More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC7_0880 on replicon NC_009637
Organism: Methanococcus maripaludis C7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009637  MmarC7_0880  phage integrase family protein  100 
 
 
291 aa  594  1e-169  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.0027577 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0240  tyrosine recombinase XerC subunit  45.6 
 
 
291 aa  224  1e-57  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.295303  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0653  integrase family protein  39.76 
 
 
282 aa  211  1e-53  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.319783  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0279  phage integrase family protein  41.53 
 
 
282 aa  202  5e-51  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.033075  hitchhiker  0.000013626 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0762  phage integrase family protein  41.09 
 
 
287 aa  201  9.999999999999999e-51  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0574  integrase family protein  34.71 
 
 
295 aa  174  9.999999999999999e-43  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1297  phage integrase family protein  34.02 
 
 
295 aa  171  1e-41  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0949  phage integrase family protein  35.82 
 
 
275 aa  170  2e-41  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.427827  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2378  tyrosine recombinase XerD  28.36 
 
 
296 aa  108  7.000000000000001e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.336575 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2544  site-specific tyrosine recombinase XerD  27.76 
 
 
308 aa  107  2e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5117  tyrosine recombinase XerD  28.27 
 
 
327 aa  105  7e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.843466 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0519  site-specific tyrosine recombinase XerD  28.51 
 
 
302 aa  105  1e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0998774  normal  0.238721 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0988  tyrosine recombinase XerD  28.63 
 
 
303 aa  105  1e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.252447  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0903  tyrosine recombinase XerD  28.63 
 
 
303 aa  105  1e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0523  site-specific tyrosine recombinase XerD  27.59 
 
 
315 aa  104  2e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.221654  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2022  tyrosine recombinase XerD subunit  28.81 
 
 
309 aa  104  2e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1185  tyrosine recombinase XerD  29.96 
 
 
310 aa  103  3e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.497096  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1313  tyrosine recombinase XerD  28.27 
 
 
309 aa  103  4e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0537  tyrosine recombinase XerD subunit  29.75 
 
 
302 aa  103  4e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3212  site-specific tyrosine recombinase XerD  29.31 
 
 
311 aa  102  8e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2329  tyrosine recombinase XerD  30.28 
 
 
277 aa  102  9e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00235896  normal  0.0350779 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0577  site-specific tyrosine recombinase XerD  27.54 
 
 
305 aa  101  1e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0855221  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1971  tyrosine recombinase XerD subunit  28.15 
 
 
309 aa  100  2e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000860406  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0750  site-specific tyrosine recombinase XerD  29.31 
 
 
311 aa  100  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3458  tyrosine recombinase XerD  28.05 
 
 
303 aa  100  3e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.664548  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0359  tyrosine recombinase XerD  29.66 
 
 
290 aa  100  4e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00723526 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0098  integrase family protein  31.74 
 
 
298 aa  99.8  5e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11080  phage integrase family protein  32.13 
 
 
310 aa  99.8  5e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0105178  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0626  site-specific tyrosine recombinase XerC  31.25 
 
 
315 aa  99.4  7e-20  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0319  tyrosine recombinase XerD  27.86 
 
 
307 aa  99.4  7e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.944891  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0292  tyrosine recombinase XerD  34.81 
 
 
305 aa  99  8e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0369  site-specific tyrosine recombinase XerD  29.79 
 
 
305 aa  99  9e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1067  site-specific tyrosine recombinase XerD  29.79 
 
 
305 aa  99  9e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0669  site-specific tyrosine recombinase XerD  29.79 
 
 
305 aa  99  9e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0047  tyrosine recombinase XerC  26.33 
 
 
298 aa  97.4  2e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2105  tyrosine recombinase XerD  28.28 
 
 
297 aa  97.8  2e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.179497  hitchhiker  0.00877552 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0519  phage integrase family protein  26.26 
 
 
300 aa  97.8  2e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.24612  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0914  site-specific tyrosine recombinase XerD  29.79 
 
 
333 aa  98.2  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.1246  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0911  site-specific tyrosine recombinase XerD  29.79 
 
 
333 aa  98.2  2e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0118  site-specific tyrosine recombinase XerD  29.79 
 
 
333 aa  98.2  2e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.412982  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2504  site-specific tyrosine recombinase XerD  29.79 
 
 
329 aa  97.8  2e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5891  site-specific tyrosine recombinase XerD  28.94 
 
 
316 aa  97.1  3e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.51818 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5250  site-specific tyrosine recombinase XerC  30.42 
 
 
298 aa  97.4  3e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0184  site-specific tyrosine recombinase XerC  26.81 
 
 
303 aa  97.1  3e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.72736  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1716  tyrosine recombinase XerD  27.62 
 
 
303 aa  97.1  3e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.500655  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0842  hypothetical protein  31.14 
 
 
290 aa  97.1  3e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2607  site-specific tyrosine recombinase XerD  28.94 
 
 
322 aa  97.4  3e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2346  tyrosine recombinase XerC  27.87 
 
 
302 aa  97.4  3e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.126195  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2383  tyrosine recombinase XerD  26.39 
 
 
295 aa  96.7  4e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0726  site-specific tyrosine recombinase XerD  29.36 
 
 
333 aa  96.7  4e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.218987  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03409  tyrosine recombinase  26.57 
 
 
308 aa  96.7  4e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3654  site-specific tyrosine recombinase XerC  25.9 
 
 
301 aa  96.3  5e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000489449  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0737  site-specific tyrosine recombinase XerD  28.33 
 
 
316 aa  95.9  6e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.088128  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03687  site-specific tyrosine recombinase XerC  30.04 
 
 
298 aa  95.9  7e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.446663  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2332  tyrosine recombinase XerD  27.07 
 
 
292 aa  95.9  7e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0234  site-specific tyrosine recombinase XerC  32.35 
 
 
302 aa  95.9  7e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03636  hypothetical protein  30.04 
 
 
298 aa  95.9  7e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.487194  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1432  tyrosine recombinase XerD  25.29 
 
 
321 aa  94.7  1e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0895087  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1427  tyrosine recombinase XerD subunit  24.81 
 
 
295 aa  94.7  1e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3929  site-specific tyrosine recombinase XerC  27.18 
 
 
299 aa  95.1  1e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000313294  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2583  site-specific tyrosine recombinase XerD  28.51 
 
 
318 aa  94.4  2e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3682  site-specific tyrosine recombinase XerC  26.26 
 
 
299 aa  94.7  2e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.245295  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0185  site-specific tyrosine recombinase XerC  33.88 
 
 
299 aa  94  2e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3969  site-specific tyrosine recombinase XerC  26.26 
 
 
299 aa  94.7  2e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000391393  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3973  site-specific tyrosine recombinase XerC  31.37 
 
 
311 aa  94.4  2e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.556004  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002113  tyrosine recombinase XerC  28.87 
 
 
310 aa  94.7  2e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1948  site-specific tyrosine recombinase XerD  28.51 
 
 
318 aa  94.4  2e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2478  site-specific tyrosine recombinase XerD  28.94 
 
 
322 aa  94.4  2e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0183983 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1934  phage integrase family protein  30.67 
 
 
297 aa  94.4  2e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1300  tyrosine recombinase XerD subunit  27.89 
 
 
297 aa  94.7  2e-18  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2559  site-specific tyrosine recombinase XerD  28.51 
 
 
318 aa  94.4  2e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4330  site-specific tyrosine recombinase XerC  29.66 
 
 
298 aa  93.6  3e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4168  tyrosine recombinase XerC  29.66 
 
 
298 aa  94  3e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3572  site-specific tyrosine recombinase XerC  25.93 
 
 
299 aa  93.6  3e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000685052  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1314  site-specific tyrosine recombinase XerC  26.58 
 
 
299 aa  94  3e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000019497  unclonable  8.39468e-26 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1196  tyrosine recombinase XerD  27.47 
 
 
309 aa  93.6  3e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0670859  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4177  site-specific tyrosine recombinase XerC  29.66 
 
 
298 aa  94  3e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0208532 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3843  site-specific tyrosine recombinase XerC  25.93 
 
 
299 aa  93.6  3e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.27577e-62 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0159  integrase family protein  27.87 
 
 
295 aa  94  3e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0478  integrase family protein  27.17 
 
 
312 aa  93.6  3e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4271  site-specific tyrosine recombinase XerC  29.66 
 
 
298 aa  94  3e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4036  site-specific tyrosine recombinase XerC  29.66 
 
 
298 aa  94  3e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4196  site-specific tyrosine recombinase XerC  29.66 
 
 
298 aa  94  3e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0689633  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4164  site-specific tyrosine recombinase XerC  30.39 
 
 
311 aa  93.6  4e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.154418  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08760  tyrosine recombinase XerD  30.53 
 
 
309 aa  93.2  4e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.940341  unclonable  0.00000000128305 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0128  site-specific tyrosine recombinase XerC  33.64 
 
 
303 aa  93.2  4e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.742386  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2692  tyrosine recombinase XerD  25.87 
 
 
295 aa  93.2  4e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.457784  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0222  integrase/recombinase XerC  37.59 
 
 
299 aa  93.2  5e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3590  site-specific tyrosine recombinase XerC  25.75 
 
 
299 aa  93.2  5e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0796955  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3873  site-specific tyrosine recombinase XerC  25.67 
 
 
299 aa  92.8  6e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00557083  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3878  site-specific tyrosine recombinase XerC  25.75 
 
 
299 aa  92.8  6e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000107327  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1554  tyrosine recombinase XerD  26.44 
 
 
295 aa  92.4  8e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1585  tyrosine recombinase XerD  26.44 
 
 
295 aa  92.4  8e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3928  integrase family protein  31.14 
 
 
290 aa  92  9e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1381  site-specific tyrosine recombinase XerD  27.73 
 
 
298 aa  92  9e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00360913  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0396  tyrosine recombinase XerD  28.63 
 
 
309 aa  92  1e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00307  site-specific tyrosine recombinase XerC  27.89 
 
 
313 aa  92  1e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0185  site-specific tyrosine recombinase XerC  27.48 
 
 
302 aa  91.7  1e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.182372  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1878  tyrosine recombinase XerD  26.69 
 
 
292 aa  91.7  1e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1003  tyrosine recombinase XerD subunit  29.1 
 
 
302 aa  92  1e-17  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.497558  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>