53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_4576 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009077  Mjls_4576  hypothetical protein  100 
 
 		 315 aa  642    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.531442  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2641  integrase family protein  45.34 
 
 		 377 aa  264  1e-69  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06640  site-specific recombinase XerD  45.78 
 
 		 373 aa  264  2e-69  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2644  phage integrase family protein  46.3 
 
 		 373 aa  243  3.9999999999999997e-63  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.135178  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2600  phage integrase  46.3 
 
 		 373 aa  243  3.9999999999999997e-63  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0038  integrase family protein  43.04 
 
 		 373 aa  239  4e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.967515  normal  1 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4341  phage integrase family protein  41.16 
 
 		 368 aa  207  2e-52  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.693444  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2200  phage integrase family protein  40.84 
 
 		 368 aa  207  2e-52  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.343714  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0582  phage integrase family protein  28.52 
 
 		 355 aa  67.8  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5943  phage integrase family protein  28.52 
 
 		 355 aa  67.8  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.702508  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0474  phage integrase family protein  28.52 
 
 		 355 aa  67.8  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5552  phage integrase family protein  27.34 
 
 		 360 aa  60.8  0.00000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0894209 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2908  phage integrase family protein  38.37 
 
 		 147 aa  59.3  0.00000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4725  phage integrase family protein  27.08 
 
 		 375 aa  57.4  0.0000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.675287  normal  1 
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4218  phage integrase family protein  26.17 
 
 		 352 aa  55.8  0.0000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3617  phage integrase family protein  23.5 
 
 		 305 aa  54.3  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3671  phage integrase family protein  28.78 
 
 		 305 aa  52  0.00001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1082  integrase family protein  23.45 
 
 		 290 aa  52  0.00001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4274  phage integrase family protein  26.32 
 
 		 363 aa  52  0.00001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0082  site-specific tyrosine recombinase XerC  31.88 
 
 		 339 aa  51.2  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.472951  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0651  tyrosine recombinase XerC subunit  25.83 
 
 		 307 aa  50.1  0.00005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3642  phage integrase family protein  28.68 
 
 		 305 aa  49.7  0.00007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.000185721  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1980  phage integrase family protein  40.62 
 
 		 132 aa  49.3  0.00008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.782566  normal  0.263895 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0057  site-specific tyrosine recombinase XerC  29.73 
 
 		 369 aa  49.3  0.00009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.326798  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2344  phage integrase  32.58 
 
 		 322 aa  48.5  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0456613  normal  0.219342 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00203  tyrosine recombinase  23.05 
 
 		 306 aa  47  0.0004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2544  tyrosine recombinase XerC  28.36 
 
 		 318 aa  47  0.0004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.774585  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3710  phage integrase family protein  26.23 
 
 		 305 aa  47  0.0005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0716  tyrosine recombinase XerC  27.03 
 
 		 307 aa  46.6  0.0006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.841608  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0010  tyrosine recombinase XerC  20.87 
 
 		 299 aa  46.2  0.0008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3445  integrase family protein  33.58 
 
 		 358 aa  45.4  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.210447  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0367  site-specific tyrosine recombinase XerD  31.11 
 
 		 298 aa  45.4  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_623  site-specific recombinase  24.44 
 
 		 307 aa  45.8  0.001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0235  integrase family protein  26.44 
 
 		 289 aa  45.4  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1060  tyrosine recombinase XerD  24.9 
 
 		 295 aa  45.1  0.002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.17947  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0350  phage integrase family protein  28.79 
 
 		 341 aa  44.3  0.002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000105216  hitchhiker  0.0000498769 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2881  tyrosine recombinase XerC  25.29 
 
 		 343 aa  44.7  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.312354  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0879  site-specific tyrosine recombinase XerD  28.57 
 
 		 299 aa  44.3  0.003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.201006  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2695  tyrosine recombinase XerC  24.9 
 
 		 342 aa  44.3  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.400065  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0920  site-specific tyrosine recombinase XerD  28.57 
 
 		 299 aa  44.3  0.003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3847  site-specific tyrosine recombinase XerD  28.57 
 
 		 299 aa  44.3  0.003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.349121 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8253  phage integrase family protein  26.35 
 
 		 409 aa  43.9  0.004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.564196  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2689  tyrosine recombinase XerC  23.22 
 
 		 311 aa  43.9  0.004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.147909 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4076  phage integrase  25.76 
 
 		 298 aa  43.1  0.005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0139  tyrosine recombinase XerD  26.42 
 
 		 312 aa  43.5  0.005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0912  integrase/recombinase  27.63 
 
 		 304 aa  43.5  0.005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0261382  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2788  tyrosine recombinase XerC  24.9 
 
 		 343 aa  43.1  0.006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0114244  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3665  integrase family protein  30.15 
 
 		 313 aa  43.1  0.006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.211751 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3796  phage integrase family protein  28.48 
 
 		 304 aa  43.1  0.007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1159  integrase family protein  30.3 
 
 		 344 aa  42.7  0.007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.226555 
 
 
-
 
NC_014000  Ava_D0026  Phage integrase  31.13 
 
 		 309 aa  42.7  0.007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2471  tyrosine recombinase XerC subunit  33.33 
 
 		 308 aa  42.4  0.01  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0340389  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0221  phage integrase  25.49 
 
 		 349 aa  42.4  0.01  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.118358  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>