192 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BCAH187_A2252 on replicon NC_011658
Organism: Bacillus cereus AH187



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011658  BCAH187_A2252  prophage LambdaBa02, site-specific recombinase, phage integrase family  100 
 
 
319 aa  660    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.243711  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3986  prophage LambdaBa02, site-specific recombinase, phage integrase family  93.73 
 
 
319 aa  626  1e-178  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.578221  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0675  prophage LambdaBa02, site-specific recombinase, phage integrase family  93.42 
 
 
319 aa  625  1e-178  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4366  prophage LambdaBa02, site-specific recombinase, phage integrase family  92.48 
 
 
319 aa  623  1e-177  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3786  prophage LambdaBa02, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  92.48 
 
 
325 aa  619  1e-176  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00278104  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4075  prophage lambdaba02, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  92.48 
 
 
325 aa  619  1e-176  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1639  phage integrase family site specific recombinase  24 
 
 
338 aa  67.8  0.0000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.787761  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0738  integrase/recombinase  27.59 
 
 
340 aa  64.7  0.000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3062  site-specific tyrosine recombinase XerD  26.76 
 
 
308 aa  59.7  0.00000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0196  integrase family protein  23.34 
 
 
328 aa  59.3  0.00000009  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000565414 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2567  site-specific tyrosine recombinase XerD  28.01 
 
 
313 aa  58.5  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.615759 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00956  site-specific tyrosine recombinase XerD  25.74 
 
 
305 aa  58.2  0.0000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004441  site-specific recombinase XerD  25.83 
 
 
305 aa  56.6  0.0000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3407  integrase family protein  24.07 
 
 
325 aa  57  0.0000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.155435 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0519  phage integrase family protein  25.09 
 
 
300 aa  56.2  0.0000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.24612  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3304  tyrosine recombinase XerD  24.73 
 
 
298 aa  54.7  0.000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0133185  normal  0.394454 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0840  integrase family protein  22.79 
 
 
294 aa  53.5  0.000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.774041 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0562  integrase/recombinase  25.78 
 
 
308 aa  52.8  0.000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0843058  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1922  integrase family protein  25.97 
 
 
401 aa  52.8  0.000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.612381  hitchhiker  0.00155149 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1823  integrase family protein  50 
 
 
253 aa  52.4  0.000009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.987007  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2544  site-specific tyrosine recombinase XerD  25.77 
 
 
308 aa  52.4  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0967  phage integrase family protein  25.36 
 
 
324 aa  52.4  0.00001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1780  phage integrase family protein  48.08 
 
 
256 aa  52  0.00001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000232909  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7462  integrase family protein  22.94 
 
 
292 aa  51.6  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.105755  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3458  tyrosine recombinase XerD  26.67 
 
 
303 aa  51.2  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.664548  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6957  integrase family protein  23.01 
 
 
292 aa  51.6  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1241  phage integrase  21.48 
 
 
336 aa  51.6  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.097797 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2452  tyrosine recombinase XerD  23.57 
 
 
306 aa  51.6  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0952029  normal  0.728507 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0842  hypothetical protein  25.61 
 
 
290 aa  51.6  0.00002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4020  phage integrase family protein  24.24 
 
 
327 aa  51.2  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6605  integrase family protein  22.94 
 
 
292 aa  51.6  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7619  integrase family protein  22.94 
 
 
292 aa  51.6  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.192826  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4851  integrase family protein  26.47 
 
 
294 aa  51.6  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1902  phage integrase  24.31 
 
 
293 aa  50.8  0.00003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.162765  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4760  integrase family protein  26.32 
 
 
354 aa  50.8  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0169  phage integrase family protein  25.45 
 
 
282 aa  50.8  0.00003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0558238  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0788  phage integrase family protein  24 
 
 
293 aa  50.1  0.00006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3696  integrase family protein  21.29 
 
 
334 aa  49.7  0.00006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4006  integrase family protein  21.29 
 
 
334 aa  49.7  0.00006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0447  phage integrase family site specific recombinase  24.45 
 
 
307 aa  49.7  0.00007  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0577  site-specific tyrosine recombinase XerD  26.63 
 
 
305 aa  49.3  0.00008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0855221  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1099  tyrosine recombinase XerD  28.11 
 
 
296 aa  49.3  0.00008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0023  integrase family protein  26 
 
 
291 aa  49.3  0.00008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1683  phage integrase family protein  23.78 
 
 
287 aa  49.3  0.00008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0684  site-specific tyrosine recombinase XerD  25.11 
 
 
324 aa  49.3  0.00009  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.631001  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2241  integrase family protein  24.3 
 
 
345 aa  49.3  0.00009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.640527  hitchhiker  0.000757999 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0653  integrase family protein  23.21 
 
 
282 aa  49.3  0.00009  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.319783  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0772  site-specific tyrosine recombinase XerD  25.55 
 
 
324 aa  48.5  0.0001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3694  integrase family protein  24.74 
 
 
348 aa  48.9  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0279  phage integrase family protein  22.73 
 
 
282 aa  48.5  0.0001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.033075  hitchhiker  0.000013626 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1720  tyrosine recombinase XerD  23.38 
 
 
319 aa  48.9  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.514315 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0903  tyrosine recombinase XerD  24.59 
 
 
303 aa  47.8  0.0002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0537  tyrosine recombinase XerD subunit  27.08 
 
 
302 aa  48.1  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0401  integrase family protein  22.28 
 
 
304 aa  48.1  0.0002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.966282 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2320  phage integrase  26.58 
 
 
379 aa  48.1  0.0002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.971576  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0988  tyrosine recombinase XerD  24.59 
 
 
303 aa  47.8  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.252447  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1716  tyrosine recombinase XerD  25.41 
 
 
303 aa  48.1  0.0002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.500655  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0872  phage integrase family protein  22.46 
 
 
324 aa  48.1  0.0002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4655  tyrosine recombinase XerC  25.18 
 
 
365 aa  48.1  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.223284 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4288  tyrosine recombinase XerC  25.18 
 
 
365 aa  48.5  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.710874 
 
 
-
 
NC_013163  Cyan8802_4591  integrase family protein  28.21 
 
 
316 aa  47.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000000427706  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0795  tyrosine recombinase XerD  21.66 
 
 
300 aa  47.8  0.0003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0660  integrase family protein  27.22 
 
 
284 aa  47.4  0.0003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0890  tyrosine recombinase XerD  22.97 
 
 
300 aa  47.8  0.0003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.267893  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1995  site-specific tyrosine recombinase XerD  26.49 
 
 
302 aa  47.4  0.0003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0011  phage integrase family protein  23.65 
 
 
301 aa  47.4  0.0003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0358  integrase family protein  25.45 
 
 
287 aa  47.4  0.0003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3701  integrase family protein  22.03 
 
 
392 aa  47  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1347  tyrosine recombinase XerD  24.7 
 
 
306 aa  47  0.0004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.816733  normal  0.74121 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0900  integrase  23.49 
 
 
322 aa  47  0.0004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000819417  hitchhiker  0.000000626468 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1191  site-specific tyrosine recombinase XerC  24.05 
 
 
313 aa  47.4  0.0004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.60628  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1434  phage integrase family protein  26.06 
 
 
322 aa  47  0.0004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1162  integrase family protein  23.45 
 
 
287 aa  47  0.0004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2788  site-specific tyrosine recombinase XerD  23.97 
 
 
296 aa  47.4  0.0004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000777667  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1189  integrase family protein  23.45 
 
 
287 aa  47  0.0004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00933678  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6023  site-specific tyrosine recombinase XerC  25 
 
 
303 aa  47  0.0005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3102  integrase family protein  40.74 
 
 
301 aa  46.6  0.0006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000184896  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1668  tyrosine recombinase XerD subunit  23.67 
 
 
295 aa  46.6  0.0006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.179488  normal  0.0195248 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1900  phage integrase family protein  25.76 
 
 
331 aa  46.6  0.0006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.125862  hitchhiker  0.00365877 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_63  site-specific recombinase, phage integrase family  23.58 
 
 
332 aa  46.6  0.0006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014000  Ava_D0026  Phage integrase  24.24 
 
 
309 aa  46.6  0.0006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2329  tyrosine recombinase XerD  24.01 
 
 
277 aa  46.2  0.0007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00235896  normal  0.0350779 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3654  site-specific tyrosine recombinase XerC  23.27 
 
 
301 aa  46.2  0.0007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000489449  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3331  tyrosine recombinase XerD  21.66 
 
 
300 aa  45.8  0.0009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0051  resolvase  34.85 
 
 
268 aa  45.8  0.0009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3999  site-specific tyrosine recombinase XerD  23.63 
 
 
296 aa  45.8  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.189801  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3830  site-specific tyrosine recombinase XerD  23.63 
 
 
296 aa  45.8  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4311  site-specific tyrosine recombinase XerD  23.63 
 
 
296 aa  45.8  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.789664  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2544  tyrosine recombinase XerC  24.55 
 
 
318 aa  45.8  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.774585  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4113  site-specific tyrosine recombinase XerD  23.63 
 
 
296 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.00015e-24 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3191  tyrosine recombinase XerD subunit  24.86 
 
 
300 aa  45.4  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0750  site-specific tyrosine recombinase XerD  24.54 
 
 
311 aa  45.8  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0031  resolvase  34.85 
 
 
259 aa  45.4  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.131142  normal  0.303073 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4199  site-specific tyrosine recombinase XerD  23.29 
 
 
296 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00345142  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1038  site-specific tyrosine recombinase XerD  23.29 
 
 
296 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00331502  normal  0.0102802 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4323  phage integrase family protein  35.59 
 
 
257 aa  45.4  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.239874  normal  0.980189 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1185  tyrosine recombinase XerD  23.98 
 
 
315 aa  45.4  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0531401  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0055  resolvase  34.85 
 
 
237 aa  45.4  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0142  integrase family protein  22.38 
 
 
292 aa  45.4  0.001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4805  tyrosine recombinase XerC  24.91 
 
 
367 aa  45.8  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.104736  normal  0.146847 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>