More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BCE_A0151 on replicon NC_005707
Organism: Bacillus cereus ATCC 10987



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_005707  BCE_A0151  site-specific tyrosine recombinase XerS  100 
 
 
361 aa  741    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0136  site-specific tyrosine recombinase XerS  85.32 
 
 
361 aa  649    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.293476  n/a   
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0200  site-specific tyrosine recombinase XerS  75.07 
 
 
361 aa  554  1e-157  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  9.249629999999999e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0261  site-specific tyrosine recombinase XerS  75.35 
 
 
361 aa  555  1e-157  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0311  site-specific tyrosine recombinase XerS  75.35 
 
 
361 aa  553  1e-156  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5532  site-specific tyrosine recombinase XerS  63.43 
 
 
368 aa  494  9.999999999999999e-139  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000644958 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0018  site-specific tyrosine recombinase XerS  41.06 
 
 
358 aa  263  4.999999999999999e-69  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000485096  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5530  site-specific tyrosine recombinase XerS  40.47 
 
 
357 aa  260  2e-68  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.267916  hitchhiker  0.00142122 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1302  site-specific tyrosine recombinase XerS  35.49 
 
 
356 aa  231  1e-59  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.287333  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1013  site-specific tyrosine recombinase XerS  36.9 
 
 
356 aa  226  7e-58  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00257725  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0978  site-specific tyrosine recombinase XerS  34.65 
 
 
356 aa  216  5.9999999999999996e-55  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1006  site-specific tyrosine recombinase XerS  32.13 
 
 
356 aa  208  1e-52  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000475631  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0994  site-specific tyrosine recombinase XerS  30.85 
 
 
359 aa  193  3e-48  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000205377  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2195  integrase family protein  27.79 
 
 
350 aa  110  4.0000000000000004e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2699  integrase family protein  26.99 
 
 
327 aa  106  6e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11080  phage integrase family protein  36.47 
 
 
310 aa  102  1e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0105178  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1366  site-specific tyrosine recombinase XerC  27.4 
 
 
450 aa  100  5e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000415693  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4306  integrase/recombinase XerC  35.53 
 
 
299 aa  98.6  1e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0063  tyrosine recombinase XerC  24.07 
 
 
304 aa  99  1e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1179  site-specific tyrosine recombinase XerC  27.14 
 
 
450 aa  97.4  3e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.0000000142279  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0273  tyrosine recombinase XerC  32.53 
 
 
300 aa  96.7  6e-19  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.007038  normal  0.809464 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1390  site-specific tyrosine recombinase XerC  35.33 
 
 
328 aa  96.3  7e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000179914  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3715  integrase family protein  25.45 
 
 
298 aa  96.3  8e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3580  tyrosine recombinase XerC  35.53 
 
 
302 aa  95.9  9e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.636062  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0728  site-specific tyrosine recombinase XerC  36.97 
 
 
330 aa  94.7  2e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.442089  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1617  site-specific tyrosine recombinase XerC  26.61 
 
 
330 aa  94.7  2e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000155402  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1299  site-specific tyrosine recombinase XerC  32.53 
 
 
291 aa  95.1  2e-18  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0394  tyrosine recombinase XerC  35.53 
 
 
299 aa  94.7  2e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3631  tyrosine recombinase XerC  35.53 
 
 
299 aa  94.7  2e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.465228 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0393  tyrosine recombinase XerC  35.53 
 
 
299 aa  94.7  2e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.426652 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0325  tyrosine recombinase XerC  25.62 
 
 
297 aa  94.4  3e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3971  tyrosine recombinase XerC  35.53 
 
 
306 aa  94.4  3e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1982  tyrosine recombinase XerC  36.77 
 
 
298 aa  94  4e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0026523  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0688  integrase family protein  26.15 
 
 
336 aa  94  4e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1654  site-specific tyrosine recombinase XerC  27.01 
 
 
330 aa  93.2  6e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000000234006  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3450  tyrosine recombinase XerD  24.2 
 
 
322 aa  92.8  8e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0912  integrase/recombinase  33.15 
 
 
304 aa  92.4  1e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0261382  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0180  site-specific tyrosine recombinase XerC  24.47 
 
 
324 aa  92.4  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1996  site-specific tyrosine recombinase XerC  23.4 
 
 
300 aa  92.4  1e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3796  phage integrase family protein  33.15 
 
 
304 aa  92.4  1e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0727  tyrosine recombinase XerD  25.3 
 
 
304 aa  91.7  2e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.689003 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1556  integrase family protein  26.88 
 
 
307 aa  91.3  2e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.36987  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0489  tyrosine recombinase XerC  32.24 
 
 
299 aa  91.7  2e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.110232  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0651  tyrosine recombinase XerC subunit  24.55 
 
 
307 aa  91.7  2e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3993  tyrosine recombinase XerC  35.53 
 
 
306 aa  91.3  2e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3894  tyrosine recombinase XerC  35.53 
 
 
306 aa  91.3  2e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00533729 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0447  tyrosine recombinase XerC  27.55 
 
 
299 aa  91.7  2e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2117  tyrosine recombinase XerD  34.34 
 
 
298 aa  91.7  2e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.815623  normal  0.0464222 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4087  tyrosine recombinase XerC  35.53 
 
 
306 aa  91.3  2e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0169707 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0396  tyrosine recombinase XerD  32.34 
 
 
309 aa  90.9  3e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0788  phage integrase family protein  32.77 
 
 
293 aa  90.9  3e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3398  integrase  36.2 
 
 
293 aa  91.3  3e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.292469  normal  0.438437 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0842  hypothetical protein  23.96 
 
 
290 aa  90.9  3e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1624  phage/XerD family site-specific recombinase  25.15 
 
 
341 aa  90.5  4e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.389199 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1914  integrase/recombinase  32.6 
 
 
304 aa  90.5  4e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00100079  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0564  tyrosine recombinase XerC subunit  25.83 
 
 
328 aa  90.1  5e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4127  tyrosine recombinase XerC  32.24 
 
 
301 aa  89.7  6e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.442069 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0380  tyrosine recombinase XerC  32.24 
 
 
304 aa  89.4  8e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002113  tyrosine recombinase XerC  25 
 
 
310 aa  89.7  8e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1687  tyrosine recombinase XerD subunit  33.54 
 
 
314 aa  89.7  8e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0607  recombinase  32.73 
 
 
296 aa  89.4  9e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0285  tyrosine recombinase XerC  25.83 
 
 
302 aa  89.4  9e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10100  site-specific recombinase XerD  30.23 
 
 
332 aa  88.6  1e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0758  phage integrase family protein  31.45 
 
 
304 aa  88.6  1e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.000222973  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0623  site-specific recombinase  25.37 
 
 
332 aa  89.4  1e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00203  tyrosine recombinase  34.21 
 
 
306 aa  89.4  1e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2169  tyrosine recombinase XerD  33.54 
 
 
298 aa  89  1e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.167772  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0722  phage integrase family protein  30.34 
 
 
306 aa  89.4  1e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0599364 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0952  site-specific tyrosine recombinase XerC  27.64 
 
 
329 aa  88.2  2e-16  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0582  integrase family protein  26.41 
 
 
330 aa  88.2  2e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.132855 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0271  site-specific tyrosine recombinase XerC  27.84 
 
 
351 aa  87.8  3e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.28022  normal  0.462537 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_623  site-specific recombinase  24.02 
 
 
307 aa  87.8  3e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1457  integrase family protein  23.17 
 
 
326 aa  87.4  3e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0497  tyrosine recombinase XerC  21.3 
 
 
324 aa  87.8  3e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.237269  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00307  site-specific tyrosine recombinase XerC  30.12 
 
 
313 aa  87.4  4e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1698  integrase family protein  24.64 
 
 
314 aa  87.4  4e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.23599  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5501  site-specific tyrosine recombinase XerC  23.05 
 
 
299 aa  87  5e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.345753  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004441  site-specific recombinase XerD  23.91 
 
 
305 aa  86.3  8e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0716  tyrosine recombinase XerC  23.95 
 
 
307 aa  86.3  8e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.841608  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3960  site-specific tyrosine recombinase XerC  26.57 
 
 
311 aa  86.3  8e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.011638  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0128  site-specific tyrosine recombinase XerC  30 
 
 
303 aa  86.3  8e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.742386  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1268  integrase family protein  29.37 
 
 
353 aa  86.3  8e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1320  tyrosine recombinase XerD  22.42 
 
 
302 aa  85.9  9e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1286  site-specific tyrosine recombinase XerD  31.93 
 
 
298 aa  85.5  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0511461  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0409  Phage integrase  32.74 
 
 
317 aa  85.5  0.000000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.383536  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0198  tyrosine recombinase XerC subunit  23.7 
 
 
291 aa  85.5  0.000000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0021573 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0536  site-specific tyrosine recombinase XerC  28.27 
 
 
300 aa  85.5  0.000000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.538013  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3102  integrase family protein  27.05 
 
 
301 aa  85.5  0.000000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000184896  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2391  site-specific tyrosine recombinase XerC  30.72 
 
 
311 aa  85.9  0.000000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1524  integrase family protein  30.97 
 
 
300 aa  84.7  0.000000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.681425  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1023  integrase family protein  23.35 
 
 
297 aa  84.7  0.000000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0854512  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2332  tyrosine recombinase XerD  25.83 
 
 
292 aa  85.1  0.000000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2746  tyrosine recombinase XerC  24.04 
 
 
314 aa  84.7  0.000000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0470  tyrosine recombinase XerC  23.6 
 
 
293 aa  84.7  0.000000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0553  site-specific tyrosine recombinase XerC  27.37 
 
 
329 aa  85.1  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.172687  normal  0.167276 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3300  tyrosine recombinase XerD  32.32 
 
 
299 aa  84.7  0.000000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1659  tyrosine recombinase XerD  32.9 
 
 
254 aa  84.7  0.000000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3247  integrase/recombinase XerC  30.92 
 
 
296 aa  84.7  0.000000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2366  integrase family protein  24.04 
 
 
314 aa  84.7  0.000000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.18523  hitchhiker  0.000000198716 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0177  site-specific tyrosine recombinase XerC  33.12 
 
 
323 aa  84  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>