34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_0850 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_0850  integrase family protein  100 
 
 		 429 aa  888    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5872  integrase family protein  30.39 
 
 		 433 aa  158  2e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3827  integrase family protein  32.14 
 
 		 354 aa  149  1.0000000000000001e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.730502  normal  0.406581 
 
 
-
 
NC_002950  PG0838  integrase  27.87 
 
 		 432 aa  82.8  0.00000000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.116388 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4202  integrase family protein  21.36 
 
 		 406 aa  57.4  0.0000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5219  integrase family protein  23.91 
 
 		 406 aa  55.1  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.759008  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4345  phage integrase family protein  25.23 
 
 		 435 aa  55.1  0.000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0608  phage integrase family protein  22.26 
 
 		 348 aa  53.9  0.000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0952  integrase family protein  21.66 
 
 		 412 aa  53.1  0.000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.571908  normal  0.0199815 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2366  integrase family protein  19.77 
 
 		 415 aa  52.4  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4009  prophage LambdaBa04, site-specific recombinase, phage integrase family  26.38 
 
 		 180 aa  51.2  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0819  integrase  21.48 
 
 		 409 aa  51.2  0.00004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1454  integrase  21.48 
 
 		 409 aa  51.2  0.00004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0330  hypothetical protein  32.79 
 
 		 148 aa  47.8  0.0004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.13206  hitchhiker  0.000000768464 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1283  phage integrase family protein  22.18 
 
 		 304 aa  47.4  0.0005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000135681  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1386  integrase family protein  24.29 
 
 		 344 aa  47.4  0.0005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.114707  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1368  prophage LambdaBa04, site-specific recombinase, phage integrase family  25.77 
 
 		 180 aa  47.4  0.0005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.358053 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4708  integrase family protein  26.85 
 
 		 342 aa  47  0.0006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.014031  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1859  prophage LambdaSa2, site-specific recombinase phage integrase family protein  25.47 
 
 		 180 aa  46.6  0.0009  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00377207  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1750  tyrosine recombinase XerD  22.73 
 
 		 294 aa  45.8  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04300  integrase  24.15 
 
 		 393 aa  46.2  0.001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.662362  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2711  prophage LambdaBa04, site-specific recombinase, phage integrase family  24.55 
 
 		 180 aa  46.6  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0042219  normal  0.247582 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0539  integrase family protein  20.98 
 
 		 436 aa  45.4  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.19804 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5707  integrase domain protein SAM domain protein  26.1 
 
 		 319 aa  45.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5304  site-specific recombinase, phage integrase family  22.82 
 
 		 322 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2124  phage integrase family protein  22.45 
 
 		 301 aa  45.4  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.308322  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1590  phage integrase family site specific recombinase  24.28 
 
 		 182 aa  45.8  0.002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000133866  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3599  integrase family protein  25.33 
 
 		 180 aa  44.7  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.616601  n/a   
 
 
-
 
NC_013163  Cyan8802_4591  integrase family protein  24.46 
 
 		 316 aa  44.3  0.004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000000427706  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2090  integrase family protein  23.3 
 
 		 392 aa  44.3  0.004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.30003  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0863  phage integrase family protein  19.44 
 
 		 313 aa  44.3  0.005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0652  DNA integration/recombination/invertion protein  26.32 
 
 		 180 aa  43.9  0.006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0047  integrase family protein  21.62 
 
 		 314 aa  43.5  0.008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.456307  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0145  integrase family protein  21.88 
 
 		 411 aa  43.1  0.009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.468231  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>