More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SAG0978 on replicon NC_004116
Organism: Streptococcus agalactiae 2603V/R



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004116  SAG0978  site-specific tyrosine recombinase XerS  100 
 
 
356 aa  727    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1013  site-specific tyrosine recombinase XerS  81.74 
 
 
356 aa  591  1e-168  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00257725  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1302  site-specific tyrosine recombinase XerS  73.03 
 
 
356 aa  535  1e-151  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.287333  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1006  site-specific tyrosine recombinase XerS  46.47 
 
 
356 aa  305  7e-82  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000475631  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0994  site-specific tyrosine recombinase XerS  44.66 
 
 
359 aa  295  6e-79  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000205377  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5530  site-specific tyrosine recombinase XerS  39.83 
 
 
357 aa  253  4.0000000000000004e-66  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.267916  hitchhiker  0.00142122 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0018  site-specific tyrosine recombinase XerS  39.27 
 
 
358 aa  251  1e-65  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000485096  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5532  site-specific tyrosine recombinase XerS  38.38 
 
 
368 aa  238  1e-61  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000644958 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0261  site-specific tyrosine recombinase XerS  37.08 
 
 
361 aa  228  1e-58  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0200  site-specific tyrosine recombinase XerS  36.9 
 
 
361 aa  228  2e-58  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  9.249629999999999e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0311  site-specific tyrosine recombinase XerS  36.8 
 
 
361 aa  224  2e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0136  site-specific tyrosine recombinase XerS  35.49 
 
 
361 aa  223  3e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.293476  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0151  site-specific tyrosine recombinase XerS  34.65 
 
 
361 aa  204  2e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2195  integrase family protein  30.75 
 
 
350 aa  107  4e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11080  phage integrase family protein  33.33 
 
 
310 aa  100  4e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0105178  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0435  integrase family protein  30.72 
 
 
299 aa  98.6  1e-19  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2391  site-specific tyrosine recombinase XerC  30.23 
 
 
311 aa  97.4  3e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3981  site-specific tyrosine recombinase XerC  30.37 
 
 
300 aa  97.8  3e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.105897  normal  0.285215 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1225  integrase family protein  30.2 
 
 
301 aa  96.3  7e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.103765  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1390  site-specific tyrosine recombinase XerC  30.11 
 
 
328 aa  96.3  7e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000179914  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0063  tyrosine recombinase XerC  27.16 
 
 
304 aa  95.9  9e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0728  site-specific tyrosine recombinase XerC  27.93 
 
 
330 aa  91.3  2e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.442089  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0952  site-specific tyrosine recombinase XerC  29.66 
 
 
329 aa  91.3  2e-17  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2052  tyrosine recombinase XerD  30.74 
 
 
296 aa  91.3  2e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1982  tyrosine recombinase XerC  30.5 
 
 
298 aa  90.9  3e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0026523  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4429  tyrosine recombinase XerD  24.7 
 
 
301 aa  91.3  3e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0676058  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03687  site-specific tyrosine recombinase XerC  29.08 
 
 
298 aa  90.5  4e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.446663  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4168  tyrosine recombinase XerC  29.08 
 
 
298 aa  90.5  4e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4177  site-specific tyrosine recombinase XerC  29.08 
 
 
298 aa  90.5  4e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0208532 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4196  site-specific tyrosine recombinase XerC  29.08 
 
 
298 aa  90.5  4e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0689633  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03636  hypothetical protein  29.08 
 
 
298 aa  90.5  4e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.487194  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4271  site-specific tyrosine recombinase XerC  29.08 
 
 
298 aa  90.5  4e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4036  site-specific tyrosine recombinase XerC  29.08 
 
 
298 aa  90.5  4e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0842  hypothetical protein  31.8 
 
 
290 aa  90.5  4e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4330  site-specific tyrosine recombinase XerC  29.08 
 
 
298 aa  90.5  4e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5250  site-specific tyrosine recombinase XerC  29.08 
 
 
298 aa  90.1  5e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4159  site-specific tyrosine recombinase XerC  28.29 
 
 
300 aa  90.1  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.937296  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4277  site-specific tyrosine recombinase XerC  28.29 
 
 
300 aa  90.1  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4177  site-specific tyrosine recombinase XerC  28.29 
 
 
300 aa  90.1  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.225708  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4229  site-specific tyrosine recombinase XerC  28.29 
 
 
300 aa  89.7  6e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4336  site-specific tyrosine recombinase XerC  28.29 
 
 
300 aa  89.7  6e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1585  site-specific recombinase XerD-like  28.02 
 
 
332 aa  89.7  7e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.264485  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0047  tyrosine recombinase XerC  30.47 
 
 
298 aa  89.4  8e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0470  tyrosine recombinase XerC  29.49 
 
 
293 aa  89.4  8e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2699  integrase family protein  25.72 
 
 
327 aa  89.4  9e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0452  tyrosine recombinase XerC subunit  27.97 
 
 
335 aa  89.4  9e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.577676  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1099  tyrosine recombinase XerD  29.69 
 
 
296 aa  89.4  9e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0651  tyrosine recombinase XerC subunit  29.64 
 
 
307 aa  89  1e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00307  site-specific tyrosine recombinase XerC  26.83 
 
 
313 aa  89  1e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0318  site-specific tyrosine recombinase XerC  29.39 
 
 
300 aa  88.2  2e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1383  integrase family protein  29.62 
 
 
299 aa  87.8  2e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00162011  normal  0.640047 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002113  tyrosine recombinase XerC  27.84 
 
 
310 aa  88.2  2e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1215  tyrosine recombinase XerD  28.22 
 
 
302 aa  87.8  3e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.157843  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_998  integrase/recombinase  28.22 
 
 
302 aa  87.4  3e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2117  tyrosine recombinase XerD  26.38 
 
 
298 aa  87.4  4e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.815623  normal  0.0464222 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0487  tyrosine recombinase XerC  30 
 
 
293 aa  87.4  4e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000269064 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1733  integrase family protein  29.45 
 
 
333 aa  86.7  5e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0273  tyrosine recombinase XerC  26.2 
 
 
300 aa  87  5e-16  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.007038  normal  0.809464 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0574  integrase family protein  28.88 
 
 
304 aa  87  5e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000663621  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0128  site-specific tyrosine recombinase XerC  33.77 
 
 
303 aa  87  5e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.742386  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1914  integrase/recombinase  34.36 
 
 
304 aa  86.3  7e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00100079  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4696  integrase family protein  34.64 
 
 
306 aa  86.3  7e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_623  site-specific recombinase  28.52 
 
 
307 aa  85.9  9e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2346  tyrosine recombinase XerC  26.4 
 
 
302 aa  85.9  9e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.126195  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3796  phage integrase family protein  34.36 
 
 
304 aa  85.9  9e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3843  site-specific tyrosine recombinase XerC  28.23 
 
 
299 aa  85.9  0.000000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.27577e-62 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0712  integrase family protein  27.08 
 
 
285 aa  85.1  0.000000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00227312  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0716  tyrosine recombinase XerC  29.02 
 
 
307 aa  85.9  0.000000000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.841608  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1185  tyrosine recombinase XerD  25.63 
 
 
315 aa  85.9  0.000000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0531401  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3572  site-specific tyrosine recombinase XerC  28.23 
 
 
299 aa  85.9  0.000000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000685052  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1762  phage/XerD family site-specific recombinase  27.8 
 
 
338 aa  85.5  0.000000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0912  integrase/recombinase  34.36 
 
 
304 aa  85.5  0.000000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0261382  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1025  tyrosine recombinase XerD subunit  27.87 
 
 
302 aa  85.5  0.000000000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3971  tyrosine recombinase XerC  35.76 
 
 
306 aa  85.1  0.000000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3682  site-specific tyrosine recombinase XerC  28.23 
 
 
299 aa  85.1  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.245295  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3878  site-specific tyrosine recombinase XerC  28.63 
 
 
299 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000107327  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3969  site-specific tyrosine recombinase XerC  28.23 
 
 
299 aa  85.1  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000391393  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3894  tyrosine recombinase XerC  35.76 
 
 
306 aa  84.7  0.000000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00533729 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3993  tyrosine recombinase XerC  35.76 
 
 
306 aa  84.7  0.000000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1654  site-specific tyrosine recombinase XerC  27.76 
 
 
330 aa  85.1  0.000000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000000234006  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0185  site-specific tyrosine recombinase XerC  27.67 
 
 
302 aa  84.3  0.000000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.182372  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2260  integrase family protein  29.02 
 
 
395 aa  84.3  0.000000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.46728  normal  0.0539974 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4087  tyrosine recombinase XerC  35.76 
 
 
306 aa  84.3  0.000000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0169707 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3929  site-specific tyrosine recombinase XerC  27.53 
 
 
299 aa  84.3  0.000000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000313294  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1320  tyrosine recombinase XerD  27.78 
 
 
302 aa  84.3  0.000000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4127  tyrosine recombinase XerC  34.44 
 
 
301 aa  84  0.000000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.442069 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3590  site-specific tyrosine recombinase XerC  27.82 
 
 
299 aa  83.6  0.000000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0796955  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0234  site-specific tyrosine recombinase XerC  27.84 
 
 
302 aa  83.6  0.000000000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3873  site-specific tyrosine recombinase XerC  33.77 
 
 
299 aa  83.2  0.000000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00557083  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1524  integrase family protein  35.71 
 
 
300 aa  83.2  0.000000000000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.681425  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0393  tyrosine recombinase XerC  27.98 
 
 
321 aa  83.2  0.000000000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2942  site-specific tyrosine recombinase XerD  26.35 
 
 
318 aa  83.2  0.000000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2986  site-specific tyrosine recombinase XerD  26.35 
 
 
318 aa  83.2  0.000000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0431132 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1668  tyrosine recombinase XerD subunit  22.36 
 
 
295 aa  83.2  0.000000000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.179488  normal  0.0195248 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0967  integrase family protein  27.37 
 
 
373 aa  82.8  0.000000000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2957  site-specific tyrosine recombinase XerD  26.35 
 
 
318 aa  82.8  0.000000000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.271721  normal  0.636956 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0198  tyrosine recombinase XerC subunit  27.04 
 
 
291 aa  82.8  0.000000000000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0021573 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1314  site-specific tyrosine recombinase XerC  32.68 
 
 
299 aa  82  0.00000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000019497  unclonable  8.39468e-26 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1971  tyrosine recombinase XerD subunit  28.3 
 
 
309 aa  82  0.00000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000860406  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0285  tyrosine recombinase XerC  35.19 
 
 
302 aa  82.4  0.00000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>