More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_4218 on replicon NC_008539
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008538  Arth_4274  phage integrase family protein  95.17 
 
 		 363 aa  692    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4218  phage integrase family protein  100 
 
 		 352 aa  721    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4725  phage integrase family protein  57.06 
 
 		 375 aa  398  1e-109  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.675287  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5552  phage integrase family protein  46.55 
 
 		 360 aa  310  2e-83  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0894209 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6372  integrase family protein  46.85 
 
 		 358 aa  276  5e-73  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2735  integrase family protein  40.82 
 
 		 355 aa  262  6e-69  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2540  integrase family protein  40.82 
 
 		 355 aa  262  6e-69  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3445  integrase family protein  41.44 
 
 		 358 aa  249  6e-65  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.210447  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0582  phage integrase family protein  34.97 
 
 		 355 aa  176  4e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5943  phage integrase family protein  34.97 
 
 		 355 aa  176  4e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.702508  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0474  phage integrase family protein  34.97 
 
 		 355 aa  176  4e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2644  phage integrase family protein  29.57 
 
 		 373 aa  96.7  5e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.135178  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2600  phage integrase  29.57 
 
 		 373 aa  96.7  5e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2641  integrase family protein  29.04 
 
 		 377 aa  91.3  2e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0144  tyrosine recombinase XerD  31.32 
 
 		 305 aa  79.7  0.00000000000006  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1215  tyrosine recombinase XerD  28.85 
 
 		 302 aa  76.6  0.0000000000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.157843  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1622  tyrosine recombinase XerD  23.88 
 
 		 310 aa  76.6  0.0000000000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3245  phage integrase family protein  30.14 
 
 		 312 aa  75.9  0.0000000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.676462  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0409  Phage integrase  26.79 
 
 		 317 aa  75.1  0.000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.383536  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1025  tyrosine recombinase XerD subunit  27.62 
 
 		 302 aa  74.7  0.000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_998  integrase/recombinase  28.52 
 
 		 302 aa  74.7  0.000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0201  tyrosine recombinase XerC subunit  29.18 
 
 		 345 aa  74.3  0.000000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000601095 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0884  integrase  24.14 
 
 		 302 aa  74.3  0.000000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.161871  hitchhiker  0.000000000000894527 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0507  tyrosine recombinase XerD  32.85 
 
 		 339 aa  73.9  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0221  phage integrase  30.36 
 
 		 349 aa  73.6  0.000000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.118358  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2346  tyrosine recombinase XerC  30.41 
 
 		 302 aa  73.9  0.000000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.126195  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00307  site-specific tyrosine recombinase XerC  27.24 
 
 		 313 aa  73.6  0.000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0602  site-specific tyrosine recombinase XerC  34.24 
 
 		 324 aa  73.2  0.000000000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00926796 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0452  tyrosine recombinase XerC subunit  32.49 
 
 		 335 aa  73.2  0.000000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.577676  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0341  tyrosine recombinase XerC  31.66 
 
 		 317 aa  72.4  0.00000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000100724  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0350  phage integrase family protein  30.16 
 
 		 341 aa  71.6  0.00000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000105216  hitchhiker  0.0000498769 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4127  tyrosine recombinase XerC  30.15 
 
 		 301 aa  72  0.00000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.442069 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0325  tyrosine recombinase XerC  30.22 
 
 		 297 aa  71.6  0.00000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3062  site-specific tyrosine recombinase XerD  27.85 
 
 		 308 aa  71.6  0.00000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00203  tyrosine recombinase  25.73 
 
 		 306 aa  72  0.00000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0842  hypothetical protein  26.84 
 
 		 290 aa  72  0.00000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0106  phage integrase family protein  26.28 
 
 		 295 aa  71.6  0.00000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0861  integrase/recombinase XerC  34.68 
 
 		 304 aa  70.9  0.00000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002113  tyrosine recombinase XerC  26.26 
 
 		 310 aa  71.2  0.00000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1191  site-specific tyrosine recombinase XerC  34.21 
 
 		 313 aa  70.5  0.00000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.60628  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1202  tyrosine recombinase XerC  29.28 
 
 		 304 aa  70.9  0.00000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.910177  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0426  site-specific tyrosine recombinase XerC  32.61 
 
 		 321 aa  70.5  0.00000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1513  site-specific recombinase  27.17 
 
 		 295 aa  70.1  0.00000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.110584  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10430  site-specific recombinase XerD  24.86 
 
 		 313 aa  70.1  0.00000000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00129547  unclonable  0.000000000966981 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0989  integrase family protein  31.69 
 
 		 292 aa  69.7  0.00000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0618431 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06640  site-specific recombinase XerD  27.59 
 
 		 373 aa  69.7  0.00000000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0180  site-specific tyrosine recombinase XerC  34.04 
 
 		 324 aa  69.3  0.00000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0358  integrase family protein  22.26 
 
 		 287 aa  69.3  0.00000000009  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3124  integrase family protein  33.86 
 
 		 323 aa  69.3  0.0000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5470  tyrosine recombinase XerD  29.61 
 
 		 316 aa  68.9  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.602612  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0487  tyrosine recombinase XerC  26.16 
 
 		 293 aa  68.9  0.0000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000269064 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4655  tyrosine recombinase XerC  32.07 
 
 		 365 aa  68.9  0.0000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.223284 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4288  tyrosine recombinase XerC  32.07 
 
 		 365 aa  68.9  0.0000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.710874 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0163  integrase family protein  31.91 
 
 		 342 aa  68.9  0.0000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.70922  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0470  tyrosine recombinase XerC  31.25 
 
 		 293 aa  68.6  0.0000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3665  integrase family protein  33.72 
 
 		 313 aa  68.9  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.211751 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0238  site-specific tyrosine recombinase XerC  33.15 
 
 		 306 aa  68.6  0.0000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0625179  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1585  site-specific recombinase XerD-like  29.23 
 
 		 332 aa  68.6  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.264485  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0488  tyrosine recombinase XerD  30.48 
 
 		 319 aa  68.6  0.0000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0536  site-specific tyrosine recombinase XerC  32.45 
 
 		 300 aa  68.6  0.0000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.538013  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3715  integrase family protein  29.08 
 
 		 298 aa  68.2  0.0000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0285  tyrosine recombinase XerC  31.61 
 
 		 302 aa  68.2  0.0000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0767  integrase family protein  32.02 
 
 		 371 aa  67.4  0.0000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0883457 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0401  site-specific tyrosine recombinase XerC  33.33 
 
 		 324 aa  67.8  0.0000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.145415 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1390  site-specific tyrosine recombinase XerC  27.64 
 
 		 328 aa  67.4  0.0000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000179914  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2471  tyrosine recombinase XerC subunit  30.48 
 
 		 308 aa  67.4  0.0000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0340389  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4805  tyrosine recombinase XerC  32.07 
 
 		 367 aa  67.8  0.0000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.104736  normal  0.146847 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1163  phage integrase family protein  30.54 
 
 		 472 aa  67.4  0.0000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.562087  normal  0.524123 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5408  phage integrase family protein  33.14 
 
 		 330 aa  67  0.0000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.123433 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0198  tyrosine recombinase XerC subunit  28.65 
 
 		 291 aa  67  0.0000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0021573 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1225  integrase family protein  29.24 
 
 		 301 aa  67  0.0000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.103765  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0918  integrase  25.18 
 
 		 307 aa  67  0.0000000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.0200604 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2528  tyrosine recombinase XerC  30.5 
 
 		 294 aa  66.6  0.0000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.237042 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0393  tyrosine recombinase XerD  32.81 
 
 		 319 aa  66.6  0.0000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.543195  normal  0.555297 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11988  putative tyrosine recombinase  28.05 
 
 		 298 aa  66.6  0.0000000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2210  integrase family protein  31.55 
 
 		 295 aa  66.2  0.0000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000241024 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2381  site-specific tyrosine recombinase XerC  32.31 
 
 		 311 aa  66.2  0.0000000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0279  phage integrase family protein  26.58 
 
 		 282 aa  66.2  0.0000000008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.033075  hitchhiker  0.000013626 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10100  site-specific recombinase XerD  33.7 
 
 		 332 aa  65.9  0.0000000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0818  tyrosine recombinase XerC  25.51 
 
 		 296 aa  65.5  0.000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.368613  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0688  integrase family protein  28.1 
 
 		 336 aa  65.9  0.000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2194  integrase family protein  32.45 
 
 		 317 aa  65.5  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.103281  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0367  site-specific tyrosine recombinase XerD  26.76 
 
 		 298 aa  65.5  0.000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0645  site-specific tyrosine recombinase XerD  27.18 
 
 		 299 aa  65.5  0.000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.241995  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23640  tyrosine recombinase XerC subunit  26.96 
 
 		 310 aa  65.5  0.000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.154193  normal  0.0993098 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1750  tyrosine recombinase XerD  27.15 
 
 		 294 aa  65.5  0.000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0083  site-specific tyrosine recombinase XerC  30.53 
 
 		 322 aa  65.5  0.000000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0394  tyrosine recombinase XerC  29.63 
 
 		 299 aa  65.9  0.000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3631  tyrosine recombinase XerC  29.63 
 
 		 299 aa  65.9  0.000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.465228 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0607  recombinase  24.47 
 
 		 296 aa  65.9  0.000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0393  tyrosine recombinase XerC  29.63 
 
 		 299 aa  65.9  0.000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.426652 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0159  integrase family protein  33.71 
 
 		 295 aa  65.1  0.000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3090  tyrosine recombinase XerD  27.85 
 
 		 320 aa  65.1  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3619  phage integrase family protein  33.15 
 
 		 309 aa  64.7  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.215155  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3189  integrase family protein  30.85 
 
 		 320 aa  65.1  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00303256 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08760  tyrosine recombinase XerD  29.26 
 
 		 309 aa  65.1  0.000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.940341  unclonable  0.00000000128305 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0447  tyrosine recombinase XerC  29.41 
 
 		 299 aa  64.7  0.000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0067  phage integrase family protein  26.95 
 
 		 328 aa  64.7  0.000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.183253 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0038  integrase family protein  31.43 
 
 		 373 aa  65.1  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.967515  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4306  integrase/recombinase XerC  30.69 
 
 		 299 aa  64.3  0.000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>