More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_5707 on replicon NC_011738
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011738  PCC7424_5707  integrase domain protein SAM domain protein  100 
 
 		 319 aa  659    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011727  PCC8801_4563  integrase domain protein SAM domain protein  66.78 
 
 		 314 aa  387  1e-106  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2894  integrase domain protein SAM domain protein  48.62 
 
 		 356 aa  303  3.0000000000000004e-81  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0142  Phage integrase  43.23 
 
 		 343 aa  230  2e-59  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0189  Phage integrase  42.9 
 
 		 343 aa  229  6e-59  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0863  phage integrase family protein  31.9 
 
 		 313 aa  106  4e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2788  site-specific tyrosine recombinase XerD  32.02 
 
 		 296 aa  106  5e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000777667  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4199  site-specific tyrosine recombinase XerD  30.83 
 
 		 296 aa  106  6e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00345142  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1038  site-specific tyrosine recombinase XerD  30.83 
 
 		 296 aa  106  6e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00331502  normal  0.0102802 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1668  tyrosine recombinase XerD subunit  30.42 
 
 		 295 aa  105  8e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.179488  normal  0.0195248 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3999  site-specific tyrosine recombinase XerD  30.83 
 
 		 296 aa  104  2e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.189801  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3830  site-specific tyrosine recombinase XerD  30.83 
 
 		 296 aa  104  2e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4311  site-specific tyrosine recombinase XerD  30.83 
 
 		 296 aa  104  2e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.789664  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4113  site-specific tyrosine recombinase XerD  30.83 
 
 		 296 aa  104  2e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.00015e-24 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0047  integrase family protein  32.12 
 
 		 314 aa  104  2e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.456307  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3920  site-specific tyrosine recombinase XerD  30.43 
 
 		 296 aa  103  3e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000317777  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4158  site-specific tyrosine recombinase XerD  30.43 
 
 		 296 aa  103  4e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.44443  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4222  site-specific tyrosine recombinase XerD  30.43 
 
 		 296 aa  103  4e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00160259  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3846  site-specific tyrosine recombinase XerD  30.43 
 
 		 296 aa  103  4e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0256715  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1751  tyrosine recombinase XerD  29.93 
 
 		 294 aa  102  8e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2052  tyrosine recombinase XerD  32.93 
 
 		 296 aa  102  1e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0367  site-specific tyrosine recombinase XerD  32.94 
 
 		 298 aa  102  1e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2257  site-specific tyrosine recombinase XerD  32.54 
 
 		 299 aa  100  2e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.977256  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4696  integrase family protein  29.72 
 
 		 306 aa  99.8  6e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1839  integrase family protein  28.42 
 
 		 310 aa  97.4  3e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2332  tyrosine recombinase XerD  31.62 
 
 		 292 aa  97.1  3e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2038  tyrosine recombinase XerD  30.62 
 
 		 311 aa  96.3  7e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.487981  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1450  integrase family protein  30.83 
 
 		 299 aa  95.9  8e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00858396  normal  0.734684 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0676  tyrosine recombinase XerD subunit  28.88 
 
 		 296 aa  95.9  8e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1554  tyrosine recombinase XerD  32.32 
 
 		 295 aa  95.5  1e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013386  Adeg_2179  integrase family protein  33.46 
 
 		 288 aa  95.5  1e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.353401  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1585  tyrosine recombinase XerD  32.32 
 
 		 295 aa  95.5  1e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2383  tyrosine recombinase XerD  32.3 
 
 		 295 aa  95.1  1e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0562  site-specific tyrosine recombinase XerD  32.08 
 
 		 300 aa  95.5  1e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3275  site-specific tyrosine recombinase XerD  33.08 
 
 		 298 aa  94.4  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09590  tyrosine recombinase XerD  32.83 
 
 		 302 aa  94.4  2e-18  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.0503565 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1878  tyrosine recombinase XerD  30.88 
 
 		 292 aa  94.7  2e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3380  site-specific tyrosine recombinase XerD  33.08 
 
 		 298 aa  94  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3212  site-specific tyrosine recombinase XerD  33.08 
 
 		 298 aa  94  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.476349 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4012  tyrosine recombinase XerC  30.36 
 
 		 294 aa  94  3e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00152232  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3200  site-specific tyrosine recombinase XerD  33.08 
 
 		 298 aa  94  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.550002  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3278  site-specific tyrosine recombinase XerD  33.08 
 
 		 298 aa  94  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1513  site-specific recombinase  32.54 
 
 		 295 aa  93.2  5e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.110584  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1003  tyrosine recombinase XerD subunit  30.22 
 
 		 302 aa  93.2  5e-18  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.497558  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1060  tyrosine recombinase XerD  31.56 
 
 		 295 aa  93.2  6e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.17947  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02726  site-specific tyrosine recombinase XerD  33.08 
 
 		 298 aa  92.4  8e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.292633  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0798  tyrosine recombinase XerD  33.08 
 
 		 298 aa  92.4  8e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.966972  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3027  site-specific tyrosine recombinase XerD  33.08 
 
 		 298 aa  92.4  8e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02689  hypothetical protein  33.08 
 
 		 298 aa  92.4  8e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.364794  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3220  site-specific tyrosine recombinase XerD  33.08 
 
 		 298 aa  92.4  8e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4185  site-specific tyrosine recombinase XerD  33.08 
 
 		 298 aa  92.4  8e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3314  site-specific tyrosine recombinase XerD  33.08 
 
 		 298 aa  92.4  8e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3053  site-specific tyrosine recombinase XerD  33.08 
 
 		 298 aa  92.4  9e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004441  site-specific recombinase XerD  31.14 
 
 		 305 aa  92.4  1e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0435  integrase family protein  29.56 
 
 		 299 aa  90.9  2e-17  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1427  tyrosine recombinase XerD subunit  30.36 
 
 		 295 aa  91.3  2e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3892  site-specific tyrosine recombinase XerD  30.99 
 
 		 299 aa  91.3  2e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.413643  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1720  tyrosine recombinase XerD  32.74 
 
 		 319 aa  90.9  3e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.514315 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03409  tyrosine recombinase  29.62 
 
 		 308 aa  90.5  3e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1995  site-specific tyrosine recombinase XerD  30.28 
 
 		 302 aa  90.5  3e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1971  tyrosine recombinase XerD subunit  30.11 
 
 		 309 aa  90.1  4e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000860406  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0350  phage integrase family protein  32.18 
 
 		 341 aa  90.1  4e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000105216  hitchhiker  0.0000498769 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00956  site-specific tyrosine recombinase XerD  29.73 
 
 		 305 aa  89.4  7e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2105  tyrosine recombinase XerD  31.64 
 
 		 297 aa  89  9e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.179497  hitchhiker  0.00877552 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0815  site-specific tyrosine recombinase XerD  32.7 
 
 		 298 aa  89  9e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.624778  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0452  tyrosine recombinase XerC subunit  28.71 
 
 		 335 aa  88.2  2e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.577676  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1819  integrase/recombinase XerD  30.95 
 
 		 295 aa  87  3e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.530175  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3847  site-specific tyrosine recombinase XerD  30.74 
 
 		 299 aa  87.4  3e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.349121 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1023  integrase family protein  30.77 
 
 		 297 aa  87.4  3e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0854512  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0879  site-specific tyrosine recombinase XerD  30.74 
 
 		 299 aa  87.4  3e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.201006  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0920  site-specific tyrosine recombinase XerD  30.74 
 
 		 299 aa  87.4  3e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0492  phage integrase family site specific recombinase  30.11 
 
 		 294 aa  86.7  4e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0248661  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1099  tyrosine recombinase XerD  31.15 
 
 		 296 aa  87  4e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0678  tyrosine recombinase XerD  32.14 
 
 		 294 aa  87  4e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0265142 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0201  tyrosine recombinase XerC subunit  31.89 
 
 		 345 aa  86.7  5e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000601095 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0645  site-specific tyrosine recombinase XerD  31.03 
 
 		 299 aa  86.7  5e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.241995  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1786  tyrosine recombinase XerD  25.53 
 
 		 291 aa  85.9  9e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0596225  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2544  site-specific tyrosine recombinase XerD  34 
 
 		 308 aa  85.1  0.000000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0660  integrase family protein  27.09 
 
 		 284 aa  85.5  0.000000000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1750  tyrosine recombinase XerD  28.12 
 
 		 294 aa  85.5  0.000000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1225  integrase family protein  31.32 
 
 		 301 aa  85.1  0.000000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.103765  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1560  tyrosine recombinase XerD  29.69 
 
 		 331 aa  85.1  0.000000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.736869  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3300  tyrosine recombinase XerD  30 
 
 		 299 aa  84.7  0.000000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0341  tyrosine recombinase XerC  29.63 
 
 		 317 aa  85.1  0.000000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000100724  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0772  site-specific tyrosine recombinase XerD  28.32 
 
 		 324 aa  84.7  0.000000000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0861  site-specific tyrosine recombinase XerD  31.03 
 
 		 299 aa  85.1  0.000000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4429  tyrosine recombinase XerD  30.43 
 
 		 301 aa  84.3  0.000000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0676058  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1185  tyrosine recombinase XerD  29.66 
 
 		 315 aa  84  0.000000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0531401  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2378  tyrosine recombinase XerD  31.87 
 
 		 296 aa  84.3  0.000000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.336575 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0221  phage integrase  31.73 
 
 		 349 aa  84  0.000000000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.118358  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1023  tyrosine recombinase XerC subunit  28.88 
 
 		 307 aa  84  0.000000000000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.554982  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1142  tyrosine recombinase XerD  30.04 
 
 		 295 aa  84  0.000000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0476  tyrosine recombinase XerD  29.96 
 
 		 302 aa  83.6  0.000000000000004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0139  tyrosine recombinase XerD  29.68 
 
 		 312 aa  84  0.000000000000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08760  tyrosine recombinase XerD  32.66 
 
 		 309 aa  83.2  0.000000000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.940341  unclonable  0.00000000128305 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1266  tyrosine recombinase XerD  30.46 
 
 		 310 aa  83.2  0.000000000000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2739  integrase/recombinase XerD  29.11 
 
 		 321 aa  82.8  0.000000000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1827  tyrosine recombinase XerD  29.41 
 
 		 306 aa  82.4  0.000000000000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1282  tyrosine recombinase XerD  30.42 
 
 		 295 aa  82.4  0.000000000000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.63418  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1025  tyrosine recombinase XerD subunit  26.62 
 
 		 302 aa  82  0.00000000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>