More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_0030 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010816  BLD_0030  Integrase  100 
 
 		 351 aa  716    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0264646  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1806  Integrase  100 
 
 		 351 aa  716    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0548075  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0310  Integrase  100 
 
 		 351 aa  716    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.004878  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1335  Integrase  100 
 
 		 351 aa  716    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.128026  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2216  integrase family protein  38.27 
 
 		 349 aa  231  2e-59  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000229864 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1434  integrase family protein  29.21 
 
 		 342 aa  143  5e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2241  integrase family protein  28.65 
 
 		 345 aa  140  1.9999999999999998e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.640527  hitchhiker  0.000757999 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3694  integrase family protein  28.43 
 
 		 348 aa  130  4.0000000000000003e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8259  integrase/recombinase  34.19 
 
 		 246 aa  124  2e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.483567  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0370  integrase family protein  30.65 
 
 		 332 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5937  phage integrase family protein  29.87 
 
 		 329 aa  114  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7620  integrase family protein  28.06 
 
 		 343 aa  110  3e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.998258  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0736  integrase/recombinase  26.83 
 
 		 337 aa  109  6e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6955  integrase family protein  28.75 
 
 		 343 aa  107  4e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0600  phage integrase family protein  30.31 
 
 		 329 aa  106  5e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4012  tyrosine recombinase XerC  30.94 
 
 		 294 aa  106  7e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00152232  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0738  integrase/recombinase  25.3 
 
 		 340 aa  105  9e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1241  phage integrase  26.96 
 
 		 336 aa  104  2e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.097797 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7458  integrase family protein  28.57 
 
 		 335 aa  104  2e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.259677  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1273  phage integrase  30.42 
 
 		 331 aa  99  1e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.010146 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3042  tyrosine recombinase XerD subunit  29.51 
 
 		 294 aa  98.6  2e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000138339  normal  0.959316 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0470  tyrosine recombinase XerC  29.07 
 
 		 293 aa  97.1  5e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0421  integrase family protein  26.93 
 
 		 329 aa  96.7  6e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5348  integrase family protein  29.11 
 
 		 330 aa  95.9  1e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.464558 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2228  integrase family protein  29.11 
 
 		 330 aa  95.9  1e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.763924 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2008  integrase family protein  29.11 
 
 		 330 aa  95.9  1e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.461761  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0704  integrase family protein  27.6 
 
 		 305 aa  95.1  1e-18  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000143659  unclonable  0.0000000274126 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2992  tyrosine recombinase XerD  30.91 
 
 		 308 aa  92.8  7e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0487  tyrosine recombinase XerC  28.43 
 
 		 293 aa  92.4  1e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000269064 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0768  integrase family protein  29.22 
 
 		 337 aa  91.3  2e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000101801 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0772  site-specific tyrosine recombinase XerD  29.57 
 
 		 324 aa  91.7  2e-17  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0238  site-specific tyrosine recombinase XerC  30.54 
 
 		 306 aa  89.7  6e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0625179  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0775  integrase family protein  28.21 
 
 		 339 aa  89.7  7e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000364623 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0684  site-specific tyrosine recombinase XerD  29.24 
 
 		 324 aa  89.7  7e-17  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.631001  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0245  integrase family protein  27.41 
 
 		 333 aa  87.8  2e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4897  integrase family protein  26.51 
 
 		 336 aa  87.4  3e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02665  site-specific tyrosine recombinase XerD  31.49 
 
 		 336 aa  87  5e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5408  phage integrase family protein  27.96 
 
 		 330 aa  86.3  6e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.123433 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1520  tyrosine recombinase XerD  31.48 
 
 		 362 aa  86.3  7e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000383292 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1521  tyrosine recombinase XerD  30.84 
 
 		 346 aa  86.3  7e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.531713  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4429  tyrosine recombinase XerD  30.6 
 
 		 301 aa  86.3  8e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0676058  normal  1 
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3505  phage integrase family protein  27.9 
 
 		 330 aa  85.9  9e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.431904  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1560  tyrosine recombinase XerD  30.98 
 
 		 331 aa  85.9  0.000000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.736869  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0478  tyrosine recombinase XerD  27.87 
 
 		 319 aa  85.5  0.000000000000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1489  tyrosine recombinase XerD  34.11 
 
 		 313 aa  85.9  0.000000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.966498  normal  1 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4020  phage integrase family protein  27.65 
 
 		 327 aa  85.9  0.000000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1003  tyrosine recombinase XerD subunit  24.34 
 
 		 302 aa  84.3  0.000000000000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.497558  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0818  tyrosine recombinase XerC  25.24 
 
 		 296 aa  84  0.000000000000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.368613  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1924  site-specific tyrosine recombinase XerD  35.63 
 
 		 325 aa  84  0.000000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.239497 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0540  site-specific tyrosine recombinase XerD  29.01 
 
 		 325 aa  83.6  0.000000000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0147694  normal  0.75101 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2994  tyrosine recombinase XerD  29.06 
 
 		 315 aa  83.6  0.000000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7593  integrase family protein  26.32 
 
 		 331 aa  83.2  0.000000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0447  phage integrase family site specific recombinase  26.4 
 
 		 307 aa  82.8  0.000000000000007  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1201  site-specific tyrosine recombinase XerD  30.56 
 
 		 321 aa  82.8  0.000000000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.731595  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2375  tyrosine recombinase XerD  29.59 
 
 		 324 aa  82.8  0.000000000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.973456  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0492  phage integrase family site specific recombinase  28.01 
 
 		 294 aa  82  0.00000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0248661  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2821  tyrosine recombinase XerD  30.53 
 
 		 313 aa  82  0.00000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.346068  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19920  tyrosine recombinase XerD  29.47 
 
 		 317 aa  82  0.00000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.210765  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0367  site-specific tyrosine recombinase XerD  29.25 
 
 		 298 aa  82  0.00000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3500  site-specific tyrosine recombinase XerD  35.51 
 
 		 314 aa  82.4  0.00000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.385537  normal  0.347515 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1932  tyrosine recombinase XerD  30.77 
 
 		 310 aa  82  0.00000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1082  integrase family protein  24.84 
 
 		 290 aa  82  0.00000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10430  site-specific recombinase XerD  26.21 
 
 		 313 aa  81.6  0.00000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00129547  unclonable  0.000000000966981 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0083  site-specific tyrosine recombinase XerC  27.16 
 
 		 322 aa  81.3  0.00000000000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2689  tyrosine recombinase XerC  31.41 
 
 		 311 aa  80.5  0.00000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.147909 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2159  tyrosine recombinase XerD  31.21 
 
 		 311 aa  80.5  0.00000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2489  tyrosine recombinase XerD  28.22 
 
 		 318 aa  80.5  0.00000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.189208  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3920  site-specific tyrosine recombinase XerD  26.1 
 
 		 296 aa  80.1  0.00000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000317777  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0872  integrase family protein  25.89 
 
 		 316 aa  79.7  0.00000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0435  integrase family protein  21.64 
 
 		 299 aa  79.7  0.00000000000007  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0350  phage integrase family protein  25.08 
 
 		 341 aa  79.7  0.00000000000007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000105216  hitchhiker  0.0000498769 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0989  integrase family protein  30.92 
 
 		 292 aa  79.3  0.00000000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0618431 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0623  site-specific recombinase  27.78 
 
 		 332 aa  79.3  0.00000000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1038  site-specific tyrosine recombinase XerD  25.84 
 
 		 296 aa  79  0.0000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00331502  normal  0.0102802 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2497  integrase family protein  26.54 
 
 		 308 aa  79  0.0000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2788  site-specific tyrosine recombinase XerD  26.17 
 
 		 296 aa  79  0.0000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000777667  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0842  hypothetical protein  23.93 
 
 		 290 aa  79  0.0000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2809  phage integrase family protein  28.2 
 
 		 311 aa  79  0.0000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1178  tyrosine recombinase XerC subunit  23.38 
 
 		 300 aa  79  0.0000000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1241  tyrosine recombinase XerD  28.57 
 
 		 311 aa  79  0.0000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.657845  normal  0.578091 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4199  site-specific tyrosine recombinase XerD  25.84 
 
 		 296 aa  79  0.0000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00345142  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1750  tyrosine recombinase XerD  29.1 
 
 		 294 aa  78.2  0.0000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1312  tyrosine recombinase XerC  25.57 
 
 		 298 aa  78.6  0.0000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.199373  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1337  tyrosine recombinase XerC  25.57 
 
 		 298 aa  78.6  0.0000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0149085  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0144  tyrosine recombinase XerD  21.94 
 
 		 305 aa  77.8  0.0000000000002  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2484  phage integrase  30.29 
 
 		 304 aa  78.2  0.0000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.72317  normal  0.0269236 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2957  site-specific tyrosine recombinase XerD  35.51 
 
 		 318 aa  77.8  0.0000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.271721  normal  0.636956 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2942  site-specific tyrosine recombinase XerD  35.51 
 
 		 318 aa  78.2  0.0000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1585  tyrosine recombinase XerD  27.42 
 
 		 295 aa  78.2  0.0000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1554  tyrosine recombinase XerD  27.42 
 
 		 295 aa  78.2  0.0000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2986  site-specific tyrosine recombinase XerD  35.51 
 
 		 318 aa  78.2  0.0000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0431132 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3281  site-specific tyrosine recombinase XerD  30.31 
 
 		 317 aa  78.6  0.0000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1060  tyrosine recombinase XerD  25.96 
 
 		 295 aa  77.4  0.0000000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.17947  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15290  tyrosine recombinase XerD subunit  29.54 
 
 		 332 aa  77.4  0.0000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.203953  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3892  site-specific tyrosine recombinase XerD  28.72 
 
 		 299 aa  77.8  0.0000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.413643  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3139  phage integrase family protein  30.79 
 
 		 344 aa  77.8  0.0000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.424721  normal  0.214127 
 
 
-
 
NC_002950  PG0386  phage integrase family site specific recombinase  28.11 
 
 		 400 aa  77  0.0000000000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3108  integrase family protein  24.6 
 
 		 292 aa  77  0.0000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000512092  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2381  site-specific tyrosine recombinase XerC  26.79 
 
 		 311 aa  77.4  0.0000000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0124  phage integrase family protein  24.23 
 
 		 298 aa  77  0.0000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.776243  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>