83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP1639 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP1639  phage integrase family site specific recombinase  100 
 
 		 338 aa  706    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.787761  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3986  prophage LambdaBa02, site-specific recombinase, phage integrase family  25.85 
 
 		 319 aa  70.9  0.00000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.578221  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3786  prophage LambdaBa02, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  24.22 
 
 		 325 aa  70.9  0.00000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00278104  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4075  prophage lambdaba02, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  24.22 
 
 		 325 aa  70.9  0.00000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2252  prophage LambdaBa02, site-specific recombinase, phage integrase family  24 
 
 		 319 aa  67.8  0.0000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.243711  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4366  prophage LambdaBa02, site-specific recombinase, phage integrase family  23.69 
 
 		 319 aa  65.1  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0675  prophage LambdaBa02, site-specific recombinase, phage integrase family  23.69 
 
 		 319 aa  65.1  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0435  integrase family protein  24.83 
 
 		 299 aa  62  0.00000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00295  site-specific recombinase, phage integrase family protein  27.59 
 
 		 297 aa  56.2  0.0000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4725  phage integrase family protein  19.94 
 
 		 375 aa  55.5  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.675287  normal  1 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8116  integrase/recombinase  22.58 
 
 		 335 aa  55.1  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.000851463  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0144  tyrosine recombinase XerD  30.72 
 
 		 305 aa  52.8  0.00001  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5470  tyrosine recombinase XerD  25.12 
 
 		 316 aa  52.4  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.602612  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2794  integrase family protein  22.86 
 
 		 304 aa  52.4  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.160655  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3221  integrase family protein  23.98 
 
 		 337 aa  51.2  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.107588  hitchhiker  0.000000474252 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1821  integrase family protein  22.76 
 
 		 307 aa  50.8  0.00003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0364742  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2751  Phage integrase:Phage integrase, N-terminal SAM-like  23.88 
 
 		 321 aa  50.8  0.00003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.74292  normal  0.0246266 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1473  tyrosine recombinase XerD  26.03 
 
 		 296 aa  50.8  0.00003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.202075  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1023  integrase family protein  21.72 
 
 		 297 aa  50.4  0.00004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0854512  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2175  tyrosine recombinase XerD  27.18 
 
 		 299 aa  50.4  0.00004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2840  Phage integrase  24.64 
 
 		 296 aa  50.1  0.00005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2966  site-specific recombinase, phage integrase family  24.88 
 
 		 321 aa  50.4  0.00005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.121059  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1730  integrase family protein  24.24 
 
 		 317 aa  50.1  0.00006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.715889  normal  1 
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2651  integrase/recombinase  23.26 
 
 		 320 aa  48.9  0.0001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.178628 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5250  site-specific tyrosine recombinase XerC  28.21 
 
 		 298 aa  48.1  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0047  tyrosine recombinase XerC  30.17 
 
 		 298 aa  48.1  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2742  phage integrase family site specific recombinase  26.49 
 
 		 269 aa  48.5  0.0002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0873278  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5348  integrase family protein  28.02 
 
 		 330 aa  47.8  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.464558 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2228  integrase family protein  28.02 
 
 		 330 aa  47.8  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.763924 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2008  integrase family protein  28.02 
 
 		 330 aa  47.8  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.461761  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0440  phage integrase  24.28 
 
 		 334 aa  47.8  0.0003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0393  tyrosine recombinase XerC  30.25 
 
 		 299 aa  47.4  0.0004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.426652 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3631  tyrosine recombinase XerC  30.25 
 
 		 299 aa  47.4  0.0004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.465228 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0394  tyrosine recombinase XerC  30.25 
 
 		 299 aa  47.4  0.0004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0142  Phage integrase  23.39 
 
 		 343 aa  47.4  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2436  tyrosine recombinase XerD  23.37 
 
 		 305 aa  47.4  0.0004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.578966 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4271  site-specific tyrosine recombinase XerC  27.56 
 
 		 298 aa  46.6  0.0005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4177  site-specific tyrosine recombinase XerC  27.56 
 
 		 298 aa  46.6  0.0005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0208532 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4196  site-specific tyrosine recombinase XerC  27.56 
 
 		 298 aa  46.6  0.0005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0689633  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4168  tyrosine recombinase XerC  27.56 
 
 		 298 aa  46.6  0.0005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4036  site-specific tyrosine recombinase XerC  27.56 
 
 		 298 aa  46.6  0.0005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03687  site-specific tyrosine recombinase XerC  27.56 
 
 		 298 aa  46.6  0.0006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.446663  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4330  site-specific tyrosine recombinase XerC  27.56 
 
 		 298 aa  46.6  0.0006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03636  hypothetical protein  27.56 
 
 		 298 aa  46.6  0.0006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.487194  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3580  tyrosine recombinase XerC  27.33 
 
 		 302 aa  45.8  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.636062  n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2840  integrase family protein  27.18 
 
 		 322 aa  45.4  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0238888  normal  0.278729 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0660  integrase family protein  22.54 
 
 		 284 aa  45.4  0.001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4306  integrase/recombinase XerC  27.33 
 
 		 299 aa  45.8  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3108  integrase family protein  25.62 
 
 		 292 aa  45.4  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000512092  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4243  phage integrase  28.87 
 
 		 309 aa  45.8  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000426285 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3139  phage integrase family protein  29.11 
 
 		 344 aa  45.8  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.424721  normal  0.214127 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0880  phage integrase family protein  25.63 
 
 		 291 aa  44.7  0.002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0027577 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1299  site-specific tyrosine recombinase XerC  26.06 
 
 		 291 aa  44.7  0.002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4006  integrase family protein  22.19 
 
 		 334 aa  44.7  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3696  integrase family protein  22.19 
 
 		 334 aa  44.7  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6023  site-specific tyrosine recombinase XerC  25.97 
 
 		 303 aa  44.3  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1202  tyrosine recombinase XerC  26.05 
 
 		 304 aa  44.3  0.003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.910177  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2848  phage integrase family protein  23.23 
 
 		 304 aa  44.3  0.003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2348  phage integrase family protein  26.09 
 
 		 301 aa  44.7  0.003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1906  integrase family protein  22.92 
 
 		 295 aa  44.3  0.003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.713326  normal  0.217947 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2841  phage integrase family site specific recombinase  23.23 
 
 		 292 aa  43.9  0.004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.424466  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69710  site-specific tyrosine recombinase XerC  25.97 
 
 		 303 aa  43.9  0.004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.737312  normal  0.478185 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3971  tyrosine recombinase XerC  26.67 
 
 		 306 aa  43.9  0.004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011732  PCC7424_5582  integrase family protein  24.35 
 
 		 313 aa  43.9  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4336  site-specific tyrosine recombinase XerC  27.39 
 
 		 300 aa  43.9  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4177  site-specific tyrosine recombinase XerC  27.39 
 
 		 300 aa  43.9  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.225708  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4159  site-specific tyrosine recombinase XerC  27.39 
 
 		 300 aa  43.9  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.937296  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4277  site-specific tyrosine recombinase XerC  27.39 
 
 		 300 aa  43.9  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4229  site-specific tyrosine recombinase XerC  27.39 
 
 		 300 aa  43.9  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2702  site-specific recombinase  26.49 
 
 		 299 aa  43.5  0.005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3981  site-specific tyrosine recombinase XerC  27.39 
 
 		 300 aa  43.5  0.005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.105897  normal  0.285215 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0381  tyrosine recombinase XerD  22.83 
 
 		 303 aa  43.5  0.005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5408  phage integrase family protein  26.89 
 
 		 330 aa  43.5  0.006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.123433 
 
 
-
 
NC_007615  Nmul_B2807  Phage integrase  23.43 
 
 		 323 aa  43.5  0.006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2012  Phage integrase  21.24 
 
 		 329 aa  43.1  0.007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7458  integrase family protein  23.64 
 
 		 335 aa  43.1  0.007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.259677  normal  1 
 
 
-
 
NC_011727  PCC8801_4563  integrase domain protein SAM domain protein  31.13 
 
 		 314 aa  43.1  0.007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3505  phage integrase family protein  27.46 
 
 		 330 aa  43.1  0.007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.431904  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0730  phage integrase  25.15 
 
 		 305 aa  43.1  0.008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0240  tyrosine recombinase XerC subunit  27.74 
 
 		 291 aa  43.1  0.008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.295303  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5707  integrase domain protein SAM domain protein  28.97 
 
 		 319 aa  42.7  0.009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3993  tyrosine recombinase XerC  26.67 
 
 		 306 aa  42.4  0.01  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4127  tyrosine recombinase XerC  28.81 
 
 		 301 aa  42.7  0.01  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.442069 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>