19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_4581 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009077  Mjls_4581  hypothetical protein  100 
 
 
116 aa  230  4.0000000000000004e-60  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.804527  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5291  hypothetical protein  63.37 
 
 
223 aa  114  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.150619  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0038  integrase family protein  39.45 
 
 
373 aa  72  0.000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.967515  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2908  phage integrase family protein  64.58 
 
 
147 aa  67.4  0.00000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1980  phage integrase family protein  56.9 
 
 
132 aa  65.9  0.0000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.782566  normal  0.263895 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4341  phage integrase family protein  60 
 
 
368 aa  65.5  0.0000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.693444  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2200  phage integrase family protein  60 
 
 
368 aa  65.5  0.0000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.343714  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2644  phage integrase family protein  53.45 
 
 
373 aa  64.7  0.0000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.135178  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2600  phage integrase  53.45 
 
 
373 aa  64.7  0.0000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06640  site-specific recombinase XerD  50 
 
 
373 aa  63.5  0.000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2641  integrase family protein  50 
 
 
377 aa  56.6  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1585  tyrosine recombinase XerD  34.69 
 
 
295 aa  47.4  0.00006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1554  tyrosine recombinase XerD  34.69 
 
 
295 aa  47.4  0.00006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1560  tyrosine recombinase XerD  37.66 
 
 
331 aa  42.4  0.002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.736869  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1266  tyrosine recombinase XerD  36.25 
 
 
310 aa  42  0.003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5431  tyrosine recombinase XerD  35.16 
 
 
299 aa  41.2  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.060431  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4696  integrase family protein  43.1 
 
 
306 aa  40.8  0.006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2452  tyrosine recombinase XerD  40.58 
 
 
306 aa  40.8  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0952029  normal  0.728507 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1520  tyrosine recombinase XerD  34.34 
 
 
362 aa  40.8  0.007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000383292 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>