More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_2216 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013216  Dtox_2216  integrase family protein  100 
 
 		 349 aa  729    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000229864 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1335  Integrase  38.27 
 
 		 351 aa  231  2e-59  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.128026  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0030  Integrase  38.27 
 
 		 351 aa  231  2e-59  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0264646  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1806  Integrase  38.27 
 
 		 351 aa  231  2e-59  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0548075  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0310  Integrase  38.27 
 
 		 351 aa  231  2e-59  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.004878  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1434  integrase family protein  33.86 
 
 		 342 aa  178  1e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2241  integrase family protein  32.84 
 
 		 345 aa  172  7.999999999999999e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.640527  hitchhiker  0.000757999 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3694  integrase family protein  30.5 
 
 		 348 aa  167  2.9999999999999998e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7593  integrase family protein  28.66 
 
 		 331 aa  134  3e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0736  integrase/recombinase  28.35 
 
 		 337 aa  129  1.0000000000000001e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0775  integrase family protein  31.1 
 
 		 339 aa  127  3e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000364623 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4385  integrase family protein  28.66 
 
 		 336 aa  126  6e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1217  integrase family protein  28.66 
 
 		 336 aa  126  6e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8259  integrase/recombinase  32.38 
 
 		 246 aa  126  6e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.483567  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2982  integrase family protein  28.66 
 
 		 336 aa  126  6e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4359  integrase family protein  28.66 
 
 		 336 aa  126  6e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5937  phage integrase family protein  30.1 
 
 		 329 aa  120  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7620  integrase family protein  29.35 
 
 		 343 aa  119  9e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.998258  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0600  phage integrase family protein  27.15 
 
 		 329 aa  117  1.9999999999999998e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7458  integrase family protein  29.73 
 
 		 335 aa  117  3e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.259677  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6955  integrase family protein  29.01 
 
 		 343 aa  116  5e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0738  integrase/recombinase  27.81 
 
 		 340 aa  116  5e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1273  phage integrase  28.03 
 
 		 331 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.010146 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0245  integrase family protein  29.01 
 
 		 333 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0713  phage integrase  26.01 
 
 		 331 aa  114  2.0000000000000002e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0370  integrase family protein  28.72 
 
 		 332 aa  114  3e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0421  integrase family protein  26.25 
 
 		 329 aa  112  8.000000000000001e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5408  phage integrase family protein  30.41 
 
 		 330 aa  112  9e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.123433 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0768  integrase family protein  28.57 
 
 		 337 aa  112  1.0000000000000001e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000101801 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4020  phage integrase family protein  28.62 
 
 		 327 aa  112  1.0000000000000001e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3505  phage integrase family protein  29.25 
 
 		 330 aa  108  1e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.431904  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4429  tyrosine recombinase XerD  29.47 
 
 		 301 aa  107  2e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0676058  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4897  integrase family protein  27.6 
 
 		 336 aa  107  3e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1668  tyrosine recombinase XerD subunit  28.2 
 
 		 295 aa  107  4e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.179488  normal  0.0195248 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1521  tyrosine recombinase XerD  31.05 
 
 		 346 aa  104  3e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.531713  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5348  integrase family protein  28.53 
 
 		 330 aa  102  1e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.464558 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2008  integrase family protein  28.53 
 
 		 330 aa  102  1e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.461761  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2228  integrase family protein  28.53 
 
 		 330 aa  102  1e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.763924 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1520  tyrosine recombinase XerD  30.62 
 
 		 362 aa  102  1e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000383292 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0833  site-specific recombinase, phage integrase family  24.77 
 
 		 332 aa  101  2e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2031  integrase family protein  24.77 
 
 		 332 aa  101  2e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0328  integrase family protein  24.77 
 
 		 332 aa  101  2e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.133269 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2399  site-specific recombinase, phage integrase family  24.77 
 
 		 332 aa  101  2e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0124  phage integrase family protein  31.68 
 
 		 298 aa  101  2e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.776243  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0667  integrase family protein  24.77 
 
 		 332 aa  101  2e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.580243  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0509  site-specific recombinase, phage integrase family  24.77 
 
 		 332 aa  101  2e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2052  tyrosine recombinase XerD  27.51 
 
 		 296 aa  100  3e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1383  integrase family protein  27.6 
 
 		 307 aa  99.8  6e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1215  tyrosine recombinase XerD  31.21 
 
 		 302 aa  98.6  1e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.157843  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2689  tyrosine recombinase XerC  29.58 
 
 		 311 aa  99  1e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.147909 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0392  site-specific tyrosine recombinase XerC  30.69 
 
 		 310 aa  99  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1241  phage integrase  25.97 
 
 		 336 aa  99  1e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.097797 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0207  site-specific tyrosine recombinase XerC  30.69 
 
 		 310 aa  99  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3258  site-specific tyrosine recombinase XerC  30.36 
 
 		 310 aa  98.2  2e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.706598  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_998  integrase/recombinase  31.21 
 
 		 302 aa  98.2  2e-19  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1025  tyrosine recombinase XerD subunit  30.89 
 
 		 302 aa  97.8  2e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3428  site-specific tyrosine recombinase XerC  30.36 
 
 		 310 aa  98.2  2e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0440  phage integrase  27.99 
 
 		 334 aa  97.8  2e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2920  site-specific tyrosine recombinase XerC  30.36 
 
 		 310 aa  98.2  2e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.510567  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2169  site-specific tyrosine recombinase XerC  30.36 
 
 		 310 aa  98.2  2e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.126979  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0195  site-specific tyrosine recombinase XerC  30.36 
 
 		 310 aa  98.2  2e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0381  tyrosine recombinase XerD  29.05 
 
 		 303 aa  97.4  3e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4006  integrase family protein  27.36 
 
 		 334 aa  97.4  3e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3696  integrase family protein  27.36 
 
 		 334 aa  97.4  3e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2797  tyrosine recombinase XerD  27.76 
 
 		 298 aa  96.3  7e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.650693  normal  0.205647 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2957  site-specific tyrosine recombinase XerD  26.96 
 
 		 318 aa  95.9  9e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.271721  normal  0.636956 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3133  site-specific tyrosine recombinase XerC  29.73 
 
 		 306 aa  95.1  1e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.40751  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3104  site-specific tyrosine recombinase XerC  29.57 
 
 		 306 aa  94.7  2e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.494742 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0170  site-specific tyrosine recombinase XerC  30.54 
 
 		 306 aa  95.1  2e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3281  site-specific tyrosine recombinase XerD  27.64 
 
 		 317 aa  95.1  2e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2996  site-specific tyrosine recombinase XerC  29.73 
 
 		 306 aa  94.7  2e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0374572 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1082  integrase family protein  27.5 
 
 		 290 aa  94  3e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3715  integrase family protein  27.8 
 
 		 298 aa  94.4  3e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2375  tyrosine recombinase XerD  27.24 
 
 		 324 aa  93.6  4e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.973456  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2942  site-specific tyrosine recombinase XerD  26.65 
 
 		 318 aa  93.6  4e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2986  site-specific tyrosine recombinase XerD  26.65 
 
 		 318 aa  93.6  4e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0431132 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11716  site-specific tyrosine recombinase XerD  28.62 
 
 		 311 aa  93.2  6e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.162629 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2497  integrase family protein  26.75 
 
 		 308 aa  93.2  6e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19920  tyrosine recombinase XerD  29.28 
 
 		 317 aa  93.2  6e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.210765  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1185  tyrosine recombinase XerD  28.47 
 
 		 315 aa  92.8  8e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0531401  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1320  tyrosine recombinase XerD  29.43 
 
 		 302 aa  92.4  9e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3082  site-specific tyrosine recombinase XerC  28.76 
 
 		 306 aa  92  1e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.633641  normal  0.120316 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1560  tyrosine recombinase XerD  27.45 
 
 		 331 aa  92.4  1e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.736869  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0435  integrase family protein  27.81 
 
 		 299 aa  92  1e-17  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2473  site-specific tyrosine recombinase XerC  29.24 
 
 		 306 aa  92.4  1e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3087  site-specific tyrosine recombinase XerC  29.24 
 
 		 306 aa  92.4  1e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25380  tyrosine recombinase XerD subunit  27.87 
 
 		 311 aa  91.7  2e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.732719 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4012  tyrosine recombinase XerC  27.54 
 
 		 294 aa  91.7  2e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00152232  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1282  tyrosine recombinase XerD  28.72 
 
 		 295 aa  91.3  2e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.63418  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_623  site-specific recombinase  28.52 
 
 		 307 aa  90.5  4e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0235  Integrase  29.23 
 
 		 308 aa  90.1  5e-17  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.386202  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0396  tyrosine recombinase XerD  27.3 
 
 		 309 aa  90.1  5e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0716  tyrosine recombinase XerC  28.52 
 
 		 307 aa  89.7  6e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.841608  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2329  tyrosine recombinase XerD  26.64 
 
 		 277 aa  89.7  6e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00235896  normal  0.0350779 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2994  tyrosine recombinase XerD  28.98 
 
 		 315 aa  90.1  6e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3266  phage integrase family protein  26.6 
 
 		 330 aa  89.7  7e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.119927  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1995  site-specific tyrosine recombinase XerD  27.3 
 
 		 302 aa  89.7  7e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2809  phage integrase family protein  29.65 
 
 		 311 aa  89.7  7e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3458  tyrosine recombinase XerD  28.67 
 
 		 303 aa  89.7  7e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.664548  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0519  site-specific tyrosine recombinase XerD  26.87 
 
 		 302 aa  89.4  8e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0998774  normal  0.238721 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>