More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_2776 on replicon NC_008010
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008010  Dgeo_2776  phage integrase  100 
 
 		 316 aa  641    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0149476  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1554  integrase family protein  34.04 
 
 		 339 aa  129  4.0000000000000003e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.86595  decreased coverage  0.00111318 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2052  integrase family protein  33.43 
 
 		 353 aa  116  5e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00829339  normal  1 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3046  integrase family protein  33.44 
 
 		 310 aa  106  4e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2277  phage integrase  36.57 
 
 		 310 aa  100  4e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.000555272  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1117  phage integrase  31 
 
 		 369 aa  92.4  9e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.343038  decreased coverage  0.00190839 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0712  integrase family protein  28.67 
 
 		 285 aa  71.2  0.00000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00227312  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2124  phage integrase family protein  22.34 
 
 		 301 aa  70.1  0.00000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.308322  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0370  phage integrase family protein  22.73 
 
 		 304 aa  67.8  0.0000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1255  integrase family protein  33.1 
 
 		 186 aa  67.8  0.0000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1131  Integrase  29.34 
 
 		 223 aa  67.4  0.0000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.127877  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0466  Fis family transcriptional regulator  32.42 
 
 		 362 aa  66.6  0.0000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12664  integrase  36.2 
 
 		 332 aa  65.5  0.000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000304658  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0815  integrase family protein  28.86 
 
 		 183 aa  64.7  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1720  tyrosine recombinase XerD  25.99 
 
 		 319 aa  65.1  0.000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.514315 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1390  site-specific tyrosine recombinase XerC  23.35 
 
 		 328 aa  64.3  0.000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000179914  n/a   
 
 
-
 
NC_013386  Adeg_2179  integrase family protein  28.83 
 
 		 288 aa  63.9  0.000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.353401  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2439  integrase family protein  24.07 
 
 		 283 aa  63.2  0.000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000285613  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3517  phage integrase family protein  28.98 
 
 		 188 aa  63.2  0.000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0285  tyrosine recombinase XerC  31.54 
 
 		 302 aa  62.4  0.000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0377  integrase family protein  28.98 
 
 		 186 aa  62.4  0.000000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000239772 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3442  phage integrase  25.82 
 
 		 337 aa  62.4  0.00000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2483  site-specific tyrosine recombinase XerC  29.61 
 
 		 299 aa  62  0.00000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000855714  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1007  site-specific recombinase  27.52 
 
 		 183 aa  61.6  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  8.22552e-63 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1619  phage integrase family protein  25.26 
 
 		 286 aa  61.6  0.00000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4429  tyrosine recombinase XerD  28.95 
 
 		 301 aa  61.2  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0676058  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001839  site-specific recombinase phage integrase family  27.91 
 
 		 186 aa  61.2  0.00000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0452  tyrosine recombinase XerC subunit  27.27 
 
 		 335 aa  61.2  0.00000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.577676  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1703  phage integrase  28.9 
 
 		 285 aa  60.5  0.00000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1099  tyrosine recombinase XerD  25.45 
 
 		 296 aa  60.1  0.00000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3654  site-specific tyrosine recombinase XerC  24.83 
 
 		 301 aa  59.3  0.00000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000489449  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0660  integrase family protein  25.83 
 
 		 284 aa  59.3  0.00000008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1082  integrase family protein  23.13 
 
 		 290 aa  59.3  0.00000008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0169  phage integrase family protein  23.51 
 
 		 282 aa  59.3  0.00000008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0558238  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5250  site-specific tyrosine recombinase XerC  24.56 
 
 		 298 aa  59.3  0.00000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03687  site-specific tyrosine recombinase XerC  24.91 
 
 		 298 aa  58.5  0.0000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.446663  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4168  tyrosine recombinase XerC  24.91 
 
 		 298 aa  58.5  0.0000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0272  phage integrase family site specific recombinase  25.12 
 
 		 319 aa  58.5  0.0000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0295  phage integrase family site specific recombinase  25.12 
 
 		 319 aa  58.5  0.0000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0905  phage integrase family site specific recombinase  25.12 
 
 		 319 aa  58.5  0.0000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4271  site-specific tyrosine recombinase XerC  24.91 
 
 		 298 aa  58.5  0.0000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3878  site-specific tyrosine recombinase XerC  24.83 
 
 		 299 aa  58.9  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000107327  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3682  site-specific tyrosine recombinase XerC  24.83 
 
 		 299 aa  58.9  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.245295  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3572  site-specific tyrosine recombinase XerC  24.83 
 
 		 299 aa  58.9  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000685052  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3590  site-specific tyrosine recombinase XerC  24.83 
 
 		 299 aa  58.9  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0796955  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4036  site-specific tyrosine recombinase XerC  24.91 
 
 		 298 aa  58.5  0.0000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3969  site-specific tyrosine recombinase XerC  24.83 
 
 		 299 aa  58.9  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000391393  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4177  site-specific tyrosine recombinase XerC  24.91 
 
 		 298 aa  58.5  0.0000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0208532 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0144  tyrosine recombinase XerD  23.67 
 
 		 305 aa  58.9  0.0000001  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03636  hypothetical protein  24.91 
 
 		 298 aa  58.5  0.0000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.487194  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2674  phage integrase family protein  23.88 
 
 		 305 aa  58.9  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.174931  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3843  site-specific tyrosine recombinase XerC  24.83 
 
 		 299 aa  58.9  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.27577e-62 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4196  site-specific tyrosine recombinase XerC  24.91 
 
 		 298 aa  58.5  0.0000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0689633  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3700  phage integrase family protein  30.18 
 
 		 305 aa  58.2  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3929  site-specific tyrosine recombinase XerC  24.5 
 
 		 299 aa  58.2  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000313294  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1617  site-specific tyrosine recombinase XerC  26.36 
 
 		 330 aa  58.2  0.0000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000155402  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4330  site-specific tyrosine recombinase XerC  25.26 
 
 		 298 aa  58.2  0.0000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2440  tyrosine recombinase XerD  27.24 
 
 		 332 aa  57.4  0.0000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.691328  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1314  site-specific tyrosine recombinase XerC  27.94 
 
 		 299 aa  57.4  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000019497  unclonable  8.39468e-26 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0447  phage integrase family site specific recombinase  25.17 
 
 		 307 aa  57.8  0.0000003  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0083  site-specific tyrosine recombinase XerC  25.61 
 
 		 322 aa  57.4  0.0000003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0728  site-specific tyrosine recombinase XerC  27.35 
 
 		 330 aa  57.4  0.0000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.442089  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1254  phage integrase family protein  27.49 
 
 		 186 aa  57.4  0.0000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.709211 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0942  site-specific tyrosine recombinase XerC  31.12 
 
 		 315 aa  57.4  0.0000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1732  integrase/recombinase XerD  24.17 
 
 		 308 aa  57  0.0000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3873  site-specific tyrosine recombinase XerC  24.5 
 
 		 299 aa  57  0.0000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00557083  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0602  site-specific tyrosine recombinase XerC  35.67 
 
 		 324 aa  57  0.0000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00926796 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0795  phage integrase family protein  27.12 
 
 		 283 aa  57  0.0000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3642  phage integrase family protein  28.74 
 
 		 305 aa  57  0.0000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.000185721  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2512  tyrosine recombinase XerD  26.55 
 
 		 328 aa  57  0.0000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.234856 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1205  integrase/recombinase XerD  26.5 
 
 		 274 aa  57  0.0000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3847  site-specific tyrosine recombinase XerD  27.04 
 
 		 299 aa  56.6  0.0000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.349121 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0177  site-specific tyrosine recombinase XerC  27.76 
 
 		 323 aa  56.6  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0879  site-specific tyrosine recombinase XerD  27.04 
 
 		 299 aa  56.6  0.0000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.201006  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1996  site-specific tyrosine recombinase XerC  28.89 
 
 		 300 aa  56.6  0.0000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3115  phage integrase  31.47 
 
 		 298 aa  56.6  0.0000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0920  site-specific tyrosine recombinase XerD  27.04 
 
 		 299 aa  56.6  0.0000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2484  phage integrase  27.5 
 
 		 304 aa  56.6  0.0000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.72317  normal  0.0269236 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2735  tyrosine recombinase XerD  26.21 
 
 		 328 aa  56.2  0.0000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.206607 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69710  site-specific tyrosine recombinase XerC  28.64 
 
 		 303 aa  56.6  0.0000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.737312  normal  0.478185 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3599  integrase family protein  25 
 
 		 180 aa  56.2  0.0000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.616601  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3108  integrase family protein  28.92 
 
 		 292 aa  56.2  0.0000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000512092  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5304  site-specific recombinase, phage integrase family  24.66 
 
 		 322 aa  56.2  0.0000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3665  integrase family protein  27.82 
 
 		 313 aa  56.2  0.0000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.211751 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1733  integrase family protein  26.49 
 
 		 333 aa  56.2  0.0000008  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0607  recombinase  26.36 
 
 		 296 aa  56.2  0.0000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0063  tyrosine recombinase XerC  28.78 
 
 		 304 aa  55.8  0.0000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6023  site-specific tyrosine recombinase XerC  28.18 
 
 		 303 aa  55.5  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1312  tyrosine recombinase XerC  25.19 
 
 		 298 aa  55.5  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.199373  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3671  phage integrase family protein  28.16 
 
 		 305 aa  55.1  0.000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1337  tyrosine recombinase XerC  25.19 
 
 		 298 aa  55.5  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0149085  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5291  site-specific tyrosine recombinase XerC  25.95 
 
 		 299 aa  55.8  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3090  tyrosine recombinase XerD  27.9 
 
 		 320 aa  55.1  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1456  integrase family protein  26.67 
 
 		 337 aa  55.5  0.000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.699839  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_5002  hypothtical protein  27.96 
 
 		 308 aa  55.5  0.000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0748381  hitchhiker  0.0000000255834 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6955  integrase family protein  28.8 
 
 		 343 aa  55.5  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0447  tyrosine recombinase XerC  25.68 
 
 		 299 aa  55.8  0.000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5139  site-specific tyrosine recombinase XerC  25.95 
 
 		 299 aa  55.1  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0497  tyrosine recombinase XerC  26.88 
 
 		 324 aa  55.1  0.000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.237269  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0978  phage integrase family protein  27.65 
 
 		 283 aa  55.5  0.000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>