More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_B2651 on replicon NC_007595
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007595  Synpcc7942_B2651  integrase/recombinase  100 
 
 		 320 aa  644    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.178628 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3084  phage integrase  43.09 
 
 		 189 aa  149  4e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5846  integrase domain protein SAM domain protein  46.26 
 
 		 148 aa  130  3e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2658  hypothetical protein  96.61 
 
 		 76 aa  122  6e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.622532 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1668  tyrosine recombinase XerD subunit  26.45 
 
 		 295 aa  102  9e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.179488  normal  0.0195248 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0842  hypothetical protein  30.17 
 
 		 290 aa  102  1e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3082  phage integrase-like SAM-like  40.57 
 
 		 117 aa  98.6  1e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0884  integrase  28.52 
 
 		 302 aa  97.1  4e-19  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.161871  hitchhiker  0.000000000000894527 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2052  tyrosine recombinase XerD  28.57 
 
 		 296 aa  94.7  2e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1839  integrase family protein  30.58 
 
 		 310 aa  95.1  2e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0285  tyrosine recombinase XerC  28.07 
 
 		 302 aa  92.8  7e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1225  integrase family protein  27.72 
 
 		 301 aa  92.4  8e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.103765  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1202  tyrosine recombinase XerC  32.29 
 
 		 304 aa  92.4  9e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.910177  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4646  Phage integrase:Phage integrase, N-terminal SAM-like  32.38 
 
 		 317 aa  92  1e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2012  Phage integrase  30.85 
 
 		 329 aa  92.4  1e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4608  site-specific recombinase, phage integrase family  31.96 
 
 		 320 aa  91.3  2e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.764652  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1475  Phage integrase:Phage integrase, N-terminal SAM-like  31.96 
 
 		 320 aa  91.3  2e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.04346  normal  0.165942 
 
 
-
 
NC_002936  DET1215  tyrosine recombinase XerD  28.17 
 
 		 302 aa  90.5  3e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.157843  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0247  integrase family protein  33.8 
 
 		 322 aa  89.7  5e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.121071  n/a   
 
 
-
 
NC_007615  Nmul_B2807  Phage integrase  31.51 
 
 		 323 aa  89.7  6e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_998  integrase/recombinase  28.17 
 
 		 302 aa  89.7  6e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1492  Phage integrase:Phage integrase, N-terminal SAM-like  31.47 
 
 		 320 aa  88.2  1e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1025  tyrosine recombinase XerD subunit  27.82 
 
 		 302 aa  87.8  2e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1786  tyrosine recombinase XerD  27.17 
 
 		 291 aa  88.2  2e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0596225  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0063  tyrosine recombinase XerC  29.79 
 
 		 304 aa  88.2  2e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2346  tyrosine recombinase XerC  29.96 
 
 		 302 aa  87.4  3e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.126195  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0273  tyrosine recombinase XerC  30.3 
 
 		 300 aa  87  3e-16  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.007038  normal  0.809464 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1133  integrase family protein  32.14 
 
 		 299 aa  87.4  3e-16  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0367  site-specific tyrosine recombinase XerD  30.45 
 
 		 298 aa  87  4e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2497  integrase family protein  26.54 
 
 		 308 aa  87  4e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0396  tyrosine recombinase XerD  30.45 
 
 		 309 aa  85.9  8e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0574  integrase family protein  33.06 
 
 		 304 aa  85.9  9e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000663621  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1282  tyrosine recombinase XerD  31.39 
 
 		 295 aa  85.9  9e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.63418  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1473  tyrosine recombinase XerD  26.6 
 
 		 296 aa  85.1  0.000000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.202075  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1524  integrase family protein  25.17 
 
 		 300 aa  85.1  0.000000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.681425  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4158  site-specific tyrosine recombinase XerD  25.44 
 
 		 296 aa  84.3  0.000000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.44443  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4222  site-specific tyrosine recombinase XerD  25.44 
 
 		 296 aa  84.3  0.000000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00160259  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1326  integrase family protein  26.87 
 
 		 309 aa  84.3  0.000000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.847423  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3654  site-specific tyrosine recombinase XerC  24.48 
 
 		 301 aa  85.1  0.000000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000489449  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0476  tyrosine recombinase XerD  29.41 
 
 		 302 aa  84  0.000000000000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3189  integrase family protein  32.57 
 
 		 320 aa  84  0.000000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00303256 
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4798  phage integrase family protein  31.23 
 
 		 331 aa  84.3  0.000000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.586427 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3878  site-specific tyrosine recombinase XerC  24.48 
 
 		 299 aa  84  0.000000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000107327  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3846  site-specific tyrosine recombinase XerD  25.44 
 
 		 296 aa  83.6  0.000000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0256715  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1827  tyrosine recombinase XerD  28.18 
 
 		 306 aa  83.6  0.000000000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0404  integrase family protein  29.19 
 
 		 320 aa  83.6  0.000000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.0000000863146  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3999  site-specific tyrosine recombinase XerD  25.44 
 
 		 296 aa  83.2  0.000000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.189801  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3830  site-specific tyrosine recombinase XerD  25.44 
 
 		 296 aa  83.2  0.000000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4113  site-specific tyrosine recombinase XerD  25.44 
 
 		 296 aa  83.2  0.000000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.00015e-24 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4311  site-specific tyrosine recombinase XerD  25.44 
 
 		 296 aa  83.2  0.000000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.789664  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0607  recombinase  29.35 
 
 		 296 aa  83.2  0.000000000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3920  site-specific tyrosine recombinase XerD  25.44 
 
 		 296 aa  83.6  0.000000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000317777  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1300  tyrosine recombinase XerD subunit  26.62 
 
 		 297 aa  83.6  0.000000000000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3873  site-specific tyrosine recombinase XerC  24.48 
 
 		 299 aa  83.2  0.000000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00557083  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4199  site-specific tyrosine recombinase XerD  25.44 
 
 		 296 aa  83.2  0.000000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00345142  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1038  site-specific tyrosine recombinase XerD  25.44 
 
 		 296 aa  83.2  0.000000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00331502  normal  0.0102802 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3572  site-specific tyrosine recombinase XerC  24.13 
 
 		 299 aa  82.8  0.000000000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000685052  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3843  site-specific tyrosine recombinase XerC  24.13 
 
 		 299 aa  82.8  0.000000000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.27577e-62 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2257  site-specific tyrosine recombinase XerD  29.41 
 
 		 299 aa  82.4  0.000000000000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.977256  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3682  site-specific tyrosine recombinase XerC  24.13 
 
 		 299 aa  82  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.245295  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1508  Phage integrase:Phage integrase, N-terminal SAM-like  31.14 
 
 		 319 aa  82  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3715  integrase family protein  29.24 
 
 		 298 aa  82.4  0.00000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3969  site-specific tyrosine recombinase XerC  24.13 
 
 		 299 aa  82  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000391393  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1028  tyrosine recombinase XerD subunit  29.76 
 
 		 313 aa  82  0.00000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00856798  unclonable  0.00000000634873 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2654  tyrosine recombinase XerD  26.84 
 
 		 306 aa  82  0.00000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0487  tyrosine recombinase XerC  26.79 
 
 		 293 aa  82  0.00000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000269064 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1970  site-specific tyrosine recombinase XerC  30.42 
 
 		 300 aa  82  0.00000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.397741 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1990  site-specific tyrosine recombinase XerC  29.37 
 
 		 300 aa  82.4  0.00000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2788  site-specific tyrosine recombinase XerD  26.13 
 
 		 296 aa  82  0.00000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000777667  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2501  site-specific tyrosine recombinase XerC  31.34 
 
 		 312 aa  82  0.00000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.504706  normal  0.936606 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4805  tyrosine recombinase XerC  31.21 
 
 		 367 aa  82  0.00000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.104736  normal  0.146847 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2036  site-specific tyrosine recombinase XerC  29.37 
 
 		 300 aa  82.4  0.00000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0541579  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0716  tyrosine recombinase XerC  28.94 
 
 		 307 aa  81.3  0.00000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.841608  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3590  site-specific tyrosine recombinase XerC  24.13 
 
 		 299 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0796955  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0863  phage integrase family protein  31.76 
 
 		 313 aa  81.6  0.00000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1971  tyrosine recombinase XerD subunit  28.57 
 
 		 309 aa  81.3  0.00000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000860406  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0676  tyrosine recombinase XerD subunit  27.05 
 
 		 296 aa  81.3  0.00000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0470  tyrosine recombinase XerC  26.69 
 
 		 293 aa  81.3  0.00000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3661  site-specific tyrosine recombinase XerC  28.06 
 
 		 311 aa  81.6  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0047  integrase family protein  30.18 
 
 		 314 aa  81.3  0.00000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.456307  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1732  integrase/recombinase XerD  27.18 
 
 		 308 aa  80.9  0.00000000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1347  tyrosine recombinase XerD  32.76 
 
 		 306 aa  80.9  0.00000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.816733  normal  0.74121 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1488  tyrosine recombinase XerD  32.11 
 
 		 304 aa  80.9  0.00000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.221019  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0163  integrase family protein  29.35 
 
 		 342 aa  80.1  0.00000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.70922  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3124  integrase family protein  28.26 
 
 		 323 aa  80.5  0.00000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0651  tyrosine recombinase XerC subunit  27.72 
 
 		 307 aa  80.5  0.00000000000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0927  tyrosine recombinase XerD  29.05 
 
 		 304 aa  80.5  0.00000000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08760  tyrosine recombinase XerD  30.83 
 
 		 309 aa  80.1  0.00000000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.940341  unclonable  0.00000000128305 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0713  phage integrase  33.88 
 
 		 331 aa  80.1  0.00000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2483  site-specific tyrosine recombinase XerC  24.13 
 
 		 299 aa  80.1  0.00000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000855714  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_623  site-specific recombinase  28.94 
 
 		 307 aa  79.7  0.00000000000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0319  tyrosine recombinase XerD  30.92 
 
 		 307 aa  79.7  0.00000000000006  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.944891  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1750  tyrosine recombinase XerD  28.97 
 
 		 294 aa  79.7  0.00000000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0788  phage integrase family protein  29.39 
 
 		 293 aa  79.3  0.00000000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5501  site-specific tyrosine recombinase XerC  28.62 
 
 		 299 aa  79.3  0.00000000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.345753  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09590  tyrosine recombinase XerD  26.03 
 
 		 302 aa  79.3  0.00000000000008  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.0503565 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3929  site-specific tyrosine recombinase XerC  23.78 
 
 		 299 aa  79  0.00000000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000313294  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0027  integrase/recombinase  30.36 
 
 		 325 aa  79  0.00000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000824478  normal  0.490771 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0478  tyrosine recombinase XerD  27.97 
 
 		 319 aa  79  0.00000000000009  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0047  tyrosine recombinase XerC  31.13 
 
 		 298 aa  79  0.0000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>