More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_2641 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_2641  integrase family protein  100 
 
 		 377 aa  773    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0038  integrase family protein  49.45 
 
 		 373 aa  356  2.9999999999999997e-97  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.967515  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06640  site-specific recombinase XerD  50.57 
 
 		 373 aa  354  1e-96  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4341  phage integrase family protein  43.38 
 
 		 368 aa  288  1e-76  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.693444  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2200  phage integrase family protein  43.1 
 
 		 368 aa  287  2e-76  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.343714  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2600  phage integrase  45.45 
 
 		 373 aa  276  3e-73  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2644  phage integrase family protein  45.45 
 
 		 373 aa  276  3e-73  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.135178  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4576  hypothetical protein  45.34 
 
 		 315 aa  249  5e-65  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.531442  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2908  phage integrase family protein  45.59 
 
 		 147 aa  126  5e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1980  phage integrase family protein  48.76 
 
 		 132 aa  115  1.0000000000000001e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.782566  normal  0.263895 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1668  tyrosine recombinase XerD subunit  27.12 
 
 		 295 aa  104  2e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.179488  normal  0.0195248 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0574  integrase family protein  29.64 
 
 		 304 aa  100  6e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000663621  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1159  integrase family protein  29.47 
 
 		 344 aa  99.8  6e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.226555 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4725  phage integrase family protein  30.88 
 
 		 375 aa  99  1e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.675287  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0582  phage integrase family protein  28.37 
 
 		 355 aa  95.5  1e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5943  phage integrase family protein  28.37 
 
 		 355 aa  95.5  1e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.702508  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0474  phage integrase family protein  28.37 
 
 		 355 aa  95.5  1e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0716  tyrosine recombinase XerC  25.16 
 
 		 307 aa  94.7  2e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.841608  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1970  site-specific tyrosine recombinase XerC  29.28 
 
 		 300 aa  94.4  3e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.397741 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0651  tyrosine recombinase XerC subunit  30.35 
 
 		 307 aa  94  3e-18  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1990  site-specific tyrosine recombinase XerC  29.28 
 
 		 300 aa  94  3e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2036  site-specific tyrosine recombinase XerC  29.28 
 
 		 300 aa  94  3e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0541579  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3920  site-specific tyrosine recombinase XerD  27.78 
 
 		 296 aa  94  4e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000317777  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1028  tyrosine recombinase XerD subunit  32.95 
 
 		 313 aa  93.6  5e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00856798  unclonable  0.00000000634873 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3550  integrase family protein  34.52 
 
 		 324 aa  93.6  6e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.74971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2821  tyrosine recombinase XerD  25.47 
 
 		 313 aa  93.2  7e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.346068  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1982  tyrosine recombinase XerC  25.83 
 
 		 298 aa  92.8  8e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0026523  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_623  site-specific recombinase  30.35 
 
 		 307 aa  92.8  9e-18  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1025  tyrosine recombinase XerD subunit  26.72 
 
 		 302 aa  91.7  2e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3999  site-specific tyrosine recombinase XerD  27.12 
 
 		 296 aa  91.3  2e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.189801  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3830  site-specific tyrosine recombinase XerD  27.12 
 
 		 296 aa  91.3  2e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3846  site-specific tyrosine recombinase XerD  27.12 
 
 		 296 aa  91.3  2e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0256715  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4113  site-specific tyrosine recombinase XerD  27.12 
 
 		 296 aa  91.3  2e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.00015e-24 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4311  site-specific tyrosine recombinase XerD  27.12 
 
 		 296 aa  91.3  2e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.789664  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4218  phage integrase family protein  29.04 
 
 		 352 aa  91.3  2e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4158  site-specific tyrosine recombinase XerD  27.12 
 
 		 296 aa  90.9  3e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.44443  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4222  site-specific tyrosine recombinase XerD  27.12 
 
 		 296 aa  90.9  3e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00160259  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1225  integrase family protein  33.93 
 
 		 301 aa  90.1  6e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.103765  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4199  site-specific tyrosine recombinase XerD  27.45 
 
 		 296 aa  89.7  7e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00345142  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1038  site-specific tyrosine recombinase XerD  27.45 
 
 		 296 aa  89.7  7e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00331502  normal  0.0102802 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4274  phage integrase family protein  29.45 
 
 		 363 aa  89.7  8e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2501  site-specific tyrosine recombinase XerC  35.8 
 
 		 312 aa  89.7  8e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.504706  normal  0.936606 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4805  tyrosine recombinase XerC  28.74 
 
 		 367 aa  89.4  9e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.104736  normal  0.146847 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2344  phage integrase  32.79 
 
 		 322 aa  89.4  1e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0456613  normal  0.219342 
 
 
-
 
NC_002936  DET1215  tyrosine recombinase XerD  26.34 
 
 		 302 aa  88.2  2e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.157843  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2735  integrase family protein  35 
 
 		 355 aa  88.2  2e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_998  integrase/recombinase  26.34 
 
 		 302 aa  88.6  2e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15290  tyrosine recombinase XerD subunit  34.71 
 
 		 332 aa  88.2  2e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.203953  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2194  integrase family protein  35.87 
 
 		 317 aa  88.2  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.103281  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2540  integrase family protein  35 
 
 		 355 aa  88.2  2e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2452  tyrosine recombinase XerD  27.4 
 
 		 306 aa  87.8  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0952029  normal  0.728507 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0401  site-specific tyrosine recombinase XerC  28.06 
 
 		 324 aa  87.8  3e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.145415 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1282  tyrosine recombinase XerD  28.34 
 
 		 295 aa  87.4  3e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.63418  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0536  site-specific tyrosine recombinase XerC  36.78 
 
 		 300 aa  87  5e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.538013  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1099  tyrosine recombinase XerD  24.92 
 
 		 296 aa  86.7  6e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0676  tyrosine recombinase XerD subunit  23.49 
 
 		 296 aa  86.7  7e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2788  site-specific tyrosine recombinase XerD  26.8 
 
 		 296 aa  86.7  7e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000777667  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2260  integrase family protein  34.86 
 
 		 395 aa  86.3  8e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.46728  normal  0.0539974 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4655  tyrosine recombinase XerC  28.45 
 
 		 365 aa  85.9  0.000000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.223284 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1060  tyrosine recombinase XerD  31.4 
 
 		 295 aa  85.5  0.000000000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.17947  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4288  tyrosine recombinase XerC  28.45 
 
 		 365 aa  85.9  0.000000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.710874 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1177  integrase family protein  36.21 
 
 		 329 aa  85.5  0.000000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.151473 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1220  site-specific tyrosine recombinase XerC  33.72 
 
 		 330 aa  85.5  0.000000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09590  tyrosine recombinase XerD  28.57 
 
 		 302 aa  85.5  0.000000000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.0503565 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0564  tyrosine recombinase XerC subunit  32.6 
 
 		 328 aa  85.5  0.000000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0602  site-specific tyrosine recombinase XerC  35.07 
 
 		 324 aa  84.7  0.000000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00926796 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2257  site-specific tyrosine recombinase XerD  32.14 
 
 		 299 aa  84.7  0.000000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.977256  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4696  integrase family protein  27.85 
 
 		 306 aa  84.7  0.000000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1457  integrase family protein  35.93 
 
 		 326 aa  85.1  0.000000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0180  site-specific tyrosine recombinase XerC  35.06 
 
 		 324 aa  85.1  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4135  site-specific tyrosine recombinase XerC  28.71 
 
 		 300 aa  84.7  0.000000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.383086  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0842  hypothetical protein  31.93 
 
 		 290 aa  85.1  0.000000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2788  tyrosine recombinase XerC  32.86 
 
 		 343 aa  85.5  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0114244  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1202  tyrosine recombinase XerC  27.39 
 
 		 304 aa  84.3  0.000000000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.910177  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00203  tyrosine recombinase  22.78 
 
 		 306 aa  84.3  0.000000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2210  integrase family protein  27.12 
 
 		 295 aa  84.7  0.000000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000241024 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3403  site-specific tyrosine recombinase XerC  37.8 
 
 		 313 aa  84.3  0.000000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0124  phage integrase family protein  22.6 
 
 		 298 aa  84.3  0.000000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.776243  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2957  site-specific tyrosine recombinase XerD  26.14 
 
 		 318 aa  84  0.000000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.271721  normal  0.636956 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1501  tyrosine recombinase XerD subunit  27.52 
 
 		 295 aa  84  0.000000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5431  tyrosine recombinase XerD  28.8 
 
 		 299 aa  84  0.000000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.060431  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0367  site-specific tyrosine recombinase XerD  33.53 
 
 		 298 aa  84  0.000000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2105  tyrosine recombinase XerD  27.49 
 
 		 297 aa  84  0.000000000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.179497  hitchhiker  0.00877552 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0727  tyrosine recombinase XerD  24.03 
 
 		 304 aa  83.6  0.000000000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.689003 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2881  tyrosine recombinase XerC  32.38 
 
 		 343 aa  83.6  0.000000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.312354  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2689  tyrosine recombinase XerC  34.71 
 
 		 311 aa  83.6  0.000000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.147909 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0247  integrase family protein  34.97 
 
 		 322 aa  83.6  0.000000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.121071  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3139  phage integrase family protein  35.15 
 
 		 344 aa  83.2  0.000000000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.424721  normal  0.214127 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2809  phage integrase family protein  28.13 
 
 		 311 aa  83.2  0.000000000000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0325  tyrosine recombinase XerC  26.74 
 
 		 297 aa  82.8  0.000000000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1241  tyrosine recombinase XerD  29.69 
 
 		 311 aa  82.8  0.000000000000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.657845  normal  0.578091 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1996  site-specific tyrosine recombinase XerC  33.14 
 
 		 300 aa  82.8  0.000000000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0704  integrase family protein  25.64 
 
 		 305 aa  82.8  0.000000000000009  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000143659  unclonable  0.0000000274126 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0131  integrase family protein  32.84 
 
 		 312 aa  82  0.00000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.144823 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0861  integrase/recombinase XerC  33.74 
 
 		 304 aa  82  0.00000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19920  tyrosine recombinase XerD  32.56 
 
 		 317 aa  82  0.00000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.210765  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2695  tyrosine recombinase XerC  32.86 
 
 		 342 aa  82.8  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.400065  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1473  tyrosine recombinase XerD  21.77 
 
 		 296 aa  82.4  0.00000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.202075  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2471  tyrosine recombinase XerC subunit  34.94 
 
 		 308 aa  82.4  0.00000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0340389  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0452  tyrosine recombinase XerC subunit  33.93 
 
 		 335 aa  82.8  0.00000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.577676  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>