More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_06640 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_06640  site-specific recombinase XerD  100 
 
 		 373 aa  774    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0038  integrase family protein  54.11 
 
 		 373 aa  379  1e-104  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.967515  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2641  integrase family protein  50.57 
 
 		 377 aa  354  1e-96  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2600  phage integrase  46.13 
 
 		 373 aa  303  4.0000000000000003e-81  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2644  phage integrase family protein  46.13 
 
 		 373 aa  303  4.0000000000000003e-81  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.135178  normal  1 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4341  phage integrase family protein  45.33 
 
 		 368 aa  301  9e-81  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.693444  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2200  phage integrase family protein  45.04 
 
 		 368 aa  299  5e-80  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.343714  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4576  hypothetical protein  45.78 
 
 		 315 aa  246  4e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.531442  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2908  phage integrase family protein  52.21 
 
 		 147 aa  144  2e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1980  phage integrase family protein  52.76 
 
 		 132 aa  130  4.0000000000000003e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.782566  normal  0.263895 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0582  phage integrase family protein  28.99 
 
 		 355 aa  99.8  7e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5943  phage integrase family protein  28.99 
 
 		 355 aa  99.8  7e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.702508  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0474  phage integrase family protein  28.99 
 
 		 355 aa  99.8  7e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2735  integrase family protein  25.61 
 
 		 355 aa  84.7  0.000000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2540  integrase family protein  25.61 
 
 		 355 aa  84.7  0.000000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4725  phage integrase family protein  29.25 
 
 		 375 aa  80.9  0.00000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.675287  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00203  tyrosine recombinase  23.33 
 
 		 306 aa  79  0.0000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5552  phage integrase family protein  24.71 
 
 		 360 aa  76.3  0.0000000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0894209 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6372  integrase family protein  25.73 
 
 		 358 aa  71.6  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3445  integrase family protein  25.52 
 
 		 358 aa  72  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.210447  normal  1 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4274  phage integrase family protein  27.88 
 
 		 363 aa  71.6  0.00000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1215  tyrosine recombinase XerD  27.17 
 
 		 302 aa  70.9  0.00000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.157843  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_998  integrase/recombinase  27.17 
 
 		 302 aa  70.5  0.00000000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1025  tyrosine recombinase XerD subunit  26.63 
 
 		 302 aa  70.5  0.00000000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4218  phage integrase family protein  27.59 
 
 		 352 aa  69.7  0.00000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0325  tyrosine recombinase XerC  29.76 
 
 		 297 aa  69.7  0.00000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3247  integrase/recombinase XerC  29.59 
 
 		 296 aa  68.9  0.0000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1201  site-specific tyrosine recombinase XerD  29.91 
 
 		 321 aa  67.4  0.0000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.731595  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0159  integrase family protein  29.79 
 
 		 295 aa  67.4  0.0000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1982  tyrosine recombinase XerC  27.75 
 
 		 298 aa  66.2  0.0000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0026523  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1659  tyrosine recombinase XerD  34.52 
 
 		 254 aa  66.2  0.0000000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05531  site-specific tyrosine recombinase XerC  23.84 
 
 		 347 aa  66.2  0.0000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5250  site-specific tyrosine recombinase XerC  31.68 
 
 		 298 aa  66.2  0.0000000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0063  tyrosine recombinase XerC  29.01 
 
 		 304 aa  66.2  0.0000000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2501  site-specific tyrosine recombinase XerC  28.5 
 
 		 312 aa  66.2  0.0000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.504706  normal  0.936606 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1322  integrase family protein  28.05 
 
 		 329 aa  66.2  0.0000000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.86275  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4127  tyrosine recombinase XerC  28.4 
 
 		 301 aa  65.9  0.000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.442069 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2260  integrase family protein  29.48 
 
 		 395 aa  65.9  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.46728  normal  0.0539974 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3115  phage integrase  28.14 
 
 		 298 aa  65.9  0.000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2996  tyrosine recombinase XerC  31.69 
 
 		 323 aa  65.9  0.000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03687  site-specific tyrosine recombinase XerC  31.68 
 
 		 298 aa  64.7  0.000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.446663  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1225  integrase family protein  30.54 
 
 		 301 aa  65.1  0.000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.103765  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4168  tyrosine recombinase XerC  31.68 
 
 		 298 aa  64.7  0.000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4196  site-specific tyrosine recombinase XerC  31.68 
 
 		 298 aa  64.7  0.000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0689633  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03636  hypothetical protein  31.68 
 
 		 298 aa  64.7  0.000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.487194  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4036  site-specific tyrosine recombinase XerC  31.68 
 
 		 298 aa  64.7  0.000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0704  integrase family protein  27.33 
 
 		 305 aa  65.1  0.000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000143659  unclonable  0.0000000274126 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4271  site-specific tyrosine recombinase XerC  31.68 
 
 		 298 aa  64.7  0.000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3993  tyrosine recombinase XerC  27.38 
 
 		 306 aa  64.7  0.000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4177  site-specific tyrosine recombinase XerC  31.68 
 
 		 298 aa  64.7  0.000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0208532 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0047  tyrosine recombinase XerC  30.6 
 
 		 298 aa  65.1  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4330  site-specific tyrosine recombinase XerC  31.68 
 
 		 298 aa  64.7  0.000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1060  tyrosine recombinase XerD  29.7 
 
 		 295 aa  64.3  0.000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.17947  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1786  tyrosine recombinase XerD  29.76 
 
 		 291 aa  64.3  0.000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0596225  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3894  tyrosine recombinase XerC  27.38 
 
 		 306 aa  64.7  0.000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00533729 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3981  site-specific tyrosine recombinase XerC  30.43 
 
 		 300 aa  64.7  0.000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.105897  normal  0.285215 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1082  integrase family protein  21.85 
 
 		 290 aa  64.7  0.000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0651  tyrosine recombinase XerC subunit  29.34 
 
 		 307 aa  64.3  0.000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4087  tyrosine recombinase XerC  27.38 
 
 		 306 aa  64.7  0.000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0169707 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19920  tyrosine recombinase XerD  28.82 
 
 		 317 aa  64.7  0.000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.210765  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0394  tyrosine recombinase XerC  26.99 
 
 		 299 aa  64.3  0.000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4336  site-specific tyrosine recombinase XerC  29.81 
 
 		 300 aa  64.3  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0676  tyrosine recombinase XerD subunit  23.35 
 
 		 296 aa  64.3  0.000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0393  tyrosine recombinase XerC  26.99 
 
 		 299 aa  64.3  0.000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.426652 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4229  site-specific tyrosine recombinase XerC  29.81 
 
 		 300 aa  64.3  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4277  site-specific tyrosine recombinase XerC  29.81 
 
 		 300 aa  64.3  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4177  site-specific tyrosine recombinase XerC  29.81 
 
 		 300 aa  64.3  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.225708  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4159  site-specific tyrosine recombinase XerC  29.81 
 
 		 300 aa  64.3  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.937296  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3631  tyrosine recombinase XerC  26.99 
 
 		 299 aa  64.3  0.000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.465228 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3304  tyrosine recombinase XerD  28.64 
 
 		 298 aa  63.9  0.000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0133185  normal  0.394454 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1320  tyrosine recombinase XerD  28.98 
 
 		 302 aa  63.9  0.000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1299  site-specific tyrosine recombinase XerC  29.19 
 
 		 291 aa  63.5  0.000000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0602  site-specific tyrosine recombinase XerC  31.68 
 
 		 324 aa  63.9  0.000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00926796 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4306  integrase/recombinase XerC  27.61 
 
 		 299 aa  63.5  0.000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4581  hypothetical protein  50 
 
 		 116 aa  63.5  0.000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.804527  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0047  integrase family protein  24.58 
 
 		 314 aa  63.5  0.000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.456307  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3665  integrase family protein  29.94 
 
 		 313 aa  63.2  0.000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.211751 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1821  integrase family protein  21.95 
 
 		 307 aa  63.2  0.000000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0364742  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3971  tyrosine recombinase XerC  27.38 
 
 		 306 aa  63.2  0.000000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2821  tyrosine recombinase XerD  27.44 
 
 		 313 aa  62.8  0.000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.346068  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0920  site-specific tyrosine recombinase XerD  31.76 
 
 		 299 aa  62.8  0.000000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0879  site-specific tyrosine recombinase XerD  31.76 
 
 		 299 aa  62.8  0.000000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.201006  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3847  site-specific tyrosine recombinase XerD  31.76 
 
 		 299 aa  62.8  0.000000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.349121 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1524  integrase family protein  27.49 
 
 		 300 aa  62.4  0.00000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.681425  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3243  tyrosine recombinase XerC subunit  27.62 
 
 		 335 aa  62.8  0.00000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3661  site-specific tyrosine recombinase XerC  29.45 
 
 		 311 aa  62.8  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0198  tyrosine recombinase XerC subunit  27.81 
 
 		 291 aa  62  0.00000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0021573 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0602  phage integrase family protein  29.1 
 
 		 317 aa  62.4  0.00000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00243284  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4851  integrase family protein  21.58 
 
 		 294 aa  62.4  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3312  site-specific tyrosine recombinase XerD  30.59 
 
 		 298 aa  62.4  0.00000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3139  phage integrase family protein  28.09 
 
 		 344 aa  62.8  0.00000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.424721  normal  0.214127 
 
 
-
 
NC_002978  WD0752  phage integrase family site specific recombinase  26.06 
 
 		 309 aa  62  0.00000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.232674  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0052  phage integrase  25.26 
 
 		 312 aa  61.6  0.00000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1427  tyrosine recombinase XerD subunit  29.7 
 
 		 295 aa  61.2  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0801  phage integrase family protein  30.27 
 
 		 326 aa  61.2  0.00000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0393  tyrosine recombinase XerC  28.05 
 
 		 321 aa  61.6  0.00000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2860  tyrosine recombinase XerC subunit  27.81 
 
 		 300 aa  61.6  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2809  phage integrase family protein  27 
 
 		 311 aa  61.6  0.00000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1178  tyrosine recombinase XerC subunit  23.56 
 
 		 300 aa  61.6  0.00000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2471  tyrosine recombinase XerC subunit  29.05 
 
 		 308 aa  61.6  0.00000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0340389  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>