More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_2735 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_2735  integrase family protein  100 
 
 		 355 aa  723    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2540  integrase family protein  100 
 
 		 355 aa  723    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3445  integrase family protein  70.74 
 
 		 358 aa  492  9.999999999999999e-139  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.210447  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6372  integrase family protein  66.76 
 
 		 358 aa  470  1.0000000000000001e-131  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5552  phage integrase family protein  62.32 
 
 		 360 aa  457  1e-127  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0894209 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4725  phage integrase family protein  41.62 
 
 		 375 aa  273  4.0000000000000004e-72  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.675287  normal  1 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4274  phage integrase family protein  40.82 
 
 		 363 aa  266  2.9999999999999995e-70  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4218  phage integrase family protein  40.82 
 
 		 352 aa  263  4.999999999999999e-69  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5943  phage integrase family protein  33.23 
 
 		 355 aa  175  9.999999999999999e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.702508  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0474  phage integrase family protein  33.23 
 
 		 355 aa  175  9.999999999999999e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0582  phage integrase family protein  33.23 
 
 		 355 aa  175  9.999999999999999e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2641  integrase family protein  36 
 
 		 377 aa  89.7  7e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06640  site-specific recombinase XerD  26.22 
 
 		 373 aa  87.4  3e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0067  phage integrase family protein  28.88 
 
 		 328 aa  87.8  3e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.183253 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0678  tyrosine recombinase XerD  27.67 
 
 		 294 aa  83.6  0.000000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0265142 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0169  phage integrase family protein  23.67 
 
 		 282 aa  82.8  0.000000000000008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0558238  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2257  site-specific tyrosine recombinase XerD  31.89 
 
 		 299 aa  80.9  0.00000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.977256  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08760  tyrosine recombinase XerD  33.88 
 
 		 309 aa  80.5  0.00000000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.940341  unclonable  0.00000000128305 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1099  tyrosine recombinase XerD  28.9 
 
 		 296 aa  78.6  0.0000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1038  site-specific tyrosine recombinase XerD  32.09 
 
 		 296 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00331502  normal  0.0102802 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4158  site-specific tyrosine recombinase XerD  31.94 
 
 		 296 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.44443  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3682  site-specific tyrosine recombinase XerC  29.35 
 
 		 299 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.245295  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3999  site-specific tyrosine recombinase XerD  31.94 
 
 		 296 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.189801  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3830  site-specific tyrosine recombinase XerD  31.94 
 
 		 296 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3846  site-specific tyrosine recombinase XerD  31.94 
 
 		 296 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0256715  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3969  site-specific tyrosine recombinase XerC  29.35 
 
 		 299 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000391393  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4311  site-specific tyrosine recombinase XerD  31.94 
 
 		 296 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.789664  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4222  site-specific tyrosine recombinase XerD  31.94 
 
 		 296 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00160259  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1320  tyrosine recombinase XerD  27.53 
 
 		 302 aa  78.2  0.0000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4113  site-specific tyrosine recombinase XerD  31.94 
 
 		 296 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.00015e-24 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2788  site-specific tyrosine recombinase XerD  31.94 
 
 		 296 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000777667  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4199  site-specific tyrosine recombinase XerD  32.09 
 
 		 296 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00345142  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2105  tyrosine recombinase XerD  31.3 
 
 		 297 aa  77.8  0.0000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.179497  hitchhiker  0.00877552 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3920  site-specific tyrosine recombinase XerD  32.09 
 
 		 296 aa  77.8  0.0000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000317777  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0367  site-specific tyrosine recombinase XerD  29.65 
 
 		 298 aa  77.4  0.0000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1060  tyrosine recombinase XerD  31.89 
 
 		 295 aa  77  0.0000000000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.17947  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3572  site-specific tyrosine recombinase XerC  28.8 
 
 		 299 aa  77  0.0000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000685052  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3590  site-specific tyrosine recombinase XerC  28.8 
 
 		 299 aa  76.6  0.0000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0796955  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3843  site-specific tyrosine recombinase XerC  28.8 
 
 		 299 aa  77  0.0000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.27577e-62 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1751  tyrosine recombinase XerD  28.51 
 
 		 294 aa  76.6  0.0000000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3929  site-specific tyrosine recombinase XerC  29.79 
 
 		 299 aa  76.6  0.0000000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000313294  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3090  tyrosine recombinase XerD  28.96 
 
 		 320 aa  76.3  0.0000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0890  tyrosine recombinase XerD  26.03 
 
 		 300 aa  75.9  0.0000000000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.267893  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3654  site-specific tyrosine recombinase XerC  28.26 
 
 		 301 aa  75.5  0.000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000489449  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2567  site-specific tyrosine recombinase XerD  37.71 
 
 		 313 aa  75.5  0.000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.615759 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1501  tyrosine recombinase XerD subunit  29.46 
 
 		 295 aa  75.5  0.000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3873  site-specific tyrosine recombinase XerC  28.26 
 
 		 299 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00557083  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2483  site-specific tyrosine recombinase XerC  27.87 
 
 		 299 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000855714  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0676  tyrosine recombinase XerD subunit  28.96 
 
 		 296 aa  74.7  0.000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1314  site-specific tyrosine recombinase XerC  29.26 
 
 		 299 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000019497  unclonable  8.39468e-26 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3878  site-specific tyrosine recombinase XerC  28.26 
 
 		 299 aa  75.5  0.000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000107327  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1300  tyrosine recombinase XerD subunit  24.69 
 
 		 297 aa  74.7  0.000000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0341  tyrosine recombinase XerC  34.24 
 
 		 317 aa  73.9  0.000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000100724  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1786  tyrosine recombinase XerD  24.01 
 
 		 291 aa  73.9  0.000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0596225  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1668  tyrosine recombinase XerD subunit  24.47 
 
 		 295 aa  73.9  0.000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.179488  normal  0.0195248 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0602  site-specific tyrosine recombinase XerC  31.47 
 
 		 324 aa  73.6  0.000000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00926796 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1556  integrase family protein  21.89 
 
 		 307 aa  73.6  0.000000000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.36987  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1762  phage/XerD family site-specific recombinase  25.77 
 
 		 338 aa  73.2  0.000000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0452  tyrosine recombinase XerC subunit  30.32 
 
 		 335 aa  73.6  0.000000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.577676  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1412  integrase family protein  28.41 
 
 		 323 aa  73.2  0.000000000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.157207  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11988  putative tyrosine recombinase  24.27 
 
 		 298 aa  72.8  0.000000000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1225  integrase family protein  29.76 
 
 		 301 aa  72.8  0.000000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.103765  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0159  integrase family protein  25.38 
 
 		 295 aa  71.6  0.00000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1585  tyrosine recombinase XerD  30 
 
 		 295 aa  71.2  0.00000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1996  site-specific tyrosine recombinase XerC  24.92 
 
 		 300 aa  72  0.00000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1554  tyrosine recombinase XerD  30 
 
 		 295 aa  71.2  0.00000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0770  tyrosine recombinase XerD  24.92 
 
 		 303 aa  70.9  0.00000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0646575 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0358  integrase family protein  19.55 
 
 		 287 aa  70.9  0.00000000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0893  tyrosine recombinase XerD  25.4 
 
 		 304 aa  70.1  0.00000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0105661 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0173  tyrosine recombinase XerD  29.67 
 
 		 309 aa  70.1  0.00000000005  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.861385  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1750  tyrosine recombinase XerD  27.02 
 
 		 294 aa  70.1  0.00000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0842  hypothetical protein  33.13 
 
 		 290 aa  70.1  0.00000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0918  integrase  25.16 
 
 		 307 aa  70.1  0.00000000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.0200604 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3449  tyrosine recombinase XerD  25.32 
 
 		 300 aa  70.1  0.00000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2735  tyrosine recombinase XerD  38.58 
 
 		 328 aa  69.7  0.00000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.206607 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0478  integrase family protein  26.84 
 
 		 312 aa  69.7  0.00000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3715  integrase family protein  26.11 
 
 		 298 aa  69.7  0.00000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0843  tyrosine recombinase XerD  25.32 
 
 		 309 aa  69.7  0.00000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2052  tyrosine recombinase XerD  25.62 
 
 		 296 aa  69.3  0.00000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0350  phage integrase family protein  31.38 
 
 		 341 aa  69.3  0.0000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000105216  hitchhiker  0.0000498769 
 
 
-
 
NC_002978  WD1148  phage integrase family site specific recombinase  27.48 
 
 		 328 aa  68.6  0.0000000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0281308  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4696  integrase family protein  26.19 
 
 		 306 aa  68.9  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2484  phage integrase  29.76 
 
 		 304 aa  68.6  0.0000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.72317  normal  0.0269236 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1191  site-specific tyrosine recombinase XerC  28.65 
 
 		 313 aa  68.9  0.0000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.60628  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3891  site-specific tyrosine recombinase XerD  33.73 
 
 		 317 aa  68.9  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.125291  decreased coverage  0.00274094 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2689  tyrosine recombinase XerC  27.9 
 
 		 311 aa  68.6  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.147909 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2512  tyrosine recombinase XerD  37.8 
 
 		 328 aa  68.6  0.0000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.234856 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3643  tyrosine recombinase XerD  24.13 
 
 		 309 aa  68.6  0.0000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2440  tyrosine recombinase XerD  39.37 
 
 		 332 aa  68.6  0.0000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.691328  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1720  tyrosine recombinase XerD  35.23 
 
 		 319 aa  68.6  0.0000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.514315 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3524  tyrosine recombinase XerD  24.13 
 
 		 309 aa  67.8  0.0000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0507  tyrosine recombinase XerD  36.67 
 
 		 339 aa  68.2  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1215  tyrosine recombinase XerD  28.65 
 
 		 302 aa  67.8  0.0000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.157843  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0950  integrase/recombinase XerD  25.95 
 
 		 300 aa  67.4  0.0000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0201  tyrosine recombinase XerC subunit  30.53 
 
 		 345 aa  67.8  0.0000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000601095 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0435  integrase family protein  25.88 
 
 		 299 aa  67.4  0.0000000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_998  integrase/recombinase  28.88 
 
 		 302 aa  67.8  0.0000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1611  tyrosine recombinase  33.87 
 
 		 308 aa  67.8  0.0000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.4794 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09590  tyrosine recombinase XerD  30.57 
 
 		 302 aa  67.4  0.0000000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.0503565 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1137  phage integrase  32.7 
 
 		 296 aa  67  0.0000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>