More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_3694 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013216  Dtox_3694  integrase family protein  100 
 
 		 348 aa  725    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2241  integrase family protein  29.64 
 
 		 345 aa  184  1.0000000000000001e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.640527  hitchhiker  0.000757999 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2216  integrase family protein  30.5 
 
 		 349 aa  167  2.9999999999999998e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000229864 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1434  integrase family protein  28.79 
 
 		 342 aa  159  6e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0667  integrase family protein  28.86 
 
 		 332 aa  136  6.0000000000000005e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.580243  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2399  site-specific recombinase, phage integrase family  28.86 
 
 		 332 aa  136  6.0000000000000005e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0833  site-specific recombinase, phage integrase family  28.86 
 
 		 332 aa  136  6.0000000000000005e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0328  integrase family protein  28.86 
 
 		 332 aa  136  6.0000000000000005e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.133269 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2031  integrase family protein  28.86 
 
 		 332 aa  136  6.0000000000000005e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0509  site-specific recombinase, phage integrase family  28.86 
 
 		 332 aa  136  6.0000000000000005e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0310  Integrase  28.43 
 
 		 351 aa  130  4.0000000000000003e-29  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.004878  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1335  Integrase  28.43 
 
 		 351 aa  130  4.0000000000000003e-29  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.128026  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0030  Integrase  28.43 
 
 		 351 aa  130  4.0000000000000003e-29  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0264646  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1806  Integrase  28.43 
 
 		 351 aa  130  4.0000000000000003e-29  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0548075  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7620  integrase family protein  29.94 
 
 		 343 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.998258  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6955  integrase family protein  29.94 
 
 		 343 aa  129  6e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7593  integrase family protein  26.92 
 
 		 331 aa  129  6e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0738  integrase/recombinase  24.07 
 
 		 340 aa  122  9e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5937  phage integrase family protein  28.43 
 
 		 329 aa  120  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7458  integrase family protein  27.36 
 
 		 335 aa  119  6e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.259677  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0421  integrase family protein  27.6 
 
 		 329 aa  118  9.999999999999999e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4006  integrase family protein  27.06 
 
 		 334 aa  117  3e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3696  integrase family protein  27.06 
 
 		 334 aa  117  3e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4897  integrase family protein  27.64 
 
 		 336 aa  116  6e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0600  phage integrase family protein  28.66 
 
 		 329 aa  115  8.999999999999998e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0370  integrase family protein  28.85 
 
 		 332 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0713  phage integrase  26.81 
 
 		 331 aa  114  2.0000000000000002e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1241  phage integrase  26.97 
 
 		 336 aa  113  5e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.097797 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0245  integrase family protein  27.08 
 
 		 333 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4020  phage integrase family protein  29.61 
 
 		 327 aa  111  2.0000000000000002e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1273  phage integrase  26.97 
 
 		 331 aa  110  3e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.010146 
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3505  phage integrase family protein  26.89 
 
 		 330 aa  110  3e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.431904  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1513  site-specific recombinase  26.25 
 
 		 295 aa  107  3e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.110584  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2228  integrase family protein  26.64 
 
 		 330 aa  107  4e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.763924 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5408  phage integrase family protein  26.81 
 
 		 330 aa  107  4e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.123433 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5348  integrase family protein  26.64 
 
 		 330 aa  107  4e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.464558 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2008  integrase family protein  26.64 
 
 		 330 aa  107  4e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.461761  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0440  phage integrase  25.64 
 
 		 334 aa  106  5e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8116  integrase/recombinase  26.73 
 
 		 335 aa  106  6e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.000851463  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0775  integrase family protein  25.89 
 
 		 339 aa  106  6e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000364623 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1217  integrase family protein  25.88 
 
 		 336 aa  105  1e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4359  integrase family protein  25.88 
 
 		 336 aa  105  1e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2982  integrase family protein  25.88 
 
 		 336 aa  105  1e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4385  integrase family protein  25.88 
 
 		 336 aa  105  1e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1320  tyrosine recombinase XerD  26.4 
 
 		 302 aa  103  6e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0768  integrase family protein  26.99 
 
 		 337 aa  103  6e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000101801 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0842  hypothetical protein  26.19 
 
 		 290 aa  102  9e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1674  tyrosine recombinase XerD  27.24 
 
 		 297 aa  100  3e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0517708  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2383  tyrosine recombinase XerD  27.04 
 
 		 295 aa  100  3e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1347  tyrosine recombinase XerD  25.17 
 
 		 306 aa  100  4e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.816733  normal  0.74121 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3266  phage integrase family protein  26.69 
 
 		 330 aa  99.8  6e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.119927  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0872  integrase family protein  26.49 
 
 		 316 aa  99  1e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2332  tyrosine recombinase XerD  26.97 
 
 		 292 aa  99  1e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0716  tyrosine recombinase XerC  26.37 
 
 		 307 aa  97.4  3e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.841608  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_623  site-specific recombinase  26.86 
 
 		 307 aa  97.4  3e-19  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1225  integrase family protein  28.24 
 
 		 301 aa  97.4  3e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.103765  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1878  tyrosine recombinase XerD  27.12 
 
 		 292 aa  97.1  4e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5643  tyrosine recombinase XerD  26.06 
 
 		 299 aa  97.1  5e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.776137 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1468  site-specific tyrosine recombinase XerD  26.71 
 
 		 298 aa  96.7  5e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.208903 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4253  site-specific tyrosine recombinase XerD  26.71 
 
 		 298 aa  96.7  5e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39510  site-specific tyrosine recombinase XerD  29.19 
 
 		 298 aa  96.3  6e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0736  integrase/recombinase  23.22 
 
 		 337 aa  96.7  6e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1282  tyrosine recombinase XerD  27.69 
 
 		 295 aa  96.3  6e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.63418  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2281  integrase domain-containing protein  29.59 
 
 		 289 aa  96.3  7e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1501  tyrosine recombinase XerD subunit  26.09 
 
 		 295 aa  95.9  1e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4151  site-specific tyrosine recombinase XerD  27.46 
 
 		 298 aa  95.5  1e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.596099 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0396  tyrosine recombinase XerD  28.3 
 
 		 309 aa  94.7  2e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0651  tyrosine recombinase XerC subunit  26.69 
 
 		 307 aa  94.7  2e-18  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1025  site-specific tyrosine recombinase XerD  27.05 
 
 		 298 aa  95.1  2e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.899371  normal  0.6007 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1073  site-specific tyrosine recombinase XerD  26.37 
 
 		 298 aa  94.4  2e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.344511  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1142  tyrosine recombinase XerD  28.29 
 
 		 295 aa  95.1  2e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0884  integrase  25.7 
 
 		 302 aa  94  3e-18  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.161871  hitchhiker  0.000000000000894527 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1971  tyrosine recombinase XerD subunit  25.82 
 
 		 309 aa  93.2  6e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000860406  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3714  tyrosine recombinase XerD  26.78 
 
 		 301 aa  93.2  7e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03409  tyrosine recombinase  26.09 
 
 		 308 aa  92.8  8e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0447  phage integrase family site specific recombinase  27.12 
 
 		 307 aa  92.8  8e-18  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0678  tyrosine recombinase XerD  27.36 
 
 		 294 aa  92.8  9e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0265142 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1982  tyrosine recombinase XerC  25.41 
 
 		 298 aa  92  1e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0026523  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1366  site-specific tyrosine recombinase XerC  25.71 
 
 		 450 aa  92.4  1e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000415693  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1668  tyrosine recombinase XerD subunit  26.03 
 
 		 295 aa  91.3  2e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.179488  normal  0.0195248 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2104  tyrosine recombinase XerD  27.67 
 
 		 301 aa  91.7  2e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.443082 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8259  integrase/recombinase  27.71 
 
 		 246 aa  91.3  2e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.483567  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1179  site-specific tyrosine recombinase XerC  26.02 
 
 		 450 aa  90.9  3e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.0000000142279  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1819  integrase/recombinase XerD  24.92 
 
 		 295 aa  90.1  5e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.530175  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2257  site-specific tyrosine recombinase XerD  26.4 
 
 		 299 aa  89.7  6e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.977256  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3396  site-specific tyrosine recombinase XerD  27.52 
 
 		 298 aa  89.7  7e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1839  integrase family protein  25 
 
 		 310 aa  89.7  7e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2788  tyrosine recombinase XerC  26.9 
 
 		 343 aa  89  1e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0114244  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0292  tyrosine recombinase XerD  27.37 
 
 		 305 aa  89  1e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00070  putative site-specific recombinase  27.7 
 
 		 295 aa  88.2  2e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1427  tyrosine recombinase XerD subunit  23.92 
 
 		 295 aa  88.2  2e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0676  tyrosine recombinase XerD subunit  24.48 
 
 		 296 aa  88.2  2e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2378  tyrosine recombinase XerD  26.24 
 
 		 296 aa  87.8  3e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.336575 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0144  tyrosine recombinase XerD  25.59 
 
 		 305 aa  87.8  3e-16  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2881  tyrosine recombinase XerC  26.43 
 
 		 343 aa  87.4  3e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.312354  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1191  site-specific tyrosine recombinase XerC  24.23 
 
 		 313 aa  87.4  3e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.60628  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1468  phage integrase family protein  28.61 
 
 		 304 aa  87  4e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1478  integrase/recombinase XerD  26.37 
 
 		 298 aa  87.4  4e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0755097  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2052  tyrosine recombinase XerD  23.79 
 
 		 296 aa  87  4e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0057  tyrosine recombinase XerD  29.31 
 
 		 312 aa  87  4e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.502069 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>