More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_0474 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009338  Mflv_0582  phage integrase family protein  100 
 
 		 355 aa  721    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5943  phage integrase family protein  100 
 
 		 355 aa  721    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.702508  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0474  phage integrase family protein  100 
 
 		 355 aa  721    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4274  phage integrase family protein  34.49 
 
 		 363 aa  182  1e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5552  phage integrase family protein  32.56 
 
 		 360 aa  179  5.999999999999999e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0894209 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3445  integrase family protein  35.17 
 
 		 358 aa  176  4e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.210447  normal  1 
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4218  phage integrase family protein  34.97 
 
 		 352 aa  176  4e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2735  integrase family protein  34.43 
 
 		 355 aa  176  7e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2540  integrase family protein  34.43 
 
 		 355 aa  176  7e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4725  phage integrase family protein  35.24 
 
 		 375 aa  174  1.9999999999999998e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.675287  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6372  integrase family protein  36.02 
 
 		 358 aa  156  6e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06640  site-specific recombinase XerD  28.99 
 
 		 373 aa  99.8  7e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2641  integrase family protein  28.37 
 
 		 377 aa  95.5  1e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2600  phage integrase  28.77 
 
 		 373 aa  90.5  4e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2644  phage integrase family protein  28.77 
 
 		 373 aa  90.5  4e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.135178  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0038  integrase family protein  27.69 
 
 		 373 aa  86.7  5e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.967515  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1118  tyrosine recombinase XerD  25.18 
 
 		 304 aa  86.7  6e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4158  site-specific tyrosine recombinase XerD  29.58 
 
 		 296 aa  85.5  0.000000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.44443  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3999  site-specific tyrosine recombinase XerD  29.58 
 
 		 296 aa  85.1  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.189801  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3830  site-specific tyrosine recombinase XerD  29.58 
 
 		 296 aa  85.1  0.000000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3846  site-specific tyrosine recombinase XerD  29.58 
 
 		 296 aa  85.9  0.000000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0256715  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4311  site-specific tyrosine recombinase XerD  29.58 
 
 		 296 aa  85.1  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.789664  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4222  site-specific tyrosine recombinase XerD  29.58 
 
 		 296 aa  85.5  0.000000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00160259  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4113  site-specific tyrosine recombinase XerD  29.58 
 
 		 296 aa  85.1  0.000000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.00015e-24 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0842  hypothetical protein  30.68 
 
 		 290 aa  85.5  0.000000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2257  site-specific tyrosine recombinase XerD  29.86 
 
 		 299 aa  84.7  0.000000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.977256  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3920  site-specific tyrosine recombinase XerD  29.23 
 
 		 296 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000317777  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4199  site-specific tyrosine recombinase XerD  29.58 
 
 		 296 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00345142  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1038  site-specific tyrosine recombinase XerD  29.58 
 
 		 296 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00331502  normal  0.0102802 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08760  tyrosine recombinase XerD  28.62 
 
 		 309 aa  83.2  0.000000000000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.940341  unclonable  0.00000000128305 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1191  site-specific tyrosine recombinase XerC  41.67 
 
 		 313 aa  82.8  0.000000000000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.60628  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2105  tyrosine recombinase XerD  28.43 
 
 		 297 aa  80.9  0.00000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.179497  hitchhiker  0.00877552 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2788  site-specific tyrosine recombinase XerD  28.47 
 
 		 296 aa  81.3  0.00000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000777667  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3665  integrase family protein  34.5 
 
 		 313 aa  80.5  0.00000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.211751 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0817  tyrosine recombinase XerD  25.74 
 
 		 305 aa  80.1  0.00000000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.763193  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2194  integrase family protein  30.47 
 
 		 317 aa  79.7  0.00000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.103281  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1185  tyrosine recombinase XerD  36.69 
 
 		 310 aa  79.7  0.00000000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.497096  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11988  putative tyrosine recombinase  33.93 
 
 		 298 aa  78.6  0.0000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2383  tyrosine recombinase XerD  29.7 
 
 		 295 aa  77.4  0.0000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0727  tyrosine recombinase XerD  25.74 
 
 		 304 aa  77.4  0.0000000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.689003 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1025  site-specific tyrosine recombinase XerD  26.98 
 
 		 298 aa  77.4  0.0000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.899371  normal  0.6007 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5470  tyrosine recombinase XerD  25.62 
 
 		 316 aa  77.4  0.0000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.602612  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1060  tyrosine recombinase XerD  26.71 
 
 		 295 aa  76.6  0.0000000000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.17947  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1554  tyrosine recombinase XerD  25.81 
 
 		 295 aa  76.6  0.0000000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1585  tyrosine recombinase XerD  25.81 
 
 		 295 aa  76.6  0.0000000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1142  tyrosine recombinase XerD  29.32 
 
 		 295 aa  76.3  0.0000000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0590  tyrosine recombinase XerD  25.93 
 
 		 306 aa  76.3  0.0000000000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0893  tyrosine recombinase XerD  29.67 
 
 		 304 aa  75.9  0.0000000000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0105661 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1209  phage integrase family site specific recombinase  25.71 
 
 		 305 aa  75.5  0.000000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.764611  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0367  site-specific tyrosine recombinase XerD  29.03 
 
 		 298 aa  75.9  0.000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0039  tyrosine recombinase XerD  28.71 
 
 		 312 aa  75.1  0.000000000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0476  tyrosine recombinase XerD  26.84 
 
 		 302 aa  75.1  0.000000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09590  tyrosine recombinase XerD  26.5 
 
 		 302 aa  74.3  0.000000000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.0503565 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0884  integrase  24.92 
 
 		 302 aa  74.3  0.000000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.161871  hitchhiker  0.000000000000894527 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00203  tyrosine recombinase  25.98 
 
 		 306 aa  74.3  0.000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0478  integrase family protein  27.33 
 
 		 312 aa  73.6  0.000000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0602  phage integrase family protein  30.06 
 
 		 317 aa  73.6  0.000000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00243284  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0067  phage integrase family protein  26.62 
 
 		 328 aa  73.2  0.000000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.183253 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19920  tyrosine recombinase XerD  31.98 
 
 		 317 aa  73.2  0.000000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.210765  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1520  tyrosine recombinase XerD  26.47 
 
 		 362 aa  72.8  0.000000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000383292 
 
 
-
 
NC_002936  DET1215  tyrosine recombinase XerD  31.03 
 
 		 302 aa  72.4  0.00000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.157843  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3278  site-specific tyrosine recombinase XerD  31.22 
 
 		 298 aa  72  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4012  tyrosine recombinase XerC  31.55 
 
 		 294 aa  72.4  0.00000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00152232  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3275  site-specific tyrosine recombinase XerD  31.22 
 
 		 298 aa  72  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1320  tyrosine recombinase XerD  29.38 
 
 		 302 aa  72  0.00000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3212  site-specific tyrosine recombinase XerD  31.22 
 
 		 298 aa  72  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.476349 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5304  site-specific recombinase, phage integrase family  27.38 
 
 		 322 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1283  site-specific tyrosine recombinase XerD  26.38 
 
 		 297 aa  72  0.00000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1003  tyrosine recombinase XerD subunit  30.41 
 
 		 302 aa  72.4  0.00000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.497558  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3380  site-specific tyrosine recombinase XerD  31.22 
 
 		 298 aa  72  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1300  tyrosine recombinase XerD subunit  30.95 
 
 		 297 aa  72  0.00000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3200  site-specific tyrosine recombinase XerD  31.22 
 
 		 298 aa  72  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.550002  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3090  tyrosine recombinase XerD  24.68 
 
 		 320 aa  72  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0124  phage integrase family protein  31.4 
 
 		 298 aa  71.6  0.00000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.776243  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3450  tyrosine recombinase XerD  25.64 
 
 		 322 aa  72  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1220  site-specific tyrosine recombinase XerC  36.2 
 
 		 330 aa  71.6  0.00000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0602  site-specific tyrosine recombinase XerC  30.2 
 
 		 324 aa  71.6  0.00000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00926796 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2064  phage integrase  36.16 
 
 		 297 aa  72  0.00000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2260  integrase family protein  35.29 
 
 		 395 aa  71.2  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.46728  normal  0.0539974 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_998  integrase/recombinase  30.46 
 
 		 302 aa  71.2  0.00000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1521  tyrosine recombinase XerD  31.76 
 
 		 346 aa  71.2  0.00000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.531713  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4114  site-specific tyrosine recombinase XerC  32.35 
 
 		 322 aa  71.2  0.00000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1468  site-specific tyrosine recombinase XerD  27.3 
 
 		 298 aa  70.9  0.00000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.208903 
 
 
-
 
NC_002950  PG1732  integrase/recombinase XerD  27.33 
 
 		 308 aa  71.2  0.00000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4253  site-specific tyrosine recombinase XerD  27.3 
 
 		 298 aa  70.9  0.00000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0747  tyrosine recombinase XerD  26.27 
 
 		 303 aa  70.9  0.00000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000635712  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0967  integrase family protein  30.62 
 
 		 373 aa  70.9  0.00000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1025  tyrosine recombinase XerD subunit  29.47 
 
 		 302 aa  70.5  0.00000000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1556  integrase family protein  23.57 
 
 		 307 aa  70.9  0.00000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.36987  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0645  site-specific tyrosine recombinase XerD  29.66 
 
 		 299 aa  70.5  0.00000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.241995  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3892  site-specific tyrosine recombinase XerD  29.2 
 
 		 299 aa  70.5  0.00000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.413643  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1457  tyrosine recombinase XerD  29.22 
 
 		 292 aa  70.5  0.00000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0432704  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1585  site-specific recombinase XerD-like  34.39 
 
 		 332 aa  70.1  0.00000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.264485  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0470  tyrosine recombinase XerC  28.24 
 
 		 293 aa  70.1  0.00000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0815  site-specific tyrosine recombinase XerD  25.9 
 
 		 298 aa  70.5  0.00000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.624778  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0452  tyrosine recombinase XerC subunit  32.56 
 
 		 335 aa  70.1  0.00000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.577676  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0285  tyrosine recombinase XerC  29.79 
 
 		 302 aa  70.1  0.00000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3027  site-specific tyrosine recombinase XerD  25.9 
 
 		 298 aa  70.1  0.00000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3220  site-specific tyrosine recombinase XerD  25.9 
 
 		 298 aa  70.1  0.00000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1266  tyrosine recombinase XerD  31.1 
 
 		 310 aa  70.1  0.00000000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>