More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_2320 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007955  Mbur_2320  phage integrase  100 
 
 		 379 aa  776    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.971576  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1324  integrase family protein  33.95 
 
 		 423 aa  168  2e-40  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000000102488 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2299  phage integrase  29.89 
 
 		 342 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0506  phage integrase family protein  31.73 
 
 		 424 aa  130  3e-29  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1736  integrase family protein  31.63 
 
 		 417 aa  130  4.0000000000000003e-29  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0866  phage integrase  45.45 
 
 		 139 aa  122  8e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.201994  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0046  integrase family protein  29.34 
 
 		 417 aa  119  6e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.362306  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1002  phage integrase  30.34 
 
 		 408 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.606138  decreased coverage  0.00492215 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1605  integrase family protein  24.03 
 
 		 453 aa  94.4  3e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0820528  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1668  tyrosine recombinase XerD subunit  29.2 
 
 		 295 aa  92.8  9e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.179488  normal  0.0195248 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1399  integrase family protein  26.82 
 
 		 430 aa  88.6  2e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.433904  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0435  integrase family protein  27.1 
 
 		 299 aa  80.1  0.00000000000006  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1282  tyrosine recombinase XerD  27.04 
 
 		 295 aa  79.3  0.0000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.63418  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1823  integrase family protein  25.23 
 
 		 253 aa  77.4  0.0000000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.987007  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1191  site-specific tyrosine recombinase XerC  29.29 
 
 		 313 aa  76.6  0.0000000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.60628  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2798  phage integrase  33.59 
 
 		 312 aa  75.5  0.000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1202  tyrosine recombinase XerC  26.99 
 
 		 304 aa  74.7  0.000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.910177  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0272  phage integrase family site specific recombinase  29.3 
 
 		 319 aa  74.7  0.000000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0295  phage integrase family site specific recombinase  29.3 
 
 		 319 aa  74.7  0.000000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0905  phage integrase family site specific recombinase  29.3 
 
 		 319 aa  74.7  0.000000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0967  phage integrase family protein  27.13 
 
 		 324 aa  73.9  0.000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0704  integrase family protein  23.65 
 
 		 305 aa  73.6  0.000000000006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000143659  unclonable  0.0000000274126 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2329  tyrosine recombinase XerD  22.43 
 
 		 277 aa  72.8  0.000000000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00235896  normal  0.0350779 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3124  integrase family protein  24.01 
 
 		 323 aa  72.8  0.000000000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3694  integrase family protein  25.55 
 
 		 348 aa  72.4  0.00000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0716  tyrosine recombinase XerC  28 
 
 		 307 aa  72  0.00000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.841608  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1780  phage integrase family protein  24.56 
 
 		 256 aa  71.6  0.00000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000232909  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0106  phage integrase family protein  22.65 
 
 		 295 aa  71.6  0.00000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3715  integrase family protein  26.09 
 
 		 298 aa  71.2  0.00000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_623  site-specific recombinase  26.61 
 
 		 307 aa  70.9  0.00000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0196  integrase family protein  25.83 
 
 		 328 aa  70.9  0.00000000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000565414 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0623  site-specific recombinase  28.52 
 
 		 332 aa  71.2  0.00000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0748  tyrosine recombinase XerD  24.92 
 
 		 303 aa  70.9  0.00000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.50433  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1524  integrase family protein  26.77 
 
 		 300 aa  70.1  0.00000000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.681425  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0063  tyrosine recombinase XerC  25.62 
 
 		 304 aa  70.1  0.00000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1619  phage integrase family protein  23.98 
 
 		 286 aa  69.7  0.00000000007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1174  tyrosine recombinase XerD  24.2 
 
 		 300 aa  69.7  0.00000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.784052  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3550  integrase family protein  25.3 
 
 		 324 aa  69.3  0.0000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.74971  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1906  integrase family protein  25.52 
 
 		 295 aa  68.9  0.0000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.713326  normal  0.217947 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1142  tyrosine recombinase XerD  24.37 
 
 		 295 aa  69.3  0.0000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0660  integrase family protein  29.15 
 
 		 284 aa  67.8  0.0000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0758  phage integrase family protein  25.9 
 
 		 304 aa  67.8  0.0000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.000222973  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0431  phage integrase  26.47 
 
 		 291 aa  67.4  0.0000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.173073 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0074  site-specific tyrosine recombinase XerC  24.9 
 
 		 307 aa  67.4  0.0000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0169  phage integrase family protein  26.96 
 
 		 282 aa  67  0.0000000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0558238  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1750  tyrosine recombinase XerD  24.64 
 
 		 294 aa  67  0.0000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0562  integrase/recombinase  24.9 
 
 		 308 aa  67  0.0000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0843058  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1786  tyrosine recombinase XerD  24.91 
 
 		 291 aa  67  0.0000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0596225  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0485  site-specific tyrosine recombinase XerC  23.51 
 
 		 322 aa  66.6  0.0000000007  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.853028 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0884  integrase  26.3 
 
 		 302 aa  66.6  0.0000000007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.161871  hitchhiker  0.000000000000894527 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0651  tyrosine recombinase XerC subunit  25.64 
 
 		 307 aa  66.2  0.0000000008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1622  tyrosine recombinase XerD  26.26 
 
 		 310 aa  66.2  0.0000000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3191  tyrosine recombinase XerD subunit  22.68 
 
 		 300 aa  66.2  0.0000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1003  tyrosine recombinase XerD subunit  26.56 
 
 		 302 aa  66.6  0.0000000008  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.497558  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1732  integrase/recombinase XerD  29.14 
 
 		 308 aa  66.2  0.0000000009  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1457  integrase family protein  21.9 
 
 		 326 aa  65.5  0.000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4012  tyrosine recombinase XerC  25.34 
 
 		 294 aa  65.9  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00152232  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0536  site-specific tyrosine recombinase XerC  23.72 
 
 		 300 aa  65.5  0.000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.538013  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1431  phage integrase  22.39 
 
 		 309 aa  65.9  0.000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.145363  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0842  hypothetical protein  27.02 
 
 		 290 aa  65.9  0.000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2257  site-specific tyrosine recombinase XerD  25.48 
 
 		 299 aa  65.5  0.000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.977256  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0262  phage integrase family protein  23.57 
 
 		 326 aa  65.5  0.000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4851  integrase family protein  28.8 
 
 		 294 aa  64.7  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0722  phage integrase family protein  24 
 
 		 306 aa  64.3  0.000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0599364 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1821  integrase family protein  25.81 
 
 		 307 aa  64.3  0.000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0364742  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4805  tyrosine recombinase XerC  25.99 
 
 		 367 aa  64.7  0.000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.104736  normal  0.146847 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0347  site-specific tyrosine recombinase XerC  24.51 
 
 		 307 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.693124 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1185  tyrosine recombinase XerD  24.19 
 
 		 315 aa  64.3  0.000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0531401  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0426  site-specific tyrosine recombinase XerC  24.09 
 
 		 321 aa  64.3  0.000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3981  site-specific tyrosine recombinase XerC  27.75 
 
 		 300 aa  63.9  0.000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.105897  normal  0.285215 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2497  integrase family protein  26.29 
 
 		 308 aa  63.9  0.000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5470  tyrosine recombinase XerD  26.36 
 
 		 316 aa  63.5  0.000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.602612  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0574  integrase family protein  25.31 
 
 		 304 aa  63.5  0.000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000663621  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0180  site-specific tyrosine recombinase XerC  25 
 
 		 324 aa  63.5  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1434  phage integrase family protein  24.9 
 
 		 322 aa  62.4  0.00000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6437  site-specific tyrosine recombinase XerC  23.75 
 
 		 306 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.798094 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1971  tyrosine recombinase XerD subunit  23.67 
 
 		 309 aa  62.8  0.00000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000860406  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2022  tyrosine recombinase XerD subunit  23.74 
 
 		 309 aa  62.4  0.00000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0679  integrase family protein  25 
 
 		 287 aa  62.8  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2538  integrase family protein  25.45 
 
 		 263 aa  62.4  0.00000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0177  site-specific tyrosine recombinase XerC  22.79 
 
 		 323 aa  62  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2528  tyrosine recombinase XerC  24.67 
 
 		 294 aa  61.6  0.00000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.237042 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1025  site-specific tyrosine recombinase XerD  25.11 
 
 		 298 aa  62  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.899371  normal  0.6007 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1099  tyrosine recombinase XerD  24.71 
 
 		 296 aa  61.6  0.00000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1501  tyrosine recombinase XerD subunit  23.1 
 
 		 295 aa  61.6  0.00000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0817  tyrosine recombinase XerD  23.18 
 
 		 305 aa  61.6  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.763193  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1674  tyrosine recombinase XerD  24.71 
 
 		 297 aa  62  0.00000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0517708  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3012  tyrosine recombinase XerD subunit  23.21 
 
 		 295 aa  62  0.00000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.146868  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2809  phage integrase family protein  23.53 
 
 		 311 aa  62  0.00000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1519  integrase family protein  27.13 
 
 		 279 aa  61.6  0.00000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.959361  decreased coverage  3.1361700000000003e-18 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2489  tyrosine recombinase XerD  21.05 
 
 		 318 aa  61.6  0.00000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.189208  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3569  phage integrase family protein  25.52 
 
 		 300 aa  61.6  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.121799  normal  0.0892176 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2127  tyrosine recombinase XerD  22.98 
 
 		 308 aa  61.6  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.518947  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03409  tyrosine recombinase  22.94 
 
 		 308 aa  61.2  0.00000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0590  tyrosine recombinase XerD  24.41 
 
 		 306 aa  61.2  0.00000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2473  site-specific tyrosine recombinase XerC  23.46 
 
 		 306 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0240  tyrosine recombinase XerC subunit  23.05 
 
 		 291 aa  60.8  0.00000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.295303  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3133  site-specific tyrosine recombinase XerC  24.03 
 
 		 306 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.40751  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3087  site-specific tyrosine recombinase XerC  23.46 
 
 		 306 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0060  phage integrase family protein  22.82 
 
 		 340 aa  61.2  0.00000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.106477  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>