More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_4274 on replicon NC_008538
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008538  Arth_4274  phage integrase family protein  100 
 
 		 363 aa  743    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4218  phage integrase family protein  95.17 
 
 		 352 aa  692    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4725  phage integrase family protein  57.82 
 
 		 375 aa  399  9.999999999999999e-111  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.675287  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5552  phage integrase family protein  46.85 
 
 		 360 aa  310  2e-83  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0894209 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6372  integrase family protein  47.45 
 
 		 358 aa  280  4e-74  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2735  integrase family protein  40.82 
 
 		 355 aa  266  4e-70  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2540  integrase family protein  40.82 
 
 		 355 aa  266  4e-70  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3445  integrase family protein  41.74 
 
 		 358 aa  249  5e-65  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.210447  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0582  phage integrase family protein  34.49 
 
 		 355 aa  182  1e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5943  phage integrase family protein  34.49 
 
 		 355 aa  182  1e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.702508  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0474  phage integrase family protein  34.49 
 
 		 355 aa  182  1e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2600  phage integrase  28.57 
 
 		 373 aa  94.7  2e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2644  phage integrase family protein  28.57 
 
 		 373 aa  94.7  2e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.135178  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2641  integrase family protein  29.45 
 
 		 377 aa  89.7  8e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1215  tyrosine recombinase XerD  28.85 
 
 		 302 aa  83.2  0.000000000000007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.157843  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_998  integrase/recombinase  28.52 
 
 		 302 aa  81.3  0.00000000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1025  tyrosine recombinase XerD subunit  28.39 
 
 		 302 aa  80.9  0.00000000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0884  integrase  23.08 
 
 		 302 aa  80.1  0.00000000000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.161871  hitchhiker  0.000000000000894527 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0201  tyrosine recombinase XerC subunit  31.07 
 
 		 345 aa  78.6  0.0000000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000601095 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00307  site-specific tyrosine recombinase XerC  27.24 
 
 		 313 aa  78.2  0.0000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10430  site-specific recombinase XerD  25.51 
 
 		 313 aa  77.4  0.0000000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00129547  unclonable  0.000000000966981 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0602  site-specific tyrosine recombinase XerC  34.78 
 
 		 324 aa  77.8  0.0000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00926796 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0144  tyrosine recombinase XerD  29.12 
 
 		 305 aa  77  0.0000000000004  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0221  phage integrase  31.58 
 
 		 349 aa  77  0.0000000000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.118358  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0452  tyrosine recombinase XerC subunit  32.99 
 
 		 335 aa  76.3  0.0000000000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.577676  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1202  tyrosine recombinase XerC  29.59 
 
 		 304 aa  75.1  0.000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.910177  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3245  phage integrase family protein  30.14 
 
 		 312 aa  75.1  0.000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.676462  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2346  tyrosine recombinase XerC  30.99 
 
 		 302 aa  74.7  0.000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.126195  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002113  tyrosine recombinase XerC  26.26 
 
 		 310 aa  73.9  0.000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00203  tyrosine recombinase  25.89 
 
 		 306 aa  73.9  0.000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0350  phage integrase family protein  31.05 
 
 		 341 aa  73.9  0.000000000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000105216  hitchhiker  0.0000498769 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1622  tyrosine recombinase XerD  23.21 
 
 		 310 aa  73.6  0.000000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4127  tyrosine recombinase XerC  30.15 
 
 		 301 aa  73.2  0.000000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.442069 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3062  site-specific tyrosine recombinase XerD  28.31 
 
 		 308 aa  73.2  0.000000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0341  tyrosine recombinase XerC  30.65 
 
 		 317 aa  73.2  0.000000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000100724  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0409  Phage integrase  27.95 
 
 		 317 aa  72.8  0.000000000008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.383536  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0325  tyrosine recombinase XerC  30.22 
 
 		 297 aa  73.2  0.000000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0426  site-specific tyrosine recombinase XerC  32.61 
 
 		 321 aa  72.4  0.00000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0106  phage integrase family protein  25.82 
 
 		 295 aa  72.8  0.00000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1191  site-specific tyrosine recombinase XerC  34.39 
 
 		 313 aa  71.6  0.00000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.60628  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06640  site-specific recombinase XerD  27.88 
 
 		 373 aa  71.6  0.00000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0488  tyrosine recombinase XerD  30.9 
 
 		 319 aa  71.2  0.00000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0238  site-specific tyrosine recombinase XerC  32.09 
 
 		 306 aa  71.2  0.00000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0625179  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0358  integrase family protein  21.68 
 
 		 287 aa  70.9  0.00000000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1390  site-specific tyrosine recombinase XerC  26 
 
 		 328 aa  70.5  0.00000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000179914  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0536  site-specific tyrosine recombinase XerC  32.07 
 
 		 300 aa  70.5  0.00000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.538013  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5408  phage integrase family protein  33.15 
 
 		 330 aa  70.5  0.00000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.123433 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4655  tyrosine recombinase XerC  32.07 
 
 		 365 aa  70.1  0.00000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.223284 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3715  integrase family protein  28.72 
 
 		 298 aa  70.5  0.00000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4288  tyrosine recombinase XerC  32.07 
 
 		 365 aa  70.1  0.00000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.710874 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3124  integrase family protein  33.33 
 
 		 323 aa  69.7  0.00000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1225  integrase family protein  29.24 
 
 		 301 aa  69.7  0.00000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.103765  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0163  integrase family protein  32.07 
 
 		 342 aa  69.7  0.00000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.70922  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0394  tyrosine recombinase XerC  27.92 
 
 		 299 aa  69.7  0.00000000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3631  tyrosine recombinase XerC  27.92 
 
 		 299 aa  69.7  0.00000000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.465228 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0393  tyrosine recombinase XerC  27.92 
 
 		 299 aa  69.7  0.00000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.426652 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1585  site-specific recombinase XerD-like  29.23 
 
 		 332 aa  69.3  0.00000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.264485  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0918  integrase  26.24 
 
 		 307 aa  69.3  0.00000000009  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.0200604 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4805  tyrosine recombinase XerC  32.07 
 
 		 367 aa  69.3  0.0000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.104736  normal  0.146847 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4012  tyrosine recombinase XerC  30.28 
 
 		 294 aa  68.6  0.0000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00152232  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0177  site-specific tyrosine recombinase XerC  31.69 
 
 		 323 aa  68.9  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1163  phage integrase family protein  30.15 
 
 		 472 aa  68.6  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.562087  normal  0.524123 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2381  site-specific tyrosine recombinase XerC  27.35 
 
 		 311 aa  68.9  0.0000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0507  tyrosine recombinase XerD  31.6 
 
 		 339 aa  68.9  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0470  tyrosine recombinase XerC  31.25 
 
 		 293 aa  68.9  0.0000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0380  tyrosine recombinase XerC  25.53 
 
 		 304 aa  68.2  0.0000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3665  integrase family protein  34.3 
 
 		 313 aa  68.6  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.211751 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0180  site-specific tyrosine recombinase XerC  32.07 
 
 		 324 aa  68.2  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0198  tyrosine recombinase XerC subunit  28.12 
 
 		 291 aa  68.2  0.0000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0021573 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0842  hypothetical protein  25.98 
 
 		 290 aa  68.6  0.0000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0818  tyrosine recombinase XerC  25.09 
 
 		 296 aa  67.8  0.0000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.368613  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4306  integrase/recombinase XerC  30.16 
 
 		 299 aa  67.4  0.0000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1457  integrase family protein  25.74 
 
 		 326 aa  67.8  0.0000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0487  tyrosine recombinase XerC  30.11 
 
 		 293 aa  67.8  0.0000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000269064 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0285  tyrosine recombinase XerC  32.95 
 
 		 302 aa  67.8  0.0000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0401  site-specific tyrosine recombinase XerC  32.97 
 
 		 324 aa  67.4  0.0000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.145415 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2528  tyrosine recombinase XerC  30.5 
 
 		 294 aa  67.4  0.0000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.237042 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5470  tyrosine recombinase XerD  29.05 
 
 		 316 aa  67.4  0.0000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.602612  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2257  site-specific tyrosine recombinase XerD  26.26 
 
 		 299 aa  67.4  0.0000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.977256  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1060  tyrosine recombinase XerD  28.04 
 
 		 295 aa  67  0.0000000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.17947  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0653  integrase family protein  28.18 
 
 		 282 aa  67  0.0000000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.319783  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2471  tyrosine recombinase XerC subunit  31.02 
 
 		 308 aa  67  0.0000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0340389  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0273  tyrosine recombinase XerC  24.61 
 
 		 300 aa  67  0.0000000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.007038  normal  0.809464 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1750  tyrosine recombinase XerD  27.18 
 
 		 294 aa  66.6  0.0000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0861  integrase/recombinase XerC  34.1 
 
 		 304 aa  66.6  0.0000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2052  tyrosine recombinase XerD  26.32 
 
 		 296 aa  66.6  0.0000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1320  tyrosine recombinase XerD  26.1 
 
 		 302 aa  66.6  0.0000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0880  phage integrase family protein  22.29 
 
 		 291 aa  66.2  0.0000000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0027577 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0607  recombinase  24.47 
 
 		 296 aa  66.2  0.0000000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0128  site-specific tyrosine recombinase XerC  28.12 
 
 		 303 aa  66.6  0.0000000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.742386  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3714  tyrosine recombinase XerD  24.39 
 
 		 301 aa  66.2  0.0000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3971  tyrosine recombinase XerC  27.73 
 
 		 306 aa  66.2  0.0000000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0279  phage integrase family protein  26.58 
 
 		 282 aa  66.2  0.0000000009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.033075  hitchhiker  0.000013626 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4087  tyrosine recombinase XerC  27.73 
 
 		 306 aa  66.2  0.0000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0169707 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23640  tyrosine recombinase XerC subunit  26.67 
 
 		 310 aa  65.5  0.000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.154193  normal  0.0993098 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0920  site-specific tyrosine recombinase XerD  27.95 
 
 		 299 aa  65.9  0.000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0879  site-specific tyrosine recombinase XerD  27.95 
 
 		 299 aa  65.9  0.000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.201006  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3847  site-specific tyrosine recombinase XerD  27.95 
 
 		 299 aa  65.9  0.000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.349121 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0553  site-specific tyrosine recombinase XerC  32.24 
 
 		 329 aa  65.9  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.172687  normal  0.167276 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1300  tyrosine recombinase XerD subunit  22.55 
 
 		 297 aa  65.9  0.000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>