287 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BCAH187_A3986 on replicon NC_011658
Organism: Bacillus cereus AH187



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011773  BCAH820_4366  prophage LambdaBa02, site-specific recombinase, phage integrase family  94.67 
 
 
319 aa  634    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3986  prophage LambdaBa02, site-specific recombinase, phage integrase family  100 
 
 
319 aa  662    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.578221  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3786  prophage LambdaBa02, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  94.36 
 
 
325 aa  628  1e-179  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00278104  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4075  prophage lambdaba02, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  94.36 
 
 
325 aa  628  1e-179  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2252  prophage LambdaBa02, site-specific recombinase, phage integrase family  93.73 
 
 
319 aa  626  1e-178  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.243711  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0675  prophage LambdaBa02, site-specific recombinase, phage integrase family  92.16 
 
 
319 aa  620  1e-177  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1639  phage integrase family site specific recombinase  25.85 
 
 
338 aa  70.9  0.00000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.787761  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0738  integrase/recombinase  27.59 
 
 
340 aa  64.7  0.000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0196  integrase family protein  23.88 
 
 
328 aa  64.3  0.000000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000565414 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3407  integrase family protein  24.75 
 
 
325 aa  63.5  0.000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.155435 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2567  site-specific tyrosine recombinase XerD  27.97 
 
 
313 aa  60.5  0.00000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.615759 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3062  site-specific tyrosine recombinase XerD  26.27 
 
 
308 aa  60.1  0.00000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00956  site-specific tyrosine recombinase XerD  25.17 
 
 
305 aa  57.4  0.0000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2788  site-specific tyrosine recombinase XerD  25.68 
 
 
296 aa  57  0.0000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000777667  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0684  site-specific tyrosine recombinase XerD  27.31 
 
 
324 aa  56.6  0.0000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.631001  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0519  phage integrase family protein  25.43 
 
 
300 aa  56.2  0.0000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.24612  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0842  hypothetical protein  26.58 
 
 
290 aa  56.2  0.0000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0169  phage integrase family protein  27.27 
 
 
282 aa  56.2  0.0000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0558238  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004441  site-specific recombinase XerD  24.92 
 
 
305 aa  56.2  0.0000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0772  site-specific tyrosine recombinase XerD  28.26 
 
 
324 aa  55.8  0.0000009  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3999  site-specific tyrosine recombinase XerD  25.59 
 
 
296 aa  55.8  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.189801  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3830  site-specific tyrosine recombinase XerD  25.59 
 
 
296 aa  55.8  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3846  site-specific tyrosine recombinase XerD  25.59 
 
 
296 aa  55.5  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0256715  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4311  site-specific tyrosine recombinase XerD  25.59 
 
 
296 aa  55.8  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.789664  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4199  site-specific tyrosine recombinase XerD  25.59 
 
 
296 aa  55.5  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00345142  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1038  site-specific tyrosine recombinase XerD  25.59 
 
 
296 aa  55.5  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00331502  normal  0.0102802 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1668  tyrosine recombinase XerD subunit  25.8 
 
 
295 aa  55.5  0.000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.179488  normal  0.0195248 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1720  tyrosine recombinase XerD  23.38 
 
 
319 aa  55.1  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.514315 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3304  tyrosine recombinase XerD  25.35 
 
 
298 aa  55.8  0.000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0133185  normal  0.394454 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4113  site-specific tyrosine recombinase XerD  25.59 
 
 
296 aa  55.8  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.00015e-24 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2544  site-specific tyrosine recombinase XerD  26.15 
 
 
308 aa  54.7  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4158  site-specific tyrosine recombinase XerD  25.59 
 
 
296 aa  54.7  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.44443  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4222  site-specific tyrosine recombinase XerD  25.59 
 
 
296 aa  54.7  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00160259  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2452  tyrosine recombinase XerD  24.47 
 
 
306 aa  54.7  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0952029  normal  0.728507 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0562  integrase/recombinase  25.58 
 
 
308 aa  54.7  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0843058  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2440  tyrosine recombinase XerD  22.79 
 
 
332 aa  54.3  0.000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.691328  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1847  integrase family protein  24.75 
 
 
314 aa  53.9  0.000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.475025 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1823  integrase family protein  46.55 
 
 
253 aa  53.5  0.000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.987007  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0840  integrase family protein  23.47 
 
 
294 aa  53.9  0.000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.774041 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0890  tyrosine recombinase XerD  23.84 
 
 
300 aa  53.1  0.000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.267893  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1099  tyrosine recombinase XerD  28.11 
 
 
296 aa  53.5  0.000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3920  site-specific tyrosine recombinase XerD  25 
 
 
296 aa  53.1  0.000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000317777  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1780  phage integrase family protein  44.83 
 
 
256 aa  53.1  0.000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000232909  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7462  integrase family protein  22.87 
 
 
292 aa  52.4  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.105755  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0891  integrase family protein  26.26 
 
 
306 aa  52.4  0.00001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.180709  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0872  phage integrase family protein  22.81 
 
 
324 aa  52  0.00001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7619  integrase family protein  22.87 
 
 
292 aa  52.4  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.192826  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0023  integrase family protein  26.67 
 
 
291 aa  52.4  0.00001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6605  integrase family protein  22.87 
 
 
292 aa  52.4  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1902  phage integrase  24.49 
 
 
293 aa  51.6  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.162765  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0795  tyrosine recombinase XerD  23.38 
 
 
300 aa  51.6  0.00002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1082  integrase family protein  24.73 
 
 
290 aa  51.2  0.00002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4851  integrase family protein  26.13 
 
 
294 aa  50.8  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0577  site-specific tyrosine recombinase XerD  27.17 
 
 
305 aa  50.8  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0855221  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3458  tyrosine recombinase XerD  26.85 
 
 
303 aa  50.8  0.00003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.664548  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6957  integrase family protein  22.32 
 
 
292 aa  50.4  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0142  integrase family protein  23.51 
 
 
292 aa  50.8  0.00003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0967  phage integrase family protein  24.58 
 
 
324 aa  50.8  0.00003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0507  tyrosine recombinase XerD  24.36 
 
 
339 aa  50.4  0.00004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0660  integrase family protein  27.22 
 
 
284 aa  50.4  0.00004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4760  integrase family protein  24.07 
 
 
354 aa  50.1  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0401  integrase family protein  22.83 
 
 
304 aa  50.1  0.00005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.966282 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0893  tyrosine recombinase XerD  24.64 
 
 
304 aa  50.1  0.00005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0105661 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1191  site-specific tyrosine recombinase XerC  23.78 
 
 
313 aa  50.1  0.00005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.60628  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03409  tyrosine recombinase  25.44 
 
 
308 aa  50.1  0.00005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1934  phage integrase family protein  24.04 
 
 
297 aa  49.7  0.00006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2329  tyrosine recombinase XerD  25.45 
 
 
277 aa  50.1  0.00006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00235896  normal  0.0350779 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1347  tyrosine recombinase XerD  24.89 
 
 
306 aa  50.1  0.00006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.816733  normal  0.74121 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0011  phage integrase family protein  23.99 
 
 
301 aa  49.7  0.00007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1519  integrase family protein  25.43 
 
 
279 aa  49.7  0.00007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.959361  decreased coverage  3.1361700000000003e-18 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0903  tyrosine recombinase XerD  24.59 
 
 
303 aa  49.7  0.00007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3331  tyrosine recombinase XerD  23.74 
 
 
300 aa  49.7  0.00007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0988  tyrosine recombinase XerD  24.59 
 
 
303 aa  49.7  0.00007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.252447  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3228  tyrosine recombinase XerD  24.56 
 
 
300 aa  49.3  0.00008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.302685  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4288  tyrosine recombinase XerC  25.09 
 
 
365 aa  49.3  0.00008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.710874 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0435  integrase family protein  24.91 
 
 
299 aa  49.3  0.00009  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1434  phage integrase family protein  23.23 
 
 
322 aa  49.3  0.00009  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4655  tyrosine recombinase XerC  25.09 
 
 
365 aa  49.3  0.00009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.223284 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3300  tyrosine recombinase XerD  25.54 
 
 
299 aa  48.5  0.0001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3380  site-specific tyrosine recombinase XerD  25.19 
 
 
298 aa  48.9  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6023  site-specific tyrosine recombinase XerC  24.63 
 
 
303 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1209  phage integrase family site specific recombinase  23.57 
 
 
305 aa  48.9  0.0001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.764611  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4805  tyrosine recombinase XerC  25.62 
 
 
367 aa  48.5  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.104736  normal  0.146847 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3212  site-specific tyrosine recombinase XerD  25.19 
 
 
298 aa  48.9  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.476349 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4006  integrase family protein  22.61 
 
 
334 aa  48.9  0.0001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3694  integrase family protein  27.04 
 
 
348 aa  49.3  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3200  site-specific tyrosine recombinase XerD  25.19 
 
 
298 aa  48.9  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.550002  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2881  tyrosine recombinase XerC  24.54 
 
 
343 aa  48.5  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.312354  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0750  site-specific tyrosine recombinase XerD  25.64 
 
 
311 aa  49.3  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1922  integrase family protein  25.32 
 
 
401 aa  48.9  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.612381  hitchhiker  0.00155149 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3278  site-specific tyrosine recombinase XerD  25.19 
 
 
298 aa  48.9  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2788  tyrosine recombinase XerC  25.23 
 
 
343 aa  48.9  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0114244  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3696  integrase family protein  22.61 
 
 
334 aa  48.9  0.0001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1003  tyrosine recombinase XerD subunit  25.71 
 
 
302 aa  48.5  0.0001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.497558  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0900  integrase  23.23 
 
 
322 aa  48.9  0.0001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000819417  hitchhiker  0.000000626468 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1716  tyrosine recombinase XerD  26.52 
 
 
303 aa  48.9  0.0001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.500655  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0540  site-specific tyrosine recombinase XerD  27.51 
 
 
325 aa  48.5  0.0001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0147694  normal  0.75101 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0907  site-specific tyrosine recombinase XerD  23.02 
 
 
307 aa  48.5  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1241  phage integrase  22.45 
 
 
336 aa  48.1  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.097797 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3275  site-specific tyrosine recombinase XerD  25.19 
 
 
298 aa  48.5  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>