724  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1178  tyrosine recombinase XerC subunit  24.52 
 
 
300 aa  82.8  0.000000000000008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0492  phage integrase family site specific recombinase  28.57 
 
 
294 aa  82.4  0.00000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0248661  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0818  tyrosine recombinase XerC  24.91 
 
 
296 aa  82  0.00000000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.368613  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1038  site-specific tyrosine recombinase XerD  24.92 
 
 
296 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00331502  normal  0.0102802 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1383  integrase family protein  24.75 
 
 
307 aa  82.4  0.00000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4199  site-specific tyrosine recombinase XerD  24.92 
 
 
296 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00345142  n/a   
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3587  integrase family protein  25.44 
 
 
304 aa  82.4  0.00000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  decreased coverage  0.00000000515843  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1201  phage integrase  24.52 
 
 
301 aa  82  0.00000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0529826  normal  0.150621 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0478  integrase family protein  26.94 
 
 
312 aa  82.4  0.00000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69710  site-specific tyrosine recombinase XerC  28.94 
 
 
303 aa  82  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.737312  normal  0.478185 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1185  tyrosine recombinase XerD  24.23 
 
 
315 aa  82.4  0.00000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0531401  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0626  site-specific tyrosine recombinase XerC  26.71 
 
 
315 aa  82  0.00000000000002  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0716  tyrosine recombinase XerC  26.27 
 
 
307 aa  81.6  0.00000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.841608  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4158  site-specific tyrosine recombinase XerD  25.23 
 
 
296 aa  81.3  0.00000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.44443  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3846  site-specific tyrosine recombinase XerD  25.23 
 
 
296 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0256715  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2391  site-specific tyrosine recombinase XerC  35.53 
 
 
311 aa  81.6  0.00000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1750  tyrosine recombinase XerD  24.92 
 
 
294 aa  82  0.00000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3920  site-specific tyrosine recombinase XerD  24.92 
 
 
296 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000317777  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_623  site-specific recombinase  26.27 
 
 
307 aa  81.6  0.00000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0607  recombinase  24.62 
 
 
296 aa  81.6  0.00000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0574  integrase family protein  25.39 
 
 
304 aa  81.3  0.00000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000663621  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4222  site-specific tyrosine recombinase XerD  25.23 
 
 
296 aa  81.3  0.00000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00160259  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0325  tyrosine recombinase XerC  27.33 
 
 
297 aa  81.6  0.00000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1113  phage integrase family protein  22.7 
 
 
364 aa  81.6  0.00000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0671879  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0825  site-specific tyrosine recombinase XerC  25.7 
 
 
277 aa  81.3  0.00000000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0104756  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0736  site-specific tyrosine recombinase XerC  23.6 
 
 
294 aa  81.6  0.00000000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1344  integrase family protein  27.53 
 
 
292 aa  82  0.00000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000678444  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4583  tyrosine recombinase XerD  35.1 
 
 
317 aa  80.9  0.00000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.422443 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4113  site-specific tyrosine recombinase XerD  24.92 
 
 
296 aa  80.9  0.00000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.00015e-24 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3999  site-specific tyrosine recombinase XerD  24.92 
 
 
296 aa  80.9  0.00000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.189801  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3830  site-specific tyrosine recombinase XerD  24.92 
 
 
296 aa  80.9  0.00000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4127  tyrosine recombinase XerC  34.44 
 
 
301 aa  80.9  0.00000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.442069 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4311  site-specific tyrosine recombinase XerD  24.92 
 
 
296 aa  80.9  0.00000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.789664  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0582  integrase family protein  24.62 
 
 
330 aa  80.9  0.00000000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.132855 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0023  integrase family protein  26.98 
 
 
291 aa  80.5  0.00000000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2788  site-specific tyrosine recombinase XerD  23.08 
 
 
296 aa  80.5  0.00000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000777667  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0476  tyrosine recombinase XerD  25 
 
 
302 aa  80.1  0.00000000000005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0788  phage integrase family protein  22.51 
 
 
293 aa  80.1  0.00000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3042  tyrosine recombinase XerD subunit  25.71 
 
 
294 aa  79.7  0.00000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000138339  normal  0.959316 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0517  integrase family protein  27.67 
 
 
335 aa  79.7  0.00000000000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>