175 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BCAH187_A0675 on replicon NC_011658
Organism: Bacillus cereus AH187



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011658  BCAH187_A0675  prophage LambdaBa02, site-specific recombinase, phage integrase family  100 
 
 		 319 aa  664    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4366  prophage LambdaBa02, site-specific recombinase, phage integrase family  94.36 
 
 		 319 aa  630  1e-179  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2252  prophage LambdaBa02, site-specific recombinase, phage integrase family  93.42 
 
 		 319 aa  625  1e-178  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.243711  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3986  prophage LambdaBa02, site-specific recombinase, phage integrase family  92.16 
 
 		 319 aa  620  1e-177  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.578221  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3786  prophage LambdaBa02, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  91.22 
 
 		 325 aa  613  9.999999999999999e-175  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00278104  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4075  prophage lambdaba02, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  91.22 
 
 		 325 aa  613  9.999999999999999e-175  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0196  integrase family protein  24.39 
 
 		 328 aa  65.5  0.000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000565414 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1639  phage integrase family site specific recombinase  23.69 
 
 		 338 aa  65.1  0.000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.787761  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0738  integrase/recombinase  27.05 
 
 		 340 aa  63.5  0.000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3407  integrase family protein  24.08 
 
 		 325 aa  62  0.00000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.155435 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3062  site-specific tyrosine recombinase XerD  25.4 
 
 		 308 aa  61.2  0.00000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0401  integrase family protein  22.71 
 
 		 304 aa  57.4  0.0000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.966282 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2567  site-specific tyrosine recombinase XerD  26.48 
 
 		 313 aa  57.8  0.0000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.615759 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1720  tyrosine recombinase XerD  23.2 
 
 		 319 aa  57  0.0000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.514315 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1902  phage integrase  24.65 
 
 		 293 aa  55.1  0.000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.162765  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0967  phage integrase family protein  25.71 
 
 		 324 aa  54.7  0.000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2452  tyrosine recombinase XerD  24.16 
 
 		 306 aa  53.9  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0952029  normal  0.728507 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1780  phage integrase family protein  48.08 
 
 		 256 aa  52  0.00001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000232909  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4760  integrase family protein  21.89 
 
 		 354 aa  52.4  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1922  integrase family protein  25.32 
 
 		 401 aa  52  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.612381  hitchhiker  0.00155149 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1823  integrase family protein  50 
 
 		 253 aa  52.4  0.00001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.987007  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0023  integrase family protein  26.67 
 
 		 291 aa  51.6  0.00002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0169  phage integrase family protein  27.49 
 
 		 282 aa  51.2  0.00002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0558238  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00956  site-specific tyrosine recombinase XerD  23.41 
 
 		 305 aa  51.6  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0840  integrase family protein  21.96 
 
 		 294 aa  50.8  0.00003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.774041 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0842  hypothetical protein  25.91 
 
 		 290 aa  50.8  0.00003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1082  integrase family protein  26.23 
 
 		 290 aa  50.4  0.00003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2544  tyrosine recombinase XerC  23.79 
 
 		 318 aa  50.4  0.00004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.774585  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0900  integrase  23.23 
 
 		 322 aa  50.4  0.00004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000819417  hitchhiker  0.000000626468 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0872  phage integrase family protein  22.11 
 
 		 324 aa  50.4  0.00004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0716  tyrosine recombinase XerC  26.19 
 
 		 307 aa  50.1  0.00005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.841608  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004441  site-specific recombinase XerD  23.59 
 
 		 305 aa  50.1  0.00005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1934  phage integrase family protein  25 
 
 		 297 aa  50.1  0.00005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1434  phage integrase family protein  23.23 
 
 		 322 aa  50.1  0.00005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1099  tyrosine recombinase XerD  25.81 
 
 		 296 aa  50.1  0.00006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4851  integrase family protein  24.39 
 
 		 294 aa  50.1  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4288  tyrosine recombinase XerC  25.09 
 
 		 365 aa  49.7  0.00006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.710874 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0519  phage integrase family protein  24.32 
 
 		 300 aa  50.1  0.00006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.24612  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4655  tyrosine recombinase XerC  25.09 
 
 		 365 aa  49.7  0.00007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.223284 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0142  integrase family protein  22.22 
 
 		 292 aa  49.3  0.00008  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0788  phage integrase family protein  22.97 
 
 		 293 aa  49.3  0.00009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1191  site-specific tyrosine recombinase XerC  23.96 
 
 		 313 aa  49.3  0.00009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.60628  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03409  tyrosine recombinase  25.52 
 
 		 308 aa  48.5  0.0001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1185  tyrosine recombinase XerD  23.98 
 
 		 315 aa  48.5  0.0001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0531401  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0891  integrase family protein  25.52 
 
 		 306 aa  48.5  0.0001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.180709  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2440  tyrosine recombinase XerD  20.68 
 
 		 332 aa  48.9  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.691328  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0660  integrase family protein  26.82 
 
 		 284 aa  48.9  0.0001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3304  tyrosine recombinase XerD  23.67 
 
 		 298 aa  48.9  0.0001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0133185  normal  0.394454 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1383  integrase family protein  23.18 
 
 		 307 aa  48.9  0.0001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3694  integrase family protein  25.45 
 
 		 348 aa  48.1  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2544  site-specific tyrosine recombinase XerD  25.63 
 
 		 308 aa  47.8  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0447  phage integrase family site specific recombinase  23.73 
 
 		 307 aa  48.1  0.0002  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1241  phage integrase  23.62 
 
 		 336 aa  48.1  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.097797 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69710  site-specific tyrosine recombinase XerC  23.62 
 
 		 303 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.737312  normal  0.478185 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4020  phage integrase family protein  22.92 
 
 		 327 aa  47.8  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0988  tyrosine recombinase XerD  25.81 
 
 		 303 aa  48.1  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.252447  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0903  tyrosine recombinase XerD  25.81 
 
 		 303 aa  48.1  0.0002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0562  integrase/recombinase  25.39 
 
 		 308 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0843058  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8116  integrase/recombinase  23.23 
 
 		 335 aa  48.1  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.000851463  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2788  site-specific tyrosine recombinase XerD  24.32 
 
 		 296 aa  48.1  0.0002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000777667  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0684  site-specific tyrosine recombinase XerD  25.55 
 
 		 324 aa  48.1  0.0002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.631001  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1611  tyrosine recombinase  22.09 
 
 		 308 aa  48.1  0.0002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.4794 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3696  integrase family protein  21.68 
 
 		 334 aa  48.1  0.0002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4006  integrase family protein  21.68 
 
 		 334 aa  48.1  0.0002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0476  tyrosine recombinase XerD  23.43 
 
 		 302 aa  48.1  0.0002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1209  phage integrase family site specific recombinase  22.85 
 
 		 305 aa  47.8  0.0003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.764611  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1847  integrase family protein  23.05 
 
 		 314 aa  47.4  0.0003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.475025 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1003  tyrosine recombinase XerD subunit  23.83 
 
 		 302 aa  47.8  0.0003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.497558  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0772  site-specific tyrosine recombinase XerD  26.52 
 
 		 324 aa  47.4  0.0003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0507  tyrosine recombinase XerD  24.22 
 
 		 339 aa  47  0.0004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3458  tyrosine recombinase XerD  25.68 
 
 		 303 aa  47  0.0004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.664548  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0063  tyrosine recombinase XerC  24.65 
 
 		 304 aa  47  0.0004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0234  site-specific tyrosine recombinase XerC  24.81 
 
 		 302 aa  47  0.0004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3102  integrase family protein  40.74 
 
 		 301 aa  46.6  0.0005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000184896  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1716  tyrosine recombinase XerD  24.86 
 
 		 303 aa  46.6  0.0005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.500655  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3999  site-specific tyrosine recombinase XerD  23.57 
 
 		 296 aa  46.6  0.0006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.189801  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3830  site-specific tyrosine recombinase XerD  23.57 
 
 		 296 aa  46.6  0.0006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4311  site-specific tyrosine recombinase XerD  23.57 
 
 		 296 aa  46.6  0.0006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.789664  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4113  site-specific tyrosine recombinase XerD  23.57 
 
 		 296 aa  46.6  0.0006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.00015e-24 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6023  site-specific tyrosine recombinase XerC  23.88 
 
 		 303 aa  46.6  0.0006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3920  site-specific tyrosine recombinase XerD  23.55 
 
 		 296 aa  46.6  0.0006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000317777  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2241  integrase family protein  23.59 
 
 		 345 aa  46.6  0.0006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.640527  hitchhiker  0.000757999 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1347  tyrosine recombinase XerD  25.33 
 
 		 306 aa  46.6  0.0006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.816733  normal  0.74121 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3846  site-specific tyrosine recombinase XerD  23.57 
 
 		 296 aa  46.2  0.0007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0256715  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1769  tyrosine recombinase XerD  24.01 
 
 		 304 aa  46.2  0.0007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.151783  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_623  site-specific recombinase  25.85 
 
 		 307 aa  46.2  0.0007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0027  integrase/recombinase  24.72 
 
 		 325 aa  46.2  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000824478  normal  0.490771 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0011  phage integrase family protein  21.77 
 
 		 301 aa  45.8  0.0009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4158  site-specific tyrosine recombinase XerD  23.57 
 
 		 296 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.44443  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0577  site-specific tyrosine recombinase XerD  26.74 
 
 		 305 aa  45.4  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0855221  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4805  tyrosine recombinase XerC  24.91 
 
 		 367 aa  45.4  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.104736  normal  0.146847 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4222  site-specific tyrosine recombinase XerD  23.57 
 
 		 296 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00160259  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2860  tyrosine recombinase XerC subunit  23.89 
 
 		 300 aa  45.8  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1668  tyrosine recombinase XerD subunit  24.56 
 
 		 295 aa  45.4  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.179488  normal  0.0195248 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1038  site-specific tyrosine recombinase XerD  23.57 
 
 		 296 aa  45.4  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00331502  normal  0.0102802 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2271  phage integrase family protein  21.12 
 
 		 321 aa  45.4  0.001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1481  phage integrase family protein  20.54 
 
 		 311 aa  45.8  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0281722  normal  0.205606 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0907  site-specific tyrosine recombinase XerD  21.8 
 
 		 307 aa  45.8  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0051  resolvase  42.86 
 
 		 268 aa  45.4  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3654  site-specific tyrosine recombinase XerC  23.42 
 
 		 301 aa  45.8  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000489449  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>