More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_1922 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_1922  integrase family protein  100 
 
 		 401 aa  806    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.612381  hitchhiker  0.00155149 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1203  phage integrase  26.47 
 
 		 394 aa  87.8  3e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00426039  normal  0.328241 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0039  integrase family protein  26.33 
 
 		 451 aa  83.2  0.000000000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0419  integrase family protein  28.31 
 
 		 414 aa  81.3  0.00000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000230336  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3913  phage integrase family protein  29.9 
 
 		 387 aa  80.5  0.00000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.126543  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3520  integrase family protein  28.48 
 
 		 365 aa  80.5  0.00000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28710  site-specific recombinase XerD  29.55 
 
 		 370 aa  80.5  0.00000000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.870092  normal  0.942592 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09660  site-specific recombinase, integrase family  28.3 
 
 		 396 aa  78.2  0.0000000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.458441  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0058  phage integrase family protein  26.92 
 
 		 395 aa  77  0.0000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.251229  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2497  integrase family protein  29.19 
 
 		 384 aa  73.6  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.355652 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2589  DNA integration/recombination/invertion protein  23.39 
 
 		 369 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2734  DNA integration/recombination/invertion protein  23.12 
 
 		 369 aa  72  0.00000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.117201  hitchhiker  0.0000120563 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0285  tyrosine recombinase XerC  26.51 
 
 		 302 aa  70.5  0.00000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0747  integrase family protein  23.16 
 
 		 325 aa  69.3  0.0000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.194299  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4448  phage integrase family protein  25.59 
 
 		 424 aa  68.9  0.0000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.322677  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0923  integrase family protein  24.93 
 
 		 363 aa  69.3  0.0000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2205  DNA integration/recombination/invertion protein  22.04 
 
 		 369 aa  68.9  0.0000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00883749  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4364  phage integrase family protein  25.56 
 
 		 373 aa  67  0.0000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.80079  normal  0.417396 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3042  tyrosine recombinase XerD subunit  25.1 
 
 		 294 aa  66.6  0.0000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000138339  normal  0.959316 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4012  tyrosine recombinase XerC  24.36 
 
 		 294 aa  66.2  0.0000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00152232  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1796  Phage integrase  24.5 
 
 		 390 aa  66.6  0.0000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1187  integrase family protein  24.21 
 
 		 370 aa  66.2  0.0000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.474728  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2020  LigA  27.17 
 
 		 397 aa  65.9  0.000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.389387  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03620  phage integrase family protein  25 
 
 		 391 aa  66.2  0.000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000382884  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3499  integrase family protein  28.06 
 
 		 368 aa  65.1  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000340769  hitchhiker  0.00860577 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1462  Phage integrase  29.14 
 
 		 387 aa  63.9  0.000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0768  integrase family protein  27.6 
 
 		 397 aa  64.3  0.000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0880  phage integrase family protein  21.64 
 
 		 291 aa  63.5  0.000000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0027577 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0492  phage integrase family site specific recombinase  25.91 
 
 		 294 aa  62.8  0.000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0248661  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3701  integrase family protein  25.8 
 
 		 392 aa  62.4  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0956  site-specific recombinase, phage integrase family  23.72 
 
 		 323 aa  62.4  0.00000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0800  Phage integrase  22.76 
 
 		 369 aa  62.8  0.00000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.64955  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0251  site-specific tyrosine recombinase XerC  35.04 
 
 		 355 aa  62.8  0.00000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00631913  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1615  phage integrase family protein  24.68 
 
 		 368 aa  62.4  0.00000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0481425  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0114  phage integrase  26.67 
 
 		 431 aa  62  0.00000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.646267 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1927  phage integrase  25.36 
 
 		 379 aa  62.4  0.00000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0252061  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4828  phage integrase  27.16 
 
 		 433 aa  61.2  0.00000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.281268  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0602  site-specific tyrosine recombinase XerC  31.25 
 
 		 324 aa  61.2  0.00000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00926796 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2689  tyrosine recombinase XerC  26.8 
 
 		 311 aa  61.2  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.147909 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3068  phage integrase family protein  25.56 
 
 		 407 aa  60.8  0.00000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2219  phage integrase  24 
 
 		 378 aa  60.1  0.00000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3720  phage integrase family protein  21.96 
 
 		 451 aa  60.1  0.00000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2351  integrase family protein  26.45 
 
 		 427 aa  60.1  0.00000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.226368  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3213  integrase family protein  26.57 
 
 		 388 aa  59.7  0.00000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1583  phage integrase family protein  22.08 
 
 		 451 aa  59.7  0.00000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0415  prophage LambdaBa04, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  22.58 
 
 		 374 aa  58.9  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.611975  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1037  Phage integrase  28.32 
 
 		 338 aa  59.3  0.0000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1201  site-specific tyrosine recombinase XerD  29.32 
 
 		 321 aa  59.3  0.0000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.731595  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0427  prophage lambdaba04, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  22.58 
 
 		 374 aa  58.9  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1301  integrase family protein  26.6 
 
 		 396 aa  59.3  0.0000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1633  Phage integrase  21.17 
 
 		 368 aa  58.9  0.0000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.576304  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3508  integrase family protein  23.18 
 
 		 443 aa  59.7  0.0000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0952  site-specific tyrosine recombinase XerC  27.72 
 
 		 329 aa  58.9  0.0000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3565  phage integrase family protein  23.37 
 
 		 402 aa  59.3  0.0000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000473566  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2283  phage integrase family protein  28.81 
 
 		 331 aa  59.3  0.0000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0831  Phage integrase  29.34 
 
 		 400 aa  58.5  0.0000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  hitchhiker  0.00496745  hitchhiker  0.00000971423 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3561  Phage integrase  26.54 
 
 		 275 aa  58.2  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4398  integrase family protein  21.52 
 
 		 451 aa  58.5  0.0000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0364227  hitchhiker  0.00879025 
 
 
-
 
NC_013168  Cyan8802_4647  integrase family protein  29.28 
 
 		 223 aa  58.9  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0860  integrase family protein  26.45 
 
 		 370 aa  58.2  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1915  site-specific tyrosine recombinase XerD  29.33 
 
 		 345 aa  58.9  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.279776  hitchhiker  0.00138491 
 
 
-
 
NC_002936  DET1474  phage integrase family site specific recombinase  21.83 
 
 		 386 aa  58.2  0.0000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0051357  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0045  phage integrase family site specific recombinase  21.76 
 
 		 456 aa  58.2  0.0000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.869382  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3786  prophage LambdaBa02, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  27.27 
 
 		 325 aa  57.8  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00278104  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0832  Phage integrase  25.69 
 
 		 341 aa  58.2  0.0000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4075  prophage lambdaba02, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  27.27 
 
 		 325 aa  57.8  0.0000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3132  phage integrase family site specific recombinase  27.2 
 
 		 222 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1481  integrase family protein  31.16 
 
 		 308 aa  57.8  0.0000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.141471  normal  0.0727308 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0996  phage integrase family protein  35.79 
 
 		 387 aa  58.2  0.0000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000294682 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2218  phage integrase family protein  26.97 
 
 		 388 aa  57.8  0.0000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2509  integrase family protein  33.33 
 
 		 380 aa  57.4  0.0000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.593152  normal  0.73908 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2105  tyrosine recombinase XerD  25.41 
 
 		 297 aa  57.4  0.0000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.179497  hitchhiker  0.00877552 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3398  phage integrase family site specific recombinase  23.21 
 
 		 407 aa  57  0.0000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1220  site-specific tyrosine recombinase XerC  29.12 
 
 		 330 aa  57  0.0000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0883  phage integrase family site specific recombinase  25.14 
 
 		 435 aa  57  0.0000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0113166  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39510  site-specific tyrosine recombinase XerD  28.9 
 
 		 298 aa  57  0.0000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23640  tyrosine recombinase XerC subunit  26.77 
 
 		 310 aa  57  0.0000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.154193  normal  0.0993098 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0485  site-specific tyrosine recombinase XerC  26.59 
 
 		 322 aa  56.6  0.0000007  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.853028 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1191  site-specific tyrosine recombinase XerC  37.04 
 
 		 313 aa  56.6  0.0000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.60628  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3274  phage integrase family site specific recombinase  33.63 
 
 		 159 aa  56.6  0.0000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3201  integrase family protein  25.85 
 
 		 351 aa  57  0.0000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.689071 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1421  phage integrase family protein  32.26 
 
 		 351 aa  56.6  0.0000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0924  phage integrase family protein  26.77 
 
 		 294 aa  56.6  0.0000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.852644  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09860  tyrosine recombinase XerC subunit  25.28 
 
 		 329 aa  56.6  0.0000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08760  tyrosine recombinase XerD  33.09 
 
 		 309 aa  56.6  0.0000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.940341  unclonable  0.00000000128305 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0704  integrase family protein  26.71 
 
 		 305 aa  56.6  0.0000009  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000143659  unclonable  0.0000000274126 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1654  site-specific tyrosine recombinase XerC  28 
 
 		 330 aa  56.2  0.0000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000000234006  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1001  integrase family protein  35.65 
 
 		 333 aa  55.5  0.000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2797  phage integrase family protein  24.91 
 
 		 451 aa  55.8  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1585  site-specific recombinase XerD-like  25.68 
 
 		 332 aa  55.8  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.264485  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0341  tyrosine recombinase XerC  23.72 
 
 		 317 aa  55.8  0.000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000100724  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1654  integrase family protein  35.34 
 
 		 298 aa  56.2  0.000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2293  phage integrase family protein  26.74 
 
 		 395 aa  55.8  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0121  integrase family protein  25.29 
 
 		 422 aa  56.2  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.534504  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3921  phage integrase family protein  29.29 
 
 		 327 aa  55.8  0.000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.470105  hitchhiker  0.00183347 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1213  ferredoxin, 4Fe-4S  21.9 
 
 		 288 aa  55.8  0.000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3933  integrase family protein  26.92 
 
 		 344 aa  55.8  0.000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00343242  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1568  integrase family protein  26.49 
 
 		 357 aa  55.5  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2661  phage integrase  27.88 
 
 		 347 aa  55.5  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0679447  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2923  phage integrase  25.86 
 
 		 379 aa  55.1  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>