More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene JJD26997_0872 on replicon NC_009707
Organism: Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009707  JJD26997_0872  hypothetical protein  100 
 
 		 286 aa  567  1e-161  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000507301  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1094  phage integrase family site specific recombinase  85.65 
 
 		 223 aa  368  1e-101  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.331299  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1037  phage integrase family site specific recombinase  100 
 
 		 116 aa  205  6e-52  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.374682  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1095  hypothetical protein  97.67 
 
 		 86 aa  168  9e-41  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.698699  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3749  phage integrase family protein  34.94 
 
 		 318 aa  161  1e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00852374  n/a   
 
 
-
 
NC_009795  CCC13826_0617  phage integrase family site specific recombinase  30.94 
 
 		 329 aa  134  1.9999999999999998e-30  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.0000798153  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1268  integrase family protein  30.71 
 
 		 353 aa  92  9e-18  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0843  phage integrase family site specific recombinase  31.2 
 
 		 354 aa  84.7  0.000000000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00824905  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0105  hydrogenase expression/formation protein  29.49 
 
 		 354 aa  79  0.00000000000008  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2090  transport protein  29.49 
 
 		 353 aa  79  0.00000000000008  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0326537  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1991  metallo-beta-lactamase family protein  29.49 
 
 		 353 aa  79  0.00000000000008  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0106  phage integrase family protein  25.09 
 
 		 295 aa  76.6  0.0000000000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0169  phage integrase family protein  27.92 
 
 		 282 aa  75.1  0.000000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0558238  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1531  phage integrase family protein  25 
 
 		 311 aa  74.7  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.504949 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1132  phage integrase family site specific recombinase  29.6 
 
 		 352 aa  73.6  0.000000000004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1012  phage integrase family site specific recombinase  29.49 
 
 		 354 aa  70.9  0.00000000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000959514  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0735  integrase/recombinase  29.49 
 
 		 355 aa  70.5  0.00000000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  decreased coverage  0.000138239  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0950  phage integrase family site specific recombinase  29.49 
 
 		 354 aa  70.1  0.00000000004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0218535  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0879  phage integrase family site specific recombinase  29.49 
 
 		 354 aa  70.1  0.00000000004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.159654  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7593  integrase family protein  25.45 
 
 		 331 aa  69.7  0.00000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1611  tyrosine recombinase  24.58 
 
 		 308 aa  69.3  0.00000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.4794 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1520  tyrosine recombinase XerD  21.79 
 
 		 362 aa  68.9  0.00000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000383292 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1337  tyrosine recombinase XerC  23.69 
 
 		 298 aa  68.2  0.0000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0149085  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3096  tyrosine recombinase XerD subunit  24.52 
 
 		 311 aa  68.9  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00033868  normal  0.385268 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1312  tyrosine recombinase XerC  23.69 
 
 		 298 aa  68.2  0.0000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.199373  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1003  tyrosine recombinase XerD subunit  26.48 
 
 		 302 aa  68.6  0.0000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.497558  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1082  integrase family protein  24.49 
 
 		 290 aa  67.8  0.0000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0787  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E-like protein  27.74 
 
 		 320 aa  67.4  0.0000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  decreased coverage  0.00453269  unclonable  0.000000000000100471 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19920  tyrosine recombinase XerD  23.4 
 
 		 317 aa  67  0.0000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.210765  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6955  integrase family protein  24.53 
 
 		 343 aa  67  0.0000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1521  tyrosine recombinase XerD  22.29 
 
 		 346 aa  66.6  0.0000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.531713  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2815  integrase/recombinase XerD  25.08 
 
 		 311 aa  66.2  0.0000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1481  phage integrase family protein  25.42 
 
 		 311 aa  65.9  0.0000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0281722  normal  0.205606 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7620  integrase family protein  24.53 
 
 		 343 aa  65.9  0.0000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.998258  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2452  tyrosine recombinase XerD  21.86 
 
 		 306 aa  65.1  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0952029  normal  0.728507 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1145  tyrosine recombinase, phage integrase family  24.5 
 
 		 301 aa  65.5  0.000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.00135559  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1300  tyrosine recombinase XerD subunit  23.81 
 
 		 297 aa  65.1  0.000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1023  integrase family protein  21.95 
 
 		 297 aa  64.7  0.000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0854512  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2501  site-specific tyrosine recombinase XerC  24.16 
 
 		 312 aa  64.3  0.000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.504706  normal  0.936606 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0788  phage integrase family protein  28.57 
 
 		 293 aa  63.5  0.000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0447  phage integrase family site specific recombinase  25.99 
 
 		 307 aa  63.5  0.000000004  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2124  phage integrase family protein  22.19 
 
 		 301 aa  63.2  0.000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.308322  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0135  integrase family protein  26.23 
 
 		 322 aa  62.8  0.000000007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0689406  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0660  integrase family protein  27.66 
 
 		 284 aa  62.4  0.000000008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12664  integrase  22.97 
 
 		 332 aa  61.6  0.00000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000304658  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1560  tyrosine recombinase XerD  18.92 
 
 		 331 aa  62  0.00000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.736869  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0676  tyrosine recombinase XerD subunit  23.94 
 
 		 296 aa  61.6  0.00000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0818  tyrosine recombinase XerC  23.73 
 
 		 296 aa  61.2  0.00000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.368613  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3102  integrase family protein  20.65 
 
 		 301 aa  61.2  0.00000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000184896  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1457  integrase family protein  23.72 
 
 		 326 aa  61.2  0.00000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4429  tyrosine recombinase XerD  23.18 
 
 		 301 aa  60.8  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0676058  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3139  phage integrase family protein  22.4 
 
 		 344 aa  60.8  0.00000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.424721  normal  0.214127 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0092  integrase family protein  26.95 
 
 		 270 aa  60.8  0.00000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.554655  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1344  integrase family protein  21.89 
 
 		 292 aa  60.8  0.00000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000678444  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0370  phage integrase family protein  29.63 
 
 		 304 aa  60.1  0.00000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2994  tyrosine recombinase XerD  22.26 
 
 		 315 aa  60.1  0.00000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2257  site-specific tyrosine recombinase XerD  23.53 
 
 		 299 aa  60.1  0.00000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.977256  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3108  integrase family protein  29.11 
 
 		 292 aa  60.1  0.00000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000512092  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0083  site-specific tyrosine recombinase XerC  22.8 
 
 		 322 aa  59.3  0.00000006  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0817  tyrosine recombinase XerD  26.92 
 
 		 305 aa  58.9  0.00000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.763193  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2489  tyrosine recombinase XerD  21.61 
 
 		 318 aa  58.9  0.00000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.189208  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1060  tyrosine recombinase XerD  25.59 
 
 		 295 aa  58.5  0.0000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.17947  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0758  phage integrase family protein  21.5 
 
 		 304 aa  58.5  0.0000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.000222973  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1839  integrase family protein  22.18 
 
 		 310 aa  58.5  0.0000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1273  phage integrase  25.8 
 
 		 331 aa  58.9  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.010146 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0722  phage integrase family protein  22.15 
 
 		 306 aa  58.5  0.0000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0599364 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1932  tyrosine recombinase XerD  21.26 
 
 		 310 aa  58.9  0.0000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4199  site-specific tyrosine recombinase XerD  23.32 
 
 		 296 aa  58.2  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00345142  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2992  tyrosine recombinase XerD  22.93 
 
 		 308 aa  58.2  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1971  tyrosine recombinase XerD subunit  21.62 
 
 		 309 aa  57.8  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000860406  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3929  site-specific tyrosine recombinase XerC  24.69 
 
 		 299 aa  57.8  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000313294  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0574  integrase family protein  23.51 
 
 		 304 aa  57.8  0.0000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000663621  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2809  phage integrase family protein  25.42 
 
 		 311 aa  57.8  0.0000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1038  site-specific tyrosine recombinase XerD  23.32 
 
 		 296 aa  58.2  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00331502  normal  0.0102802 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0359  tyrosine recombinase XerD  23.83 
 
 		 290 aa  57.8  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00723526 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3500  site-specific tyrosine recombinase XerD  22.4 
 
 		 314 aa  57.8  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.385537  normal  0.347515 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3920  site-specific tyrosine recombinase XerD  22.97 
 
 		 296 aa  57.4  0.0000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000317777  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1647  phage integrase family protein  27.04 
 
 		 322 aa  57.4  0.0000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0765801  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1314  site-specific tyrosine recombinase XerC  24.69 
 
 		 299 aa  57.4  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000019497  unclonable  8.39468e-26 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1668  tyrosine recombinase XerD subunit  25.68 
 
 		 295 aa  57  0.0000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.179488  normal  0.0195248 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1585  tyrosine recombinase XerD  23.59 
 
 		 295 aa  57  0.0000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4222  site-specific tyrosine recombinase XerD  22.97 
 
 		 296 aa  56.6  0.0000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00160259  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4158  site-specific tyrosine recombinase XerD  22.97 
 
 		 296 aa  56.6  0.0000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.44443  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1524  integrase family protein  24.84 
 
 		 300 aa  57  0.0000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.681425  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3153  tyrosine recombinase XerD  20.43 
 
 		 443 aa  56.6  0.0000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.408525  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1996  site-specific tyrosine recombinase XerC  24.13 
 
 		 300 aa  56.6  0.0000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1554  tyrosine recombinase XerD  23.59 
 
 		 295 aa  57  0.0000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3654  site-specific tyrosine recombinase XerC  24.69 
 
 		 301 aa  56.6  0.0000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000489449  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0435  integrase family protein  23.36 
 
 		 299 aa  56.6  0.0000005  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0519  phage integrase family protein  24.5 
 
 		 300 aa  56.6  0.0000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.24612  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2933  site-specific tyrosine recombinase XerC  21.78 
 
 		 313 aa  56.6  0.0000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.83049  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1178  tyrosine recombinase XerC subunit  25.32 
 
 		 300 aa  56.6  0.0000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3999  site-specific tyrosine recombinase XerD  22.97 
 
 		 296 aa  56.2  0.0000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.189801  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3830  site-specific tyrosine recombinase XerD  22.97 
 
 		 296 aa  56.2  0.0000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3846  site-specific tyrosine recombinase XerD  22.97 
 
 		 296 aa  56.2  0.0000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0256715  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4311  site-specific tyrosine recombinase XerD  22.97 
 
 		 296 aa  56.2  0.0000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.789664  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4113  site-specific tyrosine recombinase XerD  22.97 
 
 		 296 aa  56.2  0.0000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.00015e-24 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2381  site-specific tyrosine recombinase XerC  22.8 
 
 		 311 aa  55.8  0.0000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1241  tyrosine recombinase XerD  22.3 
 
 		 311 aa  56.2  0.0000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.657845  normal  0.578091 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0452  tyrosine recombinase XerC subunit  23.27 
 
 		 335 aa  55.8  0.0000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.577676  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>