80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_0312 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_0312  phage integrase  100 
 
 		 209 aa  429  1e-119  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1694  phage integrase family protein  29.9 
 
 		 212 aa  78.6  0.00000000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.470129  normal  0.0225811 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1448  phage integrase family site specific recombinase  29.9 
 
 		 188 aa  78.2  0.00000000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1771  phage integrase family protein  29.9 
 
 		 204 aa  77.8  0.0000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.753085 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1799  phage integrase family protein  29.9 
 
 		 204 aa  77.4  0.0000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.968459  normal  0.396821 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0377  integrase family protein  30.29 
 
 		 186 aa  76.6  0.0000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000239772 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3517  phage integrase family protein  30.29 
 
 		 188 aa  75.5  0.0000000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2953  phage integrase family site specific recombinase  27.41 
 
 		 186 aa  74.7  0.000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.603832  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1254  phage integrase family protein  29.35 
 
 		 186 aa  73.9  0.000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.709211 
 
 
-
 
NC_010182  BcerKBAB4_5345  integrase family protein  30.12 
 
 		 182 aa  65.1  0.0000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1255  integrase family protein  27.05 
 
 		 186 aa  64.3  0.000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012794  GWCH70_3453  integrase family protein  27.36 
 
 		 189 aa  63.5  0.000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.590005  normal  0.791222 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001839  site-specific recombinase phage integrase family  26.47 
 
 		 186 aa  61.6  0.000000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0795  phage integrase family protein  24.72 
 
 		 283 aa  57.8  0.0000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1590  phage integrase family site specific recombinase  29.08 
 
 		 182 aa  57  0.0000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000133866  n/a   
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0017  prophage integration/recombination/invertion protein  28.31 
 
 		 190 aa  56.6  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000444728  n/a   
 
 
-
 
NC_010724  Nther_2955  integrase family protein  31.06 
 
 		 187 aa  55.8  0.0000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.819146  n/a   
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3590  integrase family protein  30 
 
 		 189 aa  55.5  0.0000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  normal  0.0592429  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0652  DNA integration/recombination/invertion protein  30.92 
 
 		 180 aa  54.7  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0577  prophage LambdaBa02, site-specific recombinase, phage integrase family  30.72 
 
 		 180 aa  54.3  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1368  prophage LambdaBa04, site-specific recombinase, phage integrase family  30.92 
 
 		 180 aa  54.3  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.358053 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0775  phage integrase family protein  24.72 
 
 		 286 aa  53.5  0.000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0341069  n/a   
 
 
-
 
NC_012790  GWCH70_3470  integrase family protein  28.93 
 
 		 182 aa  53.9  0.000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007107  pE33L9_0009  integrase/recombinase  26.29 
 
 		 190 aa  52.8  0.000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4099  prophage lambdaba02, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  30.46 
 
 		 169 aa  52.4  0.000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1165  integrase family protein  27.75 
 
 		 187 aa  52.4  0.000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2613  prophage LambdaBa04, site-specific recombinase, phage integrase family  28.35 
 
 		 180 aa  52  0.000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.301879  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3811  prophage LambdaBa02, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  30.99 
 
 		 180 aa  52  0.000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0141622  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1859  prophage LambdaSa2, site-specific recombinase phage integrase family protein  28.14 
 
 		 180 aa  52  0.000007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00377207  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1646  integrase family protein  25.93 
 
 		 330 aa  51.6  0.000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1179  phage integrase family protein  25.16 
 
 		 398 aa  51.6  0.000008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0294292  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3599  integrase family protein  30.32 
 
 		 180 aa  50.8  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.616601  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1842  integrase family protein  25.53 
 
 		 340 aa  50.1  0.00002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  hitchhiker  0.00549349  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0412  integrase  25.26 
 
 		 190 aa  50.8  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0192917  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0060  phage integrase family protein  25.53 
 
 		 340 aa  50.1  0.00002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.106477  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2671  phage integrase family protein  26.98 
 
 		 191 aa  48.5  0.00007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.196134  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0602  site-specific tyrosine recombinase XerC  23.87 
 
 		 324 aa  48.1  0.0001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00926796 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1185  phage integrase family protein  25.17 
 
 		 176 aa  47.8  0.0001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00690161  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1553  site-specific recombinase, phage integrase family  26.53 
 
 		 176 aa  47.4  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000100783 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1370  phage integrase family site specific recombinase  26.53 
 
 		 179 aa  47  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1384  integrase family protein  26.53 
 
 		 176 aa  47  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.334457  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1586  phage integrase family site specific recombinase  26.53 
 
 		 176 aa  47.4  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.645051  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1622  site-specific recombinase, phage integrase family  26.53 
 
 		 176 aa  47.4  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1343  phage integrase family site specific recombinase  26.53 
 
 		 179 aa  47.4  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.311312  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1342  phage integrase family site specific recombinase  26.53 
 
 		 179 aa  47.4  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1516  site-specific recombinase, phage integrase family  26.53 
 
 		 176 aa  47.4  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1481  phage integrase family site specific recombinase  26.53 
 
 		 176 aa  47  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0262  phage integrase family protein  26.37 
 
 		 326 aa  46.2  0.0003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2232  integrase family protein  27.92 
 
 		 197 aa  46.6  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.394376  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2240  integrase family protein  27.92 
 
 		 197 aa  46.6  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.0000448435  n/a   
 
 
-
 
NC_008496  LEUM_A08  integrase  31.54 
 
 		 195 aa  46.6  0.0003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.000000003137  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0998  phage integrase family protein  28.95 
 
 		 215 aa  45.8  0.0004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00570052  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0164  DNA integration/recombination/inversion protein  24.74 
 
 		 190 aa  45.8  0.0004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0167632  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2230  prophage LambdaBa02, site-specific recombinase, phage integrase family  28.21 
 
 		 180 aa  45.4  0.0006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0169  phage integrase family protein  26.11 
 
 		 282 aa  44.7  0.0009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0558238  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1484  phage integrase family protein  26.51 
 
 		 341 aa  44.3  0.001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.269781  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1082  integrase family protein  23.89 
 
 		 290 aa  44.7  0.001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3995  phage integrase family protein  26.37 
 
 		 415 aa  44.7  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.0000158235  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2344  phage integrase  27.42 
 
 		 322 aa  44.3  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0456613  normal  0.219342 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1668  tyrosine recombinase XerD subunit  28.24 
 
 		 295 aa  43.9  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.179488  normal  0.0195248 
 
 
-
 
NC_009795  CCC13826_0617  phage integrase family site specific recombinase  27.61 
 
 		 329 aa  43.9  0.002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.0000798153  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0466  Fis family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 362 aa  43.1  0.003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3829  site-specific recombinase, phage integrase family  25.85 
 
 		 176 aa  43.1  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000329942 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3986  prophage LambdaBa02, site-specific recombinase, phage integrase family  24.46 
 
 		 319 aa  42.4  0.004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.578221  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2569  phage integrase family protein  30.64 
 
 		 198 aa  42.7  0.004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0769947 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0446  phage integrase family protein  22.83 
 
 		 347 aa  42.7  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.286621  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2661  phage integrase  22.83 
 
 		 347 aa  42.7  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0679447  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4392  prophage LambdaBa02, site-specific recombinase, phage integrase family  29.29 
 
 		 180 aa  42.4  0.005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1007  site-specific recombinase  25.66 
 
 		 183 aa  42.4  0.005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  8.22552e-63 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3066  integrase family protein  27.22 
 
 		 390 aa  42  0.006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0221886  normal  0.652565 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0815  integrase family protein  25 
 
 		 183 aa  42  0.006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2218  phage integrase family protein  28.7 
 
 		 388 aa  42.4  0.006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1202  tyrosine recombinase XerC  24.74 
 
 		 304 aa  42  0.006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.910177  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2069  phage integrase  23.53 
 
 		 359 aa  42  0.006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.244007  hitchhiker  0.000737798 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0582  phage integrase family protein  25 
 
 		 355 aa  42  0.007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3913  phage integrase family protein  25 
 
 		 387 aa  42  0.007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.126543  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5943  phage integrase family protein  25 
 
 		 355 aa  42  0.007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.702508  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0474  phage integrase family protein  25 
 
 		 355 aa  42  0.007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2062  phage integrase family site specific recombinase  28.29 
 
 		 198 aa  42  0.007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.27505  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6303  integrase family protein  26.63 
 
 		 416 aa  41.6  0.008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.66477  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>