More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Athe_2439 on replicon NC_012034
Organism: Anaerocellum thermophilum DSM 6725



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012034  Athe_2439  integrase family protein  100 
 
 		 283 aa  584  1e-166  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000285613  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1820  phage integrase family protein  39.01 
 
 		 283 aa  201  9.999999999999999e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.111306  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1127  phage integrase  38.06 
 
 		 301 aa  171  1e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013386  Adeg_2179  integrase family protein  34.59 
 
 		 288 aa  170  3e-41  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.353401  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0775  phage integrase family protein  33.22 
 
 		 286 aa  158  8e-38  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0341069  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0795  phage integrase family protein  32.53 
 
 		 283 aa  148  1.0000000000000001e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0924  phage integrase family protein  31.52 
 
 		 294 aa  147  2.0000000000000003e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.852644  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0712  integrase family protein  32.06 
 
 		 285 aa  144  1e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00227312  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0788  phage integrase family protein  30.93 
 
 		 293 aa  125  7e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0037  integrase-recombinase protein  31.94 
 
 		 285 aa  122  5e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.491877  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0660  integrase family protein  31.75 
 
 		 284 aa  121  9.999999999999999e-27  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2052  tyrosine recombinase XerD  31.34 
 
 		 296 aa  119  4.9999999999999996e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3102  integrase family protein  28.95 
 
 		 301 aa  115  6e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000184896  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1668  tyrosine recombinase XerD subunit  29.82 
 
 		 295 aa  114  2.0000000000000002e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.179488  normal  0.0195248 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1282  tyrosine recombinase XerD  29.37 
 
 		 295 aa  113  4.0000000000000004e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.63418  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0255  site-specific tyrosine recombinase XerD  33.33 
 
 		 301 aa  112  7.000000000000001e-24  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0225677  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4199  site-specific tyrosine recombinase XerD  30.07 
 
 		 296 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00345142  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1038  site-specific tyrosine recombinase XerD  30.07 
 
 		 296 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00331502  normal  0.0102802 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0489  tyrosine recombinase XerC  32.57 
 
 		 299 aa  110  3e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.110232  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1839  integrase family protein  29.35 
 
 		 310 aa  110  3e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00203  tyrosine recombinase  30.59 
 
 		 306 aa  110  3e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3999  site-specific tyrosine recombinase XerD  29.72 
 
 		 296 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.189801  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3830  site-specific tyrosine recombinase XerD  29.72 
 
 		 296 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3846  site-specific tyrosine recombinase XerD  29.72 
 
 		 296 aa  109  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0256715  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4311  site-specific tyrosine recombinase XerD  29.72 
 
 		 296 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.789664  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4113  site-specific tyrosine recombinase XerD  29.72 
 
 		 296 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.00015e-24 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4222  site-specific tyrosine recombinase XerD  29.72 
 
 		 296 aa  109  6e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00160259  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4158  site-specific tyrosine recombinase XerD  29.72 
 
 		 296 aa  109  6e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.44443  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2344  phage integrase  27.53 
 
 		 322 aa  109  6e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0456613  normal  0.219342 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0381  tyrosine recombinase XerD  29.41 
 
 		 303 aa  109  7.000000000000001e-23  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0519  phage integrase family protein  28.78 
 
 		 300 aa  108  8.000000000000001e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.24612  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0727  tyrosine recombinase XerD  31.69 
 
 		 304 aa  108  1e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.689003 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11080  phage integrase family protein  32.28 
 
 		 310 aa  108  1e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0105178  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1473  tyrosine recombinase XerD  30.94 
 
 		 296 aa  107  2e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.202075  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1885  phage integrase-like SAM-like  37.78 
 
 		 190 aa  107  2e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.618174  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1099  tyrosine recombinase XerD  33.78 
 
 		 296 aa  107  2e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1611  tyrosine recombinase  32.5 
 
 		 308 aa  107  2e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.4794 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1185  tyrosine recombinase XerD  28.52 
 
 		 310 aa  107  2e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.497096  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2788  site-specific tyrosine recombinase XerD  29.62 
 
 		 296 aa  107  3e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000777667  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3920  site-specific tyrosine recombinase XerD  29.02 
 
 		 296 aa  107  3e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000317777  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3108  integrase family protein  30.46 
 
 		 292 aa  107  3e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000512092  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1827  tyrosine recombinase XerD  32.3 
 
 		 306 aa  106  4e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1654  site-specific tyrosine recombinase XerC  29.9 
 
 		 330 aa  106  4e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000000234006  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0452  tyrosine recombinase XerC subunit  27.56 
 
 		 335 aa  106  4e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.577676  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1819  integrase/recombinase XerD  30.31 
 
 		 295 aa  105  6e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.530175  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3062  site-specific tyrosine recombinase XerD  30.15 
 
 		 308 aa  105  6e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3916  integrase family protein  28.97 
 
 		 295 aa  105  7e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0254607  normal  0.244131 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0590  tyrosine recombinase XerD  34.08 
 
 		 306 aa  105  8e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1556  integrase family protein  35.17 
 
 		 307 aa  105  1e-21  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.36987  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0367  site-specific tyrosine recombinase XerD  30.63 
 
 		 298 aa  104  1e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1215  tyrosine recombinase XerD  29.87 
 
 		 302 aa  103  2e-21  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.157843  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1585  site-specific recombinase XerD-like  28.24 
 
 		 332 aa  103  2e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.264485  n/a   
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3587  integrase family protein  27.85 
 
 		 304 aa  104  2e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  decreased coverage  0.00000000515843  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2378  tyrosine recombinase XerD  29.97 
 
 		 296 aa  103  3e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.336575 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1025  tyrosine recombinase XerD subunit  29.97 
 
 		 302 aa  103  3e-21  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_998  integrase/recombinase  30.77 
 
 		 302 aa  103  4e-21  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3619  phage integrase family protein  28.62 
 
 		 309 aa  103  4e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.215155  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1769  tyrosine recombinase XerD  33.64 
 
 		 304 aa  103  4e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.151783  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0748  tyrosine recombinase XerD  30.45 
 
 		 303 aa  102  5e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.50433  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1185  tyrosine recombinase XerD  30.22 
 
 		 315 aa  102  6e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0531401  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4135  site-specific tyrosine recombinase XerC  28.72 
 
 		 300 aa  102  9e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.383086  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2257  site-specific tyrosine recombinase XerD  31.11 
 
 		 299 aa  101  1e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.977256  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1743  Phage integrase  31.82 
 
 		 270 aa  101  1e-20  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1750  tyrosine recombinase XerD  27.97 
 
 		 294 aa  101  1e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0927  tyrosine recombinase XerD  33.04 
 
 		 304 aa  101  1e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1428  phage integrase  28.11 
 
 		 317 aa  101  1e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.473602  normal  0.0585003 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1390  site-specific tyrosine recombinase XerC  34.09 
 
 		 328 aa  102  1e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000179914  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0537  tyrosine recombinase XerD subunit  32.6 
 
 		 302 aa  101  2e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0325  tyrosine recombinase XerC  30.28 
 
 		 297 aa  101  2e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0704  integrase family protein  28.78 
 
 		 305 aa  101  2e-20  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000143659  unclonable  0.0000000274126 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1996  site-specific tyrosine recombinase XerC  28.17 
 
 		 300 aa  100  3e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0478  tyrosine recombinase XerD  26.9 
 
 		 319 aa  100  3e-20  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11988  putative tyrosine recombinase  27.33 
 
 		 298 aa  100  3e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2104  tyrosine recombinase XerD  28.98 
 
 		 301 aa  100  3e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.443082 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1751  tyrosine recombinase XerD  29.18 
 
 		 294 aa  99.8  4e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0470  tyrosine recombinase XerC  29.37 
 
 		 293 aa  99.8  4e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1934  phage integrase family protein  27.78 
 
 		 297 aa  100  4e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1720  tyrosine recombinase XerD  30 
 
 		 319 aa  99.8  5e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.514315 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1450  integrase family protein  27.56 
 
 		 299 aa  99.4  6e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00858396  normal  0.734684 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0476  tyrosine recombinase XerD  27.5 
 
 		 302 aa  99.4  6e-20  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1501  tyrosine recombinase XerD subunit  32.75 
 
 		 295 aa  99.4  6e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5218  integrase family protein  28.15 
 
 		 326 aa  99.4  6e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2175  tyrosine recombinase XerD  30.98 
 
 		 299 aa  99.4  6e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1239  hypothetical protein  31.2 
 
 		 299 aa  99.4  6e-20  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.968724 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1427  tyrosine recombinase XerD subunit  29.11 
 
 		 295 aa  99  7e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0023  integrase family protein  27.97 
 
 		 291 aa  99  8e-20  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0607  recombinase  33.48 
 
 		 296 aa  99  8e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0884  integrase  29.08 
 
 		 302 aa  99  8e-20  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.161871  hitchhiker  0.000000000000894527 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3247  integrase/recombinase XerC  29.77 
 
 		 296 aa  99  8e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09860  tyrosine recombinase XerC subunit  28.57 
 
 		 329 aa  98.6  1e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4127  tyrosine recombinase XerC  31.48 
 
 		 301 aa  98.2  1e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.442069 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0285  tyrosine recombinase XerC  30.86 
 
 		 302 aa  98.2  1e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0676  tyrosine recombinase XerD subunit  31.78 
 
 		 296 aa  98.6  1e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1732  integrase/recombinase XerD  31.28 
 
 		 308 aa  97.4  2e-19  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4012  tyrosine recombinase XerC  31.41 
 
 		 294 aa  97.4  2e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00152232  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0341  tyrosine recombinase XerC  31.08 
 
 		 317 aa  97.8  2e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000100724  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0842  hypothetical protein  32.64 
 
 		 290 aa  97.8  2e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0047  integrase family protein  29.28 
 
 		 314 aa  97.4  2e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.456307  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1003  tyrosine recombinase XerD subunit  29.93 
 
 		 302 aa  97.4  2e-19  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.497558  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0817  tyrosine recombinase XerD  31.82 
 
 		 305 aa  97.4  2e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.763193  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>