More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene JJD26997_1037 on replicon NC_009707
Organism: Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009707  JJD26997_1037  phage integrase family site specific recombinase  100 
 
 		 116 aa  233  9e-61  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.374682  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0872  hypothetical protein  100 
 
 		 286 aa  205  1e-52  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000507301  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1094  phage integrase family site specific recombinase  97.14 
 
 		 223 aa  204  2e-52  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.331299  n/a   
 
 
-
 
NC_009795  CCC13826_0617  phage integrase family site specific recombinase  41.86 
 
 		 329 aa  72.4  0.000000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.0000798153  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3749  phage integrase family protein  38.38 
 
 		 318 aa  69.3  0.00000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00852374  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1268  integrase family protein  33.98 
 
 		 353 aa  58.9  0.00000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0770  integrase family protein  42.42 
 
 		 417 aa  56.6  0.0000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000130395 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1991  metallo-beta-lactamase family protein  38.64 
 
 		 353 aa  55.5  0.0000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0105  hydrogenase expression/formation protein  38.64 
 
 		 354 aa  55.1  0.0000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2090  transport protein  38.64 
 
 		 353 aa  54.7  0.0000004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0326537  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1560  tyrosine recombinase XerD  34.72 
 
 		 331 aa  54.7  0.0000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.736869  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0419  integrase family protein  31.13 
 
 		 414 aa  54.7  0.0000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000230336  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0735  integrase/recombinase  43.42 
 
 		 355 aa  53.9  0.0000007  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  decreased coverage  0.000138239  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0843  phage integrase family site specific recombinase  37.5 
 
 		 354 aa  53.9  0.0000008  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00824905  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0950  phage integrase family site specific recombinase  42.11 
 
 		 354 aa  53.5  0.0000009  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0218535  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0879  phage integrase family site specific recombinase  42.11 
 
 		 354 aa  53.5  0.0000009  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.159654  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0817  tyrosine recombinase XerD  35.23 
 
 		 305 aa  53.1  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.763193  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1012  phage integrase family site specific recombinase  42.11 
 
 		 354 aa  53.5  0.000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000959514  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0106  phage integrase family protein  29.81 
 
 		 295 aa  53.1  0.000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0993  phage integrase family protein  40.54 
 
 		 121 aa  52.8  0.000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1003  tyrosine recombinase XerD subunit  31.96 
 
 		 302 aa  52.4  0.000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.497558  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0116  Phage integrase, N-terminal SAM- like  47.27 
 
 		 309 aa  52  0.000003  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1145  tyrosine recombinase, phage integrase family  37.66 
 
 		 301 aa  51.6  0.000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.00135559  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15230  site-specific tyrosine recombinase XerD  34.25 
 
 		 316 aa  51.6  0.000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0614301  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1082  integrase family protein  37.35 
 
 		 290 aa  51.2  0.000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1178  tyrosine recombinase XerC subunit  29.76 
 
 		 300 aa  51.2  0.000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1187  integrase family protein  39.19 
 
 		 370 aa  51.2  0.000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.474728  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4429  tyrosine recombinase XerD  36 
 
 		 301 aa  51.2  0.000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0676058  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3139  phage integrase family protein  33.33 
 
 		 344 aa  51.2  0.000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.424721  normal  0.214127 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1132  phage integrase family site specific recombinase  34.09 
 
 		 352 aa  50.4  0.000007  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1932  tyrosine recombinase XerD  35.14 
 
 		 310 aa  50.8  0.000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0396  tyrosine recombinase XerD  29.81 
 
 		 309 aa  50.4  0.000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0381  tyrosine recombinase XerD  34.12 
 
 		 303 aa  50.4  0.000008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0788  phage integrase family protein  33.63 
 
 		 293 aa  50.4  0.000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1732  integrase/recombinase XerD  32.1 
 
 		 308 aa  49.7  0.00001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5117  tyrosine recombinase XerD  34.12 
 
 		 327 aa  49.7  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.843466 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1312  tyrosine recombinase XerC  31.07 
 
 		 298 aa  49.7  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.199373  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1337  tyrosine recombinase XerC  31.07 
 
 		 298 aa  49.7  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0149085  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0660  integrase family protein  33.33 
 
 		 284 aa  49.7  0.00001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1611  tyrosine recombinase  34.41 
 
 		 308 aa  50.1  0.00001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.4794 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0169  phage integrase family protein  38.03 
 
 		 282 aa  48.9  0.00002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0558238  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0607  recombinase  34.67 
 
 		 296 aa  49.3  0.00002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7460  integrase family protein  55 
 
 		 418 aa  48.9  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.175  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1521  tyrosine recombinase XerD  35.62 
 
 		 346 aa  48.9  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.531713  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3470  phage integrase family protein  35.38 
 
 		 302 aa  49.3  0.00002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.229271  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1133  integrase family protein  32.43 
 
 		 299 aa  49.3  0.00002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2175  tyrosine recombinase XerD  31.71 
 
 		 299 aa  49.3  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4696  integrase family protein  34.78 
 
 		 306 aa  48.9  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0011  phage integrase family protein  32.53 
 
 		 301 aa  49.3  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0478  tyrosine recombinase XerD  35.06 
 
 		 319 aa  48.5  0.00003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1520  tyrosine recombinase XerD  34.25 
 
 		 362 aa  48.5  0.00003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000383292 
 
 
-
 
NC_002978  WD1148  phage integrase family site specific recombinase  45.83 
 
 		 328 aa  48.5  0.00003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0281308  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3599  integrase family protein  26.8 
 
 		 180 aa  48.1  0.00003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.616601  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3929  site-specific tyrosine recombinase XerC  26.67 
 
 		 299 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000313294  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1531  phage integrase family protein  36.36 
 
 		 311 aa  48.5  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.504949 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1902  phage integrase  33.33 
 
 		 293 aa  48.5  0.00003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.162765  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1995  site-specific tyrosine recombinase XerD  30.59 
 
 		 302 aa  48.1  0.00004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3096  tyrosine recombinase XerD subunit  32.41 
 
 		 311 aa  48.1  0.00004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00033868  normal  0.385268 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1266  tyrosine recombinase XerD  32 
 
 		 310 aa  47.8  0.00004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1489  tyrosine recombinase XerD  31.08 
 
 		 313 aa  48.1  0.00004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.966498  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0903  tyrosine recombinase XerD  34.12 
 
 		 303 aa  48.1  0.00004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1314  site-specific tyrosine recombinase XerC  26.67 
 
 		 299 aa  48.1  0.00004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000019497  unclonable  8.39468e-26 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3654  site-specific tyrosine recombinase XerC  26.67 
 
 		 301 aa  48.1  0.00004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000489449  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0988  tyrosine recombinase XerD  34.12 
 
 		 303 aa  48.1  0.00004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.252447  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1481  phage integrase family protein  32.38 
 
 		 311 aa  48.1  0.00004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0281722  normal  0.205606 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0173  tyrosine recombinase XerD  46.94 
 
 		 309 aa  47.8  0.00005  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.861385  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1300  tyrosine recombinase XerD subunit  28.12 
 
 		 297 aa  47.8  0.00005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8257  integrase/recombinase  44.83 
 
 		 109 aa  47.4  0.00006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0245886  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2613  prophage LambdaBa04, site-specific recombinase, phage integrase family  25.77 
 
 		 180 aa  47.4  0.00006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.301879  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5939  phage integrase family protein  39.66 
 
 		 395 aa  47.4  0.00006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0092  integrase family protein  34.52 
 
 		 270 aa  47  0.00008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.554655  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1104  site-specific tyrosine recombinase XerC  29.41 
 
 		 300 aa  47  0.00008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000317379  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14190  tyrosine recombinase XerD  32 
 
 		 321 aa  47.4  0.00008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.127512  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1996  site-specific tyrosine recombinase XerC  32.53 
 
 		 300 aa  47  0.00009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2815  integrase/recombinase XerD  39.71 
 
 		 311 aa  47  0.00009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3153  tyrosine recombinase XerD  31.94 
 
 		 443 aa  47  0.00009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.408525  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0068  phage integrase  38.71 
 
 		 302 aa  47  0.00009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2159  tyrosine recombinase XerD  32.88 
 
 		 311 aa  46.6  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3300  tyrosine recombinase XerD  29 
 
 		 299 aa  46.2  0.0001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0687  Phage integrase  31.4 
 
 		 310 aa  46.2  0.0001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.004827  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0235  Integrase  33.33 
 
 		 308 aa  46.6  0.0001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.386202  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2329  tyrosine recombinase XerD  31.71 
 
 		 277 aa  46.6  0.0001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00235896  normal  0.0350779 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1751  tyrosine recombinase XerD  35.63 
 
 		 294 aa  46.6  0.0001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0083  site-specific tyrosine recombinase XerC  29.47 
 
 		 322 aa  46.2  0.0001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3873  site-specific tyrosine recombinase XerC  25.53 
 
 		 299 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00557083  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3572  site-specific tyrosine recombinase XerC  25.22 
 
 		 299 aa  46.2  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000685052  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3590  site-specific tyrosine recombinase XerC  25.22 
 
 		 299 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0796955  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2378  tyrosine recombinase XerD  29.76 
 
 		 296 aa  45.8  0.0002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.336575 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3152  integrase family protein  43.1 
 
 		 352 aa  45.8  0.0002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3969  site-specific tyrosine recombinase XerC  25.22 
 
 		 299 aa  45.8  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000391393  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5294  integrase family protein  37.14 
 
 		 268 aa  45.8  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1934  phage integrase family protein  30.77 
 
 		 297 aa  45.4  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3191  tyrosine recombinase XerD subunit  32.56 
 
 		 300 aa  45.8  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1924  site-specific tyrosine recombinase XerD  32.91 
 
 		 325 aa  45.8  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.239497 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3843  site-specific tyrosine recombinase XerC  25.22 
 
 		 299 aa  46.2  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.27577e-62 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3629  integrase family protein  51.11 
 
 		 290 aa  45.8  0.0002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1457  integrase family protein  29.79 
 
 		 326 aa  45.8  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0372  integrase family protein  43.14 
 
 		 411 aa  46.2  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1823  integrase family protein  32.18 
 
 		 253 aa  45.4  0.0002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.987007  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0633  phage integrase family protein  34.62 
 
 		 333 aa  45.8  0.0002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.191689  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>