57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_5872 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_5872  integrase family protein  100 
 
 		 433 aa  896    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3827  integrase family protein  32.5 
 
 		 354 aa  193  6e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.730502  normal  0.406581 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0850  integrase family protein  30.39 
 
 		 429 aa  158  2e-37  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0838  integrase  28.57 
 
 		 432 aa  149  1.0000000000000001e-34  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.116388 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5219  integrase family protein  27.24 
 
 		 406 aa  81.6  0.00000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.759008  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1013  integrase domain protein SAM domain protein  26.05 
 
 		 404 aa  78.6  0.0000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.256622  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0952  integrase family protein  26.08 
 
 		 412 aa  78.2  0.0000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.571908  normal  0.0199815 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0608  phage integrase family protein  24.84 
 
 		 348 aa  76.3  0.000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1729  hypothetical protein  24.51 
 
 		 404 aa  75.1  0.000000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000763037 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2366  integrase family protein  24.12 
 
 		 415 aa  72.4  0.00000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04300  integrase  23.28 
 
 		 393 aa  72  0.00000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.662362  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4202  integrase family protein  29.08 
 
 		 406 aa  70.1  0.00000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2090  integrase family protein  32.47 
 
 		 392 aa  64.3  0.000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.30003  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0145  integrase family protein  25 
 
 		 411 aa  62  0.00000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.468231  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0063  integrase family protein  32.69 
 
 		 409 aa  61.6  0.00000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4345  phage integrase family protein  25.39 
 
 		 435 aa  61.6  0.00000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011656  BCAH187_E0001  site-specific recombinase  26.38 
 
 		 190 aa  56.6  0.0000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.149945  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1435  integrase  24.85 
 
 		 408 aa  56.2  0.000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.102507 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4009  prophage LambdaBa04, site-specific recombinase, phage integrase family  29.25 
 
 		 180 aa  55.1  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0890  integrase family protein  24 
 
 		 436 aa  54.7  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.304857  normal  0.483711 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6168  integrase family protein  27.14 
 
 		 411 aa  53.9  0.000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2613  prophage LambdaBa04, site-specific recombinase, phage integrase family  27.7 
 
 		 180 aa  53.5  0.000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.301879  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11843  putative transposase  27.96 
 
 		 416 aa  52.8  0.00001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.383494  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00445  tyrosine type site-specific recombinase  22.7 
 
 		 405 aa  52.8  0.00001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.459489  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3281  integrase family protein  27.39 
 
 		 372 aa  53.1  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.739809 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2711  prophage LambdaBa04, site-specific recombinase, phage integrase family  28.67 
 
 		 180 aa  52.4  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0042219  normal  0.247582 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0974  integrase family protein  27.22 
 
 		 430 aa  52  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0711773  normal  0.0223597 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3599  integrase family protein  27.89 
 
 		 180 aa  51.2  0.00003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.616601  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4353  integrase family protein  30.67 
 
 		 470 aa  51.2  0.00004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.130136  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0330  hypothetical protein  30.37 
 
 		 148 aa  50.8  0.00004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.13206  hitchhiker  0.000000768464 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1368  prophage LambdaBa04, site-specific recombinase, phage integrase family  28.57 
 
 		 180 aa  51.2  0.00004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.358053 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1694  phage integrase family protein  27.92 
 
 		 212 aa  51.2  0.00004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.470129  normal  0.0225811 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0652  DNA integration/recombination/invertion protein  29.73 
 
 		 180 aa  50.8  0.00004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3248  integrase family protein  28.4 
 
 		 437 aa  50.4  0.00005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3561  Phage integrase  22.93 
 
 		 275 aa  50.4  0.00006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3980  phage integrase family protein  31.36 
 
 		 365 aa  50.4  0.00006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.356268  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0819  integrase  22.51 
 
 		 409 aa  50.1  0.00008  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1454  integrase  22.51 
 
 		 409 aa  50.1  0.00008  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001839  site-specific recombinase phage integrase family  30.19 
 
 		 186 aa  49.7  0.0001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012794  GWCH70_3453  integrase family protein  27.12 
 
 		 189 aa  49.7  0.0001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.590005  normal  0.791222 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1448  phage integrase family site specific recombinase  26.62 
 
 		 188 aa  49.3  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0710  Integrase protein  25 
 
 		 343 aa  48.9  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1771  phage integrase family protein  26.62 
 
 		 204 aa  48.9  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.753085 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1165  integrase family protein  29.11 
 
 		 187 aa  48.5  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0539  integrase family protein  26.4 
 
 		 436 aa  47.8  0.0004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.19804 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4099  prophage lambdaba02, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  26.35 
 
 		 169 aa  47.4  0.0005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3811  prophage LambdaBa02, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  26.35 
 
 		 180 aa  47.4  0.0005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0141622  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1799  phage integrase family protein  25.97 
 
 		 204 aa  46.6  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.968459  normal  0.396821 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2644  phage integrase family protein  23.81 
 
 		 335 aa  46.6  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00120469  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1859  prophage LambdaSa2, site-specific recombinase phage integrase family protein  26.83 
 
 		 180 aa  46.2  0.001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00377207  n/a   
 
 
-
 
NC_010724  Nther_2955  integrase family protein  28.85 
 
 		 187 aa  46.2  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.819146  n/a   
 
 
-
 
NC_010182  BcerKBAB4_5345  integrase family protein  27.32 
 
 		 182 aa  45.8  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1254  phage integrase family protein  27.22 
 
 		 186 aa  46.2  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.709211 
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3590  integrase family protein  25.9 
 
 		 189 aa  45.4  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  normal  0.0592429  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0127  hypothetical protein, putative phage gene  46.81 
 
 		 273 aa  44.3  0.004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0616  integrase family protein  23.23 
 
 		 394 aa  43.1  0.009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3971  integrase family protein  22.5 
 
 		 340 aa  43.1  0.009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.164476  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>