33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_0608 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_0608  phage integrase family protein  100 
 
 
348 aa  716    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5872  integrase family protein  24.84 
 
 
433 aa  76.3  0.0000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0838  integrase  28.8 
 
 
432 aa  68.9  0.0000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.116388 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2366  integrase family protein  27.7 
 
 
415 aa  57  0.0000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2090  integrase family protein  23.93 
 
 
392 aa  57  0.0000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.30003  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4345  phage integrase family protein  23.88 
 
 
435 aa  55.8  0.000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5219  integrase family protein  26.11 
 
 
406 aa  55.1  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.759008  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1113  integrase  24.77 
 
 
407 aa  53.9  0.000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0850  integrase family protein  22.26 
 
 
429 aa  53.9  0.000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4202  integrase family protein  28.93 
 
 
406 aa  52.8  0.000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3281  integrase family protein  30.88 
 
 
372 aa  51.6  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.739809 
 
 
-
 
NC_002950  PG1435  integrase  27.45 
 
 
408 aa  51.6  0.00002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.102507 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0952  integrase family protein  26.4 
 
 
412 aa  51.6  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.571908  normal  0.0199815 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2497  integrase family protein  22.25 
 
 
308 aa  49.7  0.00008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1013  integrase domain protein SAM domain protein  22.57 
 
 
404 aa  49.3  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.256622  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3248  integrase family protein  24.06 
 
 
437 aa  49.3  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0890  integrase family protein  23.95 
 
 
436 aa  49.3  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.304857  normal  0.483711 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0145  integrase family protein  25.71 
 
 
411 aa  48.5  0.0002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.468231  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0820  integrase  36.36 
 
 
400 aa  48.1  0.0002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3827  integrase family protein  22.55 
 
 
354 aa  48.5  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.730502  normal  0.406581 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2069  phage integrase family protein  24.1 
 
 
419 aa  48.5  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0530977  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1453  integrase  36.36 
 
 
400 aa  48.1  0.0002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0539  integrase family protein  23.53 
 
 
436 aa  47.4  0.0004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.19804 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0063  integrase family protein  23.16 
 
 
409 aa  47  0.0005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5395  integrase family protein  34.43 
 
 
402 aa  45.4  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5323  integrase family protein  34.43 
 
 
422 aa  45.4  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0388032 
 
 
-
 
NC_002950  PG1454  integrase  27.27 
 
 
409 aa  44.7  0.002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0819  integrase  27.27 
 
 
409 aa  44.7  0.002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0211  integrase family protein  33.82 
 
 
384 aa  44.7  0.003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000967186 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1144  phage integrase  32.79 
 
 
422 aa  44.7  0.003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.132159  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1326  integrase family protein  19.92 
 
 
309 aa  43.9  0.004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.847423  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1037  Phage integrase  22.68 
 
 
338 aa  43.1  0.008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4262  integrase family protein  30.11 
 
 
379 aa  42.7  0.009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>