More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BCAH187_C0261 on replicon NC_011655
Organism: Bacillus cereus AH187



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007322  GBAA_pXO1_0200  site-specific tyrosine recombinase XerS  93.35 
 
 
361 aa  685    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  9.249629999999999e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0261  site-specific tyrosine recombinase XerS  100 
 
 
361 aa  745    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0311  site-specific tyrosine recombinase XerS  98.34 
 
 
361 aa  734    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0136  site-specific tyrosine recombinase XerS  80.33 
 
 
361 aa  617  1e-175  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.293476  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0151  site-specific tyrosine recombinase XerS  75.35 
 
 
361 aa  541  1e-153  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5532  site-specific tyrosine recombinase XerS  63.43 
 
 
368 aa  496  1e-139  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000644958 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0018  site-specific tyrosine recombinase XerS  39.18 
 
 
358 aa  246  4e-64  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000485096  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5530  site-specific tyrosine recombinase XerS  38.6 
 
 
357 aa  243  3e-63  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.267916  hitchhiker  0.00142122 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1302  site-specific tyrosine recombinase XerS  37.18 
 
 
356 aa  232  6e-60  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.287333  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0978  site-specific tyrosine recombinase XerS  37.08 
 
 
356 aa  229  7e-59  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1013  site-specific tyrosine recombinase XerS  36.62 
 
 
356 aa  228  2e-58  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00257725  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1006  site-specific tyrosine recombinase XerS  32.41 
 
 
356 aa  209  9e-53  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000475631  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0994  site-specific tyrosine recombinase XerS  32.69 
 
 
359 aa  201  9.999999999999999e-51  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000205377  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2195  integrase family protein  27.51 
 
 
350 aa  113  6e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2699  integrase family protein  27.56 
 
 
327 aa  108  1e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1654  site-specific tyrosine recombinase XerC  28.03 
 
 
330 aa  108  1e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000000234006  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1624  phage/XerD family site-specific recombinase  26.49 
 
 
341 aa  104  3e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.389199 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1390  site-specific tyrosine recombinase XerC  36.53 
 
 
328 aa  103  4e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000179914  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3715  integrase family protein  26.13 
 
 
298 aa  101  2e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0688  integrase family protein  27.44 
 
 
336 aa  101  2e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0063  tyrosine recombinase XerC  23.17 
 
 
304 aa  101  2e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1762  phage/XerD family site-specific recombinase  24.26 
 
 
338 aa  101  3e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11080  phage integrase family protein  31.54 
 
 
310 aa  100  6e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0105178  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0396  tyrosine recombinase XerD  34.59 
 
 
309 aa  99.4  9e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0728  site-specific tyrosine recombinase XerC  37.04 
 
 
330 aa  98.6  2e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.442089  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1617  site-specific tyrosine recombinase XerC  27.51 
 
 
330 aa  98.2  2e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000155402  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0582  integrase family protein  26.57 
 
 
330 aa  98.6  2e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.132855 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004441  site-specific recombinase XerD  26.17 
 
 
305 aa  97.4  3e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0788  phage integrase family protein  28.83 
 
 
293 aa  97.4  3e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0752  phage integrase family site specific recombinase  28 
 
 
309 aa  96.7  5e-19  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.232674  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1995  site-specific tyrosine recombinase XerD  24.61 
 
 
302 aa  95.5  1e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1982  tyrosine recombinase XerC  27.53 
 
 
298 aa  95.9  1e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0026523  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0325  tyrosine recombinase XerC  29.18 
 
 
297 aa  94.7  2e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0447  tyrosine recombinase XerC  27.44 
 
 
299 aa  94.7  2e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4306  integrase/recombinase XerC  35.53 
 
 
299 aa  94  3e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0394  tyrosine recombinase XerC  36.18 
 
 
299 aa  94.4  3e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3631  tyrosine recombinase XerC  36.18 
 
 
299 aa  94.4  3e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.465228 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0393  tyrosine recombinase XerC  36.18 
 
 
299 aa  94.4  3e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.426652 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0952  site-specific tyrosine recombinase XerC  29.33 
 
 
329 aa  94  4e-18  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0623  site-specific recombinase  26.84 
 
 
332 aa  93.2  6e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00956  site-specific tyrosine recombinase XerD  24.61 
 
 
305 aa  92.4  9e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1457  integrase family protein  24.34 
 
 
326 aa  92.4  1e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0562  site-specific tyrosine recombinase XerD  26.61 
 
 
300 aa  92.4  1e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0198  tyrosine recombinase XerC subunit  26.2 
 
 
291 aa  92  1e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0021573 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1524  integrase family protein  27.3 
 
 
300 aa  92.4  1e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.681425  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0564  tyrosine recombinase XerC subunit  26.76 
 
 
328 aa  92  1e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1556  integrase family protein  27.33 
 
 
307 aa  91.3  2e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.36987  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0727  tyrosine recombinase XerD  27.78 
 
 
304 aa  91.7  2e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.689003 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0435  integrase family protein  28.93 
 
 
299 aa  91.7  2e-17  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0273  tyrosine recombinase XerC  25.84 
 
 
300 aa  91.3  2e-17  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.007038  normal  0.809464 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1299  site-specific tyrosine recombinase XerC  27.08 
 
 
291 aa  91.3  2e-17  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00203  tyrosine recombinase  32.2 
 
 
306 aa  91.3  2e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0645  site-specific tyrosine recombinase XerD  31.46 
 
 
299 aa  92  2e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.241995  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0489  tyrosine recombinase XerC  34.87 
 
 
299 aa  91.7  2e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.110232  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1320  tyrosine recombinase XerD  23.26 
 
 
302 aa  90.9  3e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3892  site-specific tyrosine recombinase XerD  28.19 
 
 
299 aa  90.9  3e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.413643  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1996  site-specific tyrosine recombinase XerC  24.24 
 
 
300 aa  91.3  3e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4114  site-specific tyrosine recombinase XerC  26.32 
 
 
322 aa  90.9  3e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3426  tyrosine recombinase XerD  34.39 
 
 
299 aa  91.3  3e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3960  site-specific tyrosine recombinase XerC  26.51 
 
 
311 aa  90.5  5e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.011638  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0611  integrase family protein  24.27 
 
 
337 aa  90.5  5e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1769  tyrosine recombinase XerD  28.53 
 
 
304 aa  90.1  5e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.151783  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1473  tyrosine recombinase XerD  26.2 
 
 
296 aa  90.1  6e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.202075  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0497  tyrosine recombinase XerC  22.76 
 
 
324 aa  89.4  8e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.237269  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0380  tyrosine recombinase XerC  34.87 
 
 
304 aa  89.4  9e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0861  site-specific tyrosine recombinase XerD  33.74 
 
 
299 aa  89  1e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0879  site-specific tyrosine recombinase XerD  34.38 
 
 
299 aa  89  1e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.201006  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2366  integrase family protein  25.07 
 
 
314 aa  89  1e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.18523  hitchhiker  0.000000198716 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2746  tyrosine recombinase XerC  25.07 
 
 
314 aa  89  1e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3847  site-specific tyrosine recombinase XerD  34.38 
 
 
299 aa  89  1e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.349121 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0920  site-specific tyrosine recombinase XerD  34.38 
 
 
299 aa  89  1e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3929  site-specific tyrosine recombinase XerC  26.3 
 
 
299 aa  88.2  2e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000313294  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1314  site-specific tyrosine recombinase XerC  26.3 
 
 
299 aa  87.8  2e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000019497  unclonable  8.39468e-26 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1668  tyrosine recombinase XerD subunit  24.48 
 
 
295 aa  87.8  2e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.179488  normal  0.0195248 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3661  site-specific tyrosine recombinase XerC  26.43 
 
 
311 aa  88.6  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3878  site-specific tyrosine recombinase XerC  26.67 
 
 
299 aa  88.2  2e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000107327  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3312  site-specific tyrosine recombinase XerD  31.94 
 
 
298 aa  88.2  2e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2391  site-specific tyrosine recombinase XerC  30.12 
 
 
311 aa  87.8  3e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1383  integrase family protein  27.6 
 
 
299 aa  87.8  3e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00162011  normal  0.640047 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0492  phage integrase family site specific recombinase  28.29 
 
 
294 aa  87.8  3e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0248661  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0651  tyrosine recombinase XerC subunit  23.12 
 
 
307 aa  87.8  3e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10100  site-specific recombinase XerD  31.4 
 
 
332 aa  87.8  3e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5470  tyrosine recombinase XerD  24.34 
 
 
316 aa  87.8  3e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.602612  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0840  integrase family protein  29.04 
 
 
294 aa  87.4  3e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.774041 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2117  tyrosine recombinase XerD  29.38 
 
 
298 aa  87.4  4e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.815623  normal  0.0464222 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0180  site-specific tyrosine recombinase XerC  26.14 
 
 
324 aa  87.4  4e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1366  site-specific tyrosine recombinase XerC  32.72 
 
 
450 aa  87.4  4e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000415693  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0817  tyrosine recombinase XerD  25.5 
 
 
305 aa  87.4  4e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.763193  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0401  site-specific tyrosine recombinase XerC  25.62 
 
 
324 aa  87  5e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.145415 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1225  integrase family protein  26.71 
 
 
301 aa  87  5e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.103765  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3971  tyrosine recombinase XerC  34.21 
 
 
306 aa  87  5e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3572  site-specific tyrosine recombinase XerC  26.3 
 
 
299 aa  86.7  6e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000685052  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3843  site-specific tyrosine recombinase XerC  26.3 
 
 
299 aa  86.7  6e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.27577e-62 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1268  integrase family protein  28.17 
 
 
353 aa  86.7  6e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013386  Adeg_2179  integrase family protein  24.55 
 
 
288 aa  86.7  6e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.353401  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1202  tyrosine recombinase XerC  23.95 
 
 
304 aa  86.7  6e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.910177  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3590  site-specific tyrosine recombinase XerC  26.3 
 
 
299 aa  86.3  7e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0796955  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0758  phage integrase family protein  32.08 
 
 
304 aa  86.3  7e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.000222973  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1827  tyrosine recombinase XerD  28.46 
 
 
306 aa  86.3  7e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0536  site-specific tyrosine recombinase XerC  26.33 
 
 
300 aa  86.3  8e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.538013  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>