More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_1302 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008527  LACR_1302  site-specific tyrosine recombinase XerS  100 
 
 		 356 aa  726    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.287333  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1013  site-specific tyrosine recombinase XerS  71.91 
 
 		 356 aa  529  1e-149  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00257725  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0978  site-specific tyrosine recombinase XerS  73.03 
 
 		 356 aa  520  1e-146  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0994  site-specific tyrosine recombinase XerS  44.26 
 
 		 359 aa  298  7e-80  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000205377  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1006  site-specific tyrosine recombinase XerS  43.9 
 
 		 356 aa  291  1e-77  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000475631  normal  1 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5530  site-specific tyrosine recombinase XerS  38.3 
 
 		 357 aa  256  3e-67  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.267916  hitchhiker  0.00142122 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0018  site-specific tyrosine recombinase XerS  37.43 
 
 		 358 aa  251  1e-65  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000485096  n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0136  site-specific tyrosine recombinase XerS  36.34 
 
 		 361 aa  231  1e-59  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.293476  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5532  site-specific tyrosine recombinase XerS  38.03 
 
 		 368 aa  228  8e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000644958 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0261  site-specific tyrosine recombinase XerS  37.18 
 
 		 361 aa  223  4e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0200  site-specific tyrosine recombinase XerS  37.75 
 
 		 361 aa  223  4.9999999999999996e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  9.249629999999999e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0311  site-specific tyrosine recombinase XerS  37.18 
 
 		 361 aa  222  6e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0151  site-specific tyrosine recombinase XerS  35.49 
 
 		 361 aa  213  3.9999999999999995e-54  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0728  site-specific tyrosine recombinase XerC  30.24 
 
 		 330 aa  109  8.000000000000001e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.442089  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2391  site-specific tyrosine recombinase XerC  36.42 
 
 		 311 aa  101  3e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0063  tyrosine recombinase XerC  27.48 
 
 		 304 aa  100  4e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2195  integrase family protein  26.37 
 
 		 350 aa  99.8  6e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0435  integrase family protein  31.14 
 
 		 299 aa  98.6  2e-19  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1225  integrase family protein  28.63 
 
 		 301 aa  97.1  4e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.103765  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002113  tyrosine recombinase XerC  35.1 
 
 		 310 aa  97.1  5e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00307  site-specific tyrosine recombinase XerC  35.1 
 
 		 313 aa  96.3  7e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0688  integrase family protein  28.96 
 
 		 336 aa  95.5  1e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11080  phage integrase family protein  30.38 
 
 		 310 aa  94.4  3e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0105178  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0128  site-specific tyrosine recombinase XerC  33.11 
 
 		 303 aa  94  4e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.742386  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1185  tyrosine recombinase XerD  26.5 
 
 		 315 aa  94  4e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0531401  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1762  phage/XerD family site-specific recombinase  27.69 
 
 		 338 aa  93.2  7e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1654  site-specific tyrosine recombinase XerC  29.64 
 
 		 330 aa  92.4  1e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000000234006  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1982  tyrosine recombinase XerC  27.78 
 
 		 298 aa  92.4  1e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0026523  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0318  site-specific tyrosine recombinase XerC  29.96 
 
 		 300 aa  90.5  4e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0517  integrase family protein  27.55 
 
 		 335 aa  90.1  6e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0818  tyrosine recombinase XerC  28.23 
 
 		 296 aa  89.7  7e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.368613  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3981  site-specific tyrosine recombinase XerC  34.44 
 
 		 300 aa  89.7  7e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.105897  normal  0.285215 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1366  site-specific tyrosine recombinase XerC  28.89 
 
 		 450 aa  89.4  9e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000415693  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1390  site-specific tyrosine recombinase XerC  26.5 
 
 		 328 aa  88.6  2e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000179914  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1299  site-specific tyrosine recombinase XerC  32.45 
 
 		 291 aa  87.4  3e-16  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1282  tyrosine recombinase XerD  26.01 
 
 		 295 aa  87.4  4e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.63418  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5291  site-specific tyrosine recombinase XerC  25.96 
 
 		 299 aa  86.7  5e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1202  tyrosine recombinase XerC  27.95 
 
 		 304 aa  87  5e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.910177  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5139  site-specific tyrosine recombinase XerC  27.18 
 
 		 299 aa  86.7  5e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1179  site-specific tyrosine recombinase XerC  28.33 
 
 		 450 aa  86.7  5e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.0000000142279  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2528  tyrosine recombinase XerC  27.27 
 
 		 294 aa  86.7  6e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.237042 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4127  tyrosine recombinase XerC  34.44 
 
 		 301 aa  86.7  6e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.442069 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0447  tyrosine recombinase XerC  35.1 
 
 		 299 aa  86.7  6e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4277  site-specific tyrosine recombinase XerC  28.69 
 
 		 300 aa  86.3  7e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0242  site-specific tyrosine recombinase XerC  27.24 
 
 		 299 aa  86.3  7e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.322874  normal  0.826572 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4159  site-specific tyrosine recombinase XerC  28.69 
 
 		 300 aa  86.3  7e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.937296  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4177  site-specific tyrosine recombinase XerC  28.69 
 
 		 300 aa  86.3  7e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.225708  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4229  site-specific tyrosine recombinase XerC  28.69 
 
 		 300 aa  85.9  9e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4336  site-specific tyrosine recombinase XerC  28.69 
 
 		 300 aa  85.9  9e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0582  integrase family protein  26.09 
 
 		 330 aa  85.9  0.000000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.132855 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0369  site-specific tyrosine recombinase XerD  35.85 
 
 		 305 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1067  site-specific tyrosine recombinase XerD  35.85 
 
 		 305 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0911  site-specific tyrosine recombinase XerD  35.85 
 
 		 333 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0712  integrase family protein  27.3 
 
 		 285 aa  85.5  0.000000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00227312  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0669  site-specific tyrosine recombinase XerD  35.85 
 
 		 305 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0914  site-specific tyrosine recombinase XerD  35.85 
 
 		 333 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.1246  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0497  tyrosine recombinase XerC  24.76 
 
 		 324 aa  85.5  0.000000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.237269  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0118  site-specific tyrosine recombinase XerD  35.85 
 
 		 333 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.412982  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03687  site-specific tyrosine recombinase XerC  32.45 
 
 		 298 aa  84.7  0.000000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.446663  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1205  integrase/recombinase XerD  25.89 
 
 		 274 aa  84.7  0.000000000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2504  site-specific tyrosine recombinase XerD  35.85 
 
 		 329 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0185  site-specific tyrosine recombinase XerC  27.78 
 
 		 299 aa  85.1  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5250  site-specific tyrosine recombinase XerC  32.45 
 
 		 298 aa  85.1  0.000000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03636  hypothetical protein  32.45 
 
 		 298 aa  84.7  0.000000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.487194  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0952  site-specific tyrosine recombinase XerC  27.21 
 
 		 329 aa  85.1  0.000000000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4168  tyrosine recombinase XerC  32.45 
 
 		 298 aa  84.3  0.000000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4330  site-specific tyrosine recombinase XerC  32.45 
 
 		 298 aa  84.3  0.000000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4036  site-specific tyrosine recombinase XerC  32.45 
 
 		 298 aa  84.3  0.000000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2052  tyrosine recombinase XerD  25.16 
 
 		 296 aa  84.3  0.000000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5117  tyrosine recombinase XerD  34.78 
 
 		 327 aa  84.3  0.000000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.843466 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2117  tyrosine recombinase XerD  25.08 
 
 		 298 aa  84.3  0.000000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.815623  normal  0.0464222 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0737  site-specific tyrosine recombinase XerD  36.13 
 
 		 316 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.088128  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1099  tyrosine recombinase XerD  33.55 
 
 		 296 aa  84.3  0.000000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0726  site-specific tyrosine recombinase XerD  35.44 
 
 		 333 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.218987  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4177  site-specific tyrosine recombinase XerC  32.45 
 
 		 298 aa  84.3  0.000000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0208532 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4196  site-specific tyrosine recombinase XerC  32.45 
 
 		 298 aa  84.3  0.000000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0689633  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4271  site-specific tyrosine recombinase XerC  32.45 
 
 		 298 aa  84.3  0.000000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5230  site-specific tyrosine recombinase XerC  26.83 
 
 		 299 aa  83.6  0.000000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1383  integrase family protein  24.62 
 
 		 307 aa  84  0.000000000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1585  site-specific recombinase XerD-like  25.97 
 
 		 332 aa  83.6  0.000000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.264485  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1531  phage integrase family protein  24.19 
 
 		 311 aa  83.2  0.000000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.504949 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3580  tyrosine recombinase XerC  34.9 
 
 		 302 aa  83.2  0.000000000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.636062  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0222  integrase/recombinase XerC  27.38 
 
 		 299 aa  83.2  0.000000000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4429  tyrosine recombinase XerD  25.44 
 
 		 301 aa  83.2  0.000000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0676058  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1617  site-specific tyrosine recombinase XerC  27.44 
 
 		 330 aa  82.8  0.000000000000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000155402  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0489  tyrosine recombinase XerC  32.89 
 
 		 299 aa  82.8  0.000000000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.110232  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2607  site-specific tyrosine recombinase XerD  34.59 
 
 		 322 aa  82.8  0.000000000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1025  tyrosine recombinase XerD subunit  25.77 
 
 		 302 aa  82.8  0.000000000000008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5891  site-specific tyrosine recombinase XerD  34.59 
 
 		 316 aa  82.8  0.000000000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.51818 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0611  integrase family protein  25.37 
 
 		 337 aa  82.8  0.000000000000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2478  site-specific tyrosine recombinase XerD  34.81 
 
 		 322 aa  82.8  0.000000000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0183983 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0234  site-specific tyrosine recombinase XerC  26.45 
 
 		 302 aa  82.8  0.000000000000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1215  tyrosine recombinase XerD  25.85 
 
 		 302 aa  82  0.00000000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.157843  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4306  integrase/recombinase XerC  34.23 
 
 		 299 aa  82  0.00000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0380  tyrosine recombinase XerC  32.45 
 
 		 304 aa  82.4  0.00000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1320  tyrosine recombinase XerD  34.64 
 
 		 302 aa  82.4  0.00000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1023  tyrosine recombinase XerC subunit  26.88 
 
 		 307 aa  82.4  0.00000000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.554982  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1142  tyrosine recombinase XerD  25.24 
 
 		 295 aa  82.4  0.00000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0393  tyrosine recombinase XerC  33.56 
 
 		 299 aa  82  0.00000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.426652 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3247  integrase/recombinase XerC  33.11 
 
 		 296 aa  81.3  0.00000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>