More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_2277 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_2277  phage integrase  100 
 
 		 310 aa  605  9.999999999999999e-173  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.000555272  normal  1 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3046  integrase family protein  91.91 
 
 		 310 aa  546  1e-154  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2776  phage integrase  36.12 
 
 		 316 aa  110  4.0000000000000004e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0149476  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1117  phage integrase  33.84 
 
 		 369 aa  107  3e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.343038  decreased coverage  0.00190839 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1554  integrase family protein  30.87 
 
 		 339 aa  94  3e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.86595  decreased coverage  0.00111318 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2052  integrase family protein  31.37 
 
 		 353 aa  90.1  4e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00829339  normal  1 
 
 
-
 
NC_013386  Adeg_2179  integrase family protein  32.82 
 
 		 288 aa  81.3  0.00000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.353401  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0758  phage integrase family protein  26.64 
 
 		 304 aa  78.2  0.0000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.000222973  n/a   
 
 
-
 
NC_008696  Tpen_1891  phage integrase family protein  29.06 
 
 		 278 aa  76.6  0.0000000000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0795  phage integrase family protein  32.32 
 
 		 283 aa  75.1  0.000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0712  integrase family protein  30.92 
 
 		 285 aa  75.5  0.000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00227312  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1689  integrase family protein  25.77 
 
 		 292 aa  73.2  0.000000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0836065  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1082  integrase family protein  23.21 
 
 		 290 aa  72  0.00000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1456  integrase family protein  29.82 
 
 		 337 aa  71.6  0.00000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.699839  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0787  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E-like protein  27.18 
 
 		 320 aa  71.2  0.00000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  decreased coverage  0.00453269  unclonable  0.000000000000100471 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0401  integrase family protein  28.42 
 
 		 304 aa  70.9  0.00000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.966282 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0722  phage integrase family protein  24.27 
 
 		 306 aa  70.1  0.00000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0599364 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4524  Phage integrase  29.57 
 
 		 310 aa  69.3  0.00000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1023  integrase family protein  27.72 
 
 		 297 aa  69.3  0.00000000008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0854512  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1201  phage integrase  27.37 
 
 		 301 aa  68.9  0.0000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0529826  normal  0.150621 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2737  phage integrase-like SAM-like  30.59 
 
 		 300 aa  68.9  0.0000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.751865  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1619  phage integrase family protein  27.97 
 
 		 286 aa  68.9  0.0000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0106  phage integrase family protein  28.02 
 
 		 295 aa  67.4  0.0000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1349  integrase family protein  25.95 
 
 		 291 aa  66.2  0.0000000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1131  Integrase  31.65 
 
 		 223 aa  66.2  0.0000000006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.127877  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1819  integrase/recombinase XerD  28.46 
 
 		 295 aa  65.1  0.000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.530175  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1966  integrase family protein  30.81 
 
 		 353 aa  65.5  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2860  tyrosine recombinase XerC subunit  26.12 
 
 		 300 aa  65.1  0.000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0660  integrase family protein  25.45 
 
 		 284 aa  65.5  0.000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6131  integrase family protein  28.37 
 
 		 305 aa  65.5  0.000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0169  phage integrase family protein  23.72 
 
 		 282 aa  65.1  0.000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0558238  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2699  integrase family protein  25.95 
 
 		 327 aa  64.3  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1668  tyrosine recombinase XerD subunit  24.18 
 
 		 295 aa  64.3  0.000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.179488  normal  0.0195248 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4608  site-specific recombinase, phage integrase family  30.17 
 
 		 320 aa  63.5  0.000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.764652  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1475  Phage integrase:Phage integrase, N-terminal SAM-like  30.17 
 
 		 320 aa  63.5  0.000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.04346  normal  0.165942 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0419  integrase family protein  31.56 
 
 		 414 aa  63.2  0.000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000230336  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0322  phage integrase family protein  26.64 
 
 		 379 aa  62.8  0.000000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  decreased coverage  0.00211784  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4646  Phage integrase:Phage integrase, N-terminal SAM-like  29.46 
 
 		 317 aa  62.8  0.000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1750  tyrosine recombinase XerD  29.92 
 
 		 294 aa  62.4  0.000000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0023  integrase family protein  23.55 
 
 		 291 aa  62  0.00000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0989  integrase family protein  24.62 
 
 		 355 aa  62.4  0.00000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000138199  hitchhiker  0.00000000000000368709 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1654  site-specific tyrosine recombinase XerC  23.83 
 
 		 330 aa  62  0.00000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000000234006  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6303  integrase family protein  28.91 
 
 		 416 aa  62.4  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.66477  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1592  phage integrase  29.66 
 
 		 377 aa  62  0.00000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4851  integrase family protein  23.02 
 
 		 294 aa  61.6  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2567  site-specific tyrosine recombinase XerD  26.33 
 
 		 313 aa  61.2  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.615759 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3474  site-specific tyrosine recombinase XerC  26.57 
 
 		 296 aa  61.2  0.00000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.486058 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3561  Phage integrase  31.33 
 
 		 275 aa  61.2  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0736  site-specific tyrosine recombinase XerC  27 
 
 		 294 aa  61.2  0.00000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0884  integrase  26.32 
 
 		 302 aa  61.6  0.00000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.161871  hitchhiker  0.000000000000894527 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3145  integrase family protein  26.17 
 
 		 438 aa  61.6  0.00000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00138908  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0235  integrase family protein  31.64 
 
 		 289 aa  61.6  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1519  integrase family protein  25.68 
 
 		 279 aa  60.5  0.00000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.959361  decreased coverage  3.1361700000000003e-18 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0519  phage integrase family protein  25.85 
 
 		 300 aa  60.1  0.00000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.24612  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2069  phage integrase  29.58 
 
 		 359 aa  60.5  0.00000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.244007  hitchhiker  0.000737798 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0431  phage integrase  28.63 
 
 		 291 aa  60.5  0.00000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.173073 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0863  phage integrase family protein  27.46 
 
 		 313 aa  60.1  0.00000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1492  Phage integrase:Phage integrase, N-terminal SAM-like  30.17 
 
 		 320 aa  59.7  0.00000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0116  Phage integrase, N-terminal SAM- like  22.41 
 
 		 309 aa  60.1  0.00000005  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3592  phage integrase family protein  26.05 
 
 		 419 aa  60.1  0.00000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08760  tyrosine recombinase XerD  25.7 
 
 		 309 aa  60.1  0.00000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.940341  unclonable  0.00000000128305 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0772  phage integrase  29.23 
 
 		 304 aa  59.7  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.672054 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2782  phage integrase family protein  28.92 
 
 		 356 aa  59.7  0.00000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.507501  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2436  tyrosine recombinase XerD  23.88 
 
 		 305 aa  59.3  0.00000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.578966 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1720  tyrosine recombinase XerD  27.43 
 
 		 319 aa  59.7  0.00000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.514315 
 
 
-
 
NC_002936  DET0716  tyrosine recombinase XerC  23.69 
 
 		 307 aa  59.3  0.00000008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.841608  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0938  Phage integrase  23.81 
 
 		 393 aa  59.3  0.00000008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.992929  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1003  tyrosine recombinase XerD subunit  22.3 
 
 		 302 aa  59.3  0.00000008  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.497558  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1439  integrase family protein  23.76 
 
 		 317 aa  59.3  0.00000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.110569  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0967  phage integrase family protein  23.94 
 
 		 324 aa  58.9  0.0000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011734  PCC7424_5625  integrase family protein  27.56 
 
 		 273 aa  58.9  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1427  tyrosine recombinase XerD subunit  27.8 
 
 		 295 aa  58.9  0.0000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1971  tyrosine recombinase XerD subunit  25.09 
 
 		 309 aa  58.5  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000860406  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1639  integrase family protein  23.88 
 
 		 301 aa  58.9  0.0000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0514216  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0279  phage integrase family protein  26.57 
 
 		 282 aa  57.8  0.0000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.033075  hitchhiker  0.000013626 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1025  site-specific tyrosine recombinase XerD  26.49 
 
 		 298 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.899371  normal  0.6007 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0653  integrase family protein  23.42 
 
 		 282 aa  57.8  0.0000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.319783  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0240  tyrosine recombinase XerC subunit  25.56 
 
 		 291 aa  58.2  0.0000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.295303  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1273  phage integrase  29.68 
 
 		 331 aa  58.5  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.010146 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2267  phage integrase  28.45 
 
 		 392 aa  57.8  0.0000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000397895  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_623  site-specific recombinase  23.69 
 
 		 307 aa  58.5  0.0000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1202  tyrosine recombinase XerC  29.54 
 
 		 304 aa  57.8  0.0000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.910177  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2709  integrase family protein  28.48 
 
 		 210 aa  57.8  0.0000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000251547  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0704  integrase family protein  24.81 
 
 		 305 aa  57.4  0.0000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000143659  unclonable  0.0000000274126 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2538  integrase family protein  22.89 
 
 		 263 aa  57.4  0.0000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3665  integrase family protein  28.72 
 
 		 313 aa  57.4  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.211751 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4785  integrase family protein  28.47 
 
 		 284 aa  57.4  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000301446  normal  0.920031 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5431  tyrosine recombinase XerD  31.64 
 
 		 299 aa  57  0.0000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.060431  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8116  integrase/recombinase  27.12 
 
 		 335 aa  57  0.0000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.000851463  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16040  site-specific tyrosine recombinase XerD  27.57 
 
 		 298 aa  57  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5470  tyrosine recombinase XerD  23.86 
 
 		 316 aa  57  0.0000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.602612  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12664  integrase  35.68 
 
 		 332 aa  57  0.0000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000304658  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1524  integrase family protein  23.3 
 
 		 300 aa  56.6  0.0000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.681425  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0509  site-specific recombinase, phage integrase family  29.68 
 
 		 332 aa  56.6  0.0000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0651  tyrosine recombinase XerC subunit  24.91 
 
 		 307 aa  56.6  0.0000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0833  site-specific recombinase, phage integrase family  29.68 
 
 		 332 aa  56.6  0.0000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0328  integrase family protein  29.68 
 
 		 332 aa  56.6  0.0000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.133269 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0430  site-specific recombinase XerD-like  28.51 
 
 		 291 aa  56.6  0.0000005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  hitchhiker  0.00678047  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2399  site-specific recombinase, phage integrase family  29.68 
 
 		 332 aa  56.6  0.0000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04122  site-specific tyrosine recombinase XerC  32.86 
 
 		 305 aa  56.6  0.0000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>