More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_2237 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007516  Syncc9605_2237  site-specific recombinase XerD-like  100 
 
 		 225 aa  459  9.999999999999999e-129  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0311543  normal  0.392069 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0430  site-specific recombinase XerD-like  54.64 
 
 		 291 aa  213  1.9999999999999998e-54  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  hitchhiker  0.00678047  n/a   
 
 
-
 
NC_011730  PCC7424_5548  integrase family protein  38.46 
 
 		 289 aa  96.3  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4851  integrase family protein  31.94 
 
 		 294 aa  95.9  4e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011760  Mchl_5760  integrase family protein  38.61 
 
 		 291 aa  95.1  8e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0788  phage integrase family protein  35.9 
 
 		 293 aa  86.3  3e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0447  tyrosine recombinase XerC  32.97 
 
 		 299 aa  83.6  0.000000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0323  phage integrase family site specific recombinase  30.11 
 
 		 336 aa  82.8  0.000000000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.158931  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4127  tyrosine recombinase XerC  30.88 
 
 		 301 aa  83.2  0.000000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.442069 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1023  integrase family protein  39.16 
 
 		 297 aa  82.8  0.000000000000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0854512  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1025  tyrosine recombinase XerD subunit  33.88 
 
 		 302 aa  82.8  0.000000000000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_998  integrase/recombinase  34.43 
 
 		 302 aa  82.4  0.000000000000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0235  Integrase  35.05 
 
 		 308 aa  82.4  0.000000000000006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.386202  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1468  site-specific tyrosine recombinase XerD  32.79 
 
 		 298 aa  82  0.000000000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.208903 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4253  site-specific tyrosine recombinase XerD  32.79 
 
 		 298 aa  82  0.000000000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1215  tyrosine recombinase XerD  33.88 
 
 		 302 aa  82  0.000000000000008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.157843  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3971  tyrosine recombinase XerC  33.52 
 
 		 306 aa  81.3  0.00000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0805  tyrosine recombinase XerD  33.52 
 
 		 300 aa  81.3  0.00000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4151  site-specific tyrosine recombinase XerD  32.79 
 
 		 298 aa  80.5  0.00000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.596099 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1025  site-specific tyrosine recombinase XerD  33.33 
 
 		 298 aa  80.5  0.00000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.899371  normal  0.6007 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3714  tyrosine recombinase XerD  33.88 
 
 		 301 aa  80.1  0.00000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1073  site-specific tyrosine recombinase XerD  32.79 
 
 		 298 aa  80.9  0.00000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.344511  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3894  tyrosine recombinase XerC  33.52 
 
 		 306 aa  79.7  0.00000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00533729 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0770  tyrosine recombinase XerD  33.89 
 
 		 303 aa  79.7  0.00000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0646575 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4087  tyrosine recombinase XerC  33.52 
 
 		 306 aa  79.7  0.00000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0169707 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3108  integrase family protein  34.01 
 
 		 292 aa  79.7  0.00000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000512092  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3993  tyrosine recombinase XerC  33.52 
 
 		 306 aa  79.7  0.00000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0660  integrase family protein  34.93 
 
 		 284 aa  79.3  0.00000000000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39510  site-specific tyrosine recombinase XerD  33.33 
 
 		 298 aa  79  0.00000000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0359  tyrosine recombinase XerD  33.52 
 
 		 290 aa  79  0.00000000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00723526 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2127  tyrosine recombinase XerD  32.61 
 
 		 308 aa  78.6  0.00000000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.518947  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3580  tyrosine recombinase XerC  29.95 
 
 		 302 aa  78.6  0.00000000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.636062  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3426  tyrosine recombinase XerD  32.24 
 
 		 299 aa  78.6  0.00000000000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0478  tyrosine recombinase XerD  35.42 
 
 		 319 aa  78.2  0.00000000000009  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0396  tyrosine recombinase XerD  32.42 
 
 		 309 aa  78.2  0.0000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4306  integrase/recombinase XerC  31.11 
 
 		 299 aa  78.2  0.0000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1478  integrase/recombinase XerD  32.24 
 
 		 298 aa  77.8  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0755097  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1286  site-specific tyrosine recombinase XerD  32.24 
 
 		 298 aa  77.8  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0511461  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0052  phage integrase  31.22 
 
 		 312 aa  77.8  0.0000000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0325  tyrosine recombinase XerC  32.42 
 
 		 297 aa  77.8  0.0000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1750  tyrosine recombinase XerD  30.89 
 
 		 294 aa  77.4  0.0000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7458  integrase family protein  34.94 
 
 		 335 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.259677  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0393  tyrosine recombinase XerC  32.8 
 
 		 321 aa  77  0.0000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0057  tyrosine recombinase XerD  31.22 
 
 		 312 aa  77  0.0000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.502069 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3304  tyrosine recombinase XerD  31.89 
 
 		 298 aa  77  0.0000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0133185  normal  0.394454 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0861  site-specific tyrosine recombinase XerD  32.24 
 
 		 299 aa  76.6  0.0000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1827  tyrosine recombinase XerD  33.51 
 
 		 306 aa  76.6  0.0000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1148  phage integrase family site specific recombinase  26.6 
 
 		 328 aa  76.6  0.0000000000003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0281308  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0489  tyrosine recombinase XerC  32.42 
 
 		 299 aa  76.6  0.0000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.110232  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3139  phage integrase family protein  35.44 
 
 		 344 aa  75.9  0.0000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.424721  normal  0.214127 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3228  tyrosine recombinase XerD  31.87 
 
 		 300 aa  75.9  0.0000000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.302685  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1282  tyrosine recombinase XerD  34.44 
 
 		 295 aa  75.9  0.0000000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.63418  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3920  site-specific tyrosine recombinase XerD  33.71 
 
 		 296 aa  75.5  0.0000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000317777  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0139  tyrosine recombinase XerD  31.22 
 
 		 312 aa  75.5  0.0000000000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2104  tyrosine recombinase XerD  32.79 
 
 		 301 aa  75.5  0.0000000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.443082 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2489  tyrosine recombinase XerD  33.82 
 
 		 318 aa  75.5  0.0000000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.189208  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3300  tyrosine recombinase XerD  30.61 
 
 		 299 aa  75.5  0.0000000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1554  tyrosine recombinase XerD  31.18 
 
 		 295 aa  75.5  0.0000000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0663  tyrosine recombinase XerD  30.22 
 
 		 305 aa  75.5  0.0000000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1585  tyrosine recombinase XerD  31.18 
 
 		 295 aa  75.5  0.0000000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3247  integrase/recombinase XerC  32.47 
 
 		 296 aa  75.1  0.0000000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3396  site-specific tyrosine recombinase XerD  31.15 
 
 		 298 aa  75.1  0.0000000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0394  tyrosine recombinase XerC  30 
 
 		 299 aa  75.1  0.0000000000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0393  tyrosine recombinase XerC  30 
 
 		 299 aa  75.1  0.0000000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.426652 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2788  site-specific tyrosine recombinase XerD  33.71 
 
 		 296 aa  75.1  0.0000000000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000777667  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3631  tyrosine recombinase XerC  30 
 
 		 299 aa  75.1  0.0000000000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.465228 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0476  tyrosine recombinase XerD  35.29 
 
 		 302 aa  74.7  0.0000000000009  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0645  site-specific tyrosine recombinase XerD  31.69 
 
 		 299 aa  74.3  0.000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.241995  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4158  site-specific tyrosine recombinase XerD  35.29 
 
 		 296 aa  74.7  0.000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.44443  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3999  site-specific tyrosine recombinase XerD  35.29 
 
 		 296 aa  74.3  0.000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.189801  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3830  site-specific tyrosine recombinase XerD  35.29 
 
 		 296 aa  74.3  0.000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3846  site-specific tyrosine recombinase XerD  35.29 
 
 		 296 aa  74.7  0.000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0256715  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4311  site-specific tyrosine recombinase XerD  35.29 
 
 		 296 aa  74.3  0.000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.789664  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1932  tyrosine recombinase XerD  31.02 
 
 		 310 aa  74.7  0.000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1381  site-specific tyrosine recombinase XerD  31.77 
 
 		 298 aa  74.3  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00360913  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4222  site-specific tyrosine recombinase XerD  35.29 
 
 		 296 aa  74.7  0.000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00160259  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4113  site-specific tyrosine recombinase XerD  35.29 
 
 		 296 aa  74.3  0.000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.00015e-24 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16040  site-specific tyrosine recombinase XerD  31.77 
 
 		 298 aa  74.3  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0884  integrase  32.51 
 
 		 302 aa  74.7  0.000000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.161871  hitchhiker  0.000000000000894527 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3331  tyrosine recombinase XerD  31.87 
 
 		 300 aa  74.7  0.000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1118  tyrosine recombinase XerD  32.26 
 
 		 304 aa  73.6  0.000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3892  site-specific tyrosine recombinase XerD  30.6 
 
 		 299 aa  73.9  0.000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.413643  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1971  tyrosine recombinase XerD subunit  31.69 
 
 		 309 aa  73.9  0.000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000860406  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0144  tyrosine recombinase XerD  29.74 
 
 		 305 aa  74.3  0.000000000002  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3449  tyrosine recombinase XerD  31.32 
 
 		 300 aa  73.6  0.000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0795  tyrosine recombinase XerD  31.87 
 
 		 300 aa  73.9  0.000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4199  site-specific tyrosine recombinase XerD  35.29 
 
 		 296 aa  73.9  0.000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00345142  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1038  site-specific tyrosine recombinase XerD  35.29 
 
 		 296 aa  73.9  0.000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00331502  normal  0.0102802 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1082  integrase family protein  36.36 
 
 		 290 aa  73.9  0.000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3643  tyrosine recombinase XerD  31.32 
 
 		 309 aa  73.2  0.000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0950  integrase/recombinase XerD  31.15 
 
 		 300 aa  73.2  0.000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2255  tyrosine recombinase XerD  29.51 
 
 		 305 aa  73.2  0.000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000204462  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0843  tyrosine recombinase XerD  31.32 
 
 		 309 aa  73.2  0.000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1520  tyrosine recombinase XerD  29.69 
 
 		 362 aa  73.2  0.000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000383292 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3524  tyrosine recombinase XerD  31.32 
 
 		 309 aa  73.2  0.000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2739  integrase/recombinase XerD  31.87 
 
 		 321 aa  73.2  0.000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1060  tyrosine recombinase XerD  29.19 
 
 		 295 aa  72.4  0.000000000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.17947  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0380  tyrosine recombinase XerC  30 
 
 		 304 aa  72.4  0.000000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1432  tyrosine recombinase XerD  31.87 
 
 		 321 aa  72.8  0.000000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0895087  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0879  site-specific tyrosine recombinase XerD  31.15 
 
 		 299 aa  72  0.000000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.201006  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>